PLoS ONE: Foreningen mellem Individual SNP'er eller haplotyperne af matrixmetalloproteinase 1 og Gastric Cancer Modtagelighed, Progression og Prognose

Abstrakt

Baggrund

De enkelte nukleotid polymorfier (SNP) i matrixmetalloproteinase 1 (MMP-1) spiller en vigtig rolle i nogle kræftformer. Denne undersøgelse undersøgte sammenhængen mellem individuelle SNPs eller haplotyper i MMP-1 og modtagelighed, klinisk-patologiske parametre og prognosen for mavekræft i en stor stikprøve af Han befolkning i det nordlige Kina.

Metoder

I dette tilfælde-kontrolleret studie, der var 404 patienter med mavekræft og 404 raske kontrolpersoner. Syv SNP'er blev genotypebestemt ved anvendelse af MALDI-TOF MS-system. Derefter blev SPSS software, Haploview 4.2 software, Haplo.states software og THEsias software, der bruges til at estimere sammenhængen mellem individuelle SNP'er eller haplotyper af MMP-1 og mavekræft modtagelighed, progression og prognose.

Resultater

Blandt syv SNPs, var der ingen individuelle SNPs korreleret til gastrisk kræftrisiko. Desuden er det kun rs470206 genotypen havde en korrelation med histologiske kvaliteter, og patienterne med GA /AA havde godt celledifferentiering sammenlignet med patienter med genotype GG (OR = 0,573; 95% CI: 0,353 til 0,929, P = 0,023). Derefter bygget vi en fire-markør haplotype blok, der indeholdt 4 fælles haplotyper: TCCG, GCCG, TTCG og TTTA. Men alle fire fælles haplotyper havde ingen sammenhæng med gastrisk kræftrisiko, og vi fandt ikke nogen sammenhæng mellem disse haplotyper og klinisk-patologiske parametre i mavekræft. Desuden hverken individuelle SNP'er eller haplotyper havde en forening med overlevelsen af ​​patienter med mavekræft.

Konklusioner

Denne undersøgelse evaluerede polymorfier af MMP-1-genet i gastrisk kræft med MALDI-TOF MS-metoden i et stort nordkinesiske sag-kontrollerede kohorte. Vores resultater viste, at disse syv SNP'er af MMP-1 ikke kan være egnede som signifikante markører til at forudsige mavekræft modtagelighed, progression eller prognose, i det mindste i Han population i det nordlige Kina

Henvisning:. Song YX, Zhou X, Wang ZN, Gao P, Li aL, Liang JW, et al. (2012) Sammenslutningen mellem Individual SNP'er eller haplotyperne af matrixmetalloproteinase 1 og Gastric Cancer Modtagelighed, Progression og Prognose. PLoS ONE 7 (5): e38002. doi: 10,1371 /journal.pone.0038002

Redaktør: Yury E. Khudyakov, Centers for Disease Control og Forebyggelse, USA

Modtaget: Januar 30, 2012; Accepteret: April 29, 2012; Udgivet: 24. maj 2012

• PLoS ONE: β, β-Dimethylacrylshikonin inducerer Mitokondrier Dependent Apoptose gennem ERK Pathway i Human Gastric Cancer SGC-7901 Cells
• PLoS ONE: langsigtede resultater og prognostiske faktorer af mavekræft Patienter med Mikroskopisk peritoneal Carcinomatosis