Bakgrunn
enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) i matriksmetalloproteinase 1 (MMP-1) spiller viktige roller i visse typer kreft. Denne studien undersøkte sammenhengen mellom individuelle SNPs eller haplotyper i MMP-1 og mottakelighet, clinicopathological parametre og prognose av magekreft i et stort utvalg av Han befolkningen i det nordlige Kina.
I dette tilfellet kontrollert studie var det 404 pasienter med magekreft og 404 friske kontroller. Syv SNPs ble genotypet ved hjelp av MALDI-TOF MS system. Deretter ble SPSS programvare, Haploview 4.2 software, Haplo.states programvare og THEsias programvare som brukes til å estimere sammenhengen mellom individuelle SNPs eller haplotyper av MMP-1 og magekreft mottakelighet, progresjon og prognose.
Blant sju SNPs, var det ingen individuelle SNPs korrelert til magekreft risiko. Videre bare rs470206 genotype hadde en sammenheng med histologiske karakterer, og pasienter med GA /AA hadde vel celledifferensiering i forhold til pasienter med genotype GG (OR = 0,573; 95% CI: 0,353 til 0,929; p = 0,023). Deretter konstruerte vi en fire-markør haplotype blokk som inneholdt 4 vanlige haplotyper: TCCG, GCCG, TTCG og TTTA. Men alle fire vanlige haplotyper hadde ingen sammenheng med magekreft risiko, og vi fant ikke noen sammenheng mellom disse haplotyper og clinicopathological parametere i magekreft. Videre verken individuelle SNPs eller haplotyper hadde en tilknytning til overlevelse av pasienter med magekreft.
Denne studien evaluerte polymorfismer av MMP-1 genet i magekreft med en MALDI-TOF MS metode i et stort nord kinesisk case-kontrollerte kohort. Våre resultater indikerer at disse syv SNPs av MMP-en ikke kan være nyttig som viktige markører for å forutsi magekreft mottakelighet, progresjon eller prognose, i hvert fall i Han befolkningen i Nord-Kina
Citation. Song YX, Zhou X, Wang ZN, Gao P, Li AL, Liang JW, et al. (2012) Foreningen mellom Individuell SNPs eller haplotyper av matriksmetalloproteinase 1 og magekreft Følsomhet, progresjon og prognose. PLoS ONE 7 (5): e38002. doi: 10,1371 /journal.pone.0038002
Redaktør: Yury E. Khudyakov, Centers for Disease Control and Prevention, USA
mottatt: 30 januar 2012; Godkjent: 29 april 2012; Publisert: May 24, 2012