Stomach Health > Mo. Gesondheet >  > Gastric Cancer > Gastric Cancer

PLOS NËMMEN: Exclusive Association vun p53 stattfannen mat Super-High Methylation vun entholl Suppressor Genen vun der p53 Passerelle an enger eenzegaarteg Gastric Cancer Phenotype

Wat VerfÜgung

Background VerfÜgung

Eng detailléiert Sich fir DNA methylated Genen identifizéiert Kandidat entholl suppressor Genen déi bewisen hunn an der apoptotic Prozess vun der p53 VerfÜgung Passerelle Équipe ze ginn . An dëser Etude, ze propagéieren mir p53 VerfÜgung stattfannen par rapport zu esou epigenetic Verfall vun der Primärschoul gastric Kriibs VerfÜgung

Method VerfÜgung

D'methylation Profiler vun den 3 Genen:. PGP9 VerfÜgung. 5 zur VerfÜgung, NMDAR2B VerfÜgung, an CCNA1 VerfÜgung, déi an der p53 entholl suppressor Passerelle a Kombinatioun Équipe si mat p53 VerfÜgung stattfannen sech zu 163 Primärschoul gastric Cancers iwwerpréift. Den Effet vun epigenetic puer a Kombinatioun mat chemotherapeutic Drogen op apoptosis war och no der entholl évaluéieren p53 VerfÜgung stattfannen Status. VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

p53 VerfÜgung Gentherapie kennen sech zu 44 Primärschoul gastric erhéijen (27%), an super-héich methylation vun all vun den 3 Genen war nëmmen fonnt an Fäll mat Wëld Typ p53 VerfÜgung fonnt. Héich p53 VerfÜgung Passerelle aberration war zu Fäll mat männlecht Geschlecht (p = 0.003), intestinal Typ (p = 0.005), an Net-infiltrating Typ (p = 0.001) fonnt. D' p53 VerfÜgung Passerelle aberration Grupp Schatzkummer manner um Terrain zu lymph Wirbelen, wäit Organer, an peritoneum wéi p53 VerfÜgung Net-aberration Grupp. An der NUGC4 gastric Kriibs Zell Linn ( p53 VerfÜgung wëll Typ), Lamb epigenetic Behandlung apoptosis vun chemotherapeutic Drogen, deelweis duerch p53 VerfÜgung Transkriptiouns Aktivitéit. Wéinst dem, vun dem Kriibs Zell Linn Kato III ( p53 VerfÜgung Mann-), epigenetic Behandlung eleng sécherlech apoptosis entschlof, mat keen Ziel-Aktivatioun vun p53 VerfÜgung. VerfÜgung

Conclusioun VerfÜgung

an gastric Kriibs, p53 VerfÜgung relevant an Net-relevant Weeër existéieren, an erhéijen mat entweder Passerelle Typ Schatzkummer eenzegaarteg Medeziner Fonctiounen. . Waraya M, Yamashita: Epigenetic Traitementer kënnen duerch Mechanismus aner wéi duerch p53 VerfÜgung Weeër VerfÜgung

Fro apoptosis deelweis duerch p53 VerfÜgung Aktivéierung, awer hire apoptotic Effekter erklärt gin kënne gréisstendeels induce K, Iwert a, Katada N, Kikuchi S, Watanabe M (2015) Exclusive Association vun stattfannen p53 VerfÜgung mat Super-High Methylation vun entholl Suppressor Genen am p53 VerfÜgung Passerelle an enger eenzegaarteg Gastric Cancer Phenotype. PLoS NËMMEN 10 (10): e0139902. Doi: 10.1371 /journal.pone.0139902 VerfÜgung

Redakter: Ruilin Tao, D'Chinese Universitéit vun Hong Kong, Hong Kong VerfÜgung

Arnaque: 31. Mäerz 2015; Akzeptéiert: 18. September 2015; Publizéiert: Oktober 8, 2015 VerfÜgung

Copyright: © 2015 Waraya et al. Dëst ass eng oppen Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz CC BY verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt si vum original Auteur an d'Quell Kaiser VerfÜgung

Data Disponibilitéit: All Daten sinn bannent de Pabeier a seng Ennerstëtzung Informatiounen Fichieren VerfÜgung

Funding:. Dës Aarbecht am Kader vun de Grant-an Hëllef fir Cancer Research aus dem Gesondheetsministère, Labor an Wuelergoen vun Japan an déi japanesch Foundation ënnerstëtzt gouf multidisziplinärem Prefabrizéierten Cancer. D'Finanzéiere Agencen hu keng Roll am Design vun der Etude, Daten Kollektioun, oder Analyse; vun der Interpretatioun vun de Resultater; an der Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft; oder an der Decisioun déi mëttelalterlech Handschrëft fir Publikatioun ze validéieren VerfÜgung

Wettsträit Interessen:. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

DNA methylation spillt eng zentral Roll am. Gene silencing vun entholl suppressor Genen am mënschleche Kriibs. A Kriibs-spezifesch methylation Gentherapie ass eng rar Entitéiten, a reegelméissegen aberration vun methylation am primäre entholl Stoffer ass och méi rar [1, 2]. Mir identifizéiert Kriibs-spezifesch methylated Genen an all Organ engem pharmacological unmasking microarray benotzt (PUM) [1, 2] an eng geännert PUM [3-5]. Mir bestëmmt vill Kandidat entholl suppressor Genen (TSGs), wéi PGP9 VerfÜgung. 5 zur VerfÜgung am Kapp an Hals squamous Zell carcinoma (HNSCC) [2], esophageal SCC (ESCC) [6] , gastric Kriibs [4], an anere Cancers [7], NMDAR2B VerfÜgung zu ESCC [3] an gastric Kriibs [8], a CCNA1 VerfÜgung zu HNSCC [2]. D'methylation Profiler vun dësen Genen gewiescht vun anere Gruppen validéiert an /oder esouguer an anere Cancers [9-14]. Genen, datt iwwer 60% methylation zu entholl Stoffer zougedréckt huet wéi héich relevant methylated Genen (HRMGs) [15] bezeechent. Desweideren, weider mir d'Frequenz vun esou aberrant methylation vum Kandidat HRMGs mat aner Rapporte vun gastric Kriibs Verglach [16], an der Gentherapie Kandidate waren ze bestëmmter Genen gemaach huet. VerfÜgung

Wichteg, huet dëse Kandidat entholl suppressor Genen ginn Rapport vun der p53 VerfÜgung entholl suppressor Passerelle (Lalumi 1) ze ginn. Zum Beispill, PGP9 VerfÜgung. 5 zur VerfÜgung direkt openee mat p53 VerfÜgung an stabilizes p53 VerfÜgung duerch seng ofgeschnidden duerch d'ubiquitination Passerelle an hepatocellular [17] inhibiting , Broscht [18], an nasopharyngeal Kriibs [19]. NMDAR2B VerfÜgung induces apoptosis duerch seng direkt dÉxistenz DAPK VerfÜgung [20], déi, am Tour, hien ass oncogene-entschlof Transformatioun vun activating enger p19ARF VerfÜgung /Géigepol p53 VerfÜgung apoptotic Bomm [21] -dependent. CCNA1 VerfÜgung ass e p53 VerfÜgung -induced Gentherapie datt apoptosis, G2 /M verhaft mediates, an mitotic Katastrof am mënschleche keen Auto, spillt, an haett Kriibs Zellen [22]. Dofir, ass den p53 VerfÜgung Passerelle an entholl Stoffer vum primäre Cancers an eng epigenetic Manéier zesumme mat Wëld Typ ablated p53 VerfÜgung, awer et ass kee Rapport iwwer d'Associatioun vun p53
stattfannen an epigenetic hire Restaurant am primäre entholl Stoffer. VerfÜgung

an dëser Etude, ze propagéieren mir d'DNA methylation Status vun Genen am p53 VerfÜgung Passerelle datt abnormal an eng epigenetic Manéier an alleréischter gastric regulariséiert ginn Kriibs, an hir methylation Muster mat de Verglach Zoustand p53 VerfÜgung stattfannen fir de Medeziner Bedeitung vun p53 VerfÜgung aberration phenotypes ze bestëmmen. VerfÜgung

Method VerfÜgung

Zell Linnen an Otemschwieregkeeten Echantillon VerfÜgung

d'Zell gastric Kriibs Linnen, KatoIII, NUGC4, AZ521, an SH10 sech aus der RIKEN BioResource Center (Ibaraki, Japan) kaaft. An der hepatocellular carcinoma Zell Linn HepG2 war aus amerikanesche Type Kultur Collection (Manassas, VA) kaaft. Dës Zell Linnen ausser AZ521 an HepG2 sech zu RPMI 1640 mëttelfristeg (GIBCO, Karlsbad CA) ergänzt mat 10% An et Bovine serum ugebaut. AZ521 an HepG2 sech zu DMEM mëttelfristeg (GIBCO) ugebaut, mat 10% FBS ergänzt. VerfÜgung

Puer (n = 163) vun formalin-fix, paraffin-Ënnerbewosstsinn (FFPE) entholl Otemschwieregkeeten an entspriechend normal mucosal ugedait kritt am manst 5 cm vun der entholl Wäitschoss vum Patiente kritt huet Chirurgie tëscht 1 Januar Jongen, 2000, an den 31. Dezember 2010. All vun de Patienten mat Etapp II /III GC eng potenziell curative resection fir d'alleréischt GC weiderentwéckelt, a mécht adjuvant S -1 Chimiotherapie der Chirurgie (S-1 Standard Behandlung). Neo-adjuvant Therapie gouf net an dësem Patient Kohort gesuergt. Erhéijen sech mat der TNM Klassifikatioun séiert no der 7 September Editioun vun der Unioun fir International Cancer Control (UICC) an der 14. September Editioun vun der japanescher Course vun Gastric Carcinoma (JCGC). D'Patienten Charakteristiken sinn an Table 1. All Otemschwieregkeeten Echantillon duergestallt um Kitasato University Hospital gesammelt goufen, a schrëftlech informéiert Averständnes war vun all Patienten a gesond Donateuren virun Prouf Kollektioun kritt. Déi heiteg Etude vun der Ethik Comité vun Kitasato University ofgeseent gouf. VerfÜgung

