PLOS NËMMEN: Séminairen Potential vun DNA Methylation zu Gastric Cancer: Eng Meta-Analys

Wat VerfÜgung

Background VerfÜgung

Beweiser aktueller beweist aberrant DNA methylation zu gastric tumourigenesis Équipe ass, proposéiert kann et engem nëtzlech Medeziner uweist fir d'Krankheet ginn. D'Zil vun dëser Etude war assuréiert a publizéiert Donnéeën iwwert d'Potential vun methylation zu gastric Kriibs (GC) Risiko Cepheid, prognostication an Cepheid vun Behandlung Äntwert WikiCommons. VerfÜgung

Method VerfÜgung

Relevant Studien identifizéiert sech vu PubMed eng systematesch Sich Approche benotzt. Resultater goufen duerch meta-Analyse zesummegefaasst. Mantel-Haenszel Chance nennen sech fir all methylation event berechnen déi zoufälleg-Effekter Modell unzehuelen. VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

Eng Widderhuelung vun 589 Sensor Publikatiounen identifizéiert 415 relevant Artikelen, dorënner 143 case-Kontroll Studien op der Gentherapie methylation vun 142 eenzelne Genen am GC Medeziner Echantillon. Eng total vun 77 Genen huet tëscht entholl an normal gastric Otemschwieregkeeten aus GC Sujeten wesentlech differentially methylated, vun deenen Daten op 62 war vun eenheetlechen Etüden ofgeleet. Methylation vun 15, 4 a 7 Genen zu normal gastric Otemschwieregkeeten, Plasma an serum war bzw. vill verschidden zu Frequenz tëschent GC an Net-Kriibs Sujeten. A prognostic Bedeitung huet den 18. Genen an predictive Bedeitung gemellt war gemellt fir p16 VerfÜgung methylation, obwuel vill onkompatibel Conclusiounen goufen och observéiert. Nee Westen wéinst assay, Benotzung vun fixen Otemschwieregkeeten oder CpG Siten analyséiert gouf festgestallt, awer e schmäerzhafte de Westen a Richtung Publikatioun vu positive Resultater observéiert gouf. VerfÜgung

Konklusiounen VerfÜgung

DNA methylation eng villverspriechend uweist fir GC ass Risiko Cepheid an prognostication. Weider do validéiert an onofhängeg cohorts methylation lues Kandidat ass néideg seng Krankheete Potential ze entwéckelen VerfÜgung

Fro:. Sapari NS, Loh M, Vaithilingam A, Soong R (2012), Séminairen Potential vun DNA Methylation zu Gastric Cancer: A meta-Analyse. PLoS NËMMEN 7 (4): e36275. Doi: 10.1371 /journal.pone.0036275 VerfÜgung

Redakter: Rossella Rota, Ospedale Pediatrico Bambino Gesu ", Italien VerfÜgung

Arnaque: 29. September, 2011; Akzeptéiert: 31. Mäerz 2012; Publizéiert: April 27, 2012 VerfÜgung

Copyright: © 2012 Sapari et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung

Funding:. Dës Aarbecht ënnerstëtzt gouf duerch Subventiounen aus der National Medical Fuerschungen (NMRC /misst /001/2007). D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung

Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

Gastric Kriibs (GC) bleift e grousse Krankheete Géigespiller weltwäit wéinst hirem héijen prevalence, aarm hätt a limitéiert Behandlung Optiounen [1]. Obwuel d'Heefegkeet vun GC iwwer d'Joer Fro huet, geet et der zweeter Virwaat Ursaach vum Kriibs Doud ze ginn an déi véiert stäerkste gemeinsam weltwäit malignancy. Manner wéi 25% vun GC Fäll sinn op eng fréi Etapp, an den Tarif ass 5-Joer Iwwerliewe festgestallte nëmmen 24% vun den US an Europa [2]. Allerdéngs, verbessert d'Iwwerliewe Taux vum GC zu iwwer 60%, wann op eng fréi Etapp fonnt [2], vun deem Kriibs Typ d'Wichtegkeet vun fréi ze erkennen Betount. VerfÜgung

