Bakgrund
För att förbättra resultatet av patienter som lider av magcancer, krävs en bättre förståelse för bakomliggande genetiska och epigenetiska händelser i denna malignitet. Även CpG-ö methylator fenotyp (CIMP) och mikrosatellitinstabilitet (MSI) har visat sig spela avgörande roller i magcancer patogenes, den kliniska betydelsen av dessa händelser på överlevnadsresultat hos patienter med magcancer är okänd.
Den här studien ingick en patient kohort med patologiskt bekräftad magcancer som hade kirurgiska resektioner. En kohort av 68 gastric cancer analyserades. CIMP och MSI status bestämdes genom att analysera promotor CpG-ö metylering status av 28 gener /loci, och genomisk instabilitet vid 10 mikrosatellitmarkörer, respektive. En Cox proportionella faror modell utfördes för multivariat analys inklusive ålder, stadium, tumördifferentiering, KRAS Resultat Vid multivariat analys, var längre OS signifikant korrelerad med lägre patologiskt stadium ( P CIMP och /eller MLH1 Citation. Shigeyasu K, Nagasaka T, Mori Y, Yokomichi N, Kawai T, Fuji T, et al. (2015) kliniska betydelsen av MLH1 Metylering och CpG Island Methylator Fenotyp som prognostiska markörer hos patienter med magcancer. PLoS ONE 10 (6): e0130409. doi: 10.1371 /journal.pone.0130409 Redaktör: Hassan Ashktorab, Howard University, USA Mottagna: 18 februari 2015, Accepteras: 20 maj 2015; Publicerad: 29 juni 2015 Copyright: © 2015 Shigeyasu et al. Detta är en öppen tillgång artikel distribueras enligt villkoren i Creative Commons Attribution License, som tillåter obegränsad användning, distribution och reproduktion i alla medier, förutