Objective- VerfÜgung
genetesch Varianten Regulatioun de Provider immun System kënne fir d'Entwécklung vun gastric Kriibs un der waat bäidroen. Little ass iwwer d'Roll vun de Leitmotiv immunity- bekannt an Net-Hodgkin d'lymphoma (Ministeren) -related Genen fir gastric Kriibs Risiko. Dëst gemaach case-Kontroll Étude zu Kandidat Genen fir gastric Kriibs Risiko fir zukünfteg Studien z'identifizéieren. VerfÜgung
Method VerfÜgung
An der Discovery Phas, 3.072 SNPs zu 203 Leitmotiv immunity- an 264 Ministeren-Zesummenhang Genen der Illumine GoldenGateTM Opa Panel benotzt goufen zu 42 reagéiert case-Kontroll baut aus der koreanesch Multi-Zentrum Cancer Kohort (KMCC) ausgewielt analyséiert. Sechs wichteg SNPs zu véier Leitmotiv excellence ( DEFA6, DEFB1, JAK3, VerfÜgung a ACAA1 VerfÜgung) an 11 SNPs an néng Ministeren-Zesummenhang Genen ( INSL3, CHMP7, BCL2L11, TNFRSF8, RAD50, CASP7, Pö, CD79B, VerfÜgung a CLDN9 VerfÜgung) mat engem permutated p VerfÜgung -value &si besteet; 0,01 goufen du-genotyped am Gedächtnis Phas tëscht 386 Fäll an 348 Kontrollen. Chance nennen (Örs) fir Risiko gastric Kriibs sech fir Alter geschat ugepasst, Fëmmen Zoustand, an H. pylori VerfÜgung an CagA sero-komm. Zesummegefaasst Örs am Ganzen Etude Bevëlkerung (428 Fäll an 390 Kontrollen) benotzt pooled- an meta-Analyse presentéiert VerfÜgung Resultater VerfÜgung Véier SNPs hat kee heterogeneity ganze Phasen:. An der meta- Analyse, DEFA6 VerfÜgung rs13275170 a DEFB1 VerfÜgung rs2738169 hat e souwuel 1,3-fantastesch fräi Chance Verhältnis (oDER) fir gastric Kriibs (95% Well = 1.1-1.6; an 1.1-1.5, bzw.) . INSL3 VerfÜgung rs10421916 an rs11088680 hu souwuel eng 0,8-fantastesch ofgeholl ODER fir gastric Kriibs. (95% Well = 0.7-0.97; an 0.7-0.9, bzw.) VerfÜgung Konklusiounen VerfÜgung Eis Conclusiounen hindeit, datt verschidde Varianten an de Leitmotiv excellence an Ministeren-Zesummenhang Genen der gastric Kriibs Risiko betreffen, vläicht Wonn-inflammation-excellence Mechanisme vun modulating datt definéiert gin bleiwen VerfÜgung Fro:. Park SK, Yang JJ , Oh S, Cho LY, Ma néirens, Shin A, et al. (2012) Leitmotiv excellence an Non-Hodgkin d'Lymphoma (Ministeren) Contenu Genen vun enger gemaach Case-Control Sécuritéit fir Gastric Cancer Risk. PLoS NËMMEN 7 (9): e45274. Doi: 10.1371 /journal.pone.0045274 VerfÜgung Redakter: Georgina L. Stoe, Universitéit vun Aberdeen, Vereenegt Kinnekräich VerfÜgung Arnaque: Mee 10, 2012; Akzeptéiert: 14 August 2012; Publizéiert: 21. September 2012 VerfÜgung Copyright: © Park et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung Funding:. Dës Aarbecht war duerch de Ministère vun der Education, Science and Technology [2009-0066258] a vum BRL (Grondakommes Research schafft) Programm duerch d'National Research Foundation vun Korea finanzéiert finanzéiert duerch Subventiounen aus dem Grondakommes Science Research plangen duerch d'National Research Foundation vun Korea ënnerstëtzt vum Ministère vun der Educatioun, Wëssenschaft an Technologie [2011-0001564]. D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung Gastric Kriibs ass déi zweet Équipe gemeinsam Ursaach fir Kriibs Doud an d'Welt [1] mat engem markéiert geographescher an ethnesch Variant zu Heefegkeet a veruerteelt [2]. Helicobacter pylori VerfÜgung ( H. Pylori VerfÜgung) Wonn, déi International Agence fir Fuerschung op Cancer (IARC) als gastric carcinogen identifizéiert, engem causal Faktor fir gastric Kriibs bewisen ass [1], [2]. Trotzdem, hunn e puer epidemiological Studien trotz engem héijen gemellt H. pylori VerfÜgung prevalence Tarif, d'Heefegkeet vun gastric Kriibs ass héich an e puer asiatesch an afrikanesch Populatiounen, wéi d'asiatesch /afrikanesch Zäitgenossen bekannt [3], [4]. Dëst Zäitgenossen kann wéinst anere Risiko Faktoren ginn gastric Kriibs Zesummenhang mat Differenzen an eenzelne waat un. VerfÜgung An H. pylori VerfÜgung Aids, existeiert chronescher gastric inflammation a féiert zu enger immun Äntwert déi normal ëmfaasst (i.e., de Leitmotiv excellence) an Manque immun Äntwerte déi allgemeng geschéien an Non-Hodgkin d'lymphoma (Ministeren) [5] - [8]; an dës Prozesser Féierung ze atrophic gastritis gefollegt vun metaplasia an dysplasia, a schliisslech zu der Entwécklung vun gastric Kriibs onst [5] - [8]. Sou, ass et ugeholl, datt normal immun Äntwerte vun H VerfÜgung ausgeléist. pylori VerfÜgung Wonn kéint zu Manque immun Äntwerte vun enger direkter an /oder indirekter Manéier verbonne ginn an endlech, kéinten d'final Resultat wéi gastric adenocarcinoma, lymphoma, an anere malignancies bestëmmen. VerfÜgung Tatsaach, datt 1) eng Persoun vum Daniel Nepgen ass e Facteur fir eenzel waat; an 2) H. pylori VerfÜgung Wonn am gastric Otemschwieregkeeten féiert dat zu adresséieren inflammation normal /Manque immun Äntwerte induces, Genen coding Proteinen zu Gaascht am Zesummenhang normal an /oder anormal excellence vu Bedeitung fir eenzel waat fir gastric Kriibs Risiko kann. Puer epidemiologic Studien hu bewisen, dass d'Genen zu Gaascht immun Äntwert Leeschtung enger kritescher Roll an gastric carcinogenesis Zesummenhang: 1) proinflammatory Provider genotypes entschlof hypochlorhydric /atrophic Äntwerte gastric H. pylori VerfÜgung Aids, déi zu noncardia gastric adenocarcinoma verlaf [6]; 2) eng genetesch Variant vun TLR9, VerfÜgung déi eng wichteg Roll an der Leitmotiv immun System spillt, huet vill mat H assoziéiert. pylori VerfÜgung -induced premalignant gastric Ännerungen [7]; 3) TLR4 VerfÜgung Asp299Gly kéint eng genetesch Rief Faktor fir gastric mucosa-verbonne lymphoid Otemschwieregkeeten (Malz) lymphoma ginn [8]; a 4) d' CD14 VerfÜgung genetesch Varianten schéngen an der Entwécklung vun gastric Malz lymphoma Équipe gin [9]. VerfÜgung op d'Beweiser Opgrond, Hypothes mir dat genetesch Varianten am normal immun Äntwert ( dat heescht, de Leitmotiv excellence Zesummenhang Genen) an normal immun Äntwert (dh, de Ministeren Zesummenhang Genen) konnt duerch modulating eenzelne waat Differenzen gastric Kriibs Risiko Afloss. Fir eis Hypothes diskutéieren, mir gehaal eng zwee-Etapp genetesch Analyse dorënner: 1) de Discovery Phase beschen 1.536 SNPs zu 203 Leitmotiv excellence Genen an 1.536 SNPs zu 264 Ministeren Zesummenhang Genen mat der GoldenGate (Illumina) oligonucleotide Pool assay (Opa) an 2) d'Gedächtnis Phase datt weider déi bedeitendst SNPs an der Discovery Phase analyséiert. VerfÜgung Sécuritéit Themen VerfÜgung Themen aus der koreanesch ausgewielt goufen Multi-Zentrum Cancer Kohort (KMCC) zu dëser Populatioun-baséiert gemaach case-Kontroll studéieren. [12] - déi Design a probéieren Strategie vun der KMCC goufen