DNA methylation eng epigenetic Mechanismus vun transcriptional Regelung ass, mat en Engagement zu Kriibs un der surfen silencing vun entholl suppressor Genen, oder Verloscht vun oncogene Repressioun zougeschriwwen [3]. Zanter dem éischten Artikel vum Fang et al. VerfÜgung an 1996 beschreiwen DNA hypomethylation vun c-myc an c-Ha-ras am GC [4], méi wéi 550 Etuden hunn op der Bedeelegung vun aberrant DNA methylation publizéiert goufen an der Entwécklung vun GC. Als Resultat, huet d'Präsenz a funktionell Konsequenze vun aberrant DNA methylation vu méi wéi 100 Genen am GC gemellt ginn [5] - [17]. Hiwäis op Linken tëscht aberrant DNA methylation zu H. pylori VerfÜgung Wonn [1], [18] - [22] an z'engagéieren an precancerous gastric epithelial lesions an GC Werdegang [18], [19], [21], [23] - [25] ginn och ëmmer méi dokumentéiert. Geholl zesummen, hunn dës Resultater uginn aberrant DNA methylation huet eng bedeitend Roll an gastric Kriibs Entwécklung an Werdegang. VerfÜgung

D'Muster vun entholl DNA methylation kann fir Kriibs Risiko Duerchmusterung, prognostication a Behandlung Cepheid nëtzlech ginn [3], [ ,,,0],26] - [30]. Am Verglach zu somatic stattfannen, huet DNA methylation enger héijer Zuel vu aberrant hire Restaurant pro Kriibs Zell [31]. Desweideren, existeiert aberrant DNA methylation fréi an der tumourigenesis vu ville Kriibs Zorte [28], et virun allem nëtzlech fir Risiko Cepheid. Déi technesch Reiz vun DNA methylation ass datt et chemesch stabil ass a ka mat engem ganz héich Empfindlechkeet vun bis zu 1:1000 Molekülle [19] nogewise ginn. Puer Reportagen hu bewisen, och déi Kriibs-spezifesch, kann methylated DNA zu biologeschen Flëssegkeeten fonnt ginn, proposéiert Iech et eng nëtzlech Bewaacher fir Net-invasiv Diagnos kéint [28], [32], [33]. VerfÜgung

D' Wichtegkeet vun fréi ze erkennen an ze GC Iwwerliewe Resultater an der villverspriechend Beweiser vun DNA methylation als biomarkers ass d'Motivatioun fir dës Etude ze verbesseren. Trotz wuessen Beweiser vun der Medeziner Potential vun DNA methylation, ka vill onkompatibel Resultater ganze Studien observéiert ginn. Dofir gouf dës Etude Informatiounen iwwert d'Medeziner Potential vun methylation am GC mat Hëllef vun engem meta-Analyse assuréiert land, an deem Kandidat methylation Evenementer verdéngt weider Evaluatioun als klinesch relevant biomarkers fir d'Krankheet ze schloen. VerfÜgung

spontan a Methoden VerfÜgung

Umeldung an eng Zoulag vu Studien VerfÜgung

eng systematesch Literatur Sich zu PubMed fir Artikelen publizéiert bis 27. Oktober 2011 war mat ' "gastric Kriibs" aN "methylation" standing wéi d'Sich Begrëffer. Nee Restriktiounen sech während der Sich zu PubMed an déi doraus resultéierend Studien huet manuell curated no hir Relevanz fir GC DNA methylation benotzt. Dës abegraff Studie vun GC zu de Beräicher vun hypermethylation an hypomethylation /demethylation vun global a viséieren-spezifesch Regiounen. Den Titel an mythologesch vun der am initialen Sich identifizéiert Pabeiere waren fir appropriateness zu den Ziler vun dësem Pabeier évaluéieren. All potenziell relevant Artikelen sech dann am Detail évaluéiert an zousätzlech, relevant Studien sech aus der justifiéiert bannent deenen Artikelen identifizéiert. Zanter de Schwéierpunkt vun dësem Pabeier ass op mënschlech Gentherapie methylation, Studien dass methylation vun H analyséiert. pylori VerfÜgung a Epstein-Barr VerfÜgung Virus (EBV) genomes am GC Werdegang sech dorunner net. VerfÜgung

