PLoS ONE: genetische gevoeligheid op CagA-interagerende moleculen en Gen-omgeving interactie met Fyto-oestrogenen: een mogelijke risicofactor voor Gastric Cancer

De abstracte

Doelstellingen

Om te beoordelen of genen die coderen CagA- interagerende moleculen ( SRC
, PTPN11
, CRK
, CRKL
, CSK
, c-MET
en GRB2
) worden geassocieerd met de maag risico op kanker en of er een interactie tussen deze genen en fyto-oestrogenen wijzigen maag risico op kanker.

Methods

In de ontdekking fase, 137 kandidaat SNPs in zeven genen werden geanalyseerd in 76 incident maagkanker gevallen en 322 gematchte controles van de Koreaanse Multi-Center Cancer Cohort. Vijf belangrijke SNPs in drie genen ( SRC
, c-MET Kopen en CRK
) werden opnieuw geëvalueerd in 386 gevallen en 348 controles in de uitbreidingsfase. Odds ratio's (OR's) voor de maag kankerrisico werden geschat gecorrigeerd voor leeftijd, roken, H. pylori
seropositiviteit en CagA stam positiviteit. Samengevat UPR's in de totale onderzoekspopulatie (462 gevallen en 670 controles) werden gepresenteerd met behulp van pooled- en meta-analyse. Plasma concentraties van fyto-oestrogenen (genistein, daidzeïne, equol en enterolactone) werden gemeten met behulp van de tijdsopgeloste fluoroimmunoassay.

Resultaten

SRC
rs6122566, rs6124914, c -Met
rs41739 en CRK
rs7208768 toonde significante genetische effecten van maagkanker in zowel de samengevoegde en meta-analyse zonder heterogeniteit (gepoolde OR = 3,96 [95% BI 2,05-7,65], 1,24 [95 % BI = 1,01-1,53], 1,19 [95% BI = 1,01-1,41], en 1,37 [95% BI = 1,15-1,62], respectievelijk; meta OR = 4,59 [95% BI 2,74-7,70], 1,36 [95% CI = 1,09-1,70], 1,20 [95% BI = 1,00-1,44], en 1,32 [95% BI = 1,10-1,57], respectievelijk). Risico allel van CRK
rs7208768 hadden een significant verhoogd risico op maagkanker bij lage niveaus fyto-oestrogeen ( p interactie Restaurant < 0,05).

Conclusies

onze bevindingen suggereren dat SRC
, c-mET Kopen en CRK
een belangrijke rol in de maag carcinogenese te spelen door het moduleren CagA signaaltransductie en de interactie tussen de CRK
-gen en fyto-oestrogenen wijzigen maag kankerrisico

Visum:. Yang JJ, Cho LY, Ko KP, Shin A, Ma SH, Choi BY, et al. (2012) genetische gevoeligheid op CagA-interagerende moleculen en Gen-omgeving interactie met Fyto-oestrogenen: een mogelijke risicofactor voor maagkanker. PLoS ONE 7 (2): e31020. doi: 10.1371 /journal.pone.0031020

Editor: Deodutta Roy, Florida International University, Verenigde Staten van Amerika

Ontvangen: 30 november 2011; Aanvaard: 29 december 2011; Gepubliceerd: 24 februari 2012

Copyright: © 2012 Yang et al. Dit is een open-access artikel gedistribueerd onder de voorwaarden van de Creative Commons Attribution License, die onbeperkt gebruik, distributie en reproductie maakt in elk medium, op voorwaarde dat de oorspronkelijke auteur en de bron worden gecrediteerd

Financiering:. Deze studie werd ondersteund door een subsidie ​​van de National R & D Program for Cancer control, Ministerie van Volksgezondheid en Welzijn, de Republiek Korea (0520140), en de Basic Research Laboratory-programma (BRL) door de National Research Foundation Korea gefinancierd door het ministerie van Onderwijs, Wetenschap en Technologie (2011-0001564). De financiers hadden geen rol in de studie design, het verzamelen van gegevens en analyse, besluit te publiceren, of de voorbereiding van het manuscript

Competing belangen:.. De auteurs hebben verklaard dat er geen tegenstrijdige belangen bestaan ​​

