Ploche ONE: Vplyv XPD /ERCC2 polymorfizmy na žalúdočné riziko rakoviny u rôznych etník: výzva na systematickom preskúmaní a Meta-Analysis

abstraktné

Pozadie

Potenciál xeroderma pigmentosum skupina D (XPD) , tiež volal excízia oprava krížovej bezplatný skupina dva (ERCC2), Lys751Gln a Asp312Asn polymorfizmy boli zapletené v žalúdku riziko rakoviny u rôznych etník.

Metódy

Naším cieľom bolo preskúmať vplyv XPD Lys751Gln a Asp312Asn polymorfizmy na náchylnosť k rakovine žalúdka medzi rôznymi etnikami prostredníctvom systematického prehľadu a metaanalýzy. Každý spočiatku zahŕňali článok bol skóroval pre kvalitné zhodnotenie. Žiaduce údaje boli získané a zaregistrovaný do databáz. 13 štúdie boli nakoniec nárok na meta-analýzy Lys751Gln polymorfizmus a 9 štúdií meta-analýz Asp312Asn polymorfizmus. Prijali sme najpravdepodobnejší vhodný genetický model (recesívny model) pre obe Lys751Gln a Asp312Asn polymorfizmy. Potenciálne zdroje heterogenity boli vyhľadávané prostredníctvom podskupín a analýz citlivosti, a publikačné zaujatosti boli odhadnuté.

Výsledky

Štatisticky významné nálezy boli zrejme bolo uvedené v Aziatov, ale nie u belochov ako XPD Lys751Gln a XPD Asp312Asn polymorfizmy. Štatisticky významné zistenie by mohlo byť vidieť v noncardia typu rakoviny žalúdka pre XPD Lys751Gln polymorfizmus. Štatisticky významné zistenie by mohlo tiež byť videný vo vysokej kvalite podskupine, malé a stredne ťažkou veľkosť vzorky podskupina, články publikované po roku 2007, alebo PCR-RFLP Genotypizácia podskupina pre XPD Asp312Asn polymorfizmus.

Závery

Naše meta-analýzy vyplýva, že XPD Gln751Gln (CC), genotyp a Asn312Asn (AA), genotyp sa môže zdať, že je viac citlivý na žalúdočné rakoviny u ázijskej populácie, ale nie v kaukazskej populácii, čo naznačuje, že tieto dva genotypy môžu byť dôležitými biomarkery karcinómu žalúdka citlivosti pre ázijské populácie, predpoklad, že je potrebné ďalej potvrdené v dobre navrhnutých štúdií medzi rôznymi etnikami. Gln751Gln (CC), genotyp môže byť tiež spojená s noncardia typu riziko rakoviny žalúdka, ktorá by mala byť tiež potvrdená u rôznych etník v budúcnosti

Citácia :. Xue H, Lu Y, Lin B, Chen J, Tang F, G Huang (2012) Vplyv XPD /ERCC2 polymorfizmy o rakovina žalúdka rizík medzi rôznych etník: systematického prehľadu a metaanalýzy. PLoS ONE 7 (9): e43431. doi: 10,1371 /journal.pone.0043431

Editor: Rui Medeiros, IPO, Inst Port onkológie, Portugalsko

prijatá: 05.04.2012; Prijaté: 20.júla 2012; Uverejnené: 13. septembra 2012

Copyright: © Xue et al. Toto je článok o otvorený prístup distribuovaný pod podmienkami Creative Commons Attribution licencie, ktorá umožňuje neobmedzené použitie, distribúciu a reprodukciu v nejakom médiu, za predpokladu, že pôvodný autor a zdroj sú pripísané

Financovanie :. Toto dielo bol podporený Národnej prírodnej Science Foundation Číny (grantov 30830038, 30970842 a 81071180); "973" Project (2012CB932604); New Drug Discovery Project (2012ZX09506-001-005); Kľúčovým projektom pre vedu a technológiu komisia magistrátu Šanghaja (granty 10JC1410000); a Shanghai Leading akademická disciplína Project (grant S30203). Platcovia mal žiadnu úlohu v dizajne štúdie, zber a analýzu dát, rozhodnutie publikovať, alebo prípravu rukopisu

Konkurenčné záujmy: .. Autori vyhlásili, že žiadne konkurenčné záujmy neexistujú

Úvod

Hoci na celom svete žalúdka výskyt rakoviny znížila, jej mortalita naďalej zaujíma druhej [1]. V Číne, rakovina žalúdka, aj predstavuje jeden z najviac smrteľných malignít [2]. Ako je všeobecne známe, infekčné, diétne, životné prostredie a genetické faktory sa podieľajú na žalúdočné karcinogenéze, ale tí vystavená rizikovým faktorom, ktorí nakoniec vyvinie rakovina žalúdka tvorí menší podiel [3], čo naznačuje, že hostiteľskou genetickú náchylnosť hrá dôležitú úlohu pri žalúdočných riziko rakoviny medzi rôznymi etnikami. Tieto rôzne citlivosti, je možné vysvetliť sčasti jednonukleotidových polymorfizmov (Snps) vnímavých génov medzi rôznymi etnikami [4], [5]. Naše už skôr publikované meta-analýzy papiere poskytli ďalší dôkaz pre takéto etnicky citlivých rozdiely [5], [6].