Sécuritéit Auswiel an Daten Annotation VerfÜgung

Meta-Analysë Message Ofstänn zu entholl an normal gastric Otemschwieregkeeten sech zu Donnéeën aus case-Kontroll Studien limitéiert datt d'Frequenz vun methylation vun eenzelne Genen vun respektiven Gruppen gemellt. Daten aus Kritik a meta-Analysë vun der selwechter Studie goufen net considéréiert. Informatiounen iwwert d'éischt Auteur, Joer vun der Publikatioun, Gentherapie (s) analyséieren, Gréisst vun Etude Bevëlkerung, déi meescht vun methylated Fäll a Kontrollen, Employé Methode fir DNA methylation Analyse an d'Prouf Typ sech fir all studéieren (Table S1, S2) opgeholl. Aner relevant Detailer wéi den Typ vun lesion, H. pylori VerfÜgung Status, Lauren Klassifikatioun an CpG Insel methylator phenotype (CIMP) Zoustand waren och wou sinn opgeholl. Séminairen Fäll goufen an aacht Kategorië gruppéiert, nämlech (1) normal mucosa aus Net-Kriibs Sujeten, (2) normal mucosa aus Fäll mat entholl bruecht, (3) chronescher gastritis, (4) intestinal metaplasia, (5) dysplastic adenoma, ( 6) adenocarcinoma, (7) fréi GC a (8) fortgeschratt GC. Wéinst der klenger Zuel vu Studien sinn, huet de Medeziner Fäll net weider an H klassifizéiert. pylori VerfÜgung positiv /negativ Fäll oder intestinal /diffusen Typ GC an Net-Kriibs Sujete goufen an ë.a. /firstellen Kontrollen net weider klassifizéiert. Fir d'selwecht Ursaach, Ënnergrupp Analyse baséiert op de verschiddenen Etappe vun precancerous zu kriibserreegend lesions war net gesuergt. Fir Konstanz, war zu Genen mat Multiple Bezeechnung unerkannten enger eenzeger Gentherapie Numm op HUGO Nomenclature baséiert. VerfÜgung

Meta-Analyse VerfÜgung

Meta-analyséiert goufen Kritik Manager 5 standing benotzt (D'Cochrane Collaboratioun, Kopenhagen, Dänemark). Mantel-Haenszel Chance nennen (Örs) huet fir all Gentherapie berechnen duerch d'Zoufall-Effekter Modell opmaachen. Homogeneity Beraich Etuden fir déi selwecht Gentherapie war op der Basis vun der χ évaluéieren 2 Test der Cochran Q iwwerleen benotzt. D'ech 2 Statistiken, déi d'Ausmooss vun anner tëscht Studien Mesuren, war och évaluéieren. Déi 95% Vertraue nolauschterer vun der Chance Verhältnis war benotzt Differenzen tëscht Gruppen ze diskutéieren. Wann d'Vertrauen Intervalle rauszesichen iwwerlageren, déi zwou Chance nennen sech vill verschidden um 10% Niveau (zënter 1- (0,95 * 0,95) ≈0.9). Triichter Diagrammen souwéi Begg d'Tester goufen benotzt fir Publikatioun Westen ze kontrolléieren [34]. Publikatioun Westen war als bedeitendst wann der p-Wäert war &Si besteet;. 0.1 [35] VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

Sécuritéit Charakteristiken VerfÜgung

D'Manifestatioun Auswiel Prozess an dëser Etude benotzt gëtt zesummegefaasst Figur 1. eng total vun 559 Studien sech vu PubMed identifizéiert, an eng zousätzlech 30 Studien sech weider aus justifiéiert vun der initialen Sensor Publikatiounen identifizéiert. Baséiert op der appropriateness vun den Titel an mythologesch un der Etude Ziler, goufen 415 Pabeiere fir weider detailléiert Evaluatioun ausgewielt. Vun deenen, 190 Net case-Kontroll Studien, 22 Kritik, 4 Kommentare an 1 meta-Analyse huet aus case-Kontroll meta-Analysë ausgeschloss. Anere Fall-Kontroll Studie goufen och ausgeschloss, well se sech Studie vun Net-FAQ coding Genen (zB methylation vun Mikro-RNS Genen), d'Presentatioun vun Donnéeën war net gëeegent (zB Daten op eenzelne CpG Siten, an demethylation oder hypomethylation nëmmen) oder Frequenz Donnéeën gouf suivéiert. Am Ganzen, goufen 143 case-Kontroll Studien der methylation Frequenz vun 142 eenzelne Genen Informatiounsblat fir meta-Analysë considéréiert. D'Daten vun e puer Studien huet an méi wéi ee meta-Analyse benotzt, wéi se an dëser Etude als Daten op multiple Prouf Typ Vergläicher Texter. VerfÜgung

