Stomach Health > žalúdok zdravie >  > Gastric Cancer > žalúdočné Cancer

Ploche ONE: Genetické Varianty receptor epidermálneho rastového faktora dráhy génov a riziko pažeráka Spinocelulárny karcinóm a rakoviny žalúdka v čínskej populácie

Abstract

receptor epidermálneho rastového faktora (EGFR), signálne dráhy reguluje bunkovú proliferáciu, diferenciáciu a prežitie, a je často ich poškodeniu v pažeráku a žalúdku rakoviny. Niekoľko štúdií komplexne skúmala súvislosť medzi zárodočnými genetických variantov v EGFR dráhy a nebezpečenstvo pažerákových a žalúdočných rakovín. Na základe štúdie genómu-široký združenia v Han čínskej populácie na báze sme skúmali 3443 SNP v 127 génov v EGFR dráhy pre 1942 pažerákových skvamóznych karcinómov (ESCCs), 1758 karcinómov žalúdka (GC) a 2111 kontrol. Analýzy SNP úrovni boli vykonané s použitím logistické regresné modely. sme použili adaptívne rank prístup skrátený produkt prevzorkovanie na báze určiť Generic a cesta na úrovni združenia. EGFR dráha bola významne spojená s rizikom GC ( P
= 2,16 × 10 -3). Gene-level analýzy bolo nájdených 10 génov, ktoré majú byť spojené s GC, vrátane Fyn
MAPK8
MAP2K4
GNAI3
MAP2K1
TLN1
PRLR
PLCG2
RPS6KB2 stroje a PIK3R3
( P
< 0,05). Pre ESCC sme nespozorovali významný vzťah dráhy úrovne ( P
= 0,72), ale gén úrovni analýzy navrhol spojenie medzi GNAI3
CHRNE
PAK4
Wasl stroje a Itch stroje a ESCC ( P Hotel < 0,05). Naše dáta naznačujú, pridružení medzi špecifických génov v EGFR signálnej dráhy a riziko GC a ESCC. Ďalšie štúdie sú oprávnené na overenie týchto združení a skúmať základné mechanizmy

Citácia :. Li W-Q, Hu N, Wang Z, Yu K, Su H, Wang L, et al. (2013) Genetické Varianty receptor epidermálneho rastového faktora dráhy gény a riziko pažeráka Spinocelulárny karcinóm a rakoviny žalúdka v čínskej populácie. PLoS ONE 8 (7): e68999. doi: 10,1371 /journal.pone.0068999

Editor: Valli De Re, Centro di riferimento Oncologico, IRCCS National Cancer Institute, Taliansko

prijatá: 24. marca 2013; Prijaté: 04.06.2013; Uverejnené: 18. júla 2013

Toto je článok o otvorený prístup, bez všetky autorské práva, a môže byť voľne reprodukovať, distribuovať, prenášať, úprave, postavený na, alebo inak používať ktokoľvek, pre akýkoľvek zákonný účel. Práca je sprístupnený v rámci public domain venovanie Creative Commons CC0

Financovanie :. Shanxi hornej časti zažívacieho Cancer Genetics Projekt bol podporený z National Cancer Institute (NCI) zmluvy NO2-SC-66211 s nemocnicou Shanxi Cancer a Institute. Výživa Intervenčné Skúšky boli podporené NCI zmluvy No1-SC-91030 a HHSN261200477001C s Cancer Institute čínskej akadémie lekárskych vied. Aktuálna analýza bola podporená intramurálním programu výskumu v National Institutes of Health (NIH), NCI a divízie Cancer Epidemiology a genetiky. Platcovia mal žiadnu úlohu v dizajne štúdie, zber a analýzu dát, rozhodnutie publikovať, alebo prípravu rukopisu

konkurenčnými záujmami :. Autori majú tieto záujmy. Carol Giffen a Xiaoqin Xiong sú zamestnaní Management Services information, Inc. Nie sú žiadne patenty, výrobky vo vývoji alebo výrobky predávané deklarovať. To však nič nemení priľnavosť jednotlivých autorov do všetkých politík ploche jeden na zdieľanie dát a materiálov, ako je podrobne uvedené v online príručke pre autorov.