Je všeobecne známe, že DNA musí zostať stabilné, aby plniť svoje kľúčové fyziologické funkcie, ale je to stále citlivejšie na pôsobenie rôznych endogénnych a /alebo exogénnym poškodenia a tým aj jej pravdepodobné mutácie by mohla hromadiť a môže dôjsť k karcinogenézy v dôsledku poškodenia DNA. Systém opravy DNA, ale hrá dôležitú úlohu v udržiavaní funkcie normálne bunky a integrity genómu prostredníctvom obrátenia poškodenej DNA [7]. Dedičné funkčných polymorfizmov alebo nahromadené mutácie génov, opravy DNA môže mať vplyv na hostiteľa schopnosť opraviť poškodenie DNA, a tak modulovať riziko rakoviny [8]. SNP génov opravy spoločné DNA boli [9], ktoré možno identifikovať a preukázať, že je spojené s sporadické karcinogenéze [10], [11].

nukleotidov excizní opravy (NER), jeden z hlavných opravy DNA dráh u ľudí , je schopný odstrániť skrutkovici, ktorá narúša základné lézie vytvorené ultrafialového svetla (UV) a rad chemických látok [12]. XPD Predpokladá sa, že podieľať sa na DNA odvíjanie počas NER a transkripcii, pretože to má Jednopramenné DNA závislé ATPázy a 5'-3 DNA helikázy činnosti "[13], [14]. XPD gén (ERCC2), ktorý sa nachádza na chromozóme 19q13.3, obsahuje 23 exónov a jeho polymorfizmy sa predpokladá, že vyvolávajú štrukturálne zmeny Ner dráhy a náchylnosti rakoviny vplyv. Najčastejšie skúmané XPD polymorfizmy v združeniach s citlivosťou rakoviny obsahujú nonsynonymous A > substitúcie C v exóne 23 spôsobuje lyzín (Lys) na glutamín (Gin) substitúciu v kodóne 751 (Lys751Gln, rs1052559), čo je nonsynonymous G > Substitúcia v exóne 10 vedie k kyseliny asparágovej (Asp), asparagín (Asn), substitúciu v kodóne 312 (Asp312Asn, rs1799793) a synonymické C > substitúcie v exóne 6, pri zachovaní arginín (R) zvyšok v kodóne 156 (Arg156Arg, rs238406) [15].

v roku 2005 Huang WY et al.
zverejnila prvé štúdie bolo zapojených v XPD Lys751Gln polymorfizmus vo vzťahu k žalúdočnej riziko rakoviny [16]. Od tej doby, výskumníci hlásili združenia XPD Lys751Gln, Asp312Asn, a /alebo Arg156Arg s náchylnosťou k rakovine žalúdka u rôznych etnických skupín, ale so zmiešanými alebo protichodným výsledkom [17] - [30]. Je tam len jeden publikovaný článok týkajúci sa Arg156Arg polymorfizmus v súvislosti s rizikom rakoviny žalúdka [28]. K dnešnému dňu, tam boli tri relevantné publikované meta-analýzu papiere so zameraním na XPD polymorfizmy [31] - [33]. Dva články sa týkali hlavne s celkovými vnímavosťou s nádorovým ochorením skôr ako rakovina žalúdka citlivosťou do hĺbky [31], [32], čím poskytuje menej informácií o jeho vzťahu s žalúdočnej riziko rakoviny. Ešte dôležitejšie je, tieto tri metaanalýzy [31] - [33] všetky neprijala najpravdepodobnejší vhodné genetický model, a mohla byť ohrozená tým aj pôvodné hodnoty týchto štatistických výsledkov

V súlade s tým, je cieľom. naše meta-analýzy bolo zistiť, za použitia najvhodnejšieho genetický model, vplyv XPD polymorfizmy na žalúdočné riziko rakoviny medzi rôznych etník a na identifikáciu možných zdrojov heterogenity medzi oprávnených štúdií.

materiály a metódy

vyhľadávanie Strategy

systematická rešerše bola vykonaná za články týkajúce sa XPD /ERCC2 SNP spojené s rizikom rakoviny žalúdka. Medline, databázy EMBASE, Chinese National znalosti infraštruktúry (CNKI), Web of Science a databáz BIOSIS boli súčasne používať s kombináciou termínov "XPD", "ERCC2", "opravy DNA", "NER", "Lys751Gln" "Asp312Asn", alebo "Arg156Arg"; "Gén"; "Polymorfizmus", "variant" alebo "SNP"; a "rakovina žalúdka", "karcinóm žalúdka", alebo "rakovina žalúdka" až do decembra 2011. prehliadka bola vykonaná bez akéhokoľvek obmedzenia na jazyku. Rozsah počítačového literárne rešerše bola rozšírená v súlade s referenčnými zoznamami načítaných článkov. Príslušné pôvodné články boli tiež snažil ručne.