am Detail soss [10] beschriwwen. Kuerz, vun 1993 bis 2004, goufen am Ganzen 19.688 Participanten aus véier urban an ländlech Géigenden zu Korea agestallt. All Participant 1) eng Awëllegung Form ënnerschriwwen virun der Kohort Gaang; 2) ofgeschloss detailléierte standardiséierte questionnaires vun perséinlechen Interview; 3) gespent Blutt an Pipi Echantillon; a 4) waren passively gefollegt-up duerch Rekord linkages un d'national Doud Certificat, Krankeversécherung medezinesch records Datebanken an d'national Kriibs Etat. VerfÜgung Vun Dezember 2001, am Ganzen 100 Tëschefall gastric Kriibs Fäll goufen nei identifizéiert laut fir d'International statistique Course vu Krankheete Contenu Gesondheetsproblemer 10. Versioun (ICD-10, C16). Vun hinnen, 42 Fäll an 42 reagéiert Kontrollen vun Alter, Geschlecht, Aschreiwung Géigend, an engem Joer huet sech an der Discovery Phase abegraff an erfollegräich mat der GoldenGate (Illumina) oligonucleotide Pool assay (Opa) Brieder genotyped. An der Gedächtnis Phas, goufen d'Etude Populatiounsschichte ausgewielt wéi follegt zesummen: 1) no dem selwechten Méthodologie fir Fall ascertainments verwisen, 199 Fäll gastric Kriibs waren zousätzlech vun der KMCC definéiert am Dezember 2008 an 1:1 zu Kontrolle reagéiert no Alter ( ± 5 Joer), Geschlecht, an Aschreiwung Joer; 2) an der Chungnam University Hospital an Hanyang University GURI Spidol, 189 nei gastric Kriibs festgestallte sech aus Mäerz 2002 agestallt ze September 2006. Si gëtt schrëftlech informéiert Agrëff an d'Blutt Echantillon der Zäit vun Diagnos oder virun gastric Kriibs gesin; an 3) am Ganzen 189 Communautéit-baséiert Kontrollen stemmt Alter (± 5 Joer), Sex an Aschreiwung Joer waren zoufälleg aus der KMCC ausgewielt. Vun der 388 case-Kontroll Mätscher, zwee Fäll a véierzeg Kontrollen goufen wéinst aarmséileg genotyping Taux éliminéiert a Frankräich DNA Niveau. Endlech, huet 386 Fäll an 348 Kontrollen am Gedächtnis Phase analyséiert. VerfÜgung ervirgestrach, baséiert op serology-baséiert erkennen, H. pylori VerfÜgung Wonn an CagA /VacA seropositivity waren ënnert all de Etude Sujeten évaluéiert an zwou Phasë abegraff. D 'immunoblot assay Helico Blot 2.1 ™ (MP Biomedicals Asien Pazifik, Singapur) deen (fir béid H.pylori VerfÜgung an CagA seropositivity 99%) wéi och Spezifizitéit (98% fir H héich Empfindlechkeet garantéiert . ënnert der koreanesch Populatioun VerfÜgung an 90% fir seropositivity CagA) [13], huet serum Echantillonen analyséiert a interrelated am Aklang mat der Uweisungen d'Hiersteller pylori. Tatsaach, datt CagA-produzéiert H. pylori VerfÜgung si vill mat enger méi Risiko vun gastric Kriibs, H assoziéiert. pylori VerfÜgung an CagA seropositivity sech als mächtegst covariates fir gastric Kriibs a seng fir an der Statistik Modeller behandelt. VerfÜgung IFLA- breakpoint VerfÜgung D'Etude Ëmwelt- vun der KMCC an d'genetesch Analyse vun guttgeheescht huet déi institutionell review Conseils Seoul National University Hospital (H-0110-084-002, an C-0603-161-170, bzw.). Ausserdeem war d'Spidol-baséiert gastric Kriibs Etude vun de Finanzpolitiker Kritik Verwaltungsrot vun Hanyang University Hospital (IRB no.2003-4) abruecht. All Etude Participanten ënnerschriwwen eng Awëllegung Form virun der Studien am Gaang. VerfÜgung SNP selektionéiert an Genotyping