PLOS ONE: Assinaturas Gene-expressão pode Distinguir os tipos e estágios do câncer gástrico

Abstract

Foram analisados ​​dados de 54 cancro gástrico emparelhados e tecidos gástricos não cancerosas adjacentes Microarray da expressão gênica, com o objectivo de estabelecer as assinaturas genéticas para as classes de câncer (bem, moderately-, poorly- ou un- diferenciados) e as fases (I, II, III e IV), que foram determinados por patologistas. A análise estatística levou à identificação de um número de combinações de genes cujos padrões de expressão servir bem como assinaturas de diferentes tipos e diferentes fases do cancro gástrico. Uma assinatura de 19 genes foi encontrado para ter o poder discernir entre câncer gástrico de baixo grau de alta e, em geral, com precisão geral de classificação em 79,6%. Um painel de 198-gene expandida permite a estratificação dos cancros em quatro graus e controle, dando origem a um acordo de classificação global de 74,2% entre cada série designada pelos patologistas e nossa previsão. Duas assinaturas para estadiamento do câncer, que consistem em 10 genes e 9 genes, respectivamente, fornecer precisões alta classificação em 90,0% e 84,0%, entre, e controle do câncer precoce em estágio avançado. Funcional e via de análises sobre estes genes assinatura revelar a relevância significativa das assinaturas derivadas por grau e progressão do câncer. Para o melhor de nosso conhecimento, este representa o primeiro estudo sobre a identificação de genes cujos padrões de expressão podem servir como marcadores para os graus e estágios do câncer

Citation:. Cui J, Li F, Wang G, Fang X, Puett JD, Xu Y (2011) Assinaturas Gene-expressão pode Distinguir os tipos e estágios do câncer gástrico. PLoS ONE 6 (3): e17819. doi: 10.1371 /journal.pone.0017819

editor: Amanda Toland, Ohio State University Medical Center, Estados Unidos da América

Recebido: 24 de novembro de 2010; Aceito: 09 de fevereiro de 2011; Publicado: 18 Março 2011

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