Štúdium Selection

Štúdie týkajúce združenia XPD /ERCC2 SNP (Lys751Gln, Asp312Asn a /alebo Arg156Arg) s žalúdočnej riziko rakoviny boli zahrnuté v prípade, že boli splnené nasledujúce podmienky: (i) akékoľvek štúdie opísanej pridruženie najmenej jedného z XPD /ERCC2 SNP s karcinómu žalúdka; (Ii) akékoľvek štúdie uvádza počty oboch kontrol a prípadov rakoviny žalúdka; (Iii) výsledky boli vyjadrené ako pomer šancí (OR) s 95% intervalmi spoľahlivosti (CI); a (iv) štúdie boli case-control alebo vnorené tie case-control.

metodologické kvality posudku

Ak chcete zistiť vysoko kvalitné štúdie, sme prijali hlavne vopred stanovené kritériá kvality pre oceňovanie pôvodne navrhla Thakkinstian et al
[34], upravené Camargo et al
[35], a očistený Xue et al
[5] -... [7]. Kritériá (je vidieť v tabuľke S1 on-line) pokrývajú dôveryhodnosť kontrol, reprezentatívnosť prípadov, konsolidácia rakoviny žalúdka, genotypu vyšetrenie a posúdenie združenia. Metodická kvalita bola nezávisle hodnotí dva vyšetrovatelia (Lin B a Lu Y). Nezhody boli vyriešené diskusiu. Skóre bolo v rozsahu nula do najnižšieho najvyššej desať. Články s výsledkom nižším ako 6,5 boli považované za "low-or-stredne kvalitné" tých, zatiaľ čo tí nie nižšie ako 6,5 bola myšlienka ako "vysoko kvalitné" ones.

Data Extraction

nasledovné dáta z každého výrobku bolo vyťažených: autori, rok vydania, krajina, etnickej príslušnosti účastníkov (označovaná ako belochov, Ázijcov, atď), pracovňa dizajn, zdroj, počet kontrol a prípadov, spôsob stanovenia genotypu, distribúcia veku a pohlavia, Lauren klasifikácie (črevné, difúzna, alebo zmiešané), anatomická klasifikácia (kardio alebo non-kardio rakovina), fajčenie, pitie zvyk a Helicobacter pylori
zdravotný štatút.

Dáta sa vyťažilo a zaregistrovaný do dvoch databáz nezávisle na sebe dvaja vyšetrovatelia (Lin B a Lu Y), ktorí boli slepí k menám denníka, inštitúciám alebo grantov fondu. Akýkoľvek rozpor medzi týmito dvoma skúšajúcimi bol vyriešený skúšajúcim (Xue H), ktorí sa podieľali na diskusii s nimi a urobili konečné rozhodnutie.

Štatistická analýza

Všetky štatistické analýzy boli vykonané pomocou Stat štatistický software (verzia 10.1, štátom Corp, College Station, TX). Obojstranné Ps menšie ako 0,05 boli považované za štatisticky významné. Hardy-Weinberg rovnováha (HWE) pri kontrolách bola opäť vypočítala v našej meta-analýzy. Chi-kvadrát dobré zhody bol použitý na testovanie odchýlku od HWE (významné na hladine 0.05).

miery pravdepodobnosti (OR) a 95% intervaly spoľahlivosti (95% CI) boli použité pre posúdenie pevnosti asociácia medzi XPD /ERCC2 SNP a žalúdočných riziko rakoviny. OR _{1, OR 2, a OR 3 boli vypočítané pre genotypov CC proti AA, CA proti AA a CC oproti CA pre XPD Lys751Gln polymorfizmus; AA proti GG, GA proti GG a AA proti GA pre XPD Asp312Asn polymorfizmus; AA v porovnaní s CC, CA proti CC, a AA proti CA pre XPD Arg156Arg polymorfizmus, resp. Párového rozdiely boli použité na určenie najvhodnejšieho genetický model. Ak OR 1 = alebo 3 ≠ 1 a OR 2 = 1, recesívne model navrhol. Ak OR 1 = alebo 2 ≠ 1 a OR 3 = 1, dominantný model je samozrejmosťou. Ak OR 2 = 1 /OR 3 ≠ 1 a OR 1 = 1, je navrhnuté kompletná overdominant modelu. Ak OR 1 > OR 2 > 1 a OR 1 > OR 3 > 1 alebo OR 1 < OR 2 < 1 a OR 1 < OR 3 < 1, model kodominantní je indikovaná [34]. Sa XPD Lys751Gln polymorfizmus ako príklad pre ilustráciu to. Ak bola indikovaná dominantný model, pôvodná zoskupenia sa zrútil a nová skupina C nosičov (CC navyše CA) bola v porovnaní s AA genotypom; ak bolo navrhnuté recesívne model CC bol v porovnaní so skupinou AA navyše CA; ak bolo naznačené kompletné overdominant model, skupina CC a navyše AA bol porovnávaný s CA; alebo ak bol naznačil model kodominantní, CC bol porovnávaný s CA a s AA, resp.}

