Gene Ausdrock ass bei der Reunioun an Iwwersetzung Niveau gereegelt; also, souwuel Transkriptiouns Faktoren (TFs) an microRNAs (miRNA) Leeschtung Rollen an Regulatioun vun der Gentherapie Ausdrock. Dës Etude profiléiert differentially ausgedréckt mRNAs an miRNAs zu Stoffer gastric Kriibs engem TF an miRNA Co-reglementaresche Reseau an Uerdnung ze bauen verännert Genen vun gastric Kriibs Werdegang ze identifizéieren. A Ganzen 70 Fäll gastric Kriibs a vläit bascht normal Stoffer sech ze cDNA ënnerworf an miRNA microarray analyséiert. Mir kritt 887 erop-reglementéiert an 93 verwandelt-reegelen Genen an 41 verwandelt-reglementéiert an 4 weider-reegelen miRNAs zu gastric Kriibs Stoffer. D 'Transcriptional Regulatioune Element Datebank, mir kritt 105 Genen déi vun der E2F Famill vun Genen regulariséiert ginn a mat Targetscan, Miranda, miRDB an miRWalk Handwierksgeschir, virausgesot mir Potential gezielt Genen vun dësen 45 miRNAs. Mir dann déi E2F-Zesummenhang TF an miRNA Co-reglementaresche Gentherapie Reseau gebaut an 9 Punkt-Genen identifizéiert. Doriwwer eraus, hunn mir dass Niveau vun E2F1, 2, 3, 4, 5, an 7 mat Zell gastric Kriibs Invasioun Muecht verbonne mRNAs, a mat entholl dat verbonnen huet. Dës Donnéeë weisen Overexpression vun E2F mRNAs mat Werdegang gastric Kriibs verbonne VerfÜgung
Fro:. Zhang X, Ni Z, Duan Z, Xin Z, Wang H, Tan J, et al. (2015) Overexpression vun E2F mRNAs Associéierten mat Gastric Cancer zerstéiert identifizéiert vun der Transkriptioun Factor an miRNA Co-Regulatioune Network Analys. PLoS NËMMEN 10 (2): e0116979. Doi: 10.1371 /journal.pone.0116979 VerfÜgung
Arnaque: 30. September 2014; Akzeptéiert: 17. Dezember 2014; Publizéiert: Februar 3, 2015 VerfÜgung
Copyright: © 2015 Zhang et al. Dëst ass eng oppen Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz CC BY verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt si vum original Auteur an d'Quell Kaiser VerfÜgung
Data Disponibilitéit: All Daten sinn bannent de Pabeier a seng Ennerstëtzung Informatiounen Fichieren. Date goufen zu der Geo Datebank verschéckt, ënnert dem Bäitrëtt Zuel GSE63089 VerfÜgung
Funding:. Dëst Wierk war am Kader vun Stipendien aus National Natural Science Foundation of China (̭20108025 an̮72662), Foundation vun JILIN Province ënnerstëtzt Wëssenschaft an Technologie Pompjeeën (É30522013JH anÉ40414048GH) an den Norman Bethune plangen vun JILIN University (É2219). D'Auteuren Merci och der Medjaden Bioscience Limited (Hong Kong, China) fir Redaktioun an proofreading dëst eng mëttelalterlech Handschrëft. D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung
Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung
Gastric Kriibs ass nach ëmmer ee vun den Tip gesondheetlech Problemer an den Entwécklungslänner, wéi an China, obwuel hir Heefegkeet lues ass an de westlechen Länner ofgeholl. Am Allgemengen, ass gastric Kriibs Konte fir d'véiert vun Heefegkeet an der zweeter vu veruerteelt Taux ënnert all Cancers an der Welt [1-3]. Gastric Kriibs Risiko Facteure gehéiert Helicobacter pylori Krankheet heefeg Konsum vun gefëmmt Liewensmëttel, salzeg Fësch a Fleesch, an agemaachtent Geméis, Zigarettendamp, Obesitéit, oder chronesch gastritis. Dës Risiko Faktoren kéint koordinéieren fir Gentherapie