Genen methylated differentially tëscht entholl an normal gastric Otemschwieregkeeten aus gastric Kriibs Sujeten

a Ganzen 106 case-Kontroll Studien op der Frequenz vun methylation zu 122 Genen vun entholl an normal Otemschwieregkeeten Echantillon vun GC Sujete waren fir meta-Analyse (Table S1) Berichterstattung identifizéiert. Methylation vun 77 vun den 122 Genen huet vill verschidden tëscht der Echantillon (Table 1), vun deenen Donnéeë fir 62 war nëmmen aus enger eenzeger Etude ofgeleet. Methylation war wiesentlech méi héich an entholl zu 70 Genen, an zu normal Otemschwieregkeeten zu 7 Genen. VerfÜgung

Genen methylated differentially zu normal gastric Otemschwieregkeeten aus GC an Net-Kriibs Sujeten VerfÜgung

Twenty case-Kontroll Studien ze vergläichen d'Frequenz vun methylation zu 34 Genen tëscht normal Otemschwieregkeeten Echantillon vun GC an Net-Kriibs Sujete waren fir meta-Analyse (Table S2) identifizéiert. Vun deenen, methylation zu 15 Genen huet vill verschidden, vun deem d'Donnéeën vun 11 Genen vun enger eenzeger Etude ofgeleet waren nëmmen (Table 2). Fir all 15 Genen, war methylation héich zu normal Otemschwieregkeeten aus GC Verglach zu Net-Kriibs Sujeten. Betruecht methylation zu méi wéi eng Etude iwwerpréift Evenementer, 4 ( p16 VerfÜgung, CDH1 VerfÜgung, DAPK VerfÜgung, CHFR VerfÜgung) waren fonnt vill anescht ginn . VerfÜgung

Genen an Net-Otemschwieregkeeten Echantillon vun GC an Net-Kriibs Sujeten differentially methylated VerfÜgung

zu 29 Genen vun de Medeziner Echantillon aner wéi gastric Otemschwieregkeeten a Ganzen 26 Studien op methylation Informatiounsblat, dorënner ganz Blutt , Plasma, serum, gastric Mëtten, peritoneal Valoriséierung a faecal Echantillon vun GC Sujete waren identifizéiert. Vun dësen, waat 13 Studien methylation vun insgesamt 14 Genen an entweder serum, goufen faecal oder Plasma Echantillon vun engem Fall-Kontroll Design an domat gëeegent fir meta-Analyse (Table S2). Vill verschidde methylation Ofstänn goufen zu 4 Genen zu Plasma Echantillon observéiert, 7 Genen vun serum Echantillonen an 0 zu faeces (Table 2). p15 VerfÜgung war eng gemeinsam Gentherapie an Etuden vun Plasma an serum identifizéiert, et 10 eenzegaarteg Genen ofzeschafen vill verschidden zu methylation Frequenz am Blutt Echantillon bruecht. Methylation an nëmmen zwee Genen ( CDH1, p16 VerfÜgung) war méi wéi eng Etude iwwerpréift, an zwee sech vill verschidden an Heefegkeet vun der Echantillon vun GC an Net-Kriibs Sujeten am meta-Analyse. VerfÜgung

methylation als prognostic an predictive Bewaacher fir GC VerfÜgung

a Ganzen 28 Studien huet identifizéiert datt Gentherapie methylation zu 40 Genen am Bezug op d'Iwwerliewe Resultat vun GC Sujeten (Table 3) propagéieren. Vun der 40 Genen studéiert, huet nëmmen 5 zu Multiple Studien iwwerpréift. Meta-Analyse konnt net op dëser Serie vun Etuden wéinst der onregelméissegen Berichterstattung vun iwwerschloen nennen opgeféiert ginn. Eng bedeitend Associatioun mat Iwwerliewe war zu 18 vun den 40 (45%) Genen fir methylation gemellt, obwuel anner vun der Opklärung vun Differenze fir all zu Multiple Studien iwwerpréift Gentherapie observéiert gouf. VerfÜgung