Analys vun mutated p53 VerfÜgung Genen benotzt Single-staarkt conformation polymorphism (SSCP) VerfÜgung

kennen exons 5, 6, 7 an 8 vun der p53 VerfÜgung Gentherapie sech vun Net-radioaktiv Single-staarkt conformation polymorphism (SSCP) Analyse, déi eis schonns etabléiert Methode benotzt Leeschtung war opgefouert [23]. Hinnen alleguer Echantillonen vun 10 μl huet dräimol mat gelies-Luede gefiermt verdënntem (95% deionized Dës villt Gedeessems, 20 mmol /L héich, 0,01% bromophenol blo, an 0,01% xylene cyanol) a gehëtzter bis 95 ° C fir 10 min, gefollegt vun Duuscht op Äis. Aliquots vun 3 μl sech ze geännert polyacrylamide gels (: 18% polyacrylamide-bis (49: PAFG 1), 0.5x TBE, 10% glycerol, 10% Dës villt Gedeessems, 0,05% ammonium persulfate, an 30 ml TEMED) applizéiert vun Dimensioune 120 mm x 150 mm x 0,35 mm. Electrophoresis war mat 1.5x TBE Lafen gefiermt um 500 V an 30 ma fir 1 Stonn bei Raumtemperatur gesuergt. Bands sech duerch staining gels mat enger Sëlwer- stain plus Kit (Bio-Rad, Hercules, CA), gefollegt vun zéien fonnt, falsch, Entwécklung, an di vun der Reaktioun. Mutated Bands fonnt mat Hinnen alleguer-SSCP sech um 1:64 dilution vun mutated alleles evident. VerfÜgung

Bisulfite Behandlung vun ofgebaut DNA VerfÜgung

Frankräich DNA aus FFPE Stoffer an Zell Linnen ofgebaut gouf de QIAamp DNA FFPE benotzt Ray Kit (QIAGEN Sciences, Maryland, MD) an der QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN) laut der Ëmwelt- d'Hiersteller. Fir DNA denaturing, 2 μg vu Frankräich DNA war bei 50 ° C fir 20 Minutten mat 5 μg vun Saumon presuméierten DNA vun 0.3 mol /l NaOH incubated. Den DNA Prouf war dann mat 500 μl vun enger Léisung verdënntem 2,5 mol /l Natrium metabisulfite wouvun (Fläch-Aldrich Galaxy St. Louis, MO) /125 mmol /l hydroquinone (Fläch) /0,4 mol /l Natrium hydroxide Léisung, a war fir 1,5 Stonnen op 70 ° C incubated. D'Prouf war dann zu enger Kolonn applizéiert (Wizard DNA Clean-IECH System, Promega Galaxy, Madison, allem), incubated mat 0.3 mol /l NaOH fir 10 Minutten, an dono mat 3 mol /l ammonium acetate fir 5 Minutten behandelt. D'Prouf war zu 100% Ethanol Preisen, an der DNA war zu 50 μl Lote mat 10 μM Tris-HCl, pH 8 an 2,5 μM ethylene diamine tetra acetic Seier (héich), pH 8, a gouf duerno Implikatioune vun enger polymerase Kette resuspended Reaktioun (Hinnen alleguer). Bisulfite Behandlung Resultater zu der chemescher Modifikatioun vun unmethylated, mä net methylated, cytosines zu uracils, wouduerch den Ënnerscheed tëscht methylated an unmethylated Frankräich DNA. VerfÜgung

Chemeschen-methylation-spezifesch Hinnen alleguer (Q-MSP) VerfÜgung

fir grouss methylation Analyse, TaqMan methylation spezifesch Hinnen alleguer (Q-MSP) war den IQ ™ Multiplex Powermix Hëllef duerchgefouert (Bio-Rad) zu triplicate op der iCycler IQ ™ Real-Time Hinnen alleguer Detektioun System (Bio-Rad). Hinnen alleguer Konditiounen a Message sinn am S1 Table gëtt. Serial dilutions vun bisulfite geännert CpGenome universal methylated DNA (Chemicon International, Temecula, CA) waren benotzt d'Eechung rop op all zappen ze bauen als methylation positive Kontrollen a CpGenome universal unmethylated DNA (Chemicon International) als negativ Kontroll benotzt gouf. D'methylation Wäert (TaqMeth Wäert) war den Verhältnis vun methylated definéiert PGP9 VerfÜgung. 5 zur VerfÜgung, NMDAR2B VerfÜgung, CCNA1 VerfÜgung, oder DAPK VerfÜgung normalized zu methylated β-actin VerfÜgung, déi dann vun 100 VerfÜgung

Immunohistochemical staining vun PGP9.5 Raum war, NMDAR2B, an CCNA1 VerfÜgung

fir immunostaining, antigen unmasking mat autoclave fiert, war endogenous peroxidase Aktivitéit vun incubation fir 5 Minutten, an nonspecific antibody bindend ass blockéiert vun incubation mat 1% verdënntem normal Päerd serum zu 3% H 2O 2 /methanol fir 30 gespaart Leeschtung war Minutten. Sektiounen sech dann bei 4 ° C incubated Iwwernuechtung mat de folgenden antibodies: Kanéngchen PGP9.5 polyclonal antibody (dilution vun 1:. 200, Nonus Biogenesis), Kanéngchen NMDAR2B polyclonal antibody (dilution vun 1: 100, Millipore), oder Maus Cyclin A monoclonal antibody (6E6, dilution vun 1:50, Leica Biosystems Newcastle. Ltd). Immun investéiert goufen mat der Vectastain Elite ABC Kit (Vecteure Laboratoiren, INC, Burlingame, CA) fonnt laut den Hiersteller d'Uweisungen. Dës immun investéiert goufen benotzt fonnt der 3,3'-diaminobenzidine Realitéiten (Vecteure) als chromogen (PGP9.5 1,5 Minutten, NMDAR2B 6. Minutt, CCNA1 10 Minutten). Sektiounen sech mat hematoxylin counterstained. VerfÜgung