VerfÜgung An der Discovery Phas, war d'Illumina GoldenGate ™ Opa Panel mat 203 Leitmotiv excellence an 264 Ministeren Zesummenhang entworf Kandidat Genen SNPs an der SNP500Cancer Projet (http://snp500cancer.nci.nih.gov) mat bekannt bass-Haaptrei Daten an der Gentherapie Zesummenhang carcinogenic Mechanismen [14] benotzt. Schwéierpunkt op enger Regioun déi 20 kB 5 'fir de Start vun Transkriptiouns (Exon 1) an 10 KB 3' ass bis zum Schluss vun der leschter Exon (N) fir all Kandidat Gentherapie, Kandidat SNPs sech preliminarily opgefouert. No deem, goufen Tag SNPs aus der designable Formatioun vun SNPs ausgewielt, datt en Deel vun der International HapMap Project (http://www.hapmap.org/index.html) an duerno De Ben huet, benotzt mir TagZilla (http: //tagzilla .nci.nih.gov) no den Kriteren: 1) minor allele Frequenz (MAF) > 0,05; 2) Design stoung = 1,1; an 3) r Vun de 1.536 SNPs fir de Leitmotiv excellence Zesummenhang Genen zougewisen, goufen 384 SNPs wéinst engem MAF ausgeschloss &Si besteet; 0,05 (151 SNPs), engem HWE p VerfÜgung -value &Si besteet; 0.0001 (1 SNP), monomorphism (162 SNPs), an assay Problemer (71 SNPs). Fir d'Ministeren-Zesummenhang Rot, mir 396 SNPs mat engem HWE geläscht p VerfÜgung -value &Si besteet; 0.0001 (2 SNPs), engem MAF &Si besteet; 0,05 (143 SNPs), assay Problemer (50 SNPs), an monomorphism (201 SNPs). Endlech, statistesch Analyse dorënner 1.151 SNPs an de Leitmotiv immun Rot an 1.140 SNPs an de Ministeren Rot fir 42 case-Kontroll baut reagéiert vum Alter, Geschlecht, Gebitt, an Aschreiwung Joer. VerfÜgung Genotyping war mat Frankräich DNA gesuergt aus Randerscheinung Blutt mat der Gentra Puregene Blood Kit (Gentra är ganz Famill, USA) am Kär Genotyping Facility (CGF) vun der Opdeelung vun Cancer Epidemiology a Genetik, National Cancer Institut ofgebaut. An dëser Etude, genotype Réalisatioun op Frankräich DNA Echantillon iwwerschratt 95%. VerfÜgung Fir d'Gedächtnis Phas, sechs SNPs vu véier Genen vun de Leitmotiv excellence Gentherapie Rot ( DEFA6 VerfÜgung rs2738120, DEFB1 VerfÜgung rs2702829, DEFA6 VerfÜgung rs13275170, JAK3 VerfÜgung rs2286662, DEFB1 VerfÜgung rs2738169, an ACAA1 VerfÜgung rs2239621) an 11 SNPs vun néng Genen vun der Ministeren Rot ( INSL3 VerfÜgung rs10421916, CHMP7 VerfÜgung rs7463256, BCL2L11 VerfÜgung rs686952, TNFRSF8 VerfÜgung rs755398, INSL3 VerfÜgung rs11086080, RAD50 VerfÜgung rs17772583, CASP7 VerfÜgung rs11196422, Pö VerfÜgung rs2230804, CD79B VerfÜgung rs2003549, CLDN9 VerfÜgung rs11862306, an TNFRSF8 statistique Analys VerfÜgung Hardy-Weinberg Gläichgewiicht (HWE) an d'Kontroll Grupp war mat der Chi bewäert -square Test oder Fisher d'exakt Test mat e präventive Niveau vun HWE &Si besteet; 0,0001. Ausgewielt Charakteristiken huet mat bewäert χ Fir spurious Associatiounen mat falschen vermeiden positiv Resultater, ausgewielt mir all SNPs mat den Tip p VerfÜgung -value fir all Gentherapie, an der Benjamini-Hochberg falsch Entdeckung Tarif (BH-FDR) korrigéiert p VerfÜgung -values vun all SNP no der Zuel vun Genen war berechnen [18]. 0,01 an eng BH-FDR p VerfÜgung -value &Si besteet;; Mir allem relevant SNPs mat engem permutated p VerfÜgung -value &Si besteet ausgewielt. 