Stomach Health > Желудок Здоровье >  > Gastric Cancer > Рак желудка

PLoS ONE: Влияние XPD /ERCC2 полиморфизмов на желудочную риска развития рака среди различных этнических групп: систематический обзор и мета-Analysis

Абстрактный

Фон
<р> Потенциал ксеродермией пигментная группа D (XPD) , называемый также ремонт иссечение кросс-бесплатный группа двух (ERCC2), Lys751Gln и Asp312Asn полиморфизмы были вовлечены в риск развития рака желудка среди различных этнических групп.

Методы
<р> Мы стремились исследовать влияние XPD Lys751Gln и Asp312Asn полиморфизмов на восприимчивость к рака желудка среди различных этнических групп на основе систематического обзора и мета-анализа. Каждый изначально включены статьи был забит для оценки качества. Желательные данные были извлечены и зарегистрированы в базы данных. 13 исследований были в конечном счете, имеют право на мета-анализа Lys751Gln полиморфизма и 9 исследований для мета-анализа Asp312Asn полиморфизма. Мы приняли наиболее вероятно, соответствующая генетическая модель (рецессивный модель) для обоих Lys751Gln и Asp312Asn полиморфизмов. Потенциальные источники неоднородности были разыскал по подгруппе и анализ чувствительности, и смещает публикации были оценены.

Результаты
<р> Статистически значимые результаты были, по-видимому было отмечено в азиатов, но не у европеоидов как для XPD Lys751Gln и XPD Asp312Asn полиморфизмы. Статистически значимая находка может рассматриваться при раке желудка некардиальной типа для XPD Lys751Gln полиморфизма. Статистически значимая находка может также рассматриваться в подгруппе высокого качества, малого и умеренной размер выборки подгруппы, статьи, опубликованные после 2007 года, или ПЦР-ПДРФ генотипирование подгруппа для XPD Asp312Asn полиморфизма.

Выводы
<р> Наша мета-анализ показывает, что XPD Gln751Gln (CC) генотип и Asn312Asn (АА) генотип может показаться более восприимчивы к действию желудочного рака в азиатских популяциях, но не в кавказских популяциях, что свидетельствует о том, что два генотипы могут быть важными биомаркеры желудка восприимчивости рака для азиатских популяций, предположение о том, что должно быть дополнительно подтверждено в хорошо спланированные исследования среди различных этнических групп. Gln751Gln (CC) генотипа также может быть связано с риском развития рака желудка некардиальной типа, которые также должны быть подтверждены среди различных этнических групп в будущем
<р> Цитирование:. Сюэ H, Lu Y, B Лин, Чэнь J, Тан F, G Huang (2012) Влияние XPD /ERCC2 полиморфизмов на желудочную риска развития рака среди различных этнических групп: систематический обзор и мета-анализ. PLoS ONE 7 (9): e43431. DOI: 10.1371 /journal.pone.0043431
<р> Редактор: Руи Medeiros, IPO, Inst Порт Oncology, Португалия
<р> Поступило: 5 апреля 2012 года; Принято: 20 июля 2012 года; Опубликовано: 13 сентября 2012
<р> Copyright: © Xue и др. Это статья с открытым доступом распространяется в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution, которая позволяет неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии, что оригинальный автор и источник кредитуются

Финансирование:. Эта работа было поддержано Национальным фондом естественных наук Китая (гранты 30830038, 30970842 и 81071180); "973" Project (2012CB932604); Проект New Drug Discovery (2012ZX09506-001-005); Ключевым проектом науки и техники комиссии муниципалитета Шанхая (гранты 10JC1410000); и Shanghai Ведущее академической дисциплины проекта (грант S30203). Доноры не играет никакой роли в дизайн исследования, сбора и анализа данных, решение о публикации или подготовки рукописи
<р> Конкурирующие интересы:.. Авторы заявили, что не существует никаких конкурирующих интересов