Ausdrock oder stattfannen oder epigenetic hire Restaurant manipuléieren an Resultat ass schlussendlech an gastric Kriibs Entwécklung. Fir Datum, e grousse Kierper vu Wëssen huet iwwert de molekulare hire Restaurant ganzt mat gastric Kriibs assoziéiert, wéi ARID1A, TP53 [4], PTGER4, PRKAA1, ZBTB20 [5] an PLCE1 [6]. Allerdéngs bleift d'Basisdaten Mechanismus fir verschiddene Genen-mediated gastric carcinogenesis definéiert gin. Sou, ass et wichteg ze weider molekulare pathogenesis vun gastric Kriibs ermëttelen mat der systematesch Biologie Approche, wéi de Bau vun differentially ausgedréckt Genen-reglementaresche Reseau der wichteg Gentherapie Passerelle oder sécher während gastric Kriibs Entwécklung oder Werdegang ze identifizéieren. VerfÜgung
Gene Ausdrock ass bei der Reunioun an Iwwersetzung Niveauen reegelen. Um Transkriptiouns Niveau, Gentherapie Transkriptiouns Faktoren (TFs) eng wichteg Roll an Regulatioun vun de Mënscherechter Gentherapie Ausdrock spillen, während miRNA kéint um Post-Transkriptiouns Niveau mRNA Iwwersetzung an hallef-Liewen regléieren. Speziell, TFs sinn Proteinen déi zu bestëmmten DNA Message kruet an domat Gentherapie Transkriptiouns Kontroll. MiRNA ass eng Klass vun natierleche kleng noncoding RNAs mat 18 zu 22 nucleotides zu Längt Preretraite an System, kann miRNA Post-transcriptionally Hammers FAQ Ausdrock duerch ze ergänzen Zil- Gentherapie gët bindend, domat dëse Messenger RNAs onwiirdeg oder hinnen inhibiting aus Iwwersetzen u Proteinen. Sou, souwuel TFs an miRNAs kann Genen op verschidden Etappe vun der Gentherapie Ausdrock regléieren an kann bis rigoréis Kontroll Gentherapie Ausdrock e Feedback Glück an eng komplizéiert reglementaresche Reseau Form. An dat wat, Etude vun dëser Gentherapie reglementaresche Reseau kéint hëllefen eis Zell homeostasis a Fro gestallt Prozess, biologeschen Funktioun, an Mechanismus vu Krankheeten ze verstoen. Fir Datum, hunn eng Rei vu Studien Gentherapie Regulatioun vun TFs an miRNA zu gastric Kriibs, wéi nuklear Faktor Kappa B dës [7], FoxM1 [8], hypoxia-inducible Faktor 1 [9], a Mir-7 [10] , Mir-375 [11], Mir-125b, Mir-199a, Mir-100 [12]. Iwwerhaapt, dréit aberrant miRNA oder TF Ausdrock ze Mënsch carcinogenesis [13]. Dofir, an dat studéieren, ze propagéieren mir d'Roll vun der kombinéiert miRNA an Transkriptiouns Facteuren zu Regulatioun vun der Gentherapie Ausdrock vun gastric Kriibs fir Associatioun mat gastric Kriibs Werdegang. Mir fonnt éischt Ënnerscheed Ausdrock vun Genen an miRNAs zu gastric Echantillon Kriibs Otemschwieregkeeten an analyséiert se bioinformatically der TF-miRNA reglementaresche Reseau ze Form ze beschäftegen Ausdrock vun E2F Famill mRNAs zu gastric Kriibs. Mir trieden dann E2F Ausdrock fir Associatioun mat gastric Kriibs Werdegang. VerfÜgung
kennen an Otemschwieregkeeten uplanzen VerfÜgung
Dës Etude vun der Ethik Comité vun School vun Grondakommes Medical ofgeseent gouf Sciences, JILIN Universitéit an all Patient huet an engem schrëftleche Awëllegung Form dem. Duerno, iwwregens hu mir 70 gastric Kriibs Patienten aus JILIN University (Changchun, China) tëscht Abrëll 2012 an 2014. Oktober All Patienten keng Précoce-Chirurgie Behandlung kritt hutt, wéi chemo- oder radiotherapy. Béid entholl an fernen normal Stoffer sech aus der Operatioun Zëmmer an gespäichert zu flëssegem Stéckstoff bannent 10 min kritt. VerfÜgung