Epigenetic Behandlung mat 5-December-DC an TSA, an chemotherapeutic Behandlung mat CDDP VerfÜgung

BTS waren gedeelt an rakommen op eng niddreg Dicht (1x10 6 /T-75 flask) 24 Stonnen ier Behandlung. Zellen sech dann mat all 24 Stonnen fir 4 Deeg behandelt entweder 1 oder 5 μM 5-AZA-2'-deoxycytidine (5-December-DC; Fläch-Aldrich, St Louis, MO) zu 50% acetic Seier opgeléist oder sech mierkt behandelt mat PBS de selwechte Montant vun acetic Seier inklusiv. Wéi uginn, 100 nm vun trichostatinA (TSA; Fläch-Aldrich). An /oder 12,5 μM vun Well-diaminedichloroplatinum (CDDP) (Nichi-IKO Gitt mir eng Waassermeloun Co., Ltd., Japan) hat fir d'Finale 24 Stonnen notéiert VerfÜgung

Western blotting Analyse VerfÜgung

Total FAQ war vun Zell Linnen ofgebaut datt epigenetically mat /ouni chemotherapeutic Behandlung behandelt goufen, a gouf zu Western blotting Analyse ënnerworf mat de folgenden antibodies: Maus anti-p53 monoclonal antibody (1C12, dilution vun 1: 1000, Zell sécher Technology Galaxy) oder Maus anti-β-actin IgG 2a monoclonal antibody (dilution vun 1: 10000, Fläch-Aldrich) VerfÜgung

p53 reporter assay

BTS (2x 10 4 Zellen /96 gutt zappen), datt mat /ouni chemotherapeutic Behandlung mat enger goufen epigenetically behandelt goufen transfected p53 VerfÜgung reporter Vecteure (QIAGEN) benotzt Signal ™ Passerelle reporter: Super ( QIAGEN) an der Lipofectamine 2000 reagent (Invitrogen). No 24 Stonnen vun incubation, huet de Rapporteur Aktivitéit gemooss der Dual-luciferase Reporter Assay System (Promega) benotzt. Transfections sech zu triplicate an analyséiert benotzt SoftMax Pro Software (cuisine Comments, Sunnyvale, CA). VerfÜgung

Apoptosis assay VerfÜgung

Traité Zellen (1x 10 5 Zellen /Prouf) waren Kierchefënster mat standing Annexin V a 7-vunda (Guava Nexin reagent, Guava Technologies, Hayward, CA) fir Diskriminatioun vun fréi a spéit apoptotic Zellen, bzw.. D'Experiment war d'Guava PCA System duerchgefouert benotzt, an triplicate standing an analyséiert CytoSoft 2.1.5 Software (Guava Technologies) benotzt. VerfÜgung

statistique Analyse VerfÜgung

Fisher d'exakt Test oder de Mann-Whitney U Test war fir Diskussioun Verännerlechen benotzt, an Student d' t VerfÜgung Azeton war fir kontinuéierlech Verännerlechen benotzt. Donnéeën ausgedréckt sinn als Mëttel ± normale deviation (Fils). D'Kaplan-Meier Method gouf benotzt entwéckele Iwwerliewe Tariffer ze schätzen, an Oneenegkeet Iwwerliewe Tariffer sech mat der Läschlëscht-Platz Test évaluéieren. Réckwee gratis Iwwerliewe (RFS) a Punkto Iwwerliewe (OS) sech vum Datum vun Operatioun zu der Datum vum Terrain an Doud, oder d'lescht Suivi gemooss. Mat wat fir RFS oder OS, Patienten déi méi ewéi 60 Méint erëmfonnt (5-Joer) huet den Iwwerliewenden analyséiert. P &Si besteet; 0,05 war als statistesch Bedeitung unzeginn. All Statistik analyséiert goufen mat SAS Software Formulen (SAS Institut, Cary, NC) gehaal. VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

p53 VerfÜgung Gentherapie Status an methylation Profiler vun PGP9
. 5 zur VerfÜgung, NMDAR2B VerfÜgung, CCNA1 VerfÜgung, an DAPK VerfÜgung zu pStage II-III gastric Kriibs VerfÜgung