Введение
<р> Хотя во всем мире заболеваемость раком желудка уменьшилась, его смертность по-прежнему занимает второе место [1]. В Китае, рак желудка даже является одним из самых смертоносных злокачественных опухолей [2]. Как широко известно, инфекционные, пищевые, экологические и генетические факторы участвуют в желудочном канцерогенезе, но те, подвержены факторам риска, которые в конечном итоге развивается рак желудка включает незначительная часть [3], предполагая, что хост-генетическую предрасположенность играет важную роль в желудочном риск развития рака среди различных этнических групп. Такие различные восприимчивости можно объяснить, в частности, с помощью единичных нуклеотидных полиморфизмов (SNP) восприимчивых генов среди различных этнических групп [4], [5]. Наши ранее опубликованных работ мета-анализа предоставили дополнительные доказательства для таких этнически восприимчивых различий [5], [6].
<Р> Широко признано, что ДНК должна оставаться стабильной, чтобы выполнять свои важные физиологические функции, но он настойчиво уязвимы для различных эндогенных и /или экзогенных повреждений и, таким образом, ее вероятные мутации может накапливаться и может произойти канцерогенез из-за поврежденной ДНК. ДНК ремонт системы, тем не менее, играет жизненно важную роль в поддержании функции нормальных клеток и целостность генома путем инверсии поврежденной ДНК [7]. Наследственные функциональных полиморфизмов или накопившиеся мутации генов репарации ДНК могут влиять на способность хозяина для восстановления поврежденной ДНК и таким образом модулировать риск развития рака [8]. ОНП генов репарации ДНК общей были идентифицированы [9] и показано, быть связаны с спорадических канцерогенеза [10], [11].
<Р> Нуклеотидная иссечение ремонт (NER), один из главных путей репарации ДНК в организме человека , способен удалять спиралей искажающих базовые повреждения, полученные с помощью ультрафиолетового света (УФ) и множество химических агентов [12]. XPD, как полагают, участвуют в раскручивания ДНК во время NER и транскрипции, поскольку он обладает одноцепочечной ДНК-зависимой АТФазы и 5'-3 ДНК геликазы деятельности »[13], [14]. XPD (ERCC2) ген, расположенный на хромосоме 19q13.3, состоит из 23 экзонов и его полиморфизмы, как полагают, порождают структурные изменения Ниров пути и восприимчивости рака влияние. Наиболее широко исследованы XPD полиморфизм в ассоциациях с восприимчивостью рака включают несинонимичными A &° С замену в экзоне 23 вызывает лизина (Lys) в глутамин (GLN) замещения в кодоне 751 (Lys751Gln, rs1052559), A несинонимичными G > Замещение в экзоне 10 приводит к аспарагиновой кислоты (Asp) на аспарагин (Asn) замещения в кодоне 312 (Asp312Asn, rs1799793) и синонимично C > замещение в экзоне 6 при сохранении аргинина (R) остаток в кодоне 156 (Arg156Arg, rs238406) [15].
<р> в 2005 году Хуан WY и др.
опубликовал первое исследование, участвующих в XPD Lys751Gln полиморфизма в отношении риска развития рака желудка [16]. С тех пор исследователи сообщали ассоциации XPD Lys751Gln, Asp312Asn и /или Arg156Arg с предрасположенностью к раку желудка среди различных этнических групп, но со смешанными или противоречивыми результатами [17] - [30]. Существует только одна была опубликована статья относительно Arg156Arg полиморфизм в связи с риском развития рака желудка [28]. На сегодняшний день существует три соответствующих опубликованных работ мета-анализ с упором на XPD полиморфизмов [31] - [33]. Две статьи в основном были связаны с общей восприимчивостью рака желудка, а не восприимчивость рака в глубину [31], [32], тем самым обеспечивая меньший объем информации о его связи с риском развития рака желудка. Что еще более важно, эти три мета-анализа [31] - [33] все они не смогли принять наиболее вероятный соответствующая генетическая модель, и, таким образом, подлинные значения этих статистических результатов может быть нарушена
<р> Таким образом, цель. наш мета-анализ должен был исследовать, используя наиболее подходящую генетическую модель, эффект XPD полиморфизмов на риск развития рака желудка среди различных этнических групп и определить возможные источники гетерогенности среди подходящих исследований.

материалы и методы <бр>

Стратегия поиска
<р> систематический поиск литературы был проведен для статей относительно XPD /ERCC2 ОНП, связанные с риском развития рака желудка. MEDLINE, базы данных EMBASE, Китайская Национальная инфраструктура знаний (CNKI), Web-математических наук, и базы данных BIOSIS одновременно использовались с комбинацией терминов, "репарации ДНК" "ERCC2" "XPD", "НЭК", "Lys751Gln", "Asp312Asn", или "Arg156Arg"; "ген"; "Полиморфизм", "вариант", или "SNP"; и "рак желудка", "рак желудка", или "рак желудка" до декабря 2011 года Поиск проводился без каких-либо ограничений на языке. Объем компьютеризированного поиска литературы была расширена в соответствии с эталонными списки отобранных статей. Соответствующие оригинальные статьи также искали вручную.