0,2 VerfÜgung An der Gedächtnis Phase, déi bedeitendst SNPs an der Discovery Phase identifizéiert goufen du-bewäert. Baséiert op der additive oder recessive Modeller, war gastric Kriibs Risiko als Örs an 95% Well ugeholl fir déi selwecht covariates mat Logistikzenter Réckgang Modell verwisen ugepasst. Fir d'Resultater vun der Discovery an d'Gedächtnis Phasen, pooled- an meta-Analyse huet gehaal WikiCommons. Benotzt fix Effekt Modell, goufen d'zesummegefaasst Örs an 95% Well berechnen. Zousätzlech, heterogeneity ganze Studie vun der Cochran Q Statistiken bewäert gouf [19]. VerfÜgung All statistesch Analyse mat der PLINK Software Versioun 1,06 gehaal huet (http://pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink) an SAS Software Versioun 9.1 (SAS Institut, Cary, North Carolina). VerfÜgung Cases an Kontrollen waren ähnlech an Alter, H. pylori VerfÜgung Wonn, CagA /VacA seropositivity, Drénkwaasser Zoustand, an gastric oppent Geschicht. A liicht groussen a wesentleche verschiddene Verdeelung fir Zigarette fëmmen tëscht Fäll a Kontrollen war an der Gedächtnis a hinzeginn Analysë (Table 1). VerfÜgung Genotype Ofstänn fir all SNPs observéiert huet net aus der Hardy-Weinberg Gläichgewiicht wäicht (HWE) ( p VerfÜgung > 0.0001). VerfÜgung an der Discovery Phas, Six SNPs zu véier Genen ( DEFA6, DEFB1, JAK3 VerfÜgung, an ACAA1 VerfÜgung ) ënnert 1.152 vun de Leitmotiv excellence Zesummenhang Genen an 11 SNPs an néng Genen ausgewielt SNPs ( INSL3, CHMP7, CASP7, RAD50, Pö, TNFRSF8, CD79B, BCL2L11, VerfÜgung a CLDN9 VerfÜgung) ënnert der 1.104 SNPs zu 246 Ministeren-Zesummenhang Genen huet vill mat gastric Kriibs Risiko verbonnen no der permutated p VerfÜgung -values ( p VerfÜgung &si besteet; 0.01). Nom fir verschidde Vergläicher correcting, nëmmen zwee SNPs, DEFA6 VerfÜgung rs2738120 a DEFB1 VerfÜgung rs2702829, nach liicht bedeitendst fir gastric Kriibs (FDR = 0,08 an FDR = 0,08, respektiv), déi eng fräi zougedréckt Risiko fir gastric Kriibs (oDER [95% CI] = 4,1 [1.6-10.4] an 2,9 [1.3-6.1], bzw.). Vun de Ministeren-Zesummenhang Gentherapie erschéngt, nach eng SNP an néng Genen liicht bedeitendst (FDR-BH p VerfÜgung -value = 0.09); INSL3 VerfÜgung rs10421916 verbonne war mat enger däitlech fir gastric Kriibs ofgeholl (ODER [95% CI] = 0.6 [0.3-0.97]) (Table 2). VerfÜgung An der kombinéiert Analyse (dh, hinzeginn an meta Analysë) datt den Discovery a Gedächtnis Phasen abegraff, zwee SNPs, DEFA6 VerfÜgung rs13275170 a DEFA1 VerfÜgung rs2738169 an de Leitmotiv excellence Genen an INSL3 VerfÜgung rs10421916 an rs11086080 zu meta ODER = 1,3 [95% CI: 1.1-1.5];; meta ODER = 0,8 [95% CI: blouf de Ministeren-Zesummenhang Genen vill mat Risiko fir gastric Kriibs (meta ODER = 1,3 [1.1-1.6 95% CI] assoziéiert : 0.7-0.97]; meta ODER = 0,8 [95% CI: 0.7-0.9], bzw.). Et war keen heterogeneity ganze Analysë (Cochran Q Test, p VerfÜgung > 0,05). (Table 3) VerfÜgung A zwee-Etapp genetesch association Etude mat 1.536 SNPs zu 203 Leitmotiv excellence dinn (dh, déi normal immun Äntwert dinn) Genen an 1.536 SNPs zu 264 Ministeren-dinn (dh, de Manque immun Äntwert dinn) Genen gehaal huet Varianten an Leitmotiv excellence an Ministeren-Zesummenhang Kandidat Genen ze identifizéieren, verbonne mat gastric Kriibs. An der Discovery Phas, sechs SNPs zu véier Leitmotiv excellence Genen ( DEFA6, DEFB1, JAK3 VerfÜgung, an ACAA1 VerfÜgung) an 11 SNPs an néng Ministeren-Zesummenhang Genen ( INSL3, CHMP7 , CASP7, RAD50, Pö, TNFRSF8, CD79B, BCL2L11, VerfÜgung a CLDN9 VerfÜgung) huet däitlech mat gastric Kriibs Risiko verbonnen (permutated p VerfÜgung &si besteet; 0.01); an no der BH-FDR Test fir d'Genen vun 42 baut Fäll a Kontrollen, DEFA6 VerfÜgung a DEFB1 VerfÜgung an de Leitmotiv excellence Gentherapie Rot an INSL3 VerfÜgung an de Ministeren -related Gentherapie Rot mein mat gastric Kriibs Risiko (BH-FDR p VerfÜgung &si besteet; 0,1) assoziéiert. An der Gedächtnis genotyping Phas mat méi case-Kontroll baut an der meta- an hinzeginn gebueden, DEFA6, DEFB1 VerfÜgung, an INSL3 VerfÜgung nach vill mat gastric Kriibs Risiko ouni heterogeneity ganze verbonne waren Phasen. VerfÜgung DEFA6 VerfÜgung (defensin alpha 6, Paneth Zell-spezifesch) an DEFB1 VerfÜgung (defensin Beta 1), déi fir de defensin Familljememberen gehéieren, besteet aus 6 Mënsch Beta-defensins (hBD1-hBD6) an zwou Mënsch alpha-defensins (hD5-hD6) an eng enorm wichteg Roll vun de Provider Ofwier Mechanismus, virun allem a Relatioun ze antimicrobial Aktivitéit an cytotoxicity vun neutrophils [20], [21] spillen. [24] - Defensins inducible vun inflammation oder Aids kann bakteriell Kolonisatioun am epithelial Fläch dorënner gastrointestinal epithelium [22] widderstoen. Besonnesch, Photo'en defensin lipopolysaccharide op den H. pylori VerfÜgung Zell Mauer an der defensin- H. pylori VerfÜgung komplex activéiert der NF-kb Signal transduction Passerelle fir gastric carcinogenesis [25]. Rezent Studien uginn zu Kriibs Entwécklung Équipe defensins sech zu verschiddenen Mënsch erhéijen dorënner gastric Kriibs ausgedréckt [26] - [28]. Als ee vun de Potential Agenten fir gastric carcinogenesis, defensins vläicht mat H zesummekomm. pylori VerfÜgung Wonn fir béid Resistenz an Schutz, an hir anormalen kann den éischte Schrëtt a Richtung gastric Kriibs Entwécklung induce. Sou, et méiglech ass, datt e puer Varianten vun DEFA6 VerfÜgung a DEFB1 VerfÜgung de waat fir gastric Kriibs Afloss vun der demagogesch Äntwert duerch Ännerungen an den Ausdrock oder Funktioun vun deenen Proteinen verbidden. Eis Conclusiounen hindeit datt DEFA6 VerfÜgung rs2738120 (an der intron wellkomm) an DEFB1 VerfÜgung rs2702829 (matzen an der 3 "vun STP) hun Potential genetesch Auswierkungen op d'Entwécklung vun gastric Kriibs. Trotz der heterogeneity vun der Entdeckung a Gedächtnis Phase, déi aner Plaze vun DEFA6 VerfÜgung (rs2738120) an DEFB1 VerfÜgung (rs2702829) goufen och wichteg an eise Resultater. Weider Studien soll genau biologescher Funktiounen vun der SNPs zu der defensin Aktivitéit an /oder bewosst Muecht Zesummenhang beschen gehaal ginn. VerfÜgung Den INSL3 VerfÜgung Gentherapie encodes d'FAQ INSL3, deen ass en insulin- wéi Hormon. D'INSL3 FAQ ass produzéiert haaptsächlech zu gonadal Stoffer am mënschleche Kierper; awer, et gouf an entholl Stoffer vun der gastrointestinal TRACT [29] identifizéiert. Little ass bekannt wéi INSL3 VerfÜgung Gentherapie zu Mënsch carcinogenesis interferes. Ausserdeem ass et net gutt, ob d'genetesch Varianten vun de bekannte INSL3 VerfÜgung Gentherapie zu gastric carcinogenesis verbonne sinn, mä d'Resultater vun dëser Etude weisen, datt op d'mannst zwee SNPs (rs10421916 am intron matzen an rs11086080 zu den 3 "vun STP) zu staark linkage disequilibrium (d '= 0,86, LOD = 13,42, an r