RNS Isolatioun a miRNA Virbereedung VerfÜgung
Total bewosst RNS war vun Otemschwieregkeeten uplanzen mat der Trizol reagent isoléiert (Invitrogen, Karlsbad CA, USA) an dann sidd esou weider eng RNeasy Mini Kit benotzt (QIAGEN, Düsseldorf, Däitschland). RNS Konzentratioun war dunn alles d'Epoch Multi-Volumen Spectrophotometer System benotzt (BioTek, Vermont, USA). Duerno, war miRNA aus dëse RNS Echantillon mat der mirVana miRNA Isolatioun Kit (Ambion, Austin, Suerge, USA) isoléiert. VerfÜgung
Exon microarray Analyse VerfÜgung
An dëser Etude, mir éischt Gentherapie Ausdrock profiléiert tëschent 45 gastric Kriibs a vläit bascht normal Otemschwieregkeeten Echantillon mat der Affymatrix Gene Chip Exon flamenden Ofgrond 1.0 ST (Affymatrix, CA, USA). Speziell, war 1μg RNS Prouf reversely an cDNA ausserdeem an dës cDNA Echantillon waren dann an cDNA Fragmenter mat endonucleases verdaut a mat der DNA Etikette reagent benotzt DNA Etikette Kit (Affymatrix, CA, USA) gekennzeechent. D'Bezeechnung cDNA Skeletter sech den Ämter benotzt fir de fir 17 h Affymatrix Gene Chip Exon flamenden Ofgrond 1.0 ST an engem Zoustand vun 45 ° C incubation a Rotatioun um 60 Ziichter ze hybridize. Duerno, huet de flamenden Ofgrond gewäsch an gescannt benotzt Gene Chip Scanner 3000 mat Gene Chip Zesummen Software (GCOS). VerfÜgung
MiRNA microarray Analyse VerfÜgung
Mir profiléiert och de differentially ausgedréckt miRNAs zu 15 gastric Kriibs an vläit uplanzen bascht normal Otemschwieregkeeten Affymatrix Gene Chip microRNA vill benotzt. Ähnlech zu der cDNA microarray Experimenter, déi miRNA Ämter benotzt RNS Etikette Kit (Affymatrix, CA, USA) sech bei 45 ° C ze Affymatrix Gene Chip microRNA vill hybridized an rotated fir 17 h um 60 Ziichter. Duerno, huet de flamenden Ofgrond benotzt GCOS gescannt. VerfÜgung
Microarray analyteschen VerfÜgung
D'Matière microarray Date goufen Limma sind analyséiert mat de differentially ausgedréckt Genen an miRNAs ze identifizéieren an dann analyséiert d'linear Modeller benotzt an empiresche Bayes Methoden. A t VerfÜgung Azeton an Bonferroni Korrektur war fir Fliessband statistesch Bedeitung vun all Ënnerscheed Ausdrock gebraucht. Genen an miRNA mein wann p differentially ausgedréckt gin als VerfÜgung -values &Si besteet; 0,05 an der Gentherapie Ausdrock awer op d'mannst 1,5-fantastesch Ännerungen tëschent Kriibs an hir normal Stoffer. QUBIC (qualitative B-Käre) Programm huet geheescht, Stärekoup-analyséieren Genen differentially ausgedréckt. Déi fundamental Iddi vun der Algorithmus ass all subgroups vun Genen mat ähnlechen Ausdrock Musteren ënnert puer subsets vun Kriibs Stoffer ze fannen, an domat och zu all esou Muster Équipe Genen kann eventuell als Ënnerschrëfte fir Kriibs sub-ennerluecht oder Stadium genotzt ginn. r = 1, q = 0,06, c = 0,95, o = 100, f = 1 [14,15]: Fir eis bi-Stärekoup Analyse, hunn mer folgend Parameteren benotzt. Datebank fir Annotation, Visualization an Integréiert Discovery (DAVID) an Kyoto Enzyklopedie vun Genen an Genomes (Kegg) Handwierksgeschir sech fir funktionell Analyse an Passerelle Klassifikatioun vun deene verschiddene Genen benotzt. VerfÜgung qRT-Hinnen alleguer VerfÜgung mat 1 Bau vun der TF-miRNA Co-reglementaresche Reseau VerfÜgung No microarray Donnéeën Analys, mir kritt TFs an der Uklang fonnt Zil- Genen déi vun der E2F Famill duerch Recherche vun Transcriptional Regulatioune Element Datebank (TRED) gereegelt ginn. Ausserdem war de miRNAs E2F Famill gezielt sech interrogating véier Zil- Cepheid Datenbanken, i.e., Targetscan, Miranda, miRDB, an miRWalk Datebank [16-18]. Mir kombinéiert da dësen Ënnerscheed ausgedréckt Genen an miRNAs dëser TF-miRNA Co-reglementaresche Reseau ze E2F Famill mat Cytoscape Software Zesummenhang ze bauen. An der TF-miRNA Co-reglementaresche Netz, definéiert mir Node als Dréischeif Gentherapie oder miRNA wann et zu méi wéi zwee total Wirbelen a vum Netz direkt mat. VerfÜgung Analys vun E2F Famill mRNAs fir Associatioun mat Ambulanz agebousst Beméien aus gastric Kriibs Patienten VerfÜgung der Receiver Ausschöpfung charakteristesche (ROC) Kéieren Fonctionnementskäschten, analyséiert mir differentially Gene ausgedréckt, datt duerch d'E2F mRNAs tëscht gastric Kriibs a vläit bascht normal Stoffer Gentherapie reglementéiert ginn. Mir dann ausgewielt an ënnerscheeden de beschte reagéiert Genen fir Associatioun mat Ambulanz agebousst Charakteristiken de Begleetstär Logistikzenter Réckgang Analyse benotzt. VerfÜgung statistique Analyse VerfÜgung D'ROC rop an Duebelstäresystem Logistikzenter Réckgang Analyse huet fir differentially ausgedréckt Genen geheescht dat sinn déi vun den E2F mRNAs tëscht gastric Kriibs a vläit bascht normal Stoffer reegelen. One-Manéier ANOVA war geheescht tëscht E2F Famill an Ofschloss vun entholl Zell Invasioun ze associéieren. GraphPad Prism 6 Software war standing ROC rop a Berechnunge vu Sensibilitéit, Spezifizitéit an Beräich ënnert der Linn (AUC) ze kréien. SPSS 18,0 Software war fir One-Manéier ANOVA an Duebelstäresystem Logistikzenter Réckgang Analyse benotzt. A p Wäert &Si besteet; 0,05 war als statistesch relevant gin VerfÜgung Detektioun vun differentially ausgedréckt Genen an miRNAs tëscht gastric Kriibs an hire jeeweilegen normal Stoffer VerfÜgung Mir éischt opgeféiert. der Affymatrix Exon flamenden Ofgrond Analyse differentially ausgedréckt Genen tëscht gastric Kriibs a vläit bascht normal Otemschwieregkeeten zu 45 Patienten ze erkennen (Patienten Donnéeë sinn am S1 Table gewisen). Der Geo konsultéieren vun NCBI Bäitrëtt Zuel vun dëser Etude war GSE63089. Benotzt > 1,5 fantastesch Ännerungen wéi de präventive-value, identifizéiert mir 887 bis-reglementéiert an 93 verwandelt-reegelen Genen (S2 Table). Funktionell Analyse gewisen, datt dësen Ënnerscheed Genen haaptsächlech Gentherapie Weeër gemaach, wéi Zell Zyklus Kontroll, p53 sécher Passerelle, Kriibs Passerelle, extracellular Matrixentgasung-receptor Interaktioun, Zell Haftung, glycolysis /gluconeogenesis, an cytokine receptor Interaktioun (Figebam. 1). E2F Familljememberen spillen eng grouss Roll am Zell Zyklus G1 /S Iwwergank zu Zellen an der Gentherapie Ausdrock vun E2F1, 2, 3, 4, 5, an 7 waren all gin overexpression (p &Si besteet; 0.01) fonnt an gastric Kriibs an dësem studéieren. VerfÜgung Next, mir standing och de Affymatrix Gene Chip microRNA vill Analyse an 15 Fäll vu gastric Kriibs a vläit bascht normal Stoffer (Patienten Donnéeë sinn am S1 Table gewisen). Der Geo konsultéieren vun NCBI Bäitrëtt Zuel vun dëser Etude war GSE63121. Mir hunn 41 verwandelt-reglementéiert an 4 weider-reegelen miRNAs (S3 Table). Figebam. 