Исследование Выбор
<р> Исследования относительно ассоциации XPD /ERCC2 полиморфизмов (Lys751Gln, Asp312Asn и /или Arg156Arg) с риском развития рака желудка были включены, если были выполнены следующие условия: (I) любое исследование описано объединение, по меньшей мере, одного из XPD /ERCC2 полиморфизмов с раком желудка; (II) любое исследование показало число обоих управлений и желудка случаев рака; (III) результаты были выражены как отношение шансов (OR) с 95% доверительный интервал (ДИ); и (IV) исследования были случай-контроль или вложенными из них случай-контроль.

методологические оценки качества

Для того, чтобы определить исследования высокого качества, мы в основном приняты заранее определенные критерии для оценки качества первоначально предложенный Thakkinstian и др
[34], адаптированный Камарго и др
[35], и уточнена Сюэ и др
[5] -... [7]. Критерии (показано в таблице S1 онлайн) покрывают достоверность контроля, репрезентативности случаев, консолидация рака желудка, генотипирования экспертизы и оценки ассоциации. Методологического качества независимо друг от друга оценивали двумя исследователями (Lin B и Lu Y). Разногласия были урегулированы путем обсуждения. Результаты варьировались от самого низкого нуля до самого высокого десять. Статьи со счетом ниже 6,5, считались «низким или умеренной качества" из них, в то время как те не ниже 6,5 не было рассматривать как "высокое качество" из них.

Извлечение данных
<р> следующие данные из каждой статьи были извлечены: авторы, год издания, страны, этнической принадлежности участников (классифицированных как кавказцы, азиаты и т.д.), дизайн исследования, источник управления, контроля количества и случаев, метод генотипирования, распределение возраста и пол, классификация Лорен (кишечная, диффузный, или смешанная), анатомическое классификация (кардиального или не кардии рака), курение привычки, пить привычки и хеликобактер пилори
инфекции статус.
<р> данные были извлечены и зарегистрированы в двух базах данных независимо двумя исследователями (Lin B и Лу Y), которые были слепы к именам журналов, учреждений или грантов фонда. Любое несоответствие между этими двумя следователями был решен следователем (Xue H), который участвовал в обсуждении с ними и сделал окончательное решение.

Статистический анализ
<р> Все статистические анализы были проведены с использованием STATA статистическое программное обеспечение (версия 10.1, STATA Corp, College Station, TX). Двустороннее Ps &лт; 0,05 считались статистически значимыми. Харди-Вайнберга (HWE) в контрольной группе рассчитывали снова в нашем мета-анализе. Хи-квадрат критерий согласия был использован для проверки отклонения от HWE (значимо на уровне 0,05).
<Р> Отношения шансов (OR) и 95% доверительный интервал (ДИ 95%) были использованы для оценки силы ассоциации между XPD /ERCC2 полиморфизмов и риском развития рака желудка. ИЛИ <суб> 1, OR <суб> 2, и OR <суб> 3 были рассчитаны для генотипами СС против АА, СА по сравнению с АА и CC по сравнению с СА для XPD Lys751Gln полиморфизма; АА по сравнению с GG, GA по сравнению с GG, и АА против ГА для XPD Asp312Asn полиморфизма; АА по сравнению с CC, CA по сравнению с CC, и АА против СА для XPD Arg156Arg полиморфизма, соответственно. Попарные различия были использованы для определения наиболее подходящей генетической модели. Если OR <суб> 1 = OR <суб> 3 ≠ 1 и OR <суб> 2 = 1, рецессивный Предложена модель. Если OR <суб> 1 = OR <суб> 2 ≠ 1 и OR <суб> 3 = 1, доминирующей моделью подразумевается. Если OR <суб> 2 = 1 /OR <суб> 3 ≠ 1 и OR <суб> 1 = 1, полная overdominant Предложена модель. Если OR <суб> 1 > OR <суб> 2 > 1 и OR <суб> 1 > OR <суб> 3 > 1 или OR <суб> 1 &л; OR <суб> 2 &л; 1 и OR <суб> 1 &л; ИЛИ <суб> 3 &л; 1, модель кодоминантного указывается [34]. Возьмите XPD Lys751Gln полиморфизм в качестве примера для иллюстрации. Если доминирующая модель была указана, оригинальная группировка рухнула, и новая группа носителей C (CC плюс CA) сравнивали с генотипом АА; если рецессивный модель была предложена, СС, сравнивали с группой АА плюс СА; если полная overdominant модель подразумевалось, группа CC плюс АА сравнивали с СА; или если модель кодоминантного была намекали, CC сравнивали с CA и AA соответственно.
<р> Q статистики была использована для оценки гетерогенности в различных исследованиях, включенных в мета-анализ. I-квадрат ( Я
2) значение, представляющее изменение ИЛИ относящаяся к разнородности была затем использована для количественной оценки степени такого между исследованиями неоднородности [36]. Согласно недавно опубликованным критериям Венеции [37], " Я
2 &л; 25% не представляет гетерогенность, Я
2 = 25-50% представляет умеренную гетерогенность, Я
2 = 50-75% представляет собой большую разнородность, и Я
2 > 75% представляет собой крайнюю неоднородность ". Между исследованиями дисперсия тау-квадрат (τ 2) значение также используется для оценки между исследованиями дисперсии. Модель с фиксированными эффектами, используя метод Mantel-Haenszel (М-Н), была использована для расчета объединенных ОШ, когда гомогенность существовала на основе Q-тест р значение не меньше, чем отличие 0.1.By, модель со случайными эффектами, используя DerSimonian и метод Laird (D + L), был использован, если была гетерогенность на основе Q-тест р значение менее 0,1. Даже для однородности среди исследований, также был использован метод D + L. Мета-регрессионный анализ и анализ подгрупп были использованы для изучения и контроля потенциальных источников гетерогенности в различных исследованиях. Значимость объединенных ORs тестировали Z тест (P < 0,05 рассматривалось как значимое)
<р> был проведен анализ чувствительности, в котором оценки мета-анализа были вычислены после того, как каждый из исследования опущены в каждом повороте <.. BR>

Наконец, систематической ошибки оценивали путем выполнения воронкообразные участков качественно, и по оценкам Бегг-х и испытания Egger в количественном отношении.

Результаты

Литература Поиск и исследование Выбор
<р> После всестороннего поиска, были получены в общей сложности 140 статей на английском и 7 по-китайски. В нашем мета-анализе первоначально были включены в целом 15 исследований [16] - [30], которые соответствовали критериям включения. Эти 15 исследований были предварительно соответствующие мета-анализ ассоциаций с раком желудка в отношении XPD ОНП, среди которых 13 исследований, посвященных XPD Lys751Gln полиморфизм [16] - [26], [28], [29], 9 исследований, посвященных XPD Asp312Asn полиморфизм [17] - [21], [23], [27], [28], [30], и только 1 исследование касалось XPD Arg156Arg полиморфизма [28]. 1 статья [23] была проиндексирована на английском и китайском поисковых системах

Традиционно говоря, любое исследование, которое отклонилась от HWE должны были быть удалены. Тем не менее, Минелли С и др. недавно отметил, что исследования, которые, как представляется, отклоняются от HWE должны быть исследованы в дальнейшем, а не просто исключены, если нет других оснований сомневаться качество исследования [38]. На сегодняшний день, это все еще не доказан, должна ли быть включены или исключены при проведении мета-анализа исследований отклонялись от HWE. В нашем мета-анализе, 3 исследования касались XPD Lys751Gln полиморфизм [16], [25], [29] были отклонилась от HWE, и 3 исследований, посвященных XPD Asp312Asn полиморфизм [17], [27], [30] были также отклонилась от HWE; Однако, учитывая, что число участников этих исследований были большими и, учитывая, что анализ чувствительности будет проводиться, мы, наконец, остались те исследования в нашем мета-анализе
<р> Таким образом, 13 исследований [16] - [26]. , [28], [29] в общей сложности 6344 контрольных и 2750 случаев для XPD Lys751Gln полиморфизм и 9 исследований [17] - [21], [23], [27], [28], [30] с 3429 контроля и 1715 случаев для XPD Asp312Asn полиморфизма были в конечном счете, имеют право на мета-анализа XPD полиморфизм. Соответствующие характеристики были замечены в таблице 1 и таблице 2. Технологическая схема поиска литературы и исследования отбора была освещена на рисунке 1.