Five op Associatiounen gemellt Studien tëscht d'Iwwerliewe vun GC Sujeten engem spezifeschen Chimiotherapie Behandlung an methylation vun 10 Genen dorënner TMS1 VerfÜgung, DAPK VerfÜgung, LOX VerfÜgung feieren, froen VerfÜgung a CHFR VerfÜgung [36] - [40]. An all 5 Etuden, Theme mat methylation hat e schlecht Iwwerliewe wéi déi ouni methylation. Eng Etude iwwerpréift Iwwerliewe Differenzen tëscht Sujete behandelt mat an ouni Chimiotherapie no p16 VerfÜgung methylation Status [41]. An dëser Etude, Sujeten ouni p16 VerfÜgung methylation datt Chimiotherapie dobäi haten eng besser Iwwerliewe wéi déi, déi net gemaach, Coursë fir Theme mat p16 VerfÜgung methylation, et war kee groussen Ënnerscheed no Behandlung Status. VerfÜgung

Effekt vun analytesch Verännerlechkeet a Publikatioun Westen VerfÜgung

an der Annotation vun Etüden, bedeitend heterogeneity war an villen Etude Parameteren observéiert, dorënner och de assays benotzt, goufe CpG Siten, Etappe vun Krankheet iwwerpréift, an der Prouf Zorte benotzt (zB frësch, gefruer oder paraffin-Ënnerbewosstsinn Otemschwieregkeeten). Zwielef verschiddene assays sech fir d'Evaluatioun vun methylation, mat methylation-spezifesch Hinnen alleguer (MSP) ginn déi gemeinsam benotzt. Fir den Afloss vun methylation assay op studéieren Resultater, Daten aus methylation-spezifesch Hinnen alleguer a grouss methylation-spezifesch Hinnen alleguer (zB Methylight) Analyse ënnersicht Verglach sech fir d'Gene Meeschter dacks zu Studien iwwerpréift vergläichen methylation tëscht gastric entholl an normal Otemschwieregkeeten ( MLH1 VerfÜgung, 13 case-Kontroll Studien). Et gouf kee statistesch Ënnerscheed ( P VerfÜgung &Si besteet; 0,05) an der 95% Vertraue Intervalle vun der methylation Ofstänn Rapport mat der zwee assays (Dorënner S1). Keng Differenze no Prouf Typ (gefruer vs. paraffin-Ënnerbewosstsinn Otemschwieregkeeten), Etapp vun Krankheet, oder Siten CpG goufe waren och an dës Studien observéiert (Resultater net gewisen). VerfÜgung

fir Publikatioun Westen Fir Test, Donnéeën aus der selwechter 13 Studien op MLH1 VerfÜgung methylation uewen ernimmt gouf och iwwerpréift. A Trend positive Berichterstattung war zu Triichter Komplott (Dorënner S2) an Begg d'Test Analyse observéiert. Mä, soll dës Resultater mat him interpretéiert ginn, wéi déi Studie vun klengen Echantillonen Gréisst huet, an engem Minimum vun 20 Studien ass normalerweis fir eng zouverlässeg Analyse vun Publikatioun Westen recommandéiert [42]. VerfÜgung

Diskussioun VerfÜgung

vill Studien hu aberrant DNA methylation bei villen Genen vun verschiddenen Echantillon a Modeller vun gastric tumourigenesis [1], [5] agebonne - [10], [12] - [14], [16], [18] - [22] , [24], [43]. Dëst deemno huet am Tour Stopp fir d'Notioun dass methylation eng nëtzlech uweist fir verbesseren d'Medeziner Gestioun vun GC kéint [11], [15], [32], [44], [45]. Fir awer den Datum, huet dat Potential net realiséiert ginn, wahrscheinlech wéinst engem Manktem vun relevant Beweiser der Fahrt vun methylation an der Klinik ze ënnerstëtzen. VerfÜgung

An dëser Etude, eng ëmfaassend review vun all Publikatiounen op d'Ofstänn an Associatiounen vun methylation an huet gastric Kriibs Medeziner Echantillon standing Informatiounen zu den Terrain assuréiert. Meta-Analyse huet gehaal wou méiglech eng objektiv Konsens aus ëmmer propagéieren Evenementer ze gewannen. vill aus der Analyse, goufen Lëschte vun Genen generéiert differentially tëscht entholl an normal Otemschwieregkeeten kennt aus GC Sujeten (Table 1) methylated, an normal Otemschwieregkeeten an /oder Blutt aus GC an Net-Kriibs Sujeten (Table 2), all mat methylation Evenementer forcéiert fir hir Kraaft vum Veräin an Heefegkeet vun Analyse. Conclusiounen aus Studien op der prognostic an predictive Bedeitung vun methylation Evenementer sech och iwwer- (Table 3). Dës Lëschten an zousätzlech zousätzlecht Donnéeën (Bedeitung S1, S2) soll nëtzlech Informatiounen déi aus wat fir besser de Medeziner Potential vun de respektiven Evenementer bewäerten, an Prioritär weider schaffen. VerfÜgung