2 illustréiert de bi-Kéip Stärekoup Analyse vun deene 45 Ënnerscheed miRNAs zu gastric Kriibs vs. normal Stoffer. System, dës differentially ausgedréckt miRNAs hätt verschidden Gentherapie Weeër regléieren, wéi Transkriptiouns activator Aktivitéit, DNA bindend, Transkriptiouns Faktor Aktivitéit, Post transcriptional Regulatioun vun der Gentherapie Ausdrock, an G1 /S Transitioun vun mitotic Zell Zyklus. VerfÜgung Building- an an der Analyse vun de E2F Famill-Zesummenhang TF-miRNA Co-reglementaresche Reseau VerfÜgung fir d'E2F Famill-Zesummenhang TF-miRNA Co-reglementaresche Netzwierk, geheescht mir TRED TF an Uklang Zil- Genen ze Jünger reglementéiert vun E2F Famill a ausgewielt dann ausgedréckt der differentially TFs an Uklang Zil- Genen vun gastric Kriibs Stoffer. Mir hunn am Ganzen 105 TFs an Uklang Zil- Genen déi potentiel vun E2F Famill an gastric Kriibs regulariséiert ginn (5 verwandelt-reglementéiert an 100 bis-reegelen Genen; gesinn S4 Table), wat eng 105 Gentherapie Réseau no der Zwee- Form kéint Stärekéip Stärekoup Analyse (Figebam. 3) D'DAVID Analyse huet dës 105 Genen stäerkste Zell Zyklus-Zesummenhang Genen sinn (Figebam. 4). VerfÜgung Next, mir online Handwierksgeschir Targetscan, Miranda, miRDB an miRWalk Datebank ze geheescht virauszesoen Potential gezielt Genen vun dësen 45 miRNA an fusionéiert dann dës gezielt Genen mat deenen 105 differentially ausgedréckt Genen. Mir fonnt 7 verwandelt-reglementéiert an 2 weider-reegelen miRNAs (S3 Table). Duerno, baue mir de E2F-Zesummenhang TF-miRNA reglementaresche Reseau (Figebam. 5) an. VerfÜgung Duerno, mir dës E2F-Zesummenhang TF-miRNA reglementaresche Reseau analyséiert a fonnt, datt E2F1, E2F2 an E2F4 zu E2F Famill eng wichteg Roll an dësem TF an miRNA Co-reglementaresche Reseau Leeschtung. Dräi méi-reegelen mRNAs (E2F1, E2F2 an E2F4) aus der differentially ausgedréckt mRNAs validéiert goufen mat real-Zäit Hinnen alleguer (RT-Hinnen alleguer). D'Resultater bewisen, dass E2F1, E2F2 an E2F4 am gastric Kriibs Echantillon Verglach mat normal Echantillon overregulated goufen. Den RT-Hinnen alleguer Resultater an microarray Daten sinn konsequent (p &Si besteet; 0,05, Lalumi 6.). Zousätzlech, identifizéiert mir 9 Punkt-Genen aus E2F-Zesummenhang TF-miRNA reglementaresche Netz, déi vun TFs (Figebam. 7) Co-regulariséiert ginn. D'DAVID Analyse vun denen 9 Punkt Genen a Fonctioun ass an Table 2. VerfÜgung Association vun E2F Famill mRNA Niveauen mat Ambulanz agebousst Charakteristiken aus gastric Kriibs Patienten VerfÜgung Mir weider analyséiert Ausdrock vun E2F mRNAs dës Distanz an verbonne si da mat Ambulanz agebousst Charakteristiken aus gastric Kriibs Patienten. D'ROC Kéiren Analyse gewisen, datt E2F1, 2, 3, 4, 5, an 7 kann de Uklang Ziler sinn ze gastric Kriibs Otemschwieregkeeten an der normal mannste (Figebam. 8) z'ënnerscheeden. Kombinatioun vu verschiddene E2F Famill mRNAs kann weider d'Spezifizitéit an Empfindlechkeet vun hire Ënnerscheedung tëscht gastric Kriibs an normal Stoffer no de Réckgang vun Duebelstären Logistikzenter Analyse (Figebam. 