PLoS ONE: En Polymorphism (rs2295080) i mTOR Arrangøren regionen og sin tilknytning til magekreft i en kinesisk Population

Abstract

Bakgrunn

Som en viktig del av PI3K /Akt /mTOR sti , pattedyr-target av rapamycin (mTOR) har vist seg å øke i magekreftceller og svulster. Vår forskning utforsket forholdet mellom enkeltnukleotidpolymorfi (SNP) rs2295080 i mTOR
promoter-regionen og risikoen for magekreft (GC).

Metoder

Syv hundre og femti -Tre (753) adenokarsinom i ventrikkelen og 854 matchede friske personer ble rekruttert i kreftforeningen studien og 60 vev ble brukt til å teste uttrykk for mTOR
. Ubetinget logistisk regresjon ble valgt til å vurdere sammenhengen mellom rs2295080 T > G polymorfisme og GC risiko. Vi deretter undersøkt funksjonaliteten til denne arrangøren genetisk variant av luciferase assay og EMSA.

Resultater

Personer med G-allelet hadde en 23% redusert risiko for GC, som sammenligner med de som bærer T-allelet (justert OR = 0,77, 95% CI = 0,65 til 0,92). Denne beskyttende effekten av G allel sto bedre i mannlig gruppe. I mellomtiden, GC pasienter bærende TG /GG genotype vises også en redusert mRNA nivå av mTOR product: ( P
= 0,004). I luciferase-analysen, T allel hadde tendens til å øke den transkripsjonelle aktivitet av mTOR
med et omtrentlig 0,5 ganger høyere enn for G-allelet. Videre EMSA tester forklarte at ulike alleler av rs2295080 vises forskjellige affinitet til noen Transkripsjonsfaktor.

Konklusjon

mTOR
promoter polymorfi rs2295080 var signifikant assosiert med GC risiko. Dette SNP, som effektivt påvirket ekspresjonen av mTOR
, kan være en ny biomarkør for tidlig diagnose av magekreft og en passende indikator for anvendelse av mTOR-inhibitor for behandling av GC

Citation:. Xu M, Tao G, Kang M, Gao Y, Zhu H, Gong W, et al. (2013) en polymorfisme (rs2295080) i mTOR
Arrangøren regionen og sin tilknytning til magekreft i en kinesisk befolkning. PLoS ONE 8 (3): e60080. doi: 10,1371 /journal.pone.0060080

Redaktør: Paolo Peterlongo, IFOM, Fondazione Istituto FIRC di Oncologia Molecolare, Italia

mottatt: 26 november 2012; Godkjent: 21 februar 2013; Publisert: 29 mars 2013

Copyright: © 2013 Xu et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres

Finansiering:. Denne studien ble delvis støttet av National Natural Science Foundation of China (81230068, 30972444, 81001274, og 81102089), Key Program of Science Foundation i Jiangsu-provinsen Natural (BK2010080), Science Foundation i Jiangsu-provinsen Natural (BK2011773 og BK2012842), Key Program for grunnleggende forskning i Jiangsu Provincial Department of Education (11KJB330002 og 12KJA330002), Qing-Lan-prosjektet i Jiangsu Provincial Department of Education, og Priority Academic Program Utvikling av Jiangsu høgskolerådet (Public Health og forebyggende medisin). Vi vil også gjerne takke Luo Y (Nanjing Røde Kors Blood Center), for hennes assistanse med funksjonelle eksperimenter. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet

Konkurrerende interesser:. Forfatterne har erklært ingen interessekonflikter

Innledning <. br>

Magekreft kreft~~POS=HEADCOMP (GC) er den hyppigst forekommende kreft over hele verden blant menn med 640556 og kvinner med 349,042 nye tilfeller og 738,069 dødsfall i 2008 [1]. I betraktning av den terapeutiske effektivitet, kan kirurgisk fjerning være primær kurativ behandling for tidligere stadium av GC pasienter [2]. Dessverre er de fleste magekreftpasienter påvist i avansert stadium, i løpet av hvilken periode svulsten er opererbar lenger. Videre er tilbakefall etter kirurgi annen forferdelig hendelse for en dårlig 5-års overlevelse. Med tanke på pasienter med avansert eller residiverende magekreft, er det ingen tvil om at oppdagelsen av biomarkører og deres søknad sammen med tradisjonell diagnose kan være en verdifull indikasjon og et omfattende hjelpe å formulere forebygging og behandling strategi.

mammalian target av rapamycin (mTOR) består av 2,549 aminosyrer arrangert i høyt konserverte domene [3]. Strukturelt inneholder mTOR et rapamycin-bindende domene i sin sentrale del og en kinase domene i C-enden [4]. Som en viktig del av PI3K /Akt /mTOR vei, er mTOR tett relevant for kapital cellulære prosesser som cellevekst, proliferasjon, metabolisme, migrasjon, angiogenese, og apoptose [5] - [7]. Inntil nå, mTOR
produkter er bekymret som to forskjellige komplekser (dvs. mTORC1 og mTORC2) med forskjellig følsomhet [8], [9]. mTORC1 er et rapamycin-sensitiv kompleks som inkluderer mTOR pluss FK506-bindende protein 12 kDa (FKBP12), pattedyr LST8 (mLST8), og regulatoriske-assosiert protein av mTOR (raptor). I kontrast, mTORC2 består med SIN1, mLST8, og rapamycin-insensitive følgesvenn av mTOR (rictor) [10] - [12]. Feilregulering av mTOR
vises ofte i ulike typer kreft i løpet av kreftutvikling og forverring. Men årsakene til dette avvikende fenomen fortsatt mett debatter.

En rekke studier har undersøkt hvilken rolle enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) i mTOR
genet i etiologien av kreft i ulike organer, inkludert spiserørskreft [13], lungekreft [14], blærekreft [15], tykktarmskreft, endetarmskreft [16], og akutt lymfatisk leukemi [17]. De fleste av disse SNPs finne i eksoner eller introner med ukjente funksjonelle effekter. Nylig har et økende antall studier fokusert på SNP'er sitteplasser i gen-promotor-regionen, som er viste seg å påvirke bindingsevnen med noen transkripsjonelle faktorer (TFS) og slag følgende gentranskripsjon. I denne studien har vi en hypotese om at mTOR
rs2295080 T > G polymorfisme i promoter regionen kan påvirke mottakelighet for GC. For å teste denne hypotesen, genotypet vi hyppigheten av mTOR
rs2295080 å teste sin betydning på GC risiko i vår pågående, sykehusbasert, case-kontrollstudie i en kinesisk befolkning. Derfor, vi har oppdaget at mTOR
mRNA nivåer med ulike genotyper i vev av magekreftpasienter. Videre preges vi videre funksjonaliteten til denne genetiske varianten på mTOR
promoter transkripsjon av luciferase assay og EMSA.

Materialer og metoder

forsøkspersonene

Denne studien omfattet 753 pasienter med histologisk bekreftet adenokarsinom i ventrikkel og 854 kreftfrie kontroller. Alle pasienter ble rekruttert fra Kreft Clinical Research Base av Nanjing Medical University mellom mars 2006 og januar 2010. Og alle demografiske og kliniske opplysninger, inkludert alder, kjønn, tumorstørrelse, tumorlokalisering, histologiske typer, dybden av invasjonen, lymfeknutemetastaser, fjernmetastaser, og TNM stadium, ble oppnådd ved hjelp av et kort spørreskjema og klinisk medisinske poster.

frekvens~~POS=TRUNC-matchet kontroller i disse tilfellene etter alder (± 5 år) og kjønn var samlet på samme periode og regioner urelatert genetiske forhold med magesykdom og fordøyelsessystemet svulster. Hver deltaker inngått en skriftlig informert samtykke og donert 5 ml venøs blod for genomisk DNA-ekstraksjon. Forskningen protokollen ble godkjent av Institutional Review Board of Nanjing Medical University.