Introductie

Helicobacter pylori
( H. pylori
), een groep I menselijke maag carcinogeen door het Internationaal Agentschap voor kankeronderzoek (IARC) [1], is de sterkste risicofactor in de maag kankerontwikkeling en aanhoudende H. pylori
infectie is de eerste stap op weg naar de maag carcinogenese [1] - [3]. Ondanks talrijke aanwijzingen dat H. pylori
speelt een cruciale rol bij maagkanker, slechts een klein deel van geïnfecteerde mensen ontwikkelen maagkanker. Dit houdt in dat andere factoren die betrokken zijn bij de pathogene mechanisme van de H. pylori
kunnen individuele gevoeligheid voor maagkanker te wijzigen. Onze eerdere studies aangetoond H. pylori
infectie zelf was niet geassocieerd met de maag risico op kanker, maar specifiek CagA positieve H.
pylori infectie significant verhoogd risico op maagkanker door 3,57-voudige [4], [5].

cytotoxine-geassocieerde gen A (CagA), een immunodominante proteïne uitgescheiden door H. pylori
, blijkt een van de pathogene modificerende factoren [6] - [8]. Na het infecteren van H. pylori
in de maag epitheelcellen, CagA fungeert als een belangrijke kankerverwekkende en giftige component via sequentiële CagA signaaltransductie route. De eerste stap begint met de interactie tussen CagA en diverse eiwitten zoals SRC, SHP2, CRK, CRKL en CSK na fosforylatie en c-MET en GRB2 zonder fosforylatie [9] - [12]. Tyrosine gefosforyleerd CagA van SRC-familie-kinasen wisselwerking met SHP2 tyrosine fosfatase (gecodeerd door het PTPN11
oncogen), CRK, CRKL en CSK en induceert cel verstrooiing, dissociatie en mortaliteit verbonden met tumorigenese [8], [12] - [15]. Bovendien, niet-gefosforyleerd CagA interactie met c-MET en GRB2 die oncogene reactie waaronder celproliferatie en morfologische veranderingen, zoals de vorming kolibrie [8] bevordert [16] - [19]. Dit CagA translocatie en zijn cellulaire interactie met deze eiwitten kan een cruciale stap in het initiëren van de maag carcinogenese zijn [9] - [12].

Cellular wijziging in de CagA positieve H. pylori
pathogene mechanisme lijkt te zijn verschillende gevoeligheid van maagkanker bij H verklaren. Pylori
besmette personen. Aangezien cellulaire functies kunnen worden geregeld door hun gastheer genen kunnen genetische varianten met betrekking tot de CagA interagerende moleculen de pijl op individuele maagkanker vatbaarheid. Op basis van de vermoedelijke genetische verschillen veronderstelden we dat genen die coderen CagA-interagerende eiwitten risico op maagkanker kan wijzigen. Bovendien hebben we ons gericht op de fyto-oestrogenen als een effect modifier in de CagA signaaltransductie proces. Studies hebben gemeld dat fyto-oestrogenen met anti-inflammatoire, anti-bacteriële en anti-oxidant eigenschappen kan remmen H. pylori
activiteit en maagkanker groei en proliferatie [20] cell - [22]. Met name genisteïne, een van fyto-oestrogenen en fosfotyrosine kinase inhibitors, wordt melding gemaakt van een doeltreffende antagonist voor fosforylatie CagA [23].

De hypothesen te evalueren, een tweetraps genetische analyse gericht op genen die coderen rechtstreeks CagA-bindende moleculen, SRC
, PTPN11
, CRK
, CRKL
, CSK
, c- BMO Kopen en GRB2
, werd uitgevoerd dat inbegrepen: 1) de ontdekking fase die gescreend en geïdentificeerd single nucleotide polymorfismen (SNP's) met een significante genetische associatie op maagkanker; 2) de uitbreiding fase die opnieuw geanalyseerd de belangrijkste SNPs in de ontdekking fase. Bovendien, in een sub-analyse, evalueren we het gen-omgeving interactie te bepalen of fyto-oestrogeen niveaus wijzigen van de associatie tussen gen polymorfismen die direct coderen-CagA bindende moleculen en het risico op maagkanker.

Methods

Ethics Verklaring

de studie protocollen werden goedgekeurd door de Institutional review Board van Seoul National University Hospital (H-0110-084-002 voor de KMCC studie en C-0910-049-297 voor de huidige geneste case -control studie) en door de Institutional review Board van Hanyang University Hospital (2003-4). Bovendien zijn alle deelnemers tekenden een informed consent formulier voor het invoeren van de studies.