8) verbesseren. Desweideren, fonnt mir Niveau vun E2F1, 2, 3, 4, 5, an 7 mRNA verbonne mat Déift vun gastric Kriibs Invasioun (Figebam. 9). Mir hunn och déi E2F Ausdrock mat entholl dat verbonnen huet (Figebam. 10). VerfÜgung An dëser Etude, mir geheescht engem präventive Wäert vun 1,5 fantastesch änneren ze profiléiert differentially ausgedréckt mRNAs an miRNAs zu gastric Kriibs Stoffer, déi mat de meeschte vu virdrun Etude vun cDNA oder miRNA microarrays konsequent ass [19]. Dës differentially ausgedréckt mRNAs an miRNAs zu gastric Kriibs Stoffer sech haaptsächlech am Zesummenhang mat Zell Zyklus Werdegang, besonnesch E2F Famill. Fir Datum, gehéiert och d'Memberen vun E2F Proteinen E2F1- E2F8 an ënner vun hinnen, E2F1, 2, 3, 4, 5, an 7 Proteinen waren all wiesentlech zu gastric Kriibs an der aktueller Etude overexpressed. Sou, virausgesot mir dass E2F Famill wichteg reglementaresche Funktiounen am gastric Kriibs huet. Sou, gebaut mir dës E2F-Zesummenhang TF-miRNA Co-reglementaresche Reseau fir gastric Kriibs baséiert op eise microarray profiling Daten. Dëse Réseau enthält 105 TFs an hir reegelen Uklang Zil- Genen (5 verwandelt-reglementéiert an 100 bis-reegelen Genen) dat zu E2F Famill an 9 Ënnerscheed miRNAs Zesummenhang sinn (7 verwandelt-reglementéiert an 2 weider-reegelen miRNAs) (Figebam. 5) . An anere Wierder, konnt E2F Famill vun Genen Akt op dës 105 Genen an 9 miRNAs Zell Zyklus Werdegang vun gastric Kriibs ze regléieren. Iwwerhaapt hunn mir dat Zil Genen reegelen E2F1 an E2F4 wossten Quantitéite vun Ënnerscheed Ausdrock vun gastric Kriibs, wat beweist, datt E2F1 an E2F4 si ganz wahrscheinlech eng wichteg deelen zu Wuesstem vun gastric Kriibs ze besetzen. Ausserdeem, miRNAs differentially zu gastric Kriibs ausdrécke konnten Ausdrock vun E2F1, E2F2, E2F5 an E2F7 ze regléieren, wat beweist, datt miRNAs-verännert Ausdrock vun E2Fs Proteinen wichteg Facteure zu gastric Kriibs Entwécklung oder Werdegang ass. VerfÜgung Iwwerhaapt E2F Familljememberen spillen eng grouss Roll am Zell Zyklus G1 /S Iwwergank zu Zellen an hir beschiedegt Ausdrock enger Zuel vun erhéigen bedeelegt, dorënner Kriibs [20]. Zum Beispill, während gastric Kriibs Wuesstem an Werdegang, wäert Kriibs Zellen entholl Zell Prolifératioun, Promotioun mä apoptosis inhibit. Op der Gentherapie Niveau, Transkriptiouns Faktor E2F Famill vun Genen spillt eng wichteg Roll Zell Zyklus Prozess zu Regulatioun vun de virgesinnen Ausdrock vun Genen Promotioun fir DNA Synthes um G1 /S Phase Transitioun néideg. E2F Aktivitéit selwer ass vun retinoblastoma FAQ (RB) an d'bluddeg Proteinen p107 an p130 kontrolléiert haten. Fir Datum, sinn d'Memberen vun E2F Proteinen E2F1-E2F8, dorënner Transkriptiouns-ageschalt Faktoren E2F1-3a, déi haaptsächlech Zell Zyklus Iwwergank vum G0 bis S Phase regléieren, an Transkriptiouns inhibited Faktoren E2F3b-E2F8, déi zu quiescent oder ënnerscheet Zellen ausgedréckt ginn a verhënneren Zell Zyklus Werdegang [21]. Virdrun Etuden bewisen, dass verännert Ausdrock vun E2F Gentherapie Famill enk mat Wuesstem vun Broscht Kriibs [22], spillt Kriibs [23], BBC Kriibs [24], colorectal Kriibs an pancreatic Kriibs [25] verbonne war. An gastric Kriibs, awer virdrun Studien dass E2F sech abnormal ausgedréckt an E2F Ausdrock vun miRNAs gereegelt gouf mat Zell Zyklus Werdegang an apoptosis Repressioun vun gastric Kriibs Zellen verbonne TGFβ entholl suppressor Passerelle [26] zu oofgesinn. E2F Gentherapie stattfannen ass och eent vun den Ursaache vun Ufank gastric Kriibs Optriede [27]. Eis aktuell Donnéeën sinn dës Opklärung ënnerstëtzt. VerfÜgung awer, nieft E2F Famill, TP53, BRCA1, an STAT3 och eng wichteg Roll an dësem TF an miRNA Co-reglementaresche Reseau (Figebam. 