Q štatistika bola použitá na posúdenie heterogénnosť celej štúdie zahrnuté v meta-analýzy. I-kvadrát ( I
^{2) hodnota, ktorá predstavuje zmenu v OR pripísať heterogenity bol potom použitý pre kvantifikáciu stupňa takého medzi-štúdii heterogenity [36]. Podľa nedávno zverejnených kritérií Venice [37] ", I
2 < 25% nepredstavuje žiadnu heterogénnosť, I
2 = 25-50% predstavuje mierny heterogénnosť, aj
2 = 50-75% predstavuje veľkú heterogénnosť a aj
2 > 75% predstavuje extrémnu rôznorodosť ". Medzi priebehu štúdie variance Tau-kvadrát (τ 2) hodnota bola aj pri hodnotení medzi-štúdii rozptylu. Model s fixnými účinkami, metódou Mantel-Haenszel (M-H), bola použitá na výpočet združené najvzdialenejšie regióny pri homogenita existoval na základe p hodnoty Q-testu nie je menšia ako 0.1.By Naproti tomu náhodné-efekty model za použitia DerSimonian a spôsobu Laird (D + L), bol použitý v prípade, že sa vychádza z p heterogenita hodnoty Q-testu menší ako 0,1. Aj pre homogenitu medzi-štúdiách, bola tiež použitá metóda D + L. Meta-regresnej analýzy a analýzy podskupín boli použité k objavovaniu a kontrolovať potenciálne zdroje heterogénnosti naprieč štúdiami. Význam združených najvzdialenejších regiónov bola testovaná Z testu (P menšia ako 0,05 bola považovaná za významnú)}

analýza citlivosti bola vykonaná, v ktorom boli odhady Metaanalýza vypočítaná po každom jedna štúdia boli vynechané v každom kole <.. br>

Na záver publikácia zaujatosť bola hodnotená implementáciou časti cesty pozemky kvalitatívne a odhadujú Begg je a Egger testami kvantitatívne.

výsledky

literatúra vyhľadávanie a štúdium Selection

po úplnom hľadaní, boli získané celkom 140 článkov v angličtine a 7 v čínštine. V našej meta-analýzy boli spočiatku zahŕňali celkovo 15 štúdií [16] - [30], ktoré splnilo kritériá zaradenia. Tieto 15 štúdie boli predbežne vhodné meta-analýzy prepojení s rakovinou žalúdka, pokiaľ ide o XPD SNP, z ktorých 13 štúdie týka XPD Lys751Gln polymorfizmus [16] - predmetné [26], [28], [29], 9 štúdie XPD Asp312Asn polymorfizmus [17] - [21], [23], [27], [28], [30], a to iba jedna štúdia týka XPD Arg156Arg polymorfizmus [28]. 1 článok [23] bola indexovaná v angličtine a čínskych vyhľadávacích motorov

Tradične povedané, akákoľvek štúdia, ktorá sa odchýlila od HWE by mali byť odstránené .; Avšak, Minelli C et al. nedávno poukázal na to, že štúdie, ktoré sa objavujú odchýliť sa od HWE by mala ďalej skúmať, skôr než len vylúčené, pokiaľ existujú iné dôvody na pochybnosti o kvalitu štúdia [38]. K dnešnému dňu je stále nepresvedčivé, či štúdie sa odklonili od HWE by mali byť zahrnuté alebo vylúčené pri vykonávaní meta-analýzu. V našej meta-analýzu, predmetné 3 štúdie XPD Lys751Gln polymorfizmus [16], [25], [29] sa odchýlil od HWE a 3 štúdie týka XPD Asp312Asn polymorfizmus [17], [27], [30] boli tiež odchýlil od HWE; Avšak vzhľadom na to, že počet účastníkov v týchto štúdiách boli veľké a vzhľadom na to, že analýzy citlivosti by prebiehala, sme sa nakoniec zostal týchto štúdií v našej meta-analýzu

Tak, 13 štúdie [16] - [26]. , [28], [29] s celkom 6344 kontrol a 2750 prípadov za XPD Lys751Gln polymorfizmus a 9 štúdie [17] - [21], [23], [27], [28], [30] s 3429 ovládacie prvky a 1715 puzdra pre XPD Asp312Asn polymorfizmus boli nakoniec nárok na meta-analýzy XPD polymorfizmy. Zodpovedajúce charakteristiky boli vidieť v tabuľke 1 a tabuľke 2. vývojový diagram rešerše a štúdie výberu bola osvetlená na obrázku 1.