Studiepopulatie

Twee-fase genetische associatie studie werd uitgevoerd. De geneste case-control studie populatie werd gerekruteerd uit de Koreaanse Multi-Center Cancer Cohort (KMCC). Gedetailleerde informatie over de KMCC elders [24] beschreven. In het kort werden de deelnemers gerekruteerd uit vier stedelijke en landelijke gebieden (Haman, Chungju, Uljin en Youngil) in Korea. Informatie over individuele kenmerken waaronder algemene levensstijl en de blootstelling van het milieu werd verzameld met behulp van gestandaardiseerde-interview op basis van vragenlijsten. Bloed- en spot urinemonsters werden ook verzameld. Alle deelnemers werden passief follow-up door middel van geautomatiseerde plaat koppelingen met de nationale kanker register, het nationale overlijdensakte, en de ziektekostenverzekering medische dossiers. De passieve follow-up methoden van de KMCC gemeld zeer efficiënt en volledig te zijn [25].

Op december 2002 in totaal 136 gevallen maagkanker vastgesteld volgens de Internationale Statistische Classificatie van Ziekten en Betrokken gezondheidsproblemen 10 Revision (ICD-10, C16) werden geïdentificeerd in de ontdekking fase. Onder hen, 84 gevallen met uitzondering van de gevallen gediagnosticeerd voordat er aanwervingen (n = 36) en zonder bloedmonsters (n = 16) werden in eerste instantie geselecteerd voor genotypering. Vier kanker-vrij controles (n = 336) werden op elkaar afgestemd maagkanker geval steekproefsgewijs incidentiedichtheid op basis van leeftijd (± 5 jaar), geslacht, woonwijk, en inschrijving jaar. Acht gevallen en 14 controles werden uitgesloten als gevolg van slechte genotypering prestaties, en dus 76 gevallen en 322 controles werden opgenomen in de discovery-fase.

In de verlenging fase werden 388 maagkanker case-control sets geselecteerd als volgt : 1) 334 maagkanker gevallen, waaronder 136 gevallen vastgesteld op 31 december 2002 werden vastgesteld uit de KMCC in 31 december 2008. Met uitzondering van de gevallen in de ontdekking fase geanalyseerd (N = 84) en zonder bloedmonsters (N = 51), 199 maagkanker gevallen werden gevonden 01:01 de controles op basis van leeftijd (± 5 jaar), geslacht, en de inschrijving jaar. 2) 189 nieuw gediagnosticeerde gevallen van maagkanker bij Chungnam University Hospital en Hanyang University GURI Ziekenhuis met informed consent werden gerekruteerd van maart 2002 tot september 2006. Er werden bloedmonsters verzameld op het moment van diagnose of voorafgaand aan maagkanker chirurgie. Bovendien werden 189 community-gebaseerde controles geëvenaard door leeftijd (± 5 jaar), het geslacht en de inschrijving jaar (2001-2005) willekeurig gekozen uit de KMCC. Van de 388 maagkanker case-control wedstrijden, werden twee gevallen en 40 controles geëlimineerd als gevolg van slechte genotypering en onvoldoende monster en tenslotte 386 gevallen en 348 controles werden geanalyseerd in de extensie fase.

Kandidaat genen en SNP selectie

In het CagA signaaltransductie route, CagA direct bindt aan zeven eiwitten die leiden tot sequentiële processen. Host genen die coderen voor de zeven eiwitten werden als volgt geselecteerd: v-Crk sarcoma virus CT10 oncogen homoloog ( CRK
); v-Crk sarcoma virus CT10 oncogen homoloog (aviaire) -achtige ( CRKL
); c-Src tyrosine kinase ( CSK
); groeifactor receptor-gebonden eiwit 2 ( GRB2
); Ontmoette proto-oncogen ( c-MET
); nucleaire factor van geactiveerde T-cellen, eiwit tyrosine fosfatase, niet-receptor type 11 ( PTPN11
) codeert SHP2 tyrosine fosfatase en v-Src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viraal oncogeen homoloog ( . SRC
)

kandidaat SNPs werden geselecteerd volgens de drie criteria: SNPs gemeld om 1) mogelijk functioneel relevant voor kanker in eerdere studies; 2) minor allel frequentie (MAF) > 0,05 in Aziatische bevolking in openbare databanken zoals SNP500Cancer of de internationale HapMap project met behulp van dbSNP IDs (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp); en gelijktijdig 3) MAF > 0,05 in het Japans (JET) in de internationale HapMap project. Tot slot, 137 SNPs met een ontwerp score = 1,1 en r ^{2 > 0.8 werd het genotype van de aanzienlijke SNPs voor de maag risico op kanker te screenen. 108 SNPs zijn gelegen in het intron gebied; 24 SNPs liggen in het promotorgebied (flankerende gebied of UTR); vijf SNPs liggen in het coderende gebied.}