mat 77% (101/132) vu Fall -control Analysë (Dorënner 1), iwwerschafft de gréisste Grupp vun Studien waren déi d'Frequenz vun methylation zu entholl an normal gastric Otemschwieregkeeten aus GC Sujeten ze vergläichen. D'Revisioun identifizéiert 77 bedeitendst Gentherapie methylation Evenementer, déi meta-Analyse an der selwechter Zäit an tumourigenesis déi vill verschidden methylation vun enger Zuel vu Genen Toast agebonne confirméiert, dorënner MLH1 VerfÜgung, p16 VerfÜgung, an CHFR VerfÜgung a RUNX3 VerfÜgung (Table 1). Dës Evenementer vertrieden nëtzlech Handwierksgeschir fir besser ze verstoe gastric tumourigenesis an eventuell nei therapeutesch Strategien Erkenntnesser [3], [28]. Ee vun de Standpunkt vun Risiko lues, kann dës Evenementer nëmmen eng éischte Pool vu Kandidaten considéréiert ginn weider ze testen an méi klinesch relevant analyséiert, wéi d'Evenementer op hir eegen nëmmen gastric entholl Echantillon identifizéieren, datt si schonn histologically diagnosable. VerfÜgung

aus Studien methylation Niveauen an normal Otemschwieregkeeten, Plasma an serum aus GC an Net-Kriibs Sujeten, 15, 4 a 7 (Table 2) vill verschidden Gentherapie methylation Evenementer vergläichen bzw. identifizéiert goufen. Genen mat zwou etabléiert Rollen (wéi p16 VerfÜgung, CDH1 VerfÜgung, DAPK VerfÜgung, RUNX3 VerfÜgung, p15 VerfÜgung) an hu -known Rollen (wéi BX161496 VerfÜgung, SULF1 VerfÜgung, RPRM VerfÜgung) zu tumourigenesis identifizéiert goufen. Eng Zuel vun Evenementer goufen tëscht Studien op normal Otemschwieregkeeten a Blutt, wéi methylation op p16 VerfÜgung, CDH1 VerfÜgung, DAPK VerfÜgung gemeinsam. Dës Evenementer sinn klinesch versprécht, wéi se fir estimating GC Risiko vu Echantillon discriminative Capacitéiten bewisen, datt am aktuelle Spillstand Praxis, wéi am Bild Duerchmusterung (Otemschwieregkeeten), oder Bevëlkerung oder Krankheete Duerchmusterung (Blutt) kritt een kann. VerfÜgung

d'Hypothes, datt Gentherapie silencing vun methylation och Gravitéit vun der Krankheet bestëmmen kann [27] huet Suite och vill Ënnersich vun der Gentherapie methylation Associatiounen mat Iwwerliewe vun GC. An dëser review, deemno 28 Studien op der Associatioun vun Iwwerliewe vun GC Sujeten an methylation um 40 Genen och identifizéiert. An Ënnerstëtzung vun der Hypothes, ware vill bedeitendst Associatiounen tëscht methylation an aarme Iwwerliewe opgeholl, virun allem bei entholl suppressor Genen (Table 3). Associatiounen tëscht methylation a besser Iwwerliewe sech och fir véier Genen gemellt ( PTGS2 VerfÜgung, MINT31 VerfÜgung, MLH1 VerfÜgung, Camion VerfÜgung), viraussiichtlech datt Ennerdréckung Spigelteleskopen vun oncogenic Aktivitéit vun der Gentherapie methylation och geschéie kann. Mä, eng bedeitend opgepasst onofhängeg Etude a Gedächtnis vun Associatiounen fir déi meescht vun de Genen studéiert (Table 3) Héichpunkter e brauch fir weider Enquête zu dësem Aspekt vun methylation am GC. VerfÜgung