DNA Extraction og SNP genotyping

Genomisk DNA ble ekstrahert fra blodprøver som beskrevet tidligere [18]. Genotyping ble fullført av TaqMan SNP genotyping analysen ved hjelp av ABI 7900HT real-time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) og sekvens Detection System versjon 2.4 (SDS 2.4). Sekvensene av primere og prober var tilgjengelig på forespørsel, og kontroller ble inneholdt for hver plate for å sikre nøyaktigheten av genotyping. Den genotyping Analysen ble utført av to personer uavhengig av hverandre i en blind mote. Mer enn 10% av prøvene ble tilfeldig valgt for bekreftelse, og resultatene var 100% konkordant. Primere og prober ble oppført i tabell S1.

Cell Kultur og bygging av arrangøren Reporter Plasmider

En normal mageslimhinnen epitel cellelinje (GES-1) og tre forskjellige mage kreft cellelinjer (BGC -823, MGC-803, og SGC-7901) ble vedtatt i denne studien. Alle celler ble dyrket i Dulbeccos modifiserte Egale middels /høy glukose kulturmedium med 10% FBS, 10 mM HEPES, 2 mM L-glutamin, 1 mM pyruvat-natrium, 100 U /ml penicillin og 100 ug /ml streptomycin ved 37 ° C i en fuktig atmosfære inneholdende 95% luft og 5% CO _{2. De fleste av reagenser ble oppnådd fra GIBCO (Burlington, Ontario, Canada)}

I luciferase reporter plasmider, det humane mTOR
promotersekvenser med forskjellige alleler for rs2295080 T >. G polymorfisme ble syntetisert og konstruert inn pGL3-basic vektor (Promega, Madison, WI, USA) ved Generay Company (Shanghai, Kina). Alle plasmider ble bekreftet ved DNA-sekvensering. Primere involvert i testen var oppført i Tabell S2.

Transient Transfeksjon og Luciferase Assay

GES-1, BGC-823, MGC-803, og SGC-7901 celler ble transfektert med Lipofectamine 2000 (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) med 0,8 ug av hver enkelt konstruerte vektor, enten med T-allel eller med G-allelen. Samtidig, 10 ng PRL-SV40 per brønn ble også transfektert som en intern kontroll for å korrigere transfeksjonseffektivitet. Før det ble cellene sådd ut på 24-brønners plater over natten for å sikre at 90% -95% konfluens på tidspunktet for transfeksjon. Tjuefire timer etter transfeksjon, ble luciferase-aktivitet målt ved hjelp av Dual-luciferase reporter Assay System (Promega, Madison, WI, USA) og uttrykt som forholdet mellom ildflueluciferase til Renilla luciferase-aktivitet. Alle celler ble utført i tre eksemplarer med de samme betingelsene

Elektro Mobility Skift Assay (EMSA)

Følelsen probe sekvenser var som følger: rs2295080 T sonde, 5'-AGGGTTCCCATCCCTGAGGAC-3. '; rs2295080 G sonde, 5'-AGGGTTCCCAGCCCTGAGGAC-3 '. Atom proteiner ble ekstrahert med NE-PERTM Kjerne- og cytoplasmatiske Utvinning reagenser (Pierce, Rock-ford, IL, USA). DNA-prober ble utarbeidet med Biotin 3'-End DNA Merking Kit (Pierce, Rock-ford, IL, USA). Elektroforetiske mobilitet shift analyse (EMSA) ble utført med en LightShift Chemiluminescent EMSA Kit (Pierce, Rock-ford, IL, USA). Bindingsreaksjoner ble utført som følger: nukleære ekstrakter (8 ug protein), og 1 x bindingsbuffer med 2,5% glycerol, 5 mM MgCl _{2, 50 ng /ul poly (di-dC), 0,05% NP-40, og 20 fmol biotinmerkede rs2295080 T /G rs2295080 prober ble inkubert på is i 30 minutter i et volum på 20 ul. For konkurrerende studier ble det nukleære ekstrakter inkubert med ikke-merket oligonukleotid i 30 minutter før tilsetningen av merket oligonukleotid.}

ekspresjonsnivåer av mTOR
mRNA.

