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PLoS ONE: Angeborene Immunität und Non-Hodgkin-Lymphom (NHL) Related Gene in einer eingebetteten Fall-Kontroll-Studie für Magenkrebsrisiko

Abstrakte

Ziel

Genetische Varianten das Immunsystem des Wirts Regulierung auf die Anfälligkeit für die Entwicklung von Magenkrebs beitragen können. Wenig ist über die Rolle des angeborenen Immunitäts bekannt und Non-Hodgkin-Lymphom (NHL) -related Gene für Magenkrebsrisiko. Diese verschachtelte Fall-Kontroll-Studie wurde durchgeführt, um Kandidatengene für Magenkrebsrisiko für zukünftige Studien zu identifizieren.

Methoden

In der Discovery-Phase, 3.072 SNPs in 203 angeborenen Immunitäts und 264 NHL-verwandten Gene, die die Illumine GoldenGateTM OPA-Panel mit wurden in 42 abgestimmt Fall-Kontroll-Sets aus der koreanischen Multi-Center-Krebs-Cohort (KMCC) ausgewählt analysiert. Sechs bedeutende SNPs in vier angeborenen Immunität ( DEFA6, DEFB1, JAK3, Poster und ACAA1
) und 11 SNPs in neun NHL-verwandten Genen ( INSL3, CHMP7, BCL2L11, TNFRSF8, RAD50, CASP7, CHUK, CD79B, Poster und CLDN9
) mit einem permutierten p
-Wert < 0,01 wurden erneut genotypisierter in der Replikationsphase unter 386 Fällen und 348 Kontrollen. Odds Ratios (OR) für das Risikomagenkrebs wurden für das Alter geschätzt Einstellung Raucherstatus und H. pylori
und CagA Sero-Positivität. Zusammengefasst OPs in der gesamten Studienpopulation (428 Fälle und 390 Kontrollen) verwenden pooled- und Meta-Analysen präsentiert

Ergebnisse

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