Data aus fënnef Studien op Patienten Erhalen Chimiotherapie och huet virgeschloen, datt DNA methylation op CHFR VerfÜgung, DAPK VerfÜgung, TMS1 VerfÜgung nëtzlech dacks Äntwert ze Chimiotherapie kéint [36] - [40]. Allerdéngs, aus dem Design vun dësen Analyse, ass et schwéier fir festzestellen, ob d'Iwwerliewe Differenzen ze Onfruchtbarkeet prognostic Ennerscheeder wéinst goufen oder eng Funktioun vun enger Behandlung Interaktioun goufen, oder zwee. An enger Étude vun engem aneren Design, Mitsuno et al. VerfÜgung gemellt, dass Patienten mat p16 methylation engem Iwwerliewe profitéiere Chimiotherapie verdengten, iwwerdeems déi ouni methylation net gemaach [41]. Dëst Resultat hindeit datt p16 methylation eng nëtzlech Bewaacher fir en Äntwert op Chimiotherapie goen kann, an déi Beweiser vun enger Behandlung Interaktioun. Mä dës Etude iwwerpréift nëmmen 56 Punkten an enger Retrospektiv Analyse, a vill weider Aarbecht ass néideg dës Conclusiounen ze confirméieren. VerfÜgung

D'Resultater vun dëser Etude e versprécht Potenzial fir DNA methylation am GC Risiko Cepheid Highlight, prognostication an Cepheid vum Traitement Äntwert. vill Froen relevant fir Medeziner Ëmsetzung bleift awer, unaddressed vun de Studien. Methodologically, definéieren d'Studien schlecht optimal Approche fir Analyse, wéinst hirer grousser Verännerlechkeet an assays, Hinnen alleguer primers an Ämter, Hinnen alleguer Konditiounen, a watfir fir hir benotzt. Déi meescht Studien (102/143, 71%) hunn op methylation-spezifesch Hinnen alleguer baséiert ginn, fir déi d'Net-grouss Natur vun Analyse Schwieregkeeten ze Qualitéitskontroll a Stan- presentéiert. Mat methylation eng dynamesch Evenement, Ëmwelt- fir probéieren si och brauchen vun Ännerung, souwuel mat Respekt un der Regioun oder Site vun probéieren, an Zäit vun probéieren. D'Distanz vun normal Otemschwieregkeeten aus entholl [46], an Zäit vun probéieren [21], [22] hunn all vill dokumentéiert gouf zu methylation Niveauen Afloss. VerfÜgung

Déi grouss Verännerlechkeet vun de Genen an der Gentherapie Brieder tëscht Studien iwwerpréift mat engem Mangel vun publizéieren, an onofhängeg Serie an characterization vun Test Leeschtung Charakteristiken kombinéiert, mécht och et schwéier eng klinesch relevant Test ze definéieren. Variant vun der Khamenei vun oft System verschidden CpG Siten [47] - [49] tëschent Studie vun der selwechter Gentherapie gëtt zousätzlech komplizéiert. Desweideren, all d'Gene methylation Evenementer zu Multiple Studien iwwerpréift a wesentleche mat GC verbonne (dorënner p16 VerfÜgung, DAPK VerfÜgung, CHFR VerfÜgung, MLH1 VerfÜgung, RUNX3 VerfÜgung) goufen als Risiko lues vu villen anere Kriibs Zorte agebonne [26], [27], [50], Froen iwwer d'Interpretatioun vun hiren Detectioun an asymptomatic Persounen bewegen. VerfÜgung

of weider allem sinn d'Co-variates vun Analyse datt mat methylation analyséiert géif ginn. Methylation huet mat vill Demographie, Medeziner a molekulare Fonctiounen, dorënner Alter, Geschlecht, Fëmmen, intestinal metaplasia, Provider Genetik verbonne ginn, an H. pylori VerfÜgung an Epstein Barr Virus Status [1], [24]. Nieft direkt Associatiounen, hunn och vill Studien gemellt Interaktiounen tëschent ville vun dëse Fonctiounen an methylation op GC riskéieren [51] verbidden. Methylation Evenementer selwer kann och mat all aner [50] Hausnummeren an zesummekomm sinn, eng Erausfuerderung Fotoe souwéi eng optimal Rot vun methylation lues ze definéieren. A CpG Insel methylator phenotype (CIMP), aus Frae bestemmt vun GC mat Co-adjoints methylation zeréckzeféieren, huet beschriwwe ginn [52] - [55], obwuel d'Beweiser fir CIMP am GC ass net esou iwwerzeegend wéi fir colorectal Kriibs [56 ], [57]. VerfÜgung