Total RNA fra 60 gastrisk kreft vev, inkludert i 753 tilfeller, med ulike genotyper ble hentet ved hjelp Trizol Reagens (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA). MRNA ble målt ved hjelp av kvantitativ real-time PCR (ABI 7300) etter revers transkripsjon. GAPDH ble anvendt som en intern kvantitativ kontroll for hver prøve. Primerne anvendt for mTOR forsterkning var F: 5'-TTGCTTGAGGTGCTACTG-3 'og R: 5'-CTGACTTGACTTGGATTCTG-3'; primerne for GAPDH var F: 5'-AAGGTGAAGGTCGGAGTCAAC-3 'og R: 5'-GGGGTCATTGATGGCAACAATA-3'. Relativ kvantifisering av mTOR
mRNA ble beregnet ved hjelp av to-ΔΔCt metoden. Brett endringer ble normalisert i forhold til GAPDH, og hver analyse ble gjort i tre eksemplarer.

Statistisk analyse.

Hardy-Weinberg likevekt (HWE) ble evaluert av chi-square egnethetstest å sammenligne de observerte genotypefrekvensene med forventet blant kontrollene. Assosiasjoner mellom genotyper og risikoen for magekreft ble estimert ved å beregne odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (CIS) fra logistiske regresjonsanalyser med justering for alder og kjønn. Tosidige χ ^{2 tester av statistisk signifikans ble utført ved hjelp av SAS programvare (versjon 9.1.3, SAS Institute, Inc., Cary, NC, USA) og P
< 0,05 ble ansett som statistisk betydning.}

Resultater

kjennetegn på forsøkspersonene

de valgte egenskapene til disse sakene og kontroller er oppsummert i Tabell 1. sakene og kontroller syntes å være tilstrekkelig matches på alder ( P
= 0,424) og kjønn ( P
= 0,406). Blant de 753 tilfellene svulst områder inkludert 295 Cardia kreft (39,2%) og 458 ikke-Cardia kreft (60,8%). Pasienter med diffuse type (437, 58,0%) viste en noe høyere andel enn intestinal type (316, 42,0%). Basert på TNM klassifisering av det amerikanske Joint Committee on Cancer (AJCC stadieinndeling manuell, 6 ^{th edition) [19], 17,3%, 17,3%, 50,6% og 14,8% av pasientene hadde T1, T2, T3, og T4, respektivt. I mellomtiden, 60,6% av pasientene positivt lymfeknutemetastase og 13,0% eksisterte fjern metastase. Ifølge disse kliniske karakteristika, ble alle pasienter endelig identifisert å stadium I, II, III og IV med 26,8%, 21,9%, 35,3% og 16,0%, respektivt.}

de samlede virkninger av rs2295080 Polymorfisme på Fare for GC

genotypen distribusjoner og allelfrekvenser av rs2295080 er presentert i tabell 2. genotypefrekvensene i kontrollene var enige med HWE modellen ( P
= 0,569). Som vist i tabell 2, genotypefrekvensene av rs2295080 var 64,0%, 32,7% og 3,3% for de TT, TG, og GG genotyper blant tilfeller, og 58,2%, 35,7% og 6,1% blant kontrollene, respektivt. Forskjellen mellom de tilfeller og kontrollene var statistisk signifikant ( P =
0,008). Også G allelfrekvens var signifikant lavere blant tilfeller enn kontrollene (19,7% versus 23,9%, P
= 0,003). I tillegg er den kombinerte TG /GG genotype frekvensen var lavere hos tilfeller enn kontrollene (36,0% mot 41,8%, P
= 0,016). Når man tar TT genotype som referanse, har vi funnet at variant genotyper (TG og GG) ble forbundet med en redusert risiko for GC på en dose-respons måte sammenlignet med TT genotype (justert OR = 0,83, 95% CI = 0,67 til 1,02 for TG, og 0,49, 0,30 til 0,80 for GG; P
_{trend = 0,003). Tilsvarende har vi også observert at de forenede TG /GG genotyper forbundet med en statistisk signifikant lavere følsomhet for Gc sammenlignet med TT genotype (0,78, 0,64 til 0,96). Samlet utgjør disse dataene antydet at mTOR
rs2295080 G allel kan være en antatt beskyttende allel.}