p53 VerfÜgung kennen sech an 44 vun 163 Primärschoul gastric Kriibs Patienten (27%) vun SSPC Analyse identifizéiert. p53 VerfÜgung Gentherapie stattfannen gemaach hunn net prognostic Relevanz (Lalumi 2A). Mir analyséieren dann d'methylation Profiler vun PGP9 VerfÜgung. 5 zur VerfÜgung, NMDAR2B VerfÜgung, CCNA1 VerfÜgung, an DAPK VerfÜgung an dëse Stoffer Hëllef Q-MSP. D'TaqMeth Wäert vun all Genen war héich an alleréischter erhéijen vun gastric Kriibs mat Wëld Typ p53 VerfÜgung wéi an deene mat Mann- p53 VerfÜgung (Gentherapie methylation Bestellung:. PGP9 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung > NMDAR2B VerfÜgung > CCNA1 VerfÜgung > DAPK VerfÜgung) (Lalumi 3A an S1 an S2 Dozou). Methylation vun de Promoteur war DNA méi héich fir CCNA1 VerfÜgung (p &Si besteet; 0.0001) an PGP9 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung (p = 0,03), a liicht méi héich fir NMDAR2B VerfÜgung (p = 0.10) an DAPK VerfÜgung (p = 0,05) am primäre Verglach gastric Kriibs ze desinfizéieren normal mucosa. Wichtegst, e super-héich methylation Niveau vun PGP9 VerfÜgung. 5 zur VerfÜgung, NMDAR2B VerfÜgung, an CCNA1 VerfÜgung exklusiv war an alleréischter erhéijen mat kee fonnt p53 VerfÜgung stattfannen, de präventive TaqMeth Wäerter waren 50, 163, an 133, respektiv (Lalumi 3A). Esou super-héich methylation vun PGP9 VerfÜgung. 5 zur VerfÜgung, NMDAR2B VerfÜgung a CCNA1 VerfÜgung zu 14 fonnt gouf, 19, an 8 Echantillon respektiv, a e puer vun dëse Echantillon waren phpNuke (Lalumi 3B). DAPK VerfÜgung huet dës Entwécklung net affichéieren, well den DAPK VerfÜgung methylation Niveau vun de jeeweilegen normal mucosa Stoffer vun enger Pri- Deel vun de Fäll (S2 Lalumi) zimlech héich war. VerfÜgung

Immunohistochemical Analyse vun PGP9.5, NMDAR2N, an CCNA1 FAQ Ausdrock am primäre gastric Kriibs VerfÜgung

Immunohistochemical staining fir PGP9.5, Ausdrock NAMDR2B an CCNA1 FAQ war dann souwuel mat super-héich methylation zu Fäll duerchgefouert ginn an déi mat niddregen methylation vun dësen Genen. Eng staark Reduktioun vun den Ausdrock vun PGP9.5, NMDAR2B, an CCNA1 war an alleréischter gastric Kriibs Stoffer observéiert wou de Promoteur DNA methylation super-Héich (Lalumi 3) war. Wollt den Trainer awer keng Ofsenkung an d'FAQ Ausdrock vun PGP9.5, NMDAR2B, oder CCNA1 fonnt gouf, wou den Promoteur DNA methylation war niddereg (Lalumi 4). VerfÜgung

Clinicopathological Analyse an alleréischter gastric Kriibs mat agebousst Etapp II /III gastric Kriibs mat Norm Behandlung VerfÜgung

Clinicopathological Fonctiounen an hätt (5-Joer RFS an OS) sech dann zu engem univariable Fassong gastric Kriibs mat agebousst Etapp analyséiert II /III gastric Kriibs mat Norm Behandlung (Chirurgie plus Thes S-1 Administratioun) (Table 1). Mir klassifizéiert den gastric Kriibs Patienten an 3 Kategorien baséiert op den p53 VerfÜgung stattfannen Status wéi och d'DNA methylation Status vun PGP9 VerfÜgung. 5 zur VerfÜgung, NMDAR2B
a CCNA1 VerfÜgung, déi mir als Frankräich an epigenetic Kategorien designéierte, bzw. (GEC). Dës dräi Kategorien goufen p53 VerfÜgung Mann-, p53 VerfÜgung wëll Typ mat Super-héich methylation (SHM) vun de genannte 3 p53 VerfÜgung Passerelle Genen ( p53
virstellen /SHM), an p53 VerfÜgung wëll Typ ouni (w /o) SHM ( p53 VerfÜgung virstellen w /o SHM). VerfÜgung

Spannen, kleng Patient Gruppen baséiert op GECs sech mat Geschlecht (p = 0.0003) bedeitend soll, Alter (p = 0.08), Lauren d'Histologie (p = 0.005) an einfach Muster (p = 0.001), mee net mat prognostic Facteure wéi haut Facteuren. Patient Gruppen séiert baséiert op GECs zougedréckt och déi p53 VerfÜgung Mann- a p53 VerfÜgung virstellen /SHM Gruppen zu Conditioune vun de Patient Zuel fir all Medeziner charakteristesche ähnlechen sech awer an deem Sënn ënnerscheet wéini de Verglach p53 VerfÜgung virstellen w /o SHM Grupp. Sou, mir nei fréiere Gruppen (den p53 VerfÜgung Mann- plus den p53 VerfÜgung virstellen /SHM Gruppen) den p53 VerfÜgung aberration Grupp, an der Pai Grupp bezeechent ( p53 VerfÜgung virstellen w /o SHM) war den p53 VerfÜgung net-aberration Grupp bezeechent. VerfÜgung

Obwuel hätt ënnert de Gruppen net vill anescht war no GEC (Lalumi 2B kategoriséiert ), sech méi recurrences am p53 VerfÜgung aberration Grupp un der p53 VerfÜgung net-aberration Grupp (Table 1, kee statistesch groussen Ënnerscheed) als Verglach fonnt. Dësen Trend war an Conditioune vun den Terrain Muster vun jidderengen vun den lymph Wirbelen, peritoneum, an fernen Organer (Table 2) festhält, suggeréiert, dass d' p53 VerfÜgung aberration Grupp wahrscheinlech ass eng klinesch eenzegaarteg phenotype ze weise souguer vun engem prognostic Siicht. Wann nëmmen Fäll mat recurrences analyséiert goufen, der p53 VerfÜgung aberration Grupp Kéier war vill mat Lauren verbonne d'Histologie (Table 2, P = 0.01), allerdéngs huet do keen Terrain zeréckzeféieren, datt zu eenzegaarteg sech p53
aberration. VerfÜgung