5) spillen. Zum Beispill, TP53is eent vun de meeschte verbreet studéiert Genen a spillt eng Roll am Regulatioun vun apoptosis, Frankräich Stabilitéit, an angiogenesis [28]. A leschter Etude gewisen, dass p53 VerfÜgung stattfannen direkt un der Entwécklung vun gastric Kriibs Hausnummeren [4] an aner Etude gewisen, datt Restauratioun vun p53 Aktivitéit der Empfindlechkeet vun gastric Kriibs ze Chimiotherapie [29] entschlof. BRCA1 ass d'waat Gentherapie vun Broscht Kriibs a reguléieren Zell apoptosis a Fléckaarbechte DNA Schued. BRCA1 spillt eng Roll am Regulatioun DNA Reparatur Aktivitéit an BRCA1 VerfÜgung stattfannen derzou Entwécklung vun Broscht Kriibs, spillt Kriibs [30], pancreatic Kriibs [31], an gastric Kriibs [32]. Lost Ausdrock vun BRCA1 FAQ war mat aarmséileg Iwwerliewe Taux vun gastric Kriibs Patienten [33] assoziéiert. Eis aktuell Etude gewisen, datt BRCA1 mRNA mat gastric Kriibs dat verbonne war. Ausserdeem, ass STAT3 engem Transkriptiouns Faktor datt an Äntwert ze Wuesstem Facteuren an cytokine ageschalt ass, an dréit zu Regulatioun vun Zell Prolifératioun, apoptosis, an motility an Zellen. Virdrun Studie weisen dass STAT3 e Schlëssel reglementaresche Faktor [34] zu gastric Kriibs Entwécklung huet an datt STAT3 Aktivéierung gefördert entholl Zell Iwwerliewe a Migratioun [35]. A virdrun Studium geheescht STAT3 inhibitor gastric Kriibs an zougedréckt Efficacitéit [36]. VerfÜgung Weideren miRNAs (Mir-125a-5p, Mir-331-3p, Mir-17, Mir-150, Mir-155 unzegesin , Mir-27b, Mir-31, Mir-92a an Mir-509-5p), déi differentially zu gastric Kriibs ausgedréckt, sech ze regléieren Ausdrock vun E2F1, E2F2, E2F5 an E2F7 an dëser Etude (S3 Table) fonnt. Virdrun Studie weisen dass Mir-125a-5p Ausdrock mat gastric carcinogenesis verbonne war déi vun E2F3 gezielt [37]. MiRNA-331-3p Ziler direkt E2F1 an entschlof Wuesstem verhaften Mënsch gastric Kriibs Zellen [38]. Desweideren, Ausdrock vum Mir-155 gebass TGF-β1-mediated Aktivatioun vun der RB an am Tour geloss d'Heefegkeet vun der inhibitory pRB-E2F1 komplex a opgehuewe G0 /G1 verhaft [39] ze blockéieren. Mir-17 Famill Stärekéip zouginn als Schlëssel modulators vun TGF-βtumor suppressor sécher an gastric Kriibs, duerch Regulatioun vun p21, E2F1-3 an E2F5 Zil- Gentherapie Ausdrock [40-42]. Zousätzlech, Mir-150, Mir-31, a Mir-92a goufen och enk Relatioun mat gastric Kriibs [43-46] gewisen. Obwuel et keng ze gastric Kriibs Zesummenhang iwwer Bord-509-5p gemellt goufen, waren Mir-509-5p der Mdm2 /p53 Feedback Glück a reguléieren Wuesstem Kriibs Zell [47]. Dës Studien sech konsequent mat eis aktuell Resultater. VerfÜgung Zousätzlech, de reglementaresche Relatioun tëscht TF-Genen an miRNA-TF kann de synergistic Effekter hunn. Baséierend op eis nei gegrënnt E2F-Zesummenhang TF-miRNA Co-reglementaresche Netz, identifizéiert mir 9 Punkt-Genen dat haaptsächlech zu Zell Zyklus abannen an chromosome Organisatioun (Figebam. 