Celkovo Meta-analýza, Meta-regresnej analýzy a podskupina Analýzy

Pre XPD Lys751Gln polymorfizmus, alebo _{1 (p hodnoty), alebo 2 (p hodnota) a alebo 3 (p hodnoty) bol 1,22 (p = 0,266), 1,11 (p = 0,369) a 1,02 (p = 0,811), v danom poradí, sotva ohováračský konkrétny model účinku predpokladaného vnímavých alely C. Heterogenita chi-kvadrát bol 29,83 (d.f. = 12), p hodnota bola 0,003 a I
^{2 bola 59,8%. Po meta-regresnej analýzy pomocou jediného kovarianciou (rasa zloženú z belochov, Ázijcov, alebo turecké populácie), str hodnoty súčiniteľa t hodnota Ázijcov, belochov, alebo turecké populácie bol 0,001, 0,139 a 0,585, v danom poradí; silne naznačuje, že Aziati jediný kovariátov mohla väčšinou predstavovať zdroj heterogénnosti naprieč štúdiami. τ 2 pre Aziatov, belochov, alebo turecké populácia jediného kovariancie boli 0, 0,09178 a 0,1347, resp. Pre Ázijci jediné kovarianciou, τ 2 znížil z 0.1233 na 0, čo znamená, Ázijcov jediný kovarianciou mohol zodpovedať za 100% zdroja heterogenity v jednotlivých štúdiách. Pri rozdelení podľa analýzy etnika podskupín, alebo 1 (p hodnoty), alebo 2 (p hodnota) a alebo 3 (p hodnoty) u ázijskej populácie bol 2,63 (p = 0,002), 1.14 ( p = 0,653), a 1,51 (p = 0,034), v danom poradí, vysoko naznačuje recesívny modelový efekt domnelého ktoré pripadajú do úvahy alely C (OR 1 = OR 3 ≠ 1 a OR 2 = 1).}}

XPD Asp312Asn polymorfizmus, alebo _{1 (p hodnoty), alebo 2 (p hodnota) a alebo 3 (p hodnoty) bol 1,75 (p = 0,015), 1,15 (p = 0,549), a 1,47 (p = 0,003), v danom poradí, vysoko naznačuje recesívny modelový efekt domnelého ktoré pripadajú do úvahy a alely (OR 1 = OR 3 ≠ 1 a OR 2 = 1) , Heterogenita chi-kvadrát bol 9,91 (d.f. = 8), p hodnota bola 0,272 a I
^{2 bola 19,2%, čo znamená žiadnu heterogénnosť naprieč štúdiami. Po meta-regresnej analýzy pomocou jediného kovarianciou (rasa zloženú z belochov a Ázijcov), p hodnota koeficientu t hodnotou pre etnický pôvod jediného kovarianciou bol 0,277, čo naznačuje, že rasa by mohlo predstavovať jeden zo zdrojov, ktoré nemajú heterogénnosti naprieč štúdiami. τ 2 poklesol z 0,0354 až 0.02075, čo naznačuje, rasa by mohla byť zodpovedná za 41,4% zdroje malého heterogénnosti naprieč štúdiami. Podobne, keď rozdelené podľa analýzy etnika podskupín, alebo 1 (p hodnoty), alebo 2 (p hodnota) a alebo 3 (p hodnoty) u ázijskej populácie bol 2,10 (p = 0,026), 1,22 (p = 0,574), a 1,80 (p = 0,008), v danom poradí, čo ďalej naznačuje recesívny modelový efekt domnelého ktoré pripadajú do úvahy a alely (OR 1 = OR 3 ≠ 1 a OR 2 = 1 ).}}

Celkovo vzaté, recesívny genetická model bol nakoniec vybraný pre obe XPD Lys751Gln a XPD Asp312Asn polymorfizmy v našej meta-analýzu.

v našej meta-analýzu, dostupné údaje boli rozdelené, vo svetle etnických účastníkov, do belochov, Ázijcov a tureckej populácie. Na obrázku 2, štatisticky významné výsledky boli zaznamenané u Ázijcov, ale nie u belochov alebo tureckej populácie (ako XPD Lys751Gln a XPD Asp312Asn polymorfizmov). Zhromaždené NR (95% CI, hodnota p) bol 2,41 (1,69 - 3,43, p = 0,000), 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803) a 0,97 (0,33 - 2,82, p = 0,954) u Ázijcov, belochov, a turecké obyvateľstvo (XPD Lys751Gln polymorfizmus v časti a) alebo 1,77 (1,19 - 2,63, p = 0,005) a 1,31 (0,86 - 1,99, p = 0,211) u belochov a ázijského pôvodu (XPD Asp312Asn polymorfizmus v časti B), resp. Čo sa týka XPD Lys751Gln polymorfizmus, hodnoty P heterogenity Q-štatistiky u belochov, Ázijcov a tureckej populácie bol 0,802, 0,701 a 0,045; Aj
^{2 boli 0,0%, 0,0% a 75,1%; a τ 2 bolo 0,0000, 0,0000, 0,4489 a, v uvedenom poradí, čo dokazuje žiadnu nejednotnosť v belochov a Ázijcov, ale extrémna heterogenita v tureckej populácii (pozri tabuľku 3). Čo sa týka XPD Asp312Asn polymorfizmus, hodnoty P heterogenity Q-štatistiky u belochov a Ázijcov boli 0,180 a 0,470; Aj
2 bola 41,6% a 0,0%; andτ 2 boli 0,0587 a 0,0000, respektíve, čo ukazuje, žiadny nejednotnosť v Ázijcov, ale mierny nejednotnosť v belochov (uvedené v tabuľke 4).}