Общий Мета-анализ, мета-регрессионный анализ и анализ Подгруппа
<р> Для XPD Lys751Gln полиморфизма или <югу> 1 (р значение) или <югу> 2 (р значение) и OR <югу> 3 (р значение) были 1,22 (р = 0,266), 1.11 (р = 0,369) и 1,02 (р = 0,811), соответственно, вряд ли намекал конкретной модели эффект мнимого восприимчивого C аллеля. Неоднородность хи-квадрат был 29,83 (радиопеленгование = 12), значение р было 0,003, а Я
2 была 59,8%. После того, как мета-регрессионного анализа с использованием одного ковариата (этнос, состоящий из кавказцев, азиатов, или турецкое население), р значения коэффициента величины т для азиатов, кавказцев или турецкое население было 0,001, 0,139 и 0,585, соответственно; сильно указывая, что азиаты сингл ковариатой может в основном являются источником гетерогенности в различных исследованиях. τ 2 для азиатов, кавказцев или турецкого населения одного ковариата были 0, 0,09178 и 0,1347 соответственно. Для азиатов одного ковариата, τ 2 снизилась с 0.1233 до 0, что указывает на азиатов одного ковариата может составить 100% от источника гетерогенности в различных исследованиях. При стратификации по анализу этнической подгруппы, или <югу> 1 (р значение) или <югу> 2 (р значение) и OR <югу> 3 (р значение) среди азиатского населения составляли 2,63 (р = 0,002), 1.14 ( р = 0,653), и 1,51 (р = 0,034), соответственно, в высшей степени указывает на рецессивный модели эффект мнимого восприимчивого C аллеля (ИЛИ <суб> 1 = ИЛИ <суб> 3 ≠ 1 и ИЛИ <суб> 2 = 1).
<р> Для XPD Asp312Asn полиморфизма или <югу> 1 (р значение) или <югу> 2 (р значение) и OR <югу> 3 (р) значения были 1,75 (р = 0,015), 1,15 (р = 0,549), и 1,47 (р = 0,003), соответственно, высоко указывая рецессивный модель эффект мнимого восприимчивого аллеля (ИЛИ <суб> 1 = ИЛИ <суб> 3 ≠ 1 и ИЛИ <суб> 2 = 1) , Неоднородность хи-квадрат был 9,91 (радиопеленгование = 8), значение р было 0,272, и Я
2 составила 19,2%, что указывает на отсутствие гетерогенности в различных исследованиях. После того, как мета-регрессионного анализа с использованием одного ковариата (этнос, состоящий из кавказцев или азиатов), с величиной значения коэффициента т для этнической одного ковариата был 0,277, что указывает на этническую принадлежность может представлять собой один из источников мало гетерогенности в различных исследованиях. τ 2 снизилась с 0.0354 до 0.02075, что указывает на этническую принадлежность может составить 41,4% от источника мало неоднородности в разных исследованиях. Аналогичным образом, когда расслаивается на основе анализа этнической подгруппы, или <югу> 1 (р значение) или <суб> 2 (р значение) и OR <суб> 3 (р значение) среди населения Азии было 2,10 (р = 0,026), 1,22 (р = 0,574), и 1,80 (р = 0,008), соответственно, что говорит о том рецессивный модель эффект мнимого восприимчивого аллеля (ИЛИ <суб> 1 = ИЛИ <суб> 3 ≠ 1 и ИЛИ <суб> 2 = 1 ).
<р> Взятые вместе, рецессивный генетическая модель была в конечном счете выбран для обоих XPD Lys751Gln и XPD Asp312Asn полиморфизмов в нашем мета-анализе.

В нашем мета-анализе, имеющиеся данные были разделены, в свете этнических участников, в кавказцев, азиатов и турецкого населения. На рисунке 2, статистически значимые результаты были отмечены в азиатов, но не у европеоидов или турецкого населения (как XPD Lys751Gln и XPD Asp312Asn полиморфизм). Обобщенные ОШ (95% ДИ, значение р) были 2.41 (1.69-3.43, р = 0,000), 0.98 (0.82-1.17, р = 0,803) и 0,97 (0.33-2.82, р = 0,954) в азиатов, кавказцев, и турецкое население (XPD Lys751Gln полиморфизм в части а) или 1,77 (1.19-2.63, р = 0,005) и 1,31 (0.86-1.99, р = 0,211) в азиатов и кавказцев (XPD Asp312Asn полиморфизма в части B), соответственно. Что касается XPD Lys751Gln полиморфизма значений P гетерогенности Q-статистики в кавказцев, азиатов и турецкого населения были 0,802, 0,701 и 0,045; Я
2 были 0,0%, 0,0% и 75,1%; и τ 2 были 0,0000, 0,0000 и 0,4489, соответственно, не демонстрируя не гетерогенность в пределах кавказцев или азиатов, но крайняя разнородность населения Турции (показано в таблице 3). Что касается XPD Asp312Asn полиморфизма, значения P гетерогенности Q-статистики в кавказцев и азиатов были 0,180 и 0,470; Я
2 были 41,6% и 0,0%; 2 были 0,0587 и 0,0000, соответственно, не демонстрируя не гетерогенность в пределах азиатов, но умеренную гетерогенность в пределах кавказцев (показанные в таблице 4).

Как показано в таблице 3 и таблице 4, конкретные данные для XPD Lys751Gln и XPD Asp312Asn полиморфизмы расслаивается, соответственно, на основании размера выборки, на две подгруппы: большой выборки (общее количество проверок и дел не менее 500), а также малого и средней степени тяжести образца (общее число проверок и дел менее 500) подгрупп. Нет статистически значимая находка не было отмечено ни в малой и умеренной выборки подгруппы или большого образца партнера для XPD Lys751Gln полиморфизма, учитывая, что объединенные ОШ (95% ДИ, значение р) были 0.96 (0.61-1.51, р = 0,858) для бывший и 1.17 (0.84-1.64, р = 0,351) для последнего, соответственно; Однако статистически значимое открытие было отмечено в малой и средней степени тяжести образца подгруппы, но не в большом образце аналога для Asp312Asn полиморфизма, учитывая, что объединенные ОШ (95% ДИ, значение р) были 1.74 (1.18-2.56, р = 0,005) для бывший и 1.35 (0.82-2.21, р = 0,239) для последнего, соответственно.
<р> данные были также расслаиваются, в соответствии с баллами оценки качества, в высококачественные (баллы не менее 6,5) и с низким и умеренной качества (баллы меньше, чем 6.5) подгрупп. Что касается XPD Lys751Gln полиморфизма, статистически достоверных вывод был свидетелем либо подгруппе высокого качества или низкой и средней степени качества коллегой, учитывая, что объединенные ОШ (95% ДИ, значение р) было 1.20 (0.91-1.60, р = 0,199) для первого и 0,61 (0.34-1.11, р = 0,104) для последнего. Когда этническая принадлежность к югу от стратификация была выполнена для высокого качества подгруппы, статистически значимая находка была значительно, по-видимому был свидетелем среди азиатов, но статистически значимого находка не было отмечено среди кавказцев, так как Отстоявшийся ОШ (95% ДИ, значение р) были 2.54 (1.77-3.65, р = 0,000) для первого и 0,98 (0.82-1.17, р = 0,803) для последнего, соответственно. Что касается Asp312Asn полиморфизма, статистически значимая находка была свидетелем в подгруппе высокого качества, но не в низкой и средней степени качества коллегой, учитывая, что объединенные ОШ (95% ДИ, значение р) были 1.56 (1.05-2.33, р = 0,028) для первого и 1,42 (0.85-2.40, р = 0,184) для последнего. Точно так же, когда этническая принадлежность к югу от стратификация была выполнена для высокого качества подгруппы, статистически значимая находка была значительно, по-видимому был свидетелем среди азиатов, но статистически значимого находка не было отмечено среди кавказцев, так как Отстоявшийся ОШ (95% ДИ, значение р) были 2.37 (1.29- 4,36, р = 0,005) для первого и 1,31 (0.86-1.99, р = 0,211) для последнего, соответственно.
<р> данные были дополнительно расслаиваются, в соответствии со временем публикации, в подгруппе более ранней публикации ( статьи, опубликованные до или в 2007 году) и последующей публикации подгруппы (статьи, опубликованные после 2007 года). Что касается XPD Lys751Gln полиморфизма, статистически значимых выводов не было обнаружено на том основании, что объединенные ОШ (95% ДИ, р) были значение 0.89 (0.66-1.19, р = 0,428) в первом случае и 1,23 (0.84-1.81, р = 0,285) в последнем, соответственно. Что касается Asp312Asn полиморфизма, статистически значимое открытие было отмечено в более поздней публикации подгруппы, но не в более ранней публикации подгруппы на том основании, что объединенные ОШ (95% ДИ, р) были значение 1.46 (1.02-2.09, р = 0,041) в бывший и 1.61 (0.89-2.92, р = 0,115) во втором, соответственно.
<р> Когда рак желудка был классифицирован в не-кардии (или дистальной) и кардии подтипов, статистически значимая находка была обнаружена среди неправительственных организаций -cardia типа, но не входит в число типа кардиального для XPD Lys751Gln полиморфизма на том основании, что объединенные ОШ (95% ДИ, значение р) были 2.03 (1.16-3.54, р = 0,013) среди типа не-кардии и 0.88 (0.66-1.18, р = 0,403) среди типа кардии. Что касается Asp312Asn полиморфизма, не наблюдалось статистически значимое нахождение среди типа кардии на том основании, что общее ОШ (95% ДИ, значение р) составило 0.89 (0.56-1.43, р = 0,642), но OR (95% ДИ, значение р ) относительно типа не-кардии не может быть рассчитан, потому что только в одном исследовании [21] четко упоминается число генотипов типа не-кардии.
<р> с точки зрения патологии, рак желудка может быть классифицирована на кишечную, диффузный, или смешанный подтипы, но только 1 исследование [19] четко рассмотрены и упомянуты числа генотипов диффузного рака подтипа; Таким образом, патологический подтип расслоение не могло быть сделано в нашем мета-анализе.
<р> вмешивающиеся факторы, такие как хеликобактер пилори
инфекции или статус курения не могут быть проанализированы в нашем мета-анализе, поскольку необходимые соответствующие данные по крайней мере, два исследования не могут быть доступны в нашем мета-анализе.
<р> И когда рассматривались методы генотипирования, отсутствие статистически значимая находка была отмечена в каждой технике генотипирование подгруппы для XPD Lys751Gln полиморфизма, поскольку объединяли ОШ (95% ДИ, значение р) были 0.94 (0.68-1.29, р = 0,701) и 1,67 (0.68-4.14, р = 0,265) в ПДРФ и TagMan подгрупп соответственно; Однако статистически значимое открытие было отмечено в ПДРФ генотипирование подгруппе, но не в подгруппе прямого секвенирования для Asp312Asn полиморфизма, поскольку объединенные ОШ (95% ДИ, р объема) были 1.90 (1.09-3.31, р = 0,023) и 1,24 (0.70-2.20, р = 0,450), соответственно.