7). Geholl all Daten zesummen, eis aktuell Étude uginn, datt gastric Kriibs Entwécklung an Werdegang implizéiert Multiple Genen a weider Studie wäert fir Kontroll vun gastric Kriibs op dës Genen als Roman Ziler konzentréieren. VerfÜgung Allerdéngs, eis aktuell Etude gëtt just eng virleefeg Daten a weider Bekräftegung Etude ass waren eis Donnéeën an ex VIVO an kënschtlech fir z'iwwerpréiwen. Dës systematesch Approche kann hëllefen eis Kriibs pathogenesis an déi d'theoretesch Basis fir Recherche Roman Strategie fir Behandlung vun gastric Kriibs an Zukunft ze entdecken. VerfÜgung mir soen der Medjaden Bioscience Limited (Hong Kong, China) fir Redaktioun an proofreading dëst eng mëttelalterlech Handschrëft. VerfÜgung
Resultater VerfÜgung
Diskussioun VerfÜgung
Informatiounen Ennerstëtzung VerfÜgung S1 Table. Charakteristike vun Patienten VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0116979.s001 VerfÜgung (Intrigue) VerfÜgung S2 Table. . Resumé vun 980 differentially ausgedréckt Genen vun gastric Kriibs Stoffer Verglach zu der wäiter normal Stoffer VerfÜgung Gene Ausdrock Niveauen am gastric Kriibs Stoffer vs. wäiter normal Stoffer sech op d'mannst 1,5-fantastesch verschiddene mat engem p-Wäert &Si besteet;. 0,05
Doi: 10,1371 /journal.pone.0116979.s002 VerfÜgung (XLSX) VerfÜgung S3 Table. . Satz vun 45 differentially ausgedréckt miRNAs zu gastric Kriibs Stoffer Verglach zu der wäiter normal Stoffer VerfÜgung Niveauen vun miRNA Ausdrock vun gastric Kriibs Stoffer vs. wäiter normal Stoffer sech op d'mannst 1,5-fantastesch verschiddene mat engem p-Wäert &Si besteet; 0,05. VerfÜgung Doi: 10,1371 /journal.pone.0116979.s003 VerfÜgung (XLSX) VerfÜgung S4 Table. Resumé vun 105 differentially ausgedréckt Genen vun der TFs-reglementaresche Réseau zu gastric Kriibs Stoffer VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0116979.s004 VerfÜgung (DOCX) VerfÜgung Arbeschterlidder VerfÜgung
COVID-19:Wéi gesäit d'Krankheet aus
Studie weist antiviral Effekter vum Curcumin
Verschidde Bakterien kënnen den HIV Risiko bei Fraen erhéijen,
Neit Tool fir den Darmmikrobiom ze entschlësselen
Darmbakterien verbonne mat metabolesche Verännerungen an Autismus an enger neier Studie
Mathematesche Modell weist de Risiko vun der SARS-CoV-2 Infektioun no fecaler Mikrobiota Transplantatioun op
Verschidde Bakterien kënnen den HIV Risiko bei Fraen erhéijen,
fënnt nei Studie Eng rezent Studie verëffentlecht am DLancet Infektiiv Krankheeten, beschreift siwen Aarte vu vaginale Bakterien, déi de Risiko vun enger HIV -Infektioun bei Fraen däitlech erhéijen
Fuerschung weist datt intestinal Parasitinfektiounen d'COVID-19 Gravitéit reduzéieren
Mir léieren all Dag méi iwwer COVID-19 Krankheet. Erwuessener vun all Alter mat bestëmmten ënnerierdesche medizinesche Bedéngungen hunn e erhéicht Risiko fir schwéier Krankheet vum Virus deen den COVI
Wuesstumsprobleemer bei virzäitege Puppelcher verbonne mat verännert Darmbakterien
Virzäiteg Puppelcher déi net wuesse wéi erwaart oder gedreemt kënne Probleemer mat der Entwécklung vun hirem Mikrobiom hunn, eng nei Etude seet. En Team vu Fuerscher am Ann &Robert H. Lurie Children