Stomach Health > Maag Gezondheid >  > Q and A > maag vraag

Metagenomische analyse helpt de rol van bacteriesoorten bij de ziekte van Crohn te begrijpen

Onderzoek naar het darmmetagenoom van patiënten met de ziekte van Crohn verheldert hoe dit de taxonomische en functionele samenstelling van de darmmicrobiota beïnvloedt. Een van de meest voorkomende veranderingen is de afname van de diversiteit van nuttige microben en de toegenomen overvloed aan Escherichia coli en andere microben geassocieerd met ontsteking. De resultaten kunnen helpen om de oorzaken en het verloop van de ziekte beter te begrijpen, evenals om behandelingsschema's te optimaliseren. De resultaten zijn gepubliceerd in BMC Genomics .

De ziekte van Crohn is een ernstige inflammatoire darmziekte die wijdverbreid is in ontwikkelde landen. Tot de mogelijke oorzakelijke factoren behoren genetische aanleg, omgeving en de levensstijl van de patiënt. De ziekte gaat gepaard met een abnormale reactie van het immuunsysteem op de eigen darmmicroben; darmdysbiose is typisch. Om de voortgang ervan te bestuderen en de methoden voor efficiënte diagnostiek en behandeling te vinden, wetenschappers onderzoeken de rol van bacteriën in het pathologische proces.

Een van de meest veelbelovende benaderingen is metagenomische analyse - sequencing van het totale genetische materiaal van een microbiële gemeenschap. Een onderzoeksteam, waaronder wetenschappers van de ITMO University en specialisten van het Federale Onderzoeks- en Klinisch Centrum voor Fysisch-Chemische Geneeskunde, hebben in samenwerking met clinici van verschillende medische centra onlangs het darmmetagenoom van patiënten met de ziekte van Crohn onderzocht. Er werd ontdekt dat de samenstelling van de microbiota bij dergelijke patiënten significant verschilt van die van gezonde proefpersonen:naarmate de fractie normale microben afneemt, pathogene soorten die niet gangbaar zijn bij de mens beginnen te domineren.

Hoewel het type dysbiose van patiënt tot patiënt verschilde, de meeste van hen manifesteerden een meervoudige toename van de overvloed aan Escherichia coli . De wetenschappers gingen op zoek naar de specifieke genen die de subtypes van Escherichia coli die in de darmen van patiënten met de ziekte van Crohn wonen en vaak voorkomen Escherichia coli dat bestaat bij gezonde mensen. De vergelijking die op de Russische bevolking werd uitgevoerd, toonde een gebrek aan dergelijke universele verschillen. De waarnemingen werden bevestigd tijdens de analyse van de openbaar beschikbare datasets over gezonde proefpersonen en patiënten met de ziekte van Crohn van over de hele wereld.

" Escherichia coli wordt beschouwd als een van de best bestudeerde darmmicroben en was ook een van de eersten die werd ontdekt. De verhoogde overvloed in de darm wordt waargenomen bij een aantal ziekten. Onze metagenomische analyse toonde aan dat de genetische inhoud van de ziekte van Crohn Escherichia coli varieert sterk, ondanks de bestaande overtuiging dat er slechts enkele specifieke variëteiten zijn. De resultaten ondersteunen het concept dat de ziekte van Crohn een syndroom is, d.w.z., een ziekte waarbij vergelijkbare manifestaties in meerdere gevallen worden veroorzaakt door verschillende factoren in elk geval, " zegt Alexander Tyakht, een onderzoeksmedewerker aan de ITMO University.

Uit het onderzoek bleek dat verschillende stammen van Escherichia coli kunnen naast elkaar bestaan ​​in een menselijke darm. Omdat stammen met verschillende genomen significant verschillende ecologische rollen kunnen spelen, dezelfde behandelingsschema's kunnen een verschillend effect hebben op verschillende stammen. Deze ontdekking biedt een kans om de balans van de darmflora te verbeteren bij patiënten met de ziekte van Crohn, terwijl gepersonaliseerde analyse van het bacteriële genotype de mogelijkheid biedt om de meest efficiënte medicijnen te selecteren, probiotica en zelfs fecale massatransplantatie (FMT) donoren voor elke patiënt.

Deze bevindingen resoneren ook met het eerdere onderzoek van de wetenschappers waarbij genoomanalyse van geïsoleerde E coli stammen. De nieuwe resultaten werpen licht op hoe de microbiota verandert bij patiënten met de ziekte van Crohn en welke soorten en stammen van bacteriën deelnemen aan de ontwikkeling ervan. Dit, beurtelings, kan helpen om het begin en de voortgang van de ziekte beter te begrijpen, en om de behandelmethoden te optimaliseren.

Other Languages