Genotypering

In de ontdekkingsfase, 137 SNPs in zeven kandidaatgenen coderen CagA interagerende eiwitten werden gegenotypeerd. Na meting van concentraties van genomisch DNA voor alle proefpersonen een spectrofotometer (NanoDrop ND-1000, NanoDrop Technologies), werd uitgevoerd met behulp genotypering GoldenGate ™ assay (Illumina®, San Diego, CA, USA). Om ervoor te zorgen kwaliteitscontrole en evaluatie van de intra-subject concordantie, werden 52 duplicaten van de monsters willekeurig verdeeld in de genotypering plaat. Concordantie tarieven voor alle tests waren meer dan 99%. Van de 137 SNPs, werden 21 SNPs uitgevallen als gevolg van het falen van genotypering (4 SNPs), SNP call rate < 90% (7 SNPs), HWE < 0,0001 (1 SNPs) en MAF ≤0.05 (9 SNPs). Acht gevallen en 14 controles werden eveneens uitgesloten vanwege genotypering call rate < 90%. Tot slot, 116 SNPs in zeven genen (genotypering tarief van 99,6%) in 76 gevallen en 322 controles werden geanalyseerd

In de verlenging fase vijf SNPs met een rauwe p
waarde <.; 0,02, tag SNPs of hoger ontwerp scores (rs6122566 en rs6124914 in SRC
; rs41739 en rs41737 in c-MET
; rs7208768 in CRK
) die in de ontdekking analyse werden gegenotypeerd met de Illumina Veracode GoldenGate Assay met BeadXpress volgens het protocol van de fabrikant (Illumina®, USA) [26]. Om de betrouwbaarheid van de genotyperingswerkwijzen van de twee fasen te waarborgen, werden 188 monsters tweemaal genotype bepaald door elke werkwijze. De concordantie bedroeg > 98,4%. Twee gevallen en 40 controles met onvoldoende DNA (n = 15) of genotypering call rate < 90% (n = 27) werden uitgesloten. Tot slot, vijf SNPs in drie genen (genotypering tarief van 99,6%) werden geanalyseerd in 386 gevallen en 348 controles.

H. pylori
infectie en CagA seropositiviteit

H. pylori
infectie en CagA seropositiviteit werden geëvalueerd met behulp van immunoblot assay, Helico Blot 2.1 ™ (MP Biomedicals Asia Pacific, Singapore). Helico 2,1 Blot ™ kits is gerapporteerd een hoge gevoeligheid en specificiteit hebben (sensitiviteit, 99% identiek in beide, op specificiteit, 98% en 90%, respectievelijk). [27]

Metingen van fyto-oestrogenen biomarkers

De plasmaconcentraties van vier phytoestrogen biomarkers die isoflavonen waren 1): genisteïne, daidzeïne en equol (daidzein stof) en 2) lignan: enterolactone werden gemeten met behulp van tijdsopgeloste fluoroimmunoassay kits (Labmaster, Finland). Na gratis phytoestrogen biomarkers werden geëxtraheerd uit 200 ul van plasma monster, de VICTOR3 ™ 1420 Multilabel Counter gemeten tijd ontbonden fluorescentie (Perkin-Elmer). Gedetailleerde meetmethoden voor phytoestrogen biomarkers worden elders [28] beschreven. Van de totale onderzoekspopulatie, werden plasma concentraties van de vier biomarkers gemeten in 406 gevallen en 417 controles met voldoende plasma volume (> 200 pi).

Statistische analyse

Om de basiskenmerken te vergelijken tussen maagkanker patiënten en controles, de chi-kwadraat-test en de Student t-
testen werden uitgevoerd. P
-waarden voor het verschil in verhouding voor geslacht, leeftijd, H. pylori
infectie, CagA en VacA seropositiviteit, het roken van sigaretten, alcohol drinken, en gastritis geschiedenis tussen patiënten en controles werden bepaald.