Wéinst dem zougedréckt a dem diffusen Typ vun gastric Kriibs bedeitend besser hätt wéi d'intestinal Typ vun gastric Kriibs am p53 VerfÜgung aberration Grupp (Lalumi 5A). Well esou Patienten zu engem méi fortgeschratt Etapp verdeelt gin Lien, proposéiert dëse Iwwerliewe Donnéeën dass S1 Thes adjuvant Chimiotherapie fir diffusen Typ gastric Kriibs méi effikass ass wéi fir intestinal Typ gastric Kriibs zu Fäll mat p53 VerfÜgung Passerelle aberration (Lalumi 5B). VerfÜgung

Endlech, als Referenz Donnéeën (Table 1), univariable prognostic Analyse fir RFS an OS vun all klinesch groussen Potential prognostic Faktoren representéiert aarmséileg Iwwerliewe wéi Geschlecht identifizéiert Patienten (P = 0,03, P = 0,1) , Alter ≥67 Joer (P = 0,009, P = 0.001), uewen entholl Standuert (P = 0,06, P = 0,1), den 14. September JGCA /7 September UICC pT (P = 0,08, P = 0,4), den 14. September JGCA pN (P = 0,001, P = 0.06), an der 14 September JGCA /7 September UICC Etapp (P &Si besteet;. 0,0001, P = 0,03) VerfÜgung

Epigenetic Behandlung entschlof p53 FAQ Ausdrock, concordant mat p53 transcriptional Aktivitéit VerfÜgung

Epigenetic Behandlung vun NUGC4 gastric Kriibs Zell Linnen (Wëllschwäin Typ p53 VerfÜgung) mat 5 μM 5-AZA-2'- deoxycytidine oder 5 μM 5-AZA-2'-deoxycytidine plus a robustly entschlof apoptosis an de Flichte vun de chemotherapeutic Agent CDDP trichostatin. Weider Behandlung mat CDDP weider Lamb vill dës apoptotic Effekter (Lalumi 6C). Spannen, CDDP a Kombinatioun mat epigenetic Behandlungen fräi robustly der p53 FAQ Niveau, wat deelweis, mee net ganz, spigelt p53 VerfÜgung transcriptional Aktivitéit vun engem luciferase reporter Gentherapie (Lalumi 6A an 6B). Dës Conclusiounen ugeholl datt p53 VerfÜgung Transkriptiouns Aktivitéit ka vun epigenetic Behandlungen reaktivéiert ginn, awer et seet och, datt apoptosis ass nëmmen deelweis entschlof duerch den p53 VerfÜgung Passerelle. VerfÜgung

Ausserdem, epigenetic gastric Kriibs Zell Linnen Behandlung vun KATOIII ( p53 VerfÜgung automatesch), mat 1 μM 5-AZA-2'-deoxycytidine oder 1 μM 5-AZA-2'-deoxycytidine plus trichostatin a robustly entschlof apoptosis an de Flichte vun CDDP, mä zousätzlech CDDP Behandlung net weider bedeitend der apoptotic Effekter (Lalumi 6C) augment. CDDP a Kombinatioun mat epigenetic Behandlungen hutt de p53 FAQ Niveau net Erhéijung, déi duerch de Mangel vun p53 VerfÜgung transcriptional Aktivitéit vun engem luciferase reporter Gentherapie (Lalumi 6A an 6B) reflektéiert gouf. Dës Conclusiounen ugeholl datt p53 VerfÜgung Transkriptiouns Aktivitéit net fir apoptosis vun epigenetic Behandlungen an KATOIII Zellen néideg ass ( p53 VerfÜgung automatesch Zellen). VerfÜgung

Diskussioun VerfÜgung

Dëst aktuell Etude ass den éischte Rapport datt SHM vun entholl suppressor Genen am p53 VerfÜgung Passerelle sinn exklusiv zu agebousst Etapp II /III gastric Kriibs mat Wëld Typ p53 VerfÜgung (Lalumi 3) fonnt. Mir ausgewielt pStage II /III gastric Kriibs Patienten mat Norm Fleeg fir p53 VerfÜgung Passerelle Analyse, well multidisziplinärem Behandlungen an esou Patienten fir Austeritéitsmoossnamen prognostic Verbesserung mat komplett curability de beschte Potential hunn [24, 25]. Dëst allem soll d'éischt Prioritéit gin wann Weiderentwécklung vun Roman therapeutesch Strategien que. VerfÜgung

bal komplett methylation vum Promoteur DNA CpG Inselen ass fir komplett Gentherapie silencing néideg, an och kleng Undeeler vun unmethylated alleles kann robustly Gentherapie Ausdrock induce [ ,,,0],1-5]. An der Primärschoul entholl Stoffer, SHM muss bal komplett methylation zu Kriibs Zellen, an SHM an der Primärschoul entholl Stoffer vertrieden war jo mat reduzéierter FAQ Ausdrock vun esou Genen (Lalumi 4) assoziéiert. Dëst Resultat ugeholl datt SHM vun Genen am p53 VerfÜgung Passerelle System gleichgestallt ginn hätt bis p53 VerfÜgung funktionell aberration déi vun als Resultat existeiert p53 VerfÜgung stattfannen, well dës 3 Molekülle Funktioun an der selwechter p53 VerfÜgung Passerelle. VerfÜgung