Ako je uvedené v tabuľke 3 a tabuľke 4, konkrétne údaje pre XPD Lys751Gln a XPD Asp312Asn polymorfizmy boli rozdelené, respektíve na základe veľkosti vzorky, na dve podskupiny: veľký vzorka (celkový počet kontrol a prípadov, nie menej ako 500) a malých a stredne ťažkej vzorka (celkový počet kontrol a prípadov menej ako 500) podskupiny. Žiadny štatisticky významný nález bol zaznamenaný v oboch malých a stredne ťažkou vzorky podskupiny alebo veľkom vzorke náprotivok XPD Lys751Gln polymorfizmus, vzhľadom k tomu, že zmesné najvzdialenejšie regióny (95% SNS, p hodnota) boli 0,96 (0,61 - 1,51, p = 0,858) pre bývalý a 1,17 (0,84 - 1,64, p = 0,351) u druhej, v uvedenom poradí; avšak štatisticky významný nález bol zaznamenaný v malých a stredne-vzorky podskupiny, ale nie vo veľkom vzorke náprotivok Asp312Asn polymorfizmus, vzhľadom k tomu, že zmesné najvzdialenejšie regióny (95% SNS, p hodnota) boli 1,74 (1,18 - 2,56, p = 0,005) po dobu bývalý a 1,35 (0,82 - 2,21, p = 0,239), pre druhé, resp.

údaje boli tiež rozvrstvené, v súlade s hodnotením skóre kvality, do vysoko kvalitné (skóre nie menej ako 6,5) a nízko a stredne ťažkej kvality (skóre menej ako 6,5) podskupín. Čo sa týka XPD Lys751Gln polymorfizmus, žiadny štatisticky významný nález bol svedkom buď vysoko kvalitné podskupiny alebo akostného náprotivok nízko a stredne ťažké, vzhľadom k tomu, že sa zlúčia najvzdialenejšie regióny (95% SNS, p hodnota) boli 1,20 (0,91 - 1,60, p = 0,199) v prvom prípade a 0,61 (0,34 - 1,11, p = 0,104) pre druhé. Keď bol etnika sub-stratifikácia vykonáva pre vysoko kvalitné podskupiny, štatisticky významný nález bol veľa zrejme svedkom medzi Ázijcov, ale žiadny štatisticky významný nález bol zaznamenaný u belochov, pretože zmesné najvzdialenejšie regióny (95% SNS, p hodnota) boli 2,54 (1,77-3,65, p = 0,000), v prvom prípade a 0,98 (0,82 - 1,17, p = 0,803), pre druhé, resp. Čo sa týka Asp312Asn polymorfizmus, štatisticky významný nález bol svedkom vo vysokej kvalite podskupine, ale nie v kvalite náprotivok nízko a stredne ťažké, vzhľadom k tomu, že zmesné najvzdialenejšie regióny (95% SNS, p hodnota) boli 1,56 (1,05 - 2,33, p = 0,028) v prvom prípade a 1,42 (0,85 - 2,40, p = 0,184) pre druhé. Podobne, keď bol etnický pôvod sub-stratifikácia vykonáva pre vysoko kvalitné podskupiny, štatisticky významný nález bol veľa zrejme svedkom medzi Ázijcov, ale žiadny štatisticky významný nález bol zaznamenaný u belochov, pretože zmesné najvzdialenejšie regióny (95% SNS, p hodnota) boli 2,37 (1.29- 4,36, p = 0,005) v prvom prípade a 1,31 (0,86 - 1,99, p = 0,211) u druhej, resp.

údaje boli dodatočne rozvrstvené, v súlade s dátumom uverejnenia, do skoršie zverejnenie podskupiny ( články publikované pred alebo v roku 2007) a neskôr publikácia podskupina (články publikované po roku 2007). Čo sa týka XPD Lys751Gln polymorfizmus, žiadny štatisticky významný nálezy z toho dôvodu, že zmesné najvzdialenejšie regióny (95% SNS, hodnota P) boli 0,89 (0,66 - 1,19, p = 0,428), v prvom prípade a 1,23 (0,84 - 1,81, p = 0,285), v druhom prípade uvedenom poradí. Čo sa týka Asp312Asn polymorfizmus, štatisticky významný nález bol zaznamenaný v neskoršej publikácii podskupiny, ale nie v skoršie zverejnenie podskupiny z toho dôvodu, že zmesné najvzdialenejšie regióny (95% SNS, hodnota P) boli 1,46 (2 /01-09 /2, p = 0,041) v bývalý a 1,61 (0,89 - 2,92, p = 0,115), v druhom prípade, v danom poradí.