Hardy-Weinberg evenwicht (HWE) in de controlegroep werd geëvalueerd met behulp van de chi kwadraat test of Fisher's exact test met een cut-off niveau van HWE < 0,0001. In de ontdekking fase, minimale wereldwijde p
waarden ( p Restaurant < 0,05) in de likelihood ratio-test (LRT) met 1 vrijheidsgraad (df) in het additief model en LRT met 2 df in het genotypische model werden berekend om significante SNPs selecteren. Met behulp van drie genetische modellen, additief, recessief en dominant modellen, de associatie tussen de geselecteerde SNPs en maag risico op kanker werd geanalyseerd. Gepermuteerd p
-waarden werden geschat op 100.000 permutatietests in de interne SNP analyse. Om valse associaties te vermijden met valse positieve resultaten, de gecorrigeerde gepermuteerd p
-waarden van de toestand van meerdere SNPs en de valse ontdekking tarief (FDR) met een Benjamini-Hochberg methode werden berekend [29]. Gastric risico op kanker werd geschat als odds ratio's (OR's) en 95% betrouwbaarheidsintervallen (CI's) met behulp van onvoorwaardelijke logistische regressie model gecorrigeerd voor risicofactoren die leeftijd, rookgedrag waren (ooit vs.
Nooit), H. pylori
infectie (positieve vs.
negatief) en CagA seropositiviteit (positieve vs.
negatief). Daarnaast werd haplotype analyse uitgevoerd naar genen die significant geassocieerd SNPs van een individu SNP analyse met behulp van Haploview 4.1 software (www.broad.mit.edu/mpg/haploview/).

In de verlengde fase, de meest significante SNPs die in de discovery-fase werden opnieuw geëvalueerd. Op basis van het additief of recessieve modellen, werd de maag risico op kanker geschat UPR's en 95% CI's met behulp van onvoorwaardelijke logistische regressie model correctie voor dezelfde covariaten hierboven vermeld. Om de resultaten van de ontdekking en de verlenging fasen pooled- en meta-analyse vatten uitgevoerd. Met behulp van de vaste effect model, samengevat UPR's en 95% CI's werden berekend. Ook heterogeniteit tussen de studies werd geëvalueerd door de Cochran Q statistiek [30].

Met behulp van de analyse van de variantie en covariantie (ANCOVA) met de leeftijd, rookgedrag (ooit vs.
Nooit), H. pylori
infectie (positieve vs.
negatief) en CagA seropositiviteit (positieve vs.
negatief) als potentiële risicofactoren voor maagkanker, de middelen van de fyto-oestrogenen biomarker niveaus tussen de gevallen en controles werden vergeleken. Gestratificeerde analyse door hoge en lage niveaus van fyto-oestrogeen biomarkers (genistein, daidzeïne, equol en enterolactone) waar de cut-off niveaus werden bepaald door de Spline analyse werd uitgevoerd met behulp van onvoorwaardelijke logistische regressie modellen. Interactie-effecten tussen de belangrijkste SNPs en fyto-oestrogeen biomarkers werden ook berekend als ultraperifere regio's en 95% CI gecorrigeerd voor leeftijd, rookgedrag (ooit vs.
Nooit), H. pylori
infectie (positieve vs.
negatief) en CagA seropositiviteit (positieve vs.
negatief).

Alle statistische analyses werden uitgevoerd met behulp van SAS-software versie 9.2 ( SAS Institute, Cary, North Carolina), en Plink softwareversie 1.07 (http://pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink) [31]. Meta-analyses werden uitgevoerd met behulp van STATA versie 10 (Stata, College Station, TX).

Resultaten

Er was geen significant verschil tussen patiënten en controles op basis van geslacht, H. pylori
infectie, CagA /VacA seropositiviteit, roken /drinken en de status maagzweer geschiedenis in de ontdekking en uitbreiding fasen (p > 0,05). CagA /VacA seropositiviteit en het aandeel van de huidige rokers waren significant hoger bij maagkanker gevallen in de samengevoegde gegevens ( p
= 0,03, p Restaurant < 0,01, p
= 0,02, respectievelijk) (Tabel S1).