Eng Zuel ze klären gemaach ginn vun Genen (dh, JAK3, CHMP7, CASP7, RAD50, Pö, TNFRSF8, CD79B, BCL2L11 VerfÜgung, an CLDN9 VerfÜgung) e groussen Veräin mat gastric Kriibs an der Discovery Phase huet, obwuel net wesentleche am BH-FDR Tester. JAK3 VerfÜgung, TNFRSF8 VerfÜgung, an Pö VerfÜgung kéint chronescher inflammation an excellence mat H betreffen. pylori VerfÜgung Kolonisatioun Richtung gastric Kriibs, deen zu gastric carcinogenesis wichteg ass wéi follegt zesummen: 1) JAK3 VerfÜgung ass zu cytokine receptor-mediated intracellular Signal transduction Équipe, an der cytokine receptor war allgemeng zu Mënsch gastric Kriibs Otemschwieregkeeten fonnt [30]; 2) TNFRSF8 VerfÜgung mediated Signal transduction féiert zu Aktivatioun vun NF-κB [31]; an 3) Pö VerfÜgung ass zu NF-κB sécher Passerelle Aktivatioun vun H Équipe. pylori VerfÜgung zu gastric Kriibs Zellen [32]. Tatsaach, datt de Mënsch gastric pathogen H. pylori VerfÜgung vun Pinguin DNA Schued a apoptosis zu Gaascht gastric epithelial Zellen [33] vill vu senge pathogenicity enormen, BCL2L11, CASP7 VerfÜgung, an CD79B VerfÜgung Untersuchungshaft apoptosis verbonne ginn [34 ] - [38] an RAD50 VerfÜgung a ACAA1 VerfÜgung Rapport zu der DNA Schued a gefléckt System par rapport zu gastric Kriibs Entwécklung mat ze ginn [39], [40] awer och enger biologescher Thes . CLDN9 VerfÜgung Akten als Gentherapie entholl suppressor zu intestinal-Typ gastric Kriibs agebonne [41]. VerfÜgung Obwuel dëser Etude ass eng zwee-Etapp genetesch association studéieren, do sinn e puer Aschränkungen an der Etude. Éischt, iwwerwonne stäerkste Genen net de heterogeneity ganze Discovery a Gedächtnis Phasen. D'heterogeneity ass an all Phase bis de verschiddenen statistesch Muecht zougeschriwwen: Eng kleng Prouf Gréisst vun der Discovery Phas zu Buergermeeschter Örs schéinen (i.e., iwwer-geschat), an d'Resultater goufen statistesch ënnerscheeden aus der normal-geschate Wäerter am Gedächtnis Phase. Obwuel d'Verdeelung vun den Ëmwelt- Faktoren tëschent de Fäll vun enger Communautéit-baséiert Kohort studéieren an Spidol-baséiert Fäll vun all anere war ascertained liicht anescht, haten d'MAFs vun stäerkste SNPs kleng Differenz. Zweet, stratified Analysë de verschiddenste Charakteristiken vun gastric Kriibs betreffend (dh, histological bestemmt, Fra vs VerfÜgung Net-Fra;. Diffusen Typ vs VerfÜgung intestinal Typ;. An TNM Etapp) an /oder onofhängeg Risiko Faktoren (dh, Alter, Geschlecht, a H. pylori VerfÜgung Wonn Status) konnt de Goss Natur vun der Etude Populatioun net well vun 1 gehaal ginn) (dat heescht, déi meescht Patienten zougedréckt net-Fra Zorte oder Onspezifizéierten Zorte, > 95%; an der intestinal an diffusen Zorte waren manner wéi 3%); an 2) e Manktem vun Detail Informatiounen iwwert d'histopathology Donnéeën wéinst passiv Suivi mat Daten linkage Methoden. Drëtten, sech zënter Markéierung SNPs baséiert op Donnéeën aus engem Caucasian Bevëlkerung ausgewielt, déi asiatesch-spezifesch genetesch lues kéinten am Design Etapp respektéierte ginn. Endlech, konnt mer net eng funktionell Effet vun der SNP op engem molekulare Niveau bestätegen. Also, sollen d'Resultater mat him interpretéiert ginn. An trotz der Aschränkungen, eiser Etude stabil ass géint e puer biases datt zu Retrospektiv Motiver wéinst hirer Bevëlkerung-baséiert