Анализ чувствительности

Мета-анализы проводились неоднократно, когда каждое конкретное исследование было удалено. Результаты показали, что оценки случайных эффектов до и после удаления каждого исследования были сходными в целом, что предполагает умеренно высокую стабильность результатов мета-анализа. Для XPD Lys751Gln полиморфизма, как показано на рисунке 3 части А, самое оказание влияния на одно исследование на общих объединенных оценок, казалось, исследование, проведенное Long XD и др. [25], сопадающе отклонилась от HWE, анализа чувствительности, однако, показали умеренно высокую стабильность результатов, полученных фактов, что ОШ (95% ДИ, значение р) были 1.12 (0.85-1.48, р = 0,410) перед удалением этого исследования и 0.98 (0.83-1.15, р = 0,781) после удаления этого исследования. С учетом исследования [16], проведенное Huang WY и соавт. которая отклонилась от HWE ОШ (95% ДИ, значение р) было 1.12 (0.85-1.48, р = 0,410) перед удалением этого исследования и 1.17 (0.87-1.58, р = 0,309) после удаления этого исследования для всей этнической принадлежности, что указывает на высокую стабильность результатов. Аналогичным образом, после удаления исследуемой [29], проведенное Engin AB и др., Также отклонилась от Hwe, ИЛИ (95% ДИ р значение) стало 1,19 (0.91-1.57, р = 0,209) для всех этнической принадлежности, указывает на высокую стабильность результатов. Если все три отклонилась-HWE исследования [16], [25], [29] были удалены, OR (95% CI, значение р) стала 1.06 (0.88-1.28, р = 0,555) для всех этнического происхождения, что указывает на умеренно высокая стабильность результатов (The иллюстрирующими цифры были опущены из-за длины бумаги).
<р> для Asp312Asn полиморфизма, как показано на рисунке 3 части в, наиболее влияющие на одно исследование на общих объединенным оценкам, казалось, исследование, проведенное Chen Z и др. [28], анализ чувствительности, однако, показали умеренно высокую стабильность результатов, полученных фактов, что ОШ (95% ДИ, значение р) были 1.48 (1.12-1.97, р = 0,007) перед удалением этого исследования и 1,32 (1.04-1.70, р = 0.025) после удаления этого исследования. Если все три отклонилась-HWE исследования [17], [27], [30] были удалены, OR (95% CI, значение р) стала 1.56 (1.05-2.33, р = 0,028) для всех этнической принадлежности, а также с указанием умеренно высокая стабильность результатов (The иллюстрирующими цифры были опущены из-за длины бумаги).