van de 116 SNPs in de zeven kandidaat-genen die coderen voor CagA interactie eiwitten in de ontdekking fase geanalyseerd, 22 SNPs in drie genen, SRC
, c-mET
en CRK
, werden significant geassocieerd met maagkanker ( p
-LRT < 0,05). SRC
rs6122566 significant verhoogd risico op maagkanker in de recessieve modellen (OR = 4,90, [95% BI 1,19-14,2]). Dertien SNPs dat rs41739 waren, rs16945, rs41738, rs6566, rs10435378, rs41737, rs2023748, rs41736, rs41735, rs6951311, rs183642, rs2237717 en rs38859 in c-MET
gen vertoonden een significante gen-dosis effect in de lineaire trend testen ( p Restaurant < 0,05). CRK
rs7208768 hadden een marginaal significant gen-dosis effect. 100.000 permutatietests in de interne SNP analyse toonde SRC
rs6122566, c-MET
rs41739 en CRK
rs7208768 met de meest significante gepermuteerde p
- waarde in elk gen ( p
_{permutatie = 0,00284, p
permutatie = 0,00989, p
permutatie = 0,01392 respectievelijk). De marginale betekenis van de gecorrigeerde gepermuteerd p
-waarde werd waargenomen bij SRC
rs6122566 ( p
= 0,0918), maar alle FDR p
-waarden in alle genetische modellen waren niet significant ( p Restaurant > 0,2). (Tabel S2)}

haplotype blokken werden geïdentificeerd door de LD perceel (figuur S1). Het grootste blok werd gebouwd met de meest significante SNPs waaronder rs41739, rs6566, en rs41738, maar de omnibus p
-waarde was niet significant ( p Restaurant > 0,05). Vier blokken gedefinieerd door SRC
en een blok gedefinieerd door CRK
kwam niet opdagen statistische significantie in de omnibus-test. De resultaten van de haplotype analyse niet aanwezige informatie over de individuele SNP resultaten (gegevens niet getoond).

In de verlengde fase, twee SNPs, rs6122566 en rs6124914 in SRC
gen en rs7208768 in CRK
bleef significant geassocieerd met een verhoogd risico op maagkanker (OR = 4.01, [95% CI: 1,62-9,96]; OR = 1,30, [95% CI: 1,00-1,70]; OR = 1,33, [95% CI: 1,08-1,64], respectievelijk). Associaties tussen de SNPs in c-MET
gen (rs41739 en rs41737) en maag risico op kanker werden verzwakt. In de gecombineerde analyse dat de ontdekking en uitbreiding fasen, de risico-inschatting van de opgenomen SRC
rs6122566 in het recessieve model was significant geassocieerd met maagkanker in zowel de samengevoegd en meta-analyses (OR = 3,96, [95% CI: 2,05-7,65]; OR = 4,59, [95% CI: 2,74-7,70], respectievelijk). Bovendien, SRC
rs6124914, c-MET
rs41739 en CRK
rs7208768 toonde significante gen-dosis effect voor maagkanker in beide analyses. Er was geen heterogeniteit over de analyses (Cochran Q test, p Restaurant > 0,05). (Tabel S3)

Onder een totaal van 823 proefpersonen (406 gevallen en 417 controles), die werden gemeten de plasma niveaus van fyto-oestrogenen de vier biomarkers de totale concentraties van genisteïne, daïdzeïne en enterolacton in gevallen aanzienlijk lager dan die van de controles (genisteïne 167,6 nmol /L in gevallen vs.
200,2 nmol /L controles p
= 0,0004; daidzein 91,4 nmol /l in gevallen vs
131,6 nmol /L in de controles, p
. < 0,0001; enterolactone 51,0 nmol /l in hoesjes vs
77,7 nmol /L in de controles, p
. < 0,0001). Over het algemeen plasma concentraties van equol, een daidzein metaboliet lager bij gevallen, maar niet statistisch significant (50,3 nmol /L voor gevallen vs
62,2 nmol /L voor de controles;. p
= 0,0977) . In gestratificeerde analyse op basis van fyto-oestrogeen biomarkers, was een belangrijke gen-omgeving interactie waargenomen bij CRK
. Risico allel van CRK
rs7208768 hadden een significant verhoogd risico op maagkanker bij lage niveaus fyto-oestrogeen. Specifiek, het allel van rs7208768 geassocieerd met een verhoogd risico op maagkanker bij lage genisteïne, daidzeïne, equol en enterolacton en statistisch significant (OR = 1,91 [95% CI: 1,44-2,52] bij lage genisteïne, OR = 2,09, [95% CI: 1,46-3,01] bij lage daidzein; OR = 1,87, [95% CI: 1,26-2,78] bij lage equol; OR = 1,77, [95% CI: 1,10-2,85] bij lage enterolactone). De p
-interactieve was significant ( p
= 0,0001, p
= 0,0013, p
= 0,0147, p
= 0,0404, respectievelijk) (Tabel S4).