Úvod

ERBBs alebo epidermálny rastový faktor receptorov (EGFRs ) patrí do receptorovej tyrozín kinázy (RTK) sú dôležité nadčeľade a signalizačné proteíny v normálnych fyziologických podmienok [1], [2]. Napríklad, ligand viazaný EGFRs sú regulátory progresie bunkového cyklu, proliferácia, prežitie, invázia a zhubných nádorov prispieva procesy [3], [4]. Nie je preto prekvapením, že členovia rodiny EGFR, najmä EGFR (známy tiež ako ErbB1 alebo HER1) a ErbB2 (HER2), sú zapojené do rozvoja radu ľudských nádorov a sú sledované ako terapeutické ciele [3], [4] , [5]. V súvislosti s pažeráka a rakovinou žalúdka, majú vyššie hladiny EGFR a ErbB2 v korelácii so zlou pažeráka a žalúdka prežitie rakoviny [4], [6], [7]. Terapia zamerané na rodinu EGFR bolo preukázané, že zlepšenie pažeráka a žalúdka, rakoviny prognózu [4]. Niektoré štúdie tiež odhalili somatické mutácie génov v rodine EGFR v pažeráku a žalúdku rakoviny [8], [9], [10], [11], [12]. Okrem toho bolo tiež zistené, rola pre signalizácie downstream rodiny EGFR, s molekulami zapojenými do MAPK /EKR aktivované v pažeráku a žalúdku rakoviny [13], [14], [15].

Vzhľadom na význam tejto dráhy, genetické variácie v EGFR signálnych proteínov by mohli korelovať s predispozíciou k pažerákových a žalúdočných rakovín. Avšak len málo štúdií skúmala úlohu zárodočnými jednonukleotidových polymorfizmy (Snps) v týchto druhov rakoviny. Týchto niekoľko predbežnej štúdie má iba obmedzený rozsah génov v tejto dráhe [16], [17], [18], [19], [20], [21], [22], [23]. Hoci SNP v tejto dráhe ešte nedosiahli genómu-široký význam v publikovaných štúdiách asociačných genómu-široký (GWAS) [24], [25], [26], [27], [28], [29], [30], [31], [32] také kritériá môžu byť príliš konzervatívny pre detekciu skromné ​​asociácie. Preto analýza cesta môže pomôcť identifikovať dôležité genetické vklady, ktorých jednotlivá efekt veľkosti môže byť príliš malý na to byť detekované za použitia kritérií GWAS významnosti [33], [34]. Na našich údajov GWAS v etnickými čínskymi subjekty založené [24], sme kompletne vyhodnotené asociácie medzi genetických variantov v EGFR dráhy a rizikom pažerákového karcinómu z dlaždicových buniek (ESCC) a rakovina žalúdka (GC) v 1942 prípadoch ESCC, 1758 prípadov GC ( 1126 prípadov rakoviny žalúdka kardia (GCA) a 632 žalúdočné noncardia rakoviny (GNCA)) a 2111 kontrol žijúci v Tchaj-chang oblasti Číny, čo je oblasť s vysokým rizikom ESCC a GC.

materiály a metódy

Ethics Prehlásenie

Shanxi horného gastrointestinálneho traktu (UGI) Cancer Genetics Project (Shanxi, zapísaná u ClinicalTrials.gov ako NCT00341276) získaný písomný informovaný súhlas od subjektov, aby sa zúčastnili materský štúdiu Shanxi a celkový GWAS (Súčasná štúdia) a celý postupy boli schválené Shanxi Hospital Cancer Institute a Institutional Review Board. Intervenčné Trials Linxian výživa (NIT, evidovaní na ClinicalTrials.gov ako NCT00342654) získaný písomný informovaný súhlas od subjektov, aby sa zúčastnili NIT nadradené štúdiu a celkové GWAS (aktuálne štúdie) a celý postup bol schválený Cancer Institute z čínskej akadémie Medical Sciences Institutional Review Board. NCI zvláštne štúdie Institutional Review Board schváli Shanxi a NIT rodičovských štúdie, rovnako ako celkový GWAS (aktuálne štúdie).

