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PLoS ONE: Die Assoziation zwischen DNA-Kopienzahl Abberationen bei Chromosome 5q22 und Magenkrebs

Abstrakt

Hintergrund

Magenkrebs ist häufig Krebs. neue genetische Biomarker Entdeckung könnte helfen, Personen mit hohem Risiko zu identifizieren. Kopieren Zahlvariation (CNV) wurde kürzlich gezeigt Risiko zu beeinflussen für mehrere Krebsarten. Das Ziel der vorliegenden Studie versucht, um den Zusammenhang zwischen der Kopienzahl bei einer Variante Region und GC zu testen.

Methoden

Insgesamt 110 Magenkrebs-Patienten und 325 gesunden Probanden in diese eingeschrieben waren Studie. Wir suchten nach einem CNV und fand eine CNV (Variation 7468), die Teil des APC
Gen, das SRP19
Gen und das REEP5
Gen. Wir haben uns für vier Sonden Targeting auf APC-intron8
, APC-exon9
, SRP19
und REEP5
Diese CNV zu befragen. Spezifische TaqMan Sonden markiert durch verschiedene Reporter Fluorophore wurden in einer Echtzeit-PCR-Plattform verwendet, um Kopienzahl erhalten. Sowohl die ursprünglichen nicht-ganzzahligen Daten und transformierten Integer-Daten auf Kopienzahl wurden für Analysen verwendet.

Ergebnisse

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