Hoewel aanvullende gestratificeerde analysen uitgevoerd om een ​​interactie tussen CagA seropositiviteit en elk gen effect maag kankerrisico detecteren, waren niet significant in geen van de drie genen, SRC
, c-MET Kopen en CRK
(gegevens niet getoond).

Discussie

CagA-afscheidende H. pylori
infectie lijkt een belangrijke rol in de maag carcinogenese spelen via sequentiële CagA signaaltransductie route. CagA aanvankelijk bindt zeven eiwitcomponenten om afwijkende cellulaire reacties die de ontwikkeling van maagkanker grondslag liggen activeren. Aangezien functie van het eiwit kan worden gereguleerd door hun gastheer genen, kunnen genen die coderen CagA interagerende moleculen kunnen risico op maagkanker wijzigen. Om deze hypothese te evalueren, we genotype 137 SNPs in zeven kandidaat-genen en aangetoond dat genetische varianten van de SRC
(rs6122566 en rs6124914), c-MET
(rs41739) en CRK
(rs7208768) waren significant geassocieerd met de maag risico op kanker. Bovendien, een interactief effect CRK
genetisch polymorfisme rs7208768 en vier biomarkers fyto-oestrogeen genisteïne, daidzeïne, equol en enterolactone op maag kankerrisico geanalyseerd.

SRC, een non-receptoreiwit tyrosine kinase (TK), absoluut noodzakelijk lijkt maagkanker is. Eenmaal geïnjecteerd in maagepitheelcellen, CagA ondergaat tyrosinefosforylering door de SRC-familie-kinasen [8], [12], [18]. De tyrosinefosforylering van CagA is een integrale stap bij het bepalen van de opeenvolgende cellulaire signalering mechanisme. Omdat sommige CagA interagerende moleculen zoals SHP-2, CRK en CSK alleen kunnen reageren met gefosforyleerde CagA, kan SRC belangrijker beïnvloeden elkaars cellulaire functies en het induceren van ontwikkeling van maagkanker is. Daarnaast is SRC gemeld dat een cruciale rol spelen bij tumorprogressie en bemiddelen tumorigenese en metastase [32]. Cellulaire activiteit van SRC lijkt te worden veranderd door de gastheer-gen en onze resultaten geven aan dat SRC
rs6122566 en rs6124914 kunnen risico modifiers in de maag carcinogenese. SRC
genetische variaties die de cellulaire capaciteit in de maag epitheelcellen van invloed zijn geassocieerd met de maag risico op kanker.

Ondanks de verzwakte betekenis in de extensie analyse, c-MET
die staat voor HGFR
(hepatocyte growth factor receptor) kan een onafhankelijke risicofactor gen voor maagkanker is. Talrijke eerdere studies die c-met, één van de receptor TK, bevordert invasieve tumorgroei, invasie en mortaliteit, en amplificatie en /of overexpressie van c-MET is geassocieerd met verschillende menselijke carcinoma waaronder maagkanker [17], [ ,,,0],33] - [36]. In termen van c-MET cellulaire mechanismen, CagA een rol speelt als een adapter eiwit, Gab, aan de receptor TK signalering bemiddelen door het regelen van een cluster van de downstream-componenten op de geactiveerde receptor zoals Grb2, PLCy en SHP-2 [37], [38]. Door functioneel nabootsen van de Gab adapter eiwit, zou CagA abnormale proliferatie en mortaliteit van de maag epitheel cellen [39] te stimuleren. In de huidige studie, een polymorfisme van de c-MET
gen (rs41739) was significant geassocieerd met maagkanker risico en een mogelijke genetische gevoelig factor op maagkanker. In overeenstemming met de cellulaire belang en de functie, c-MET
gen lijkt het risico op maagkanker te passen door middel van CagA signaaltransductie route.

CRK adapter eiwit dat splicing isovormen heeft, CRK-I ( SH2-SH3) en CRK-II (SH2-SH3-SH3), bindt aan TK en controles transcriptie en cytoskelet reorganisatie moduleren cellulaire activiteiten [40]. Ook deze adapter eiwit integreert diverse cellulaire signalen en de disregulatie is verbonden met de menselijke carcinoma [41]. Interactie tussen CRK en gefosforyleerd CagA is gemeld dat een biologisch voorwaarde dat leidt tot morfologische verandering, cel verstrooiing en deregulering van adhesie van cellen in de maag epitheel [14] zijn. Verschillende studies hebben aangetoond dat overexpressie van CRK wordt geassocieerd met verschillende soorten menselijke tumoren zoals long-, maag- en darmkanker [42], [43]. Onze bevindingen ook het genetisch potentieel van de CRK
rs7208768 steunen op de ontwikkeling van maagkanker en zowel genetische en cellulaire omvang van CRK.