Štúdium Populácia

Účastníci štúdie boli zaradení z dvoch hornej časti gastrointestinálneho traktu ( projekty UGI rakovina) vykonávané v oblasti Tchaj-chang v Čína: Shanxi a NIT štúdie. Štúdia Shanxi sa začala v roku 1997 a mal case-control časť a od prípadu k prípadu, iba časť je. Do štúdie bolo zaradených novo diagnostikovaným, histologicky potvrdených ESCC a GC prípady, a v case-control časti tejto štúdie, vek (± 5 rokov) -, pohlavné a ovládacie prvky susedstve zhodou boli zaradení do 6 mesiacov od zistenia každého prípadu [35]. Vzorky krvi boli odoberané v zápise. K NIT sa začali v Linxian v roku 1985 a testovali vplyv rôznych vitamínov a minerálnych kombináciou užívať denne po dobu až šiestich rokov na výsledku pažeráka a žalúdka rakoviny [36]. Zhromaždili sme krv v rokoch 1999 a 2000, konkrétne k získaniu DNA z účastníkov NIT. Počas sledovania až do 31. decembra 2010, všetky novo diagnostikovaným, histologicky potvrdené ESCC a prípady GC spolu s ovládacími prvkami z veku a pohlavia stratifikované náhodne vybraných subcohort, boli zaradené do aktuálneho genetickou analýzou. Všetky skúmané pažerákové nádory boli ESCC, a všetci boli GCs adenokarcinóm. Všeobecných kolektívnych zmlúv boli definované ako tie, ktoré sa nachádza v proximálnom 3 cm v žalúdku, zatiaľ čo tie, ktoré boli GNCAs v zostávajúcej časti žalúdka.

Gene a SNP výber

sme vykonali rozsiahlu rešerš z EGFR dráha gény [1], [2], [3], [4], [5]. Gén bol zahrnutý v našej analýze, pokiaľ to sa odkazovalo v najmenej jednej z týchto databáz: ErbB signálne dráhy v KEGG (http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?pathway:map04012~~HEAD=dobj, načítaná Dec 20 2012), EGF signálne dráhy v BioCarta (http://www.biocarta.com/pathfiles/h_egfPathway.asp, načítané Dec 20, 2012), alebo signalizáciu receptoru ErbB, ErbB2 /ErbB3 signalizácia, signalizácia receptoru EGF, alebo ErbB4 signálne dráha v NCI Pathway databázy interakcie (http://pid.nci.nih.gov/browse_pathways.shtml, stiahne 20.decembra 2012). Identifikovali sme celkom 131 EGFR dráhy génov. Žiadne SNP mapované na AREGB
EIF4EBP1
PAK3 stroje a SHC1
v našom dátovom súbore, takže 127 génov (tabuľka S1) pre analýzu. Celkovo 3443 SNP sa nachádzajú v týchto génov a ich sprievodných oblastí (20 kb proti smeru prúdenia a 10 kb po prúde), s menším alelové frekvenciu > 1% (v prípadoch, a ovládacie prvky kombinované) boli zahrnuté do našej analýzy, a úplný zoznam z týchto SNP boli uvedené v tabuľke S2.

genotypu a kontrola kvality

Genome-Wide snímanie sa uskutočňuje za použitia 660W Illumina pole, ktoré bolo podrobne v našej zverejnenej GWAS na rakovinu Ugi [24 ]. Po tejto správe, naskenované sme ďalšie predmety na rovnakej platforme v rovnakom objekte. Počiatočné a ďalšie údaje predmetom kontroly prekonal podobné spracovanie a kontrolu kvality filtrovanie metriky. Vylúčili sme SNP s chýbajúcim rýchlosťou > 5% jedincov s rýchlosťou dokončení všetkých SNP < 94%, pacienti s abnormálnymi priemerných hodnôt heterozygozita (viac ako 30% alebo < 25%), medzi ženami a mužmi nezlučiteľná objektov alebo neočakávané duplikát párov. Údaje GWAS o rakovine Ugi v študijných populáciách boli uložené v databáze genotypov a fenotypov (dbGaP, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/, študijné prístupovým číslom: phs000361.v1. p1).