an gastric Kriibs, déi p53 VerfÜgung aberration Grupp vill mat eenzegaarteg clinicopathological phenotypes wéi Lauren d'intestinal Histologie, männlecht Geschlecht verbonne war, al Alter, an manner infiltrative Wuesstem (Table 1). Eis aktuell Observatioune kënnen ze virdrun Rapporten am Kader ginn, datt hien dat p53 VerfÜgung stattfannen mat fréi Etapp vun intestinal Typ gastric Kriibs soll ass, oder mat spéiden Etapp vun diffusen Typ gastric Kriibs [26, 27], oder eeler Alter [ ,,,0],28], allerdéngs eis clinicopathological Analyse abegraff haaptsächlech Mëtt gastric Kriibs Etapp. Spannen, Passerelle aberration ass eenzegaarteg an nohalteg souguer an onbekannt Patienten (Table 2). VerfÜgung

Positiv prognostic Relevanz vun p53 VerfÜgung stattfannen an gastric Kriibs ass kontrovers mat béiden Sympathisanten [29] an dissenters [30 ] vun dëser Méiglechkeet. Op den éischte Bléck eis Daten géifen erschéngen d'lescht Grupp ze ënnerstëtzen, awer, soll et Rechnung gedroe ginn, datt eis Iwwerliewe Donnéeën Wahrscheinlechkeet ass zu per Post-grënnen adjuvant Chimiotherapie (Standard Therapie an Japan) geännert goufen. Well, am Géigesaz zu dem Moment Etude, déi diffusen Typ vun gastric Kriibs zougedréckt aarmen hätt wéi d'intestinal Typ vun gastric Kriibs an eiser Spidol Joerzéngten ago [15, 31], d'läscht aktualiséiert Iwwerliewe Daten de Géigendeel Resultater Ënnerstëtzung (dh, der intestinal Typ vun gastric Kriibs weist aarmen hätt wéi den diffusen Typ vun gastric Kriibs), déi wéinst S-1 Thes adjuvant Effekter putatively ass [32]. Post-grënnen adjuvant S-1 Chimiotherapie gouf proposéiert vill méi efficace fir peritoneal Krankheet ze ginn wéi fir fernen Uergel Metastasen [24], an et ass wahrscheinlech méi effikass fir diffusen Typ gastric Kriibs ze ginn wéi fir intestinal Typ gastric Kriibs [32] . Fir dëse Grënn, weist d'läscht Iwwerliewe Analyse, datt déi hätt vun der diffusen Typ vun gastric Kriibs iwwer déi vun der intestinal Typ vun gastric Kriibs verbessert ass. VerfÜgung

Et gouf kee statistesch Ënnerscheed zu den Terrain Taux oder an der eenzegaarteger Terrain Siten tëscht der p53 VerfÜgung aberration Grupp an de p53 VerfÜgung Net-aberration Grupp, huet sech awer méi recurrences zu jidderengen vun den Terrain Siten vun den p53 VerfÜgung Net-aberration fonnt Grupp fir d' p53 VerfÜgung aberration Grupp Verglach. Dës Conclusiounen kéint hindeit, datt d' p53 VerfÜgung Net-aberration Grupp huet eng méi aggressiv phenotype wéi déi p53 VerfÜgung aberration Grupp als Ganzt. An eiser Etude, zougedréckt a dem diffusen Typ vun gastric Kriibs bedeitend besser hätt wéi d'intestinal Typ vun gastric Kriibs am p53 VerfÜgung aberration Grupp. Well esou Patienten zu engem méi fortgeschratt Etapp verdeelt gin Lien, proposéiert dëse Iwwerliewe Donnéeën dass S1 Thes adjuvant Chimiotherapie fir diffusen Typ gastric Kriibs méi effikass ass wéi fir intestinal Typ gastric Kriibs zu Fäll mat p53 VerfÜgung Passerelle aberration. Dës Conclusiounen sech konsequent mat virdrun Rapporten datt Mann- p53 VerfÜgung an /oder immunostaining vun p53 FAQ predictive biomarkers fir positiv Effekter vun héich-Portioun neoadjuvant Chimiotherapie zu gastric Kriibs kéint [30]. VerfÜgung