Keď sa rakovina žalúdka rozdelené do non-kardio (alebo distálnej) a Cardia podtypy, bolo zistené štatisticky významné zistenie medzi non -cardia typ, ale nie medzi typom kardio pre XPD Lys751Gln polymorfizmus na základe toho, že zlúčených najvzdialenejších regiónov (95% CI, p hodnota) boli 2,03 (1,16 - 3,54, p = 0,013) pri type non-kardio a 0,88 (0,66 - 1,18, p = 0,403) pri type kardia. Čo sa týka Asp312Asn polymorfizmus, žiadny štatisticky významný nález nebol pozorovaný pri type kardia na základe toho, že zlúčených OR (95% CI, hodnota p) bol 0,89 (0,56 - 1,43, p = 0,642), ale OR (95% CI, hodnota p ) týkajúce sa typu non-kardio nedá vypočítať, pretože iba jedna štúdia [21] jasne povedané počty genotypov typu non-kardio.

Pokiaľ ide o patológiu, rakovina žalúdka by mohla byť zaradená do čriev, difúzna, alebo v zmesi podtypov, ale iba jedna štúdia [19] jasne zaoberal a uviedol počty genotypov difúzneho karcinómu podtypu; Takto patologický podtyp stratifikácie nemohlo byť vykonané v našej meta-analýzu.

Priťažujúce faktory, ako napríklad Helicobacter pylori
infekcie alebo štatút fajčenie nemohli byť analyzované v našej meta-analýzy, pretože sú nevyhnutné relevantných údajov aspoň dve štúdie nemohli byť prístupné v našej meta-analýzu.

Aj keď boli považované za Genotypizácia techniky, žiadny štatisticky významný nález bol zaznamenaný v každom genotype techniky podskupiny pre XPD Lys751Gln polymorfizmus, pretože spojí najvzdialenejšie regióny (95% CI, p hodnota) bola 0,94 (0,68 - 1,29, p = 0,701) a 1,67 (0,68 - 4,14, p = 0,265) v RFLP a TagMan podskupín, v uvedenom poradí; avšak štatisticky významný nález bol zaznamenaný v RFLP genotype podskupine, ale nie v priamej sekvenovanie podskupiny pre Asp312Asn polymorfizmus, pretože združené najvzdialenejšie regióny (95% SNS, p hodnota) bolo 1,90 (09.01.-31.03., p = 0,023) a 1,24 (0.70-2.20, p = 0,450), resp.

Analýza citlivosti

metaanalýzy boli opakovane poskytovať v prípade, že každý jednotlivý štúdie boli odstránené. Výsledky ukázali, že s náhodnými efektmi odhady pred a po vypustení každej štúdie boli podobné ako celok, čo svedčí o stredne vysokú stabilitu výsledkov meta-analýzy. Pre XPD Lys751Gln polymorfizmom, ako je znázornené na obrázku 3, časti A, z ktorých jeden ovplyvnenie štúdie o celkovom zmesnom odhadov sa zdalo, že je štúdia vykonaná Long XD et al. [25], zhodne odchýlil od HWE, analýzy citlivosti, však uviedli, stredne vysokú stabilitu výsledkov nastali skutočnosti, že najvzdialenejšie regióny (95% interval spoľahlivosti, hodnota p) bol 1,12 (0,85 - 1,48, p = 0,410) pred odstránením z tejto štúdie a 0,98 (0,83 - 1,15, p = 0,781), po odstránení tejto štúdie. S ohľadom na štúdiu [16] vykonaná Huang WY a kol. ktorý sa odchýlil od HWE, najvzdialenejšie regióny (95% interval spoľahlivosti, hodnota p) boli 1,12 (0,85 - 1,48, p = 0,410) pred odstránením tejto štúdie a 1,17 (0,87 - 1,58, p = 0,309) po odstránení tejto štúdie pre všetky etnické príslušnosti, čo ukazuje vysokú stabilitu výsledkov. Podobne, po odstránení štúdie [29] vykonaná Engin AB et al., Taktiež odchýlil od HWE, OR (95% CI, hodnota p) sa stala 1,19 (0,91 - 1,57, p = 0,209) pre všetky etnický pôvod, varuje pred vysokú stabilitu výsledkov. Ak sú všetky tri odchýlil-HWE štúdie [16], [25], [29] boli odstránené, OR (95% CI, hodnota p) sa stala 1,06 (0,88 - 1,28, p = 0,555) pre všetky etnického pôvodu, čo naznačuje, stredne vysoká stabilita výsledkov (The ilustrujúci údaje boli vynechané kvôli dĺžke papiera).