Štatistická analýza

sme skúmali súvislosť medzi génmi v EGFR signálnej dráhy a riziko ESCC a GC. Na vykonanie analýzy génovej úrovni, najprv vykonala analýzu SNP úrovni. Spočítali sme šance pomery (ORS) a 95% intervaly spoľahlivosti (CIS) vzhľadom na riziko ESCC alebo GC spojené s nutnosťou jeden menší alelu, pomocou nepodmienené logistickej regresie v modeli aditív pre každý SNP, úprave vzhľadom na vek, pohlavie a štúdie ( Shanxi alebo NIT). My nepovažoval populačný stratifikácia pretože tam nebol žiadny dôkaz o významných problémov s populačným spodku [24]. Použili sme dominantný vzor pre SNP, keď očakávaný počet jedincov nesúcich alely menšie menej ako päť.

združenia Gene úrovni bol potom vypočítaný za použitia adaptívne hodnosť skrátený produkt (artP) prístup, ktorý platí rank- skrátené štatistika testu a postup pri odbere vzoriek permutácie na báze (1,000,000 resamplings) [34]. Signály asociačná nad súborom SNP v géne boli spojené pri účtovaní SNP väzbové nerovnováhe (LD) štruktúr a mnohopočetné porovnanie. Tiež sme vyhodnotili združenia celkového EGFR dráhy s ESCC a GC, ktoré globálne kombinované asociácia medzi každým výsledkom a gény vnútri dráhy. Použili sme metódu artP s 1.000.000 resamplings dostať jednou súhrnnou dráhu úroveň P
-hodnota pre každý typ rakoviny.

V sekundárnej analýzy sme dodatočne upravené pre fajčenie cigariet (alebo vôbec ), príjem alkoholu (vôbec alebo len zriedka /nikdy) a rodinná história rakoviny Ugi (áno alebo nie). Vzhľadom k tomu, výsledky týchto sekundárnej analýzy SNP úrovni ukázala v podstate rovnaké výsledky ako tie z primárnych modelov, predstavujeme iba primárnej analýzy v novinách.

Testovali sme vzťah medzi SNP a ESCC a GC podľa podskupín pohlavia , fajčenie, požívanie alkoholu, a rodinnú anamnézu rakoviny Ugi. P
interakcie medzi SNP a tieto premenné boli skúmané pomocou pomerových likehood testov

Štatistická významnosť pre Generic a dráhy založená na analýzach bola definovaná ako P Hotel <.; 0.05. Keďže žiadny z SNP dosiahol Bonferroniho-opravený významnosti úrovne (1,45 x 10 -5, 0,05 /3443 SNP), štatistický význam SNP úrovni analýzy bola definovaná ako P Hotel < 0.001. Štatistické analýzy boli vykonané s použitím jazyka R. Hodnotili sme väzbové nerovnováhe (LD) medzi SNP v celej špecifických génových regiónov s Haploview verzie 4.1.

Výsledky

celkom 1942 prípadov ESCC, 1758 prípadov GC (1126 GCA a 632 GNCA prípadov) a 2111 kontroly boli zahrnuté od Shanxi a NIT štúdií (Tabuľka S3). Celkovo možno povedať, priemerný vek bol 56,0 rokov v kontrolách, 56,0 v ESCCs a 56,3 v GC.