Кумулятивный мета-анализ
<р> Совокупные мета-анализ XPD Lys751Gln полиморфизма ассоциации были проведены также среди азиатов и кавказцы через ассортимент времени публикации и общего количества размера выборки. Как показано на рисунке 4 части А, наклоны в сторону значимых ассоциаций для XPD Lys751Gln полиморфизма можно было увидеть среди азиатов. На рисунке 4 часть В наклонов в сторону нулевых ассоциаций для XPD Lys751Gln полиморфизма можно отметить среди кавказцев в хронологическом порядке. Подобные наклонности можно наблюдать за Asp312Asn полиморфизма среди различных групп населения этнической принадлежности (цифры не показаны).

Публикация Bias Анализ
<р> смещения Публикация была предварительно осмотрен воронкообразных участков качественно и оценивается Бегг-х и испытания Egger в количественном отношении , Для XPD Lys751Gln полиморфизма, его воронка участок (рис 5А) показал, что точки почти симметрично распределены, преимущественно в псевдо 95% предельных величин. Значения Р были 0,428 и 0,989 в тесте Begg и испытания Эггера, соответственно, не намекал никакой предвзятости публикации. Для Asp312Asn полиморфизма, его воронка участок (рис 5B) показал, что точки почти симметрично распределены, преимущественно в псевдо 95% предельных величин. Значения Р были 0,108 и 0,045 в тесте Begg и испытания Эггера, соответственно, вкрадчивый нет или мало смещения издание.

Обсуждение

В нашем мета-анализе статистически значимые результаты были, по-видимому было отмечено в азиатов, но не кавказцев как для XPD Lys751Gln и XPD Asp312Asn полиморфизмов. Кроме того, на основе результатов кумулятивных мета-анализов, наклоны в сторону значимых ассоциаций в азиатов как для XPD Lys751Gln и XPD Asp312Asn полиморфизмов можно было бы, очевидно, видели при сортировке по времени публикации и общего объема выборки. XPD Gln751Gln (CC) и Asn312Asn (AA) генотипы могут показаться более восприимчивы к раку желудка в азиатов. Наши мета-анализы показывают, что Gln751Gln (CC) и Asn312Asn (АА) генотипы могут быть важными биомаркеры желудка восприимчивости рака для азиатов, предположение о том, что должно быть дополнительно подтверждено в будущем хорошо спланированных исследований в азиатских популяциях. Кроме того, различные или даже противоречащие друг другу ассоциации риска, если да, то среди различных этнических групп должны быть дополнительно тщательно исследованы и вновь подтвердили в будущем.
<Р> Для XPD Asp312Asn SNP, хотя Я
2 ( %) было 19,2 и τ 2 была 0,0354, как показано в таблице 4, теоретически представляющие мало или вообще не гетерогенность; практически, после анализа этнической подгруппы, значения I
2 (%) и τ 2 стал 0,0 и 0,0000 для азиатов и 41,6 и 0.0587 для кавказцев, соответственно, что говорит о том, что, на самом деле , не гетерогенность не существовало среди азиатов исследований, а не среди кавказцев коллег. Учитывая это, мы считаем, что расслоение или анализ подгрупп по-прежнему необходимы в нашем мета-анализе.

Рак желудка

Other Languages