Hanner ble mer utsatt for magekreft med rs2295080 Polymorphism

Som det er veletablert, alder og kjønn var viktige faktorer i tumorkreft inkludert magekreft. Ifølge lagdel analyse med alder og kjønn faktorer, fant vi at signifikant sammenheng ble observert i mannlig gruppe, snarere enn i kvinnegruppen (tabell 3). Hos menn bærer rs2295080 G allel var en betydelig redusert risikofaktor (OR = 0,72, 95% CI = 0,56 til 0,93 for TG /GG versus TT), som sammenligner med bære T-allelet. Men det var ingen statistisk forskjell mellom unge og gamle fag.

Den Stratifisert analyse av sammenhengen mellom rs2295080 Polymorphism og kliniske variabler av magekreft

Vi har gjennomført lagdel analyse av rs2295080 polymorfisme i alle fag ved kliniske funksjoner i GC. Blant alle uavhengige variabler, ble den beskyttende effekten hovedsakelig observert i undergrupper av pasienter med Cardia magekreft (OR = 0,68, 95% CI = 0,52 til 0,91), intestinal type (0,73, 0,56 til 0,96), T3 dybde invasjon (0,78, 0,60 -1,00), positiv lymfeknutemetastase (0,79, 0,62 til 1,00), negativ fjernmetastaser (0,76, 0,62 til 0,94), og lokalisert trinn (0,76, 0,59 til 0,98) (tabell 4).

Effekt av rs2295080 polymorphism på transkripsjonen aktivitet

for å få et innblikk i den biologiske funksjonelle effekten av rs2295080 polymorfisme på mTOR
transkripsjon, GES-en, BGC823, MGC803 og SGC-7901 celler ble transfektert med forskjellig luciferase rapport plasmider, inkludert villtype (T-allelet) og mutere type (G-allelet). Som vist på fig. 1A, fant vi at transkripsjon aktiviteten til T-allelet var høyere enn G-allelet med en ca 1,5 ganger i over fire cellelinjer, noe som tyder på at rs2295080 G allel jobbet som forsvarer for magekreft ved å redusere transkripsjon av mTOR
.

Nuclear proteinbinding aktivitet av varianter i rs2295080

Deretter utførte vi en EMSA eksperiment for å analysere de biologiske konsekvensene av rs2295050 polymorfisme i SGC-7901 celler. En sterk band (protein kompleks) ble flyttet da atom ekstrakter ble inkubert med biotin-merket rs2295080 T sonde, mens svakere bandet ble observert da atom ekstrakter ble inkubert med biotin-merket med rs2295080 G sonde. De forskjøvne bånd ble betydelig inhibert av et molart overskudd av et umerket rs2295080 T eller rs2295080 G konkurrent i en dose-avhengige måte (Fig. 1B). Resultatene indikerte at rs2295080 G allel kan redusere atom protein bindingsaktivitet til en viss grad.

Association mellom mTOR
rs2295080 Polymorphism og uttrykket nivåer av mTOR
mRNA

sekstitre mage kreft vev med ulike genotyper av mTOR
rs2295080 var tilgjengelig i vår nåværende studie. På grunn av den lave frekvens av GG genotype, vi tilsettes det til prøvene med TG genotype for analyse. Som vist på fig. 2, uttrykket nivåer av mTOR
mRNA var dramatisk høyere i personer med TT genotype enn hos dem med TG eller GG genotype (Mean ± SEM av TT versus TG /GG: 12,35 ± 1,51 versus 6,17 ± 1,32, P
= 0,004).