an Conclusioun, eng villverspriechend Wäert fir DNA methylation fir de Risiko Cepheid, prognostication an Cepheid vun Äntwert ze Chimiotherapie vun GC d'Resultater vun dëser Etude WikiCommons. Allerdéngs bleiwen bedeitendst Archipel an Confirmatioun Froen un ginn d'Daten fir datt dës Informatiounen aktivéiert ginn fir der Ambulanz considéréiert gin. Dëst beinhalt d'Analyse vun grousst onofhängeg Prouf Serie, Applikatioun vun standardiséierte Methoden, Upassung fir Co-variates zu multivariate Analyse, grouss Definitioun vum Resultat endpoints an Upassung fir den Effet vum Traitement Interventioun. D'Realisatioun vum Potential vun DNA methylation Medeziner Gestioun ze GC zoukënnt hir Opléisung. VerfÜgung

Ennerstëtzung Informatiounen VerfÜgung S1 Dorënner. VerfÜgung Forest-Komplott vun methylated Studien vergläichen MLH1 VerfÜgung methylation tëscht entholl an normal Otemschwieregkeeten aus GC Sujeten no Gebrauch vun methylation-spezifesch Hinnen alleguer a grouss methylation-spezifesch Hinnen alleguer. VerfÜgung Doi: 10,1371 /journal.pone.0036275.s001 VerfÜgung (TIF) VerfÜgung Dorënner S2. VerfÜgung Triichter Komplott vun all 13 Studie vun MLH1 VerfÜgung methylation zu entholl an normal gastric Otemschwieregkeeten aus GC Sujeten Publikatioun Westen diskutéieren. D'vertikal Linn bedeit der hinzeginn Estimatioun vun der globale ODER an der sloping représentéieren 95% Vertraue nolauschterer VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0036275.s002 VerfÜgung (TIF) VerfÜgung Table S1. VerfÜgung Lëscht vun methylated Genen an hir Komponent Etuden fir Ënnerscheeder tëscht entholl an normal gastric Otemschwieregkeeten aus gastric Kriibs Sujeten ze vergläichen. Meta-Analyse gelungent nennen (ODER) an 95% Vertraue November ware fir all methylated Genen analyséiert berechnen. Red a fett Policen sech ze weisen, groussen Ennerscheeder tëschent Gruppe benotzt. BS-SSCP: bisulfite Single-gekëmmert conformation polymorphism; Bseq: bisulfite sequencing; Ophiophagus: bisulfite Restriktioun Analyse kombinéiert; DPHLC: Denaturing High Performance Liquid Chromatography; FFPE: formalin-fix paraffin Ënnerbewosstsinn; Egal: Héichopléisende vermëschen; MSP: methylation-spezifesch polymerase Kette Reaktioun; Hinnen alleguer: polymerase Kette Reaktioun; QMSP:. Grouss methylation-spezifesch polymerase Kette Reaktioun VerfÜgung Doi: 10,1371 /journal.pone.0036275.s003 VerfÜgung (XLS) VerfÜgung Table S2. VerfÜgung Lëscht vun methylated Genen an hir Komponent Etuden fir Ënnerscheeder zu normal Otemschwieregkeeten, Plasma an serum tëscht gastric Kriibs an Net-Kriibs Sujeten ze vergläichen. Meta-Analyse gelungent nennen (ODER) an 95% Vertraue November ware fir all methylated Genen analyséiert berechnen. Red a fett Policen sech ze weisen, groussen Ennerscheeder tëschent Gruppe benotzt. Ophiophagus: bisulfite Restriktioun Analyse kombinéiert; MSP: methylation-spezifesch polymerase Kette Reaktioun; QMSP:. Grouss methylation-spezifesch polymerase Kette Reaktioun VerfÜgung Doi: 10,1371 /journal.pone.0036275.s004 VerfÜgung (XLS) VerfÜgung

Arbeschterlidder VerfÜgung

Mir Merci Barry Iacopetta an Chee- seng KU fir hir Bäiträg zu der Resultat vun der mëttelalterlech Handschrëft. VerfÜgung

• PLOS NËMMEN: Umeldung vun kann awer och sin-Mir-335 als Prognostic ënnerschriwwe zu Gastric Cancer
• PLOS NËMMEN: Ofgeholl Niveauen vun Aktiv SMAD2 vergläichen mat Poor hätt an Gastric Cancer