Interessanter significante interacties tussen de CRK
genetisch polymorfisme en vier fyto-oestrogeen biomarkers, genisteïne, daidzeïne, equol en enterolactone, bewerkt maagkanker risico. Gaven aan beschermende effecten van fyto-oestrogenen op maagkanker [20], [28] en in het bijzonder genisteïne remde de ERK signaaltransductie cascade geïnduceerd door H. pylori
infectie een rol spelen als een tyrosine kinase inhibitor [44]. Gezien CRK is de belangrijkste upstream molecuul ERK activatie de riskante genetische varianten van CRK
het activeren van de ERK signalering kan worden geblokkeerd door fyto-oestrogenen en bemiddelen de ontwikkeling van maagkanker.

SRC, c-MET en CRK zijn ook betrokken bij de eiwit TKs die een divers multigenfamilie welke cellulaire signaaltransductie mediëren diverse stroomafwaartse cellulaire processen gecontroleerd en speelt een belangrijke rol in de ontwikkeling van verschillende klinische aandoeningen [45], [46]. TKs zijn ook bekend als oncogenen betrokken bij menselijke maligniteiten. SRC behoort tot een niet-receptor TK en c-MET is een receptor TK, terwijl CRK is een adaptor eiwit dat bindt aan TK-gefosforyleerde eiwitten en versterkt de belangrijkste eiwitten in de signaaltransductieroute [41]. Deze drie moleculen gecodeerd door SRC
, c-MET
en CRK
genen kunnen onafhankelijk van elkaar induceren celdifferentiatie, adhesie, de dood en morfologische veranderingen door transmiting cel signalen met betrekking tot TK hun activiteiten, ongeacht de interactie met CagA. Bovendien zijn genen betrokken bij TK maatregelen lijken een belangrijke rol spelen als een gevoelige factor voor maagkanker gezien dat genisteïne een tyrosine kinase remmer maagkanker risico [28] te verminderen. Dit geeft aan dat de genetische aanleg van de SRC
, c-MET
en CRK
in de maag carcinogenese moeten worden behandeld als onafhankelijke risicofactoren die de cellulaire signaaltransductie in TK wijzigen afhankelijke manieren omdat niet-geïnfecteerde personen met een CagA afscheidende H. Pylori
kan een verhoogd risico op maagkanker afhankelijk van de individuele genetische varianten van de drie genen.

Hoewel PTPN11
, CRKL
, CSK
en GRB2
geen significant verband met maagkanker in het huidige onderzoek niet heeft laten zien, hun genetische effecten mag niet worden verwaarloosd. Op cellulair niveau worden deze moleculen significant gerelateerd aan afwijkende effecten maagkanker [12] ten grondslag liggen. Als een van de menselijke proto-oncogenen, PTPN11
codeert cytoplasmatische tyrosine fosfatase met SHP2 en kan afwijkende hyperactivation van de ERK signalerende [47] induceren. Een studie heeft ook gemeld dat een PTPN11
genetische variant verhoogd het risico op maag-atrofie en kanker bij CagA positieve H. pylori
besmette mensen [48]. In het CagA signaaltransductie route, CRKL werkt heel vergelijkbaar met CRK; CSK frustreert een activiteit van SRC familie kinase en CagA-SHP2 signalering; GRB2 en fungeert als een trigger om de RAS /MEK /ERK pathway [14] te activeren, [18], [49]. Verdere studies met een groter aantal maagkanker gevallen en bredere dekking van genetische polymorfismen in deze genen zijn gerechtvaardigd.

Gastric carcinogenese geïnduceerd door CagA positieve H. Pylori
infectie kan worden infered uit onze studie resultaten en de evaluatie van cellulaire mechanismen [16], [18], [47] (figuur S2). Zodra CagA geïnjecteerd in de maag ephithelial cellen, SRC initieert CagA fosforylering die samenwerkt met CRK adapter eiwit en SHP2 de ERK activering bevorderen. c.

• PLoS ONE: Identificatie van Serum MicroRNA als nieuwe niet-invasieve biomarkers voor de vroege detectie van Gastric Cancer
• PLoS ONE: Activeren Transcription Factor 4 Verleent een multidrug resistance fenotype aan maagkanker cellen door transactivatie van SIRT1 Expression