Vykonali sme analýzu génovej úrovni medzi 127 génov, a identifikoval päť génov, vrátane GNAI3
CHRNE
PAK4
Wasl stroje a Itch
, ktoré boli významne spojené s rizikom ESCC ( P Hotel <0,05) (tabuľka 1). Desať gény boli významne spojené s rizikom GC, vrátane Fyn
MAPK8
MAP2K4
GNAI3
MAP2K1
TLN1
PRLR
PLCG2
RPS6KB2 stroje a PIK3R3
( P Hotel <0,05) (tabuľka 2). Medzi GC spojené s génmi, GNAI3
MAP2K1
Fyn stroje a MAPK8
boli spojené s GCA a , TLN1
RPS6KB2
MAP2K4 stroje a PIK3R3
boli spojené s GNCA ( P Hotel < 0,05 ). Tiež sme identifikovali niekoľko ďalších génov spojených iba s GCA ( TGFA
RASA1
JAK2
HSP90AA1
DLG4
a CHRNE
) alebo GNCA ( NEDD4
PTK2
HBEGF
CHRNA1
), ale nie s celkom GC. Gény s najsilnejšími asociáciami boli GNAI3
pre ESCC ( P
= 8,17 × 10 -3), Fyn
pre celkový GC ( P
= 2,63 × 10 -3), GNAI3
pre GCA ( P
= 4,50 × 10 -3) a MAPK8
pre GNCA ( P
= 3,79 × 10 -3), ale žiadna prekročila Bonferroniho očistený prahu ( P
= 3,94 × 10 -4, 0,05 /127 génov ) (tabuľka S1). Medzi skúmaných génov, GNAI3 stroje a CHNRE
boli spojené s oboma ESCC a GCA. Najvýznamnejšie SNP v GNAI3
bola rovnaká pre ESCC a GCA (rs1434285), ale najvýznamnejšie SNP v CHRNE
boli odlišné pre ESCC (rs8081611) a GCA (rs3760490), a tieto dva SNP neboli vo vysokej LD (r 2 = 0,007).

analýza dráhy na úrovni ukázala štatisticky signifikantné asociácie celkového EGFR dráhy s GC rizikom ( P =
2,16 × 10 -3), ale nie s ESCC riziko ( P
= 0,72). Avšak, združenia nebol významný buď GCA ( P =
0,12), alebo GNCA ( P
= 0,097).

spolky SNP úrovni sú uvedené v tabuľke 3. aj keď žiadny z SNP prekročil hranicu významnosti po korekcii pre viacnásobné porovnanie, pri zníženom prahu 0.001, rs1884361 ( NRG3
) bol spájaný s ESCC rizika a rs9387033 ( Fyn
), rs9788973 ( MAP2K4
), rs7187863 ( PLCG2
), a rs7720677 ( PRLR
) boli spojené s rizikom GC. Tiež sme identifikovali koreláciu pre rs549386 ( TGFA
) s GCA, rovnako ako korelácia pre rs16947307 a rs9923225 (ako v WWOX
) s GNCA. V podskupine analýz sme nespozorovali významné interakcie medzi SNP a ďalších charakteristík na prahu 0,001 (dáta nie sú uvedené).

Diskusia

Somatické mutácie a zmenená regulácia EGFR dráhy génov široko podieľa na vývoji a prognóze pažeráka a žalúdka rakoviny [6], [7], [8], [9], [10], [11], [12], [13], [14], [ ,,,0],15]. Na rozdiel od toho je menej jasné, či zárodočnej línie genetickej varianty v EGFR dráhy sú spojené s týmito nádormi. Nedávne GWASs identifikovali početné rizikové lokusy spojené s ESCC alebo GC, ale doteraz, nedošlo k žiadne dôkazy pre spojenie s genetickými variantmi v EGFR dráhy. prístupy dráha na báze boli vyvinuté s cieľom efektívnejšie využiť celogenomových dát, a že majú potenciál priniesť nové poznatky [33], [34]. komplexne sme hodnotili génov v EGFR dráhy a riziko ESCC a GC použitím prístupu artP. Aj keď žiadny z génov stretol s Bonferroniho-korekcia pre viacnásobné porovnávania, na prahu 0,05 sme pozorovali, že niekoľko génov, rovnako ako celkový EGFR dráhy, boli spojené s rizikom GC. Výsledky tiež navrhol spojenie medzi mnohými génov EGFR súvisiacich s rizikom a ESCC.