gemaach case-Kontroll Design gemeinsam ginn. VerfÜgung zu Conclusioun, eis Conclusiounen proposéiere DEFA6 VerfÜgung , DEFB1 VerfÜgung, an INSL3 VerfÜgung genetesch Varianten waat Facteure fir d'Entwécklung vun gastric Kriibs ginn. Weider Studie mat enger grousser Zuel vu Fäll an enger méi grousser Frankräich duerginn, erlaabt eis déi agebousst Mechanisme vun gastric Kriibs ze entschlësselen. Desweideren, weider biologescher op dës Genen do Etuden sollen hir Rollen am gastric carcinogenesis klären. VerfÜgung Mir schätzen Drs. Stephen J. Chanock, Robert Welch, Nathaniel Rothman, déi initial genotyping an de Chiffer vu Gesondheet hëllefen a Mënscherechter Services, Haaptentwéckler Genotyping Facility um Détailléiert Technology Center vun der National Cancer Institut, an der Divisioun vun Cancer Epidemiology a Genetik, National Cancer Institut , Bethesda, Maryland, USA VerfÜgung
Aféierung VerfÜgung
spontan a Methode VerfÜgung
rs641941) sech am Aklang mat den Kriteren erausgewielt: d'SNPs mat 1) eng permutated p VerfÜgung -value &si besteet; 0,01; an /oder 2) Benjamini-Hochberg falsch Entdeckung Tarif (BH-FDR) korrigéiert p VerfÜgung -values &Si besteet; 0,2 op déi bedeitendst SNPs vun all de Genen an der Discovery Phase. Genotyping war mat der Illumina VeraCode GoldenGate Assay mat BeadXpress standing laut den Hiersteller d'Instruktioune (Illumina, San Diego, CA, USA) [16]. Fir d'Zouverlässegkeet vun der genotyping Methode vun der zwou Phasë suergen, goufen 188 Echantillon zweemol vun all Method genotyped. D'concordance Taux war > 98,4%. Zwee Fäll a véierzeg Kontrolle mat genuch DNA oder engem genotyping Opruff Taux &Si besteet;. 90% ausgeschloss waren VerfÜgung Resultater VerfÜgung
Diskussioun VerfÜgung
Informatiounen Ennerstëtzung VerfÜgung Informatiounen S1 ënnerstëtzen. VerfÜgung Détailléiert Informatioun iwwert d'ausgewielten SNPs zu 203 Leitmotiv excellence Genen an 264 Ministeren Zesummenhang Genen: An der Entdeckung Phase VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0045274.s001 VerfÜgung (XLSX) VerfÜgung
Arbeschterlidder VerfÜgung
Parkinson Krankheet kéint duerch Darmmikroben verhënnert ginn
Nei Strategie kann d'Gutt-Gehir Kommunikatioun stäerken
Haushënn onwahrscheinlech SARS-CoV-2 ze iwwerdroen,
Gesondste Darmbakterien mat Planzbaséierter oder mediterraner Diät
DeNovix annoncéiert Gewënner vum Platin DS11 FX+ Spektrofotometer / Fluorometer
Fuerschung kuckt op Aerobiome,
Fastfood kann e Premier Täter bei Teenager Depressioun sinn
Firwat ass Depressioun sou e wuessende Problem bei Teenager an Amerika? Eng Äntwert ass dAart vu Liewensmëttel déi se iessen, laut enger neier Etude vu Fuerscher vun der University of Alabama zu Birmi
Wëssenschaftler extrahéieren de komplette mënschleche Genom aus engem Dausende vu Joer alen "Knätschgummi"
Et schéngt, datt Kaugummi keen neien Trend ass! Fuerscher hunn Kaugummi fonnt dat ass 5, 700 Joer al an et huet Hiweiser iwwer antike DNA geliwwert. Eng Studie mat de Befunde gouf am Journal publizéie
Leaky Darm a mikrobiell Dysbiose kéinte bäidroe fir den Zytokin Stuerm a schwéier kranke COVID-19 Fäll
Wéi dWelt de grausame Meilesteen vun dräi Milliounen Doudesfäll aus der COVID-19 Krankheet ukënnt, en neit Virdruck Fuerschungspabeier gepost op bioRxiv * Server weist datt dPräsenz vun Darmbakterie