Asp312Asn polymorfizmom, ako je znázornené na obrázku 3, časti B, najviac ovplyvňuje jediná štúdie o celkových súhrnných odhadov zdalo sa, že štúdia vykonaná Chen Z et al. [28], analýzy citlivosti, však uviedli, stredne vysokú stabilitu výsledkov nastali skutočnosti, že najvzdialenejšie regióny (95% interval spoľahlivosti, hodnota p) bol 1,48 (1,12 - 1,97, p = 0,007) pred odstránením tejto štúdie a 1,32 (1,04 - 1,70, p = 0,025), po odstránení tejto štúdie. Ak sú všetky tri odchýlil-HWE štúdie [17], [27], [30] boli odstránené, OR (95% interval spoľahlivosti, hodnota p) sa stal 1,56 (1,05 - 2,33, p = 0,028) pre všetky etnický pôvod, a to aj s uvedením stredne vysoká stabilita výsledkov (The ilustrujúci údaje boli vynechané kvôli dĺžke papiera).

Kumulatívny Metaanalýza

Kumulatívny metaanalýzy XPD Lys751Gln polymorfizmu asociácie boli tiež vykonané u Ázijcov a belochov cez sortimentu čase publikácie a celkový počet veľkosti vzorky. Ako je znázornené na obrázku 4 časti A, so sklonmi k významným asociáciou pre XPD Lys751Gln polymorfizmus mohol byť videný u Ázijcov. Na obrázku by mohla byť poznamenané 4 časť B sklony voči null asociáciou pre XPD Lys751Gln polymorfizmus u belochov v chronologickom poradí. Podobné sklony by mohli byť pozorované u Asp312Asn polymorfizmus medzi rôznymi populáciami etnika (Čísla nie sú zobrazené).

Publikácie Bias Analýza

Publikácie zaujatosť bola predbežne skúmané lievika pozemkov kvalitatívne a odhadujú Begg je a testy Egger kvantitatívne , Pre XPD Lys751Gln polymorfizmus, jeho lievik plot (Obrázok 5A) ukázala, že bodky takmer symetricky distribuované, prevažne v pseudo 95% hranicou spoľahlivosti. Hodnoty P boli 0,428 a 0,989 v Begg teste a Egger testu, respektíve ohováračský zverejnený žiadny zaujatosť. Pre Asp312Asn polymorfizmus, jeho lievik plot (obrázok 5B) ukázala, že bodky takmer symetricky distribuované, prevažne v pseudo 95% hranicou spoľahlivosti. Hodnoty P boli 0,108 a 0,045 v Begg teste a Egger testu, respektíve ohováračský žiadny alebo malý publikácia zaujatosť.

Diskusia

V našej meta-analýzy boli štatisticky významné zistenie zrejme bolo uvedené v Ázijcov, ale nie je u belochov ako pre XPD Lys751Gln a XPD Asp312Asn polymorfizmy. Aj na základe zistení kumulatívnych metaanalýz so sklonmi k významným združenia v Ázijcov ako pre XPD Lys751Gln a XPD Asp312Asn polymorfizmy mohli byť samozrejme vidieť, keď sú radené podľa času zverejnenia a celkovej veľkosti vzorky. XPD Gln751Gln (CC) a Asn312Asn (AA) genotypy sa môže zdať byť náchylnejší k rakovine žalúdka v Ázijcov. Naše meta-analýzy naznačujú, že Gln751Gln (CC) a Asn312Asn (AA) genotypy môžu byť významnými biomarkerov rakoviny žalúdka citlivosti pre Ázijcov, predpoklad, že je potrebné ďalej potvrdený v ďalších dobre navrhnutých štúdií v ázijskej populácie. Tiež rôzne alebo dokonca v rozpore, je riziko združenia, a ak áno, u rôznych etník je potrebné ďalej starostlivo prešetrili a znovu potvrdená v budúcnosti.

XPD Asp312Asn SNP, hoci I
^{2 ( %) bola 19,2 a τ 2 bola 0,0354, ako je uvedené v tabuľke 4, teoreticky predstavuje malý alebo žiadny heterogénnosť; Prakticky, po analýze etnika podskupín, hodnoty I
2 (%) a τ 2 stala 0.0 a 0,0000 pre Aziatov a 41.6 a 0.0587 pre belochmi, v uvedenom poradí, čo ďalej naznačuje, že vlastne nie heterogenita existoval medzi Ázijcov štúdiami skôr než u belochov náprotivky. Vzhľadom k tomu si myslíme, že stratifikácia alebo podskupiny analýzy sú stále potrebné v našej meta-analýzy.}

• Ploche ONE: Prirodzená imunita a Non-Hodgkinov lymfóm (NHL) Súvisiace Gény vo vnorené case-control štúdie pre rakovina žalúdka Risk
• Ploche ONE: Odhalenie molekulárnej mechanizmus Žalúdočné Cancer Marker annexinu A4 v Cancer Cell proliferácie Použitie Exon Arrays