Identifikovali sme päť génov významne spojené s ESCC riziká. Medzi nimi, GNAI3 stroje a CHRNE
boli významné ako ESCC a GCA, ale nie v GNCA. GNAI3
v 1p13.3 kódovaní guanínu nukleotid viažuci proteín G (k) podjednotky alfa, bol najvýraznejší gén ESCC a tiež koreluje s rizikom GC, najmä GCA. Guanínu nukleotidov-väzbové proteíny (G proteíny) sú zapojené ako modulátory alebo snímačov v rôznych transmembránový signálnych dráh. Jeden predchádzajúce štúdie naznačujú spojenie medzi rs11184738 ( PRMT6
, ktorý sa nachádza v 1p13.3) a riziko ESCC v GWAS skenovanie, ale nie vo fáze validácie [28]. GNAI3
sa nachádza 2,3 Mbps downstream na PRMT6 stroje a horná SNP v GNAI3
(rs1434285) nebol vo vysokej LD s rs11184738 v našej GWAS dátovom súbore (r 2 < 0,01). CHRNE
v 17p13.2 kódujúci receptor acetylcholínu, podjednotku epsilon prekurzor, korelovala s rizikom ako ESCC a GCA, ale nie s GC celkovo. Jeden GWAS hlásili, že rs17761864 ( SMG6
, ktorý sa nachádza v 17p13.3) bola spojená s rizikom ESCC [32], ale SMG6
sa nachádza viac ako 2,5 Mbps downstream od CHRNE
.

desať gény boli významne spojené s rizikom GC v našej štúdii. Fyn
v 6q21 bol najvýraznejší gén GC celkovo, ale bola spojená len s GCA a nie s GNCA. Fyn proteín patrí do rodiny Src tyrozínkinázy spojenej s membránou a má kľúčovú úlohu v bunkovej adhézii, proliferáciu a apoptóze [37]. MAPK8
v 10q11 bol najvýznamnejší gén pre GNCA a bol tiež spájaný s GCA. MAPK8 je členom mitogénom aktivovaných proteínkináz a je zapojená do bunkovej proliferácie, diferenciácie, apoptózy a transkripcie. Nedávny výskum dráha na báze ukázala, že MAPK8
bol spájaný s rakovinou konečníka a rakoviny pankreasu [38], [39].

Vzhľadom k tomu, štandardné single-lokus metódy môžu chýbať SNP s miernym veľkosť efektu , sme použili metódu artP prevzorkovanie na báze, ktorý kombinuje signály pridružení medzi jednotlivými SNP v géne, gén pre výpočet združením úrovni. Navyše k vyššie zvýraznené génov Naše výsledky naznačujú, že niektoré ďalšie gény boli spojené s rizikom GC alebo ESCC, aj keď jednotlivé SNP v týchto génoch neboli v predchádzajúcich štúdiách GWAS. Tiež sme zistili významné gény v analýze génovej úrovni, u ktorých jednotlivé SNP boli nevýznamné vo vopred definovanej prahovej hodnoty pre analýzu SNP úrovni, čo podčiarkuje nutnosť integrovanejšej pochopenie genetických príspevkov než výhľadu na SNP úrovne iba .

Naše výsledky sú biologicky vierohodné. Rodina EGFR bolo zistené, že up-regulované, a je cieľom somatických mutácií v rakoviny Ugi, a klinickú štúdiu, je uvedené zlepšenú prognózu rakoviny pre terapie cielené na rodinu EGFR [4], [6], [7]. Skoršie štúdie tiež hlásené úlohu downstream signalizácie EGFR rodinných génov v nádorových ochorení Ugi. Jedna nedávna správa ukázala, že MAPK bol obyčajne stimulovaná v esophagogastric rakoviny po aktivácii RTK [13]. Druhá štúdia ukázala, že onkogénne ČAGA podporoval riziko GC aktiváciou EKR signálnych dráh [15].