Diskusjoner

i denne studien, viste vi at G-allelet av mTOR
promoter polymorfi rs2295080 var assosiert med en betydelig redusert risiko for GC. Vi har funnet at T til G forandring i rs2295080 vesentlig endret transkripsjonen aktivitet av mTOR
genet via påvirker bindingen av en transkripsjonen faktor. Vi har også observert at mTOR
rs2295080 T allele var assosiert med høyere mTOR
mRNA uttrykk nivåer in vivo
.

mammalian target of rapamycin (mTOR) , også kjent som FRAP1, er en nødvendig medlem av PI3K /Akt /mTOR vei og sentralt til metabolsk signalering [20], [21]. Den kan aktiveres ved insulin, insulin-lignende vekstfaktorer og andre vekstfaktorer, og inaktivert i løpet av cellulær sult. mTOR finnes to forskjellige typer komplekse, oppkalt mTORC1 og mTORC2 henholdsvis [22]. Den mTORC1 kompleks phosphorylates sin nedstrøms effecter p70S6k, som kan forårsake nedbrytning av insulin reseptor substrat og ytterligere øke insulin-drevet Akt aktivitet. Den mTORC2 Komplekset fosforylerer den C-terminale ende av Akt ved ser473, noe som kan føre til at hele aktivering av Akt [9]. Som et terapeutisk mål i andre kreft [4], [8], [23] - [27], mTOR kan også dukket opp som et potensielt mål for behandling av magekreft, spontant. Sirolimus [28] og everolimus [29], mTOR-hemmere, ble identifisert til å resultere i G1 cellesyklus arrest og hemmet spredning av mage cellelinjer. Nylig har en ny potensiell mTOR
promoter polymorfi rs2295080 er blitt beskrevet i flere studier [30] - [32]. Men utilstrekkelige funksjonelle studier ble utført for å vurdere rollen til denne genetiske varianten i regulering av mTOR
uttrykk. I GC, våre funn gitt bevis for at rs2295080 T-allelet kan forbedre transkripsjon aktiviteten til mTOR
til en viss grad i GES-en cellelinje etter transfektert in vitro
. Og videre luciferase assay i tre magekreft cellelinjer (dvs. BGC-823, MGC-803, og SGC-7901) bekreftet ytterligere denne effekten av rs2295080 polymorfisme. Disse resultater i denne undersøkelsen var i overensstemmelse med resultatene i nyrecancercellelinje og livmorhals cancercellelinje [32]. I EMSA analysen ble rs2295080 spådd å finne på den potensielle bindingssetet, hvis polymorfe varianter kan påvirke rekrutt av transkripsjonsfaktorer (ved bruk av p-MATCH program, som bruker bindingsseter i TRANSFAC; www.gene-regulation.com). Tatt disse resultatene sammen, er det sannsynlig at mTOR
rs2295080 polymorfisme kan påvirke uttrykket nivået av mTOR Hotell og individuell mottakelighet for ulike kreftformer.

SNP rs2295080, samt som en annen intron SNP rs11121704, ble først rapportert av Hildebrandt et al.
å finne i mTOR
potensiell promoter-regionen [13]. Som beskrevet i spiserørskreft, rs2295080 virket ingen forening eller funksjon med overlevelse etter kjemoradioterapi og kirurgi. Men inntil nå, har flere studier identifisert effekten av denne polymorfisme i mTOR
for kreftrisiko [30] - [32], som alle regnes rs2295080 T allele som en risikofaktor. I denne studien sammenhengen mellom rs2295080 T-allel og GC risikoen var konsistent med resultatene fra tidligere tre studier [30] - [32]. I tillegg viser våre resultater også antydet at denne polymorfisme kan være en biologisk hunkjønn i utviklingen av GC. På grunn av ulike populasjoner og ulike mekanismer blant forekomst, utvikling og overlevelse, spekulerte vi etnisitet forskjeller og mekanistiske forskjeller kan forklare disse discordances.

En annen roman resultat kommer fra sammenhengen mellom kjønn og mTOR
rs2295080 polymorfisme i stratifisert analyse. Dette rs2295080 polymorfisme avslørt mer sterk betydning hos menn enn kvinner. I tillegg Hartgrink et al
. (2009) har rapportert forholdet mellom kvinner og menn er smittet av magekreft er ca 2:01 per år [33]. Ytterligere forklaring for tilkoblinger av disse resultatene må søkes, og forskjellige typer hormoner uttrykk hos menn og kvinner bli den beste behandling, rasjonelt. I en studie av brystkreft, Galoian et al.
Har gitt data som prolinerich polypeptid-en utøver antiproliferativ effekt via hemme mTOR kinase aktivitet i ER-negativ MDA-231, men det finnes ingen hemmende effekt i luminal T47 -D celle som utfører som en ER-positive cellelinje [34]. Men for studier av androgen, ble det antatt at androgen kan stimulere mTOR aktiviteten i PTEN-mangelprostatakreftceller. En fersk studie på androgen reseptor forbedret rolle androgen i opp regulerende mTORC2 aktivitet [35]. Det er sannsynlig at androgen, istedenfor østrogen, kan øke mTOR
uttrykk; androgen kan føre til den høye forekomsten av magekreft hos menn og den sterke betydningen av mTOR
rs2295080 i mannsgruppen i vår studie.

Noen begrensninger av vår nåværende studie bør påpekes som følger . Først rs2295080 var ikke den eneste polymorfisme betydelig eksisterende på mTOR
, og viktigheten av å kombinere SNPs ble neglisjert i vår studie. Andre, som avgjørende faktorer i magekreftutvikling, den mangler av Helicobacter pylori
informasjon, røyking informasjon og drikker informasjon var også mangelfull i vår studie, er det uheldig for oss for videre undersøkelser av effektene av denne polymorfisme. I tillegg, på grunn av den relative lite utvalg i vår studie, ingen signifikante resultater syntes å bli funnet særlig strata (alder undergrupper, kvinnelig undergruppe, og andre klinisk-patologisk undergrupper) av stratifisert analyser (Tabell S3 og S4). Videre større studie med mer informasjon var ventet å bekrefte våre funn.

I konklusjonen, vår studie opplyst mTOR
rs2295080 finne i promoter-regionen i mTOR
genet var signifikant assosiert med risiko for magekreft i en kinesisk befolkning.

Hjelpemiddel Informasjon
Tabell S1.
primere og prober som brukes for genotyping
doi:. 10,1371 /journal.pone.0060080.s001 plakater (DOC)
Tabell S2.
Primere for bygging av plasmider
Doi:. 10,1371 /journal.pone.0060080.s002 plakater (DOC)
tabell S3.
Interaksjon analyser av mTOR
rs2295080 polymorfisme og alder eller kjønn status på case-control studie
doi:. 10,1371 /journal.pone.0060080.s003 plakater (DOC)
Table S4.
Interaksjon analyser av mTOR
rs2295080 polymorfisme og alder /kjønn eller kliniske tegn på sak eneste studien
doi:. 10,1371 /journal.pone.0060080.s004 plakater (DOC)

takk

Vi vil gjerne takke Luo Y (Nanjing Røde Kors Blood Center), for hennes assistanse med funksjonelle eksperimenter.

• PLoS ONE: Sammenhengen mellom glutation S-transferase T1 Null Genotype og Gastric Cancer Risk: En meta-analyse av 48 studier
• PLoS ONE: Association blant Polymorfisme i EGFR Gene Eksoner, livsstil og risikoen for magekreft med Kjønnsforskjeller i kinesisk Han Temaer