Mir endlech epigenetic Behandlung Effekter a Kombinatioun mat engem chemotherapeutic Agent fir évaluéieren d'Wichtegkeet vun der p53 VerfÜgung Passerelle fir d'epigenetic Passerelle an gastric Kriibs Zellen mat CDDP behandelt ze vergläichen. Onerwart, wossten et datt d' p53 VerfÜgung Passerelle onwahrscheinlech war e ganz kriteschen Roll an apoptosis Aféierungs- vun CDDP (Lalumi 6) ze spillen. Et gouf viru kuerzem bewisen, dass epigenetic carcinogenesis jo méiglech ass. An dësem System entschlof systemesch virzehuelen déi Facteuren Resultater am systemesch Kriibs Optriede mat dynamesch epigenetic Ännerungen reprogramming, iwwerdeems systemesch puer vun dësen reprogramming Faktoren Kriibs Zellen nees normal Zellen reverts [33]. Gastric Kriibs ass wahrscheinlech manner Projet'en vun Automobilist Genen [34] wéi colorectal Kriibs [35], an, ähnlech, kennen aner wéi déi p53 VerfÜgung Gene sinn seelen zu Broscht Kriibs [35], suggeréiert datt epigenetic carcinogenesis Hafen chronescher Krankheet vun Helicobacter pylori [36-38] duerch eng méiglech grouss etiology. Mir hunn jo bewisen kuerzem d'zwéinHyperfeinstrukturniveaue-methylation vun Reprimo VerfÜgung [39], wat erëm eng Gentherapie am p53 VerfÜgung Passerelle mä déi net an dëser Etude mat abegraff ginn, a vun HOPX VerfÜgung [16] an CDO1 VerfÜgung [40] dat souwuel zu apoptosis Équipe sinn, mä putatively net duerch den p53 VerfÜgung Passerelle. Baséierend op eis aktuell funktionell Experimenter, déi p53 VerfÜgung Passerelle Beitrag ass epigenetic Behandlung Effekter wahrscheinlech vill manner gin wéi déi vun anere Weeër (Lalumi 5). Mir benotzt aner Zell Linnen (2 gastric Kriibs Zell Linnen an 1 hepatocellular Kriibs Zell Linn) ze wourop de Bäitrag vun der p53 VerfÜgung Passerelle fir apoptosis vun CDDP a Kombinatioun mat epigenetic Behandlungen entschlof bestëmmen. Déi zousätzlech Experimenter gemaach ginn an S3 Lalumi gewisen. AZ521 an HepG2 Zell Leitungen p53 VerfÜgung wëll Typ, an der SH10 Zell Linn ass p53 VerfÜgung Mann-. p53 VerfÜgung Aktivitéit war an der p53 VerfÜgung wëll Zort Zelle fonnt, allerdéngs war säi Aktivitéit op vunenee Linn ofhängeg. Sou, p53 VerfÜgung Aktivitéit war an NUGC4 Zellen mat CDDP Behandlung an am AZ521 an HepG2 Zellen ouni CDDP Behandlung fonnt. Staark apoptosis wéi duerch en apoptosis assay (Caspase 3 oder Nexin Assay) évaluéieren hutt spigelen net onbedéngt d'Ausmooss vun p53 VerfÜgung transcriptional Aktivéierung. An p53 VerfÜgung Mann- (SH10) oder p53 VerfÜgung automatesch Zellen, p53 VerfÜgung transcriptional Aktivitéit guer net entschlof war, war awer apoptosis fonnt an p53 VerfÜgung wëll Typ Zellen. Dofir, an gastric Kriibs, apoptotic Weeër anere wéi de p53 VerfÜgung Passerelle fir Aféierungs- vun apoptosis méi relevant kann wéi d' p53 VerfÜgung Passerelle. VerfÜgung

An Conclusioun, p53 VerfÜgung aberration an net-aberration Patient Gruppen existéieren an gastric Kriibs, déi p53 VerfÜgung Weeër als Resultat vun epigenetic Modifikatioun vun Genen an d'Weeër wéi och wéinst Frankräich stattfannen aberrant ginn hätt. D' p53 VerfÜgung aberration Grupp weise kann eenzegaarteg Medeziner Fonctiounen als Verglach mam p53 VerfÜgung Net-aberration Grupp. Epigenetic Kontroll vun den p53 VerfÜgung Passerelle Genen spillen eng kleng Roll an apoptosis Aféierungs- vun engem chemotherapeutic Agent, an apoptosis zu gastric Kriibs datt duerch epigenetic puer entschlof ass erkläert gréisstendeels aner vun Mechanismus kann wéi d' p53
Passerelle. Soumat ass de p53 VerfÜgung Passerelle onwahrscheinlech enger Jarnéier Roll an apoptosis vun CDDP a Kombinatioun mat epigenetic Behandlungen entschlof ze spillen. Allerdéngs huet den p53 VerfÜgung Passerelle gemellt gi wichteg Roll an natierlech gastric carcinogenesis [41-44] ze spillen. Sou, eis Entdeckung dass p53 VerfÜgung Passerelle Gentherapie methylation exklusiv zu gastric Kriibs mat engem fonnt gouf p53 VerfÜgung wëll Typ Statut kann eng wichteg Observatiounsplaz ginn, an esou hire Restaurant op der entholl Stoffer kënne entholl Werdegang Doudesursaach . Et fir dëse Grënn ass datt p53 VerfÜgung Passerelle aberration predictive Wäert vun chemotherapeutic Auswierkunge vun gastric Kriibs hun kann. VerfÜgung

Informatiounen Ennerstëtzung VerfÜgung S1 Figebam. Spezifizitéit vun der methylation vun PGP9 VerfÜgung. 5 zur VerfÜgung, NMDAR2B VerfÜgung, an CCNA1 VerfÜgung zu gastric Kriibs. VerfÜgung (A) D'TaqMeth Wäerter vun all Gentherapie an sinn gastric Kriibs an am entspriechende normal mucosa gewisen. (B) Déi TaqMeth Wäerter vun all Gentherapie séiert no der p53 VerfÜgung Gentherapie Status vun der entholl ginn gewisen. Donnéeën ausgedréckt sinn als Mëttel ± Fils VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0139902.s001 VerfÜgung (TIF) VerfÜgung S2 Figebam.

Other Languages