Predchádzajúca GWASs uvedené genetické varianty v PLCE1
ako spoločné náchylnosť loci pre ESCC a GCA, ale nie pre GNCA [24], [27]. V našich analýz sme zistili, dva gény významné pre ESCC a GCA, ale nie pre GNCA, ďalej naznačuje, že spoločný genetický mechanizmus by mohli prispieť k vývoju a ESCC GCA.

V našej štúdii sme použili predchádzajúce biologické znalosti systematicky skúmať vzťahy medzi génmi v EGFR dráhy a riziko ESCC a GC v populácii s vysokým rizikom na severe centrálnej Číne. Pokiaľ je nám známe, toto je prvá štúdia, ktorá komplexne skúmať úlohu genetickej variability v génoch dráhy EGFR a riziko vzniku rakoviny Ugi. Pomerne značná veľkosť vzorky nám umožnilo zhodnotiť združenia pre ESCC, GC celkové a anatomických lokalít s primeranou silou. Tiež sme na vedomie, však, obmedzenie našej štúdie. Po prvé, mali sme žiadne informácie o Helicobacter pylori
( H. Pylori
) infekcie [40], čo by mohlo byť problémom najmä pre analýzu GNCA. Avšak, nedávny prieskum medzi plazmy NIT ukázala prevalenciu H. pylori
séropozitivity o 96,6% medzi GNCA, 95,8% u GCA a 93,9% u kontroly (nepublikované údaje), s použitím multiplexové test s H. pylori
pozitivita definovaná ako tri alebo viac antigénov sú pozitívne [41]. Aj keď multiplex metóda má tendenciu byť citlivejšia ako tradičné testy ELISA, to sérologické vyšetrenie odhalilo veľmi vysoký H. pylori
miera infekcie v tejto oblasti, a to aj medzi ovládacími prvkami, čo naznačuje, že naše výsledky boli menej pravdepodobné, že budú značne skreslený nedostatok informácií o H. pylori
infekciu. Po druhé, ďalšie replikácie v nezávislých populácií sú potrebné na určenie, či združenie sme pozorovali medzi EGFR dráhy génmi a riziko ESCC a GC sú skutočné. Po tretie, vopred definované EGFR dráha že z dôvodu obmedzení v súčasných poznatkov testované nemusí predstavovať všetky funkčne súvisiace s EGFR génmi. Po štvrté, ďalej generalizability pre iné zásoby vyžaduje opatrnosť, pretože naša štúdia bola vykonaná iba u vysoko rizikových Han čínskej.

Na záver, naše štúdie identifikovaná významná súvislosť medzi zárodočnej línie genetickej variácie celkového EGFR signálne dráhu a niekoľko individuálnych gény a riziko GC, rovnako ako jednotlivé gény a riziko ESCC, čo naznačuje možnú úlohu EGFR dráhy génov v rozvoju rakoviny Ugi. Ďalšie štúdie sú oprávnené na potvrdenie asociácie v nezávislých populácií a preskúmať základných biologických mechanizmov.

podporné informácie
tabuľke S1.
Asociácie medzi všetkými EGFR dráhy gény a riziko pažeráka spinocelulárneho karcinómu a adenokarcinóme žalúdka
doi: 10,1371. /Journal.pone.0068999.s001
(DOCX)
tabuľke S2.
Identifikátory NCBI dbSNP, umiestnené gény a chromozómy SNP zahrnutých do štúdie
doi :. 10,1371 /journal.pone.0068999.s002
(DOCX)
Tabuľka S3.
Charakteristika účastníkov štúdie
doi :. 10,1371 /journal.pone.0068999.s003
(DOCX)

Other Languages