O estudo descreve a base de dados inicial do microbioma intestinal saudável e o perfil de abundância

Um banco de dados inicial do microbioma intestinal saudável e um perfil de abundância são descritos em um estudo publicado em 11 de setembro, 2019 no jornal de acesso aberto PLOS ONE por Charles Hadley King do George Washington University Medical Center, EUA, e colegas.

Gráfico de barras empilhadas da composição filogenética de todos os táxons do microbioma neste estudo colapsados ​​no nível dos filos nas amostras fecais. As barras verdes representam Firmicutes e as azuis representam Bacteroidetes, as duas famílias de bactérias mais abundantes. Para fins estéticos, as amostras (n =98, inferior) foram classificados de acordo com sua composição de Bacteroidetes e Firmicutes para demonstrar como os resultados do microbioma intestinal da linha de base deste estudo podem ser usados ​​em conjunto com os resultados de estudos anteriores. Crédito:King et al, 2019

Embora o interesse da pesquisa sobre a importância do microbioma intestinal humano para a saúde geral continue a crescer, atualmente não há uma lista de referência abrangente do microbioma intestinal disponível para pesquisadores e pacientes. Neste estudo, King e seus colegas começam a catalogar a composição orgânica de microbiomas intestinais humanos saudáveis, e desenvolveu um modelo de relatório de protótipo para os médicos transmitirem os resultados aos pacientes.

Para compilar seu banco de dados, os autores sequenciaram geneticamente 48 amostras fecais de dezesseis participantes saudáveis ​​recrutados do campus da George Washington University em Washington, D.C., além de usar 50 amostras metagenômicas fecais baixadas do Human Microbiome Project de indivíduos selecionados como “saudáveis”.

Depois de analisar as sequências genômicas e metagenômicas de todas as amostras usando um novo fluxo de trabalho baseado em software, King e colegas compilaram um banco de dados inicial de micróbios confirmados e sua abundância relativa em todas as amostras, o GutFeelingKB, usando informações genéticas abrangentes e publicamente disponíveis do NCBI para fornecer metadados sobre os organismos descritos.

O GutFeelingKB descreve 157 organismos (155 bactérias e dois organismos archaeal) em 60 gêneros distintos. O maior filo de bactérias representado foi Firmicutes (40 por cento de todos os organismos na lista), que por sua vez era composta de 20 por cento de Clostridia, 19 por cento Bacterioidia, 17 por cento de Bifidobacteriales, 14 por cento Enterobacterales, e 14 por cento de bactérias Lactobacillales - classes de bactérias também encontradas em iogurtes e outros alimentos probióticos. Os autores também observam que 84 organismos eram comuns a todas as amostras, potencialmente indicando que essas podem ser espécies essenciais para o intestino humano.

Este estudo recrutou apenas dezesseis participantes, uma pequena amostra. Mas embora mais estudos possam continuar a identificar organismos adicionais presentes em intestinos saudáveis ​​de todo o mundo, GutFeelingKB é um primeiro passo importante. O banco de dados pode atuar como um ponto de partida para a análise comparativa de amostras e o desenvolvimento de futuros tratamentos de microbioma de pacientes.

Os autores acrescentam:

Nosso objetivo é mapear o microbioma intestinal saudável para que nós e outros pesquisadores possamos usar nossos dados para desenvolver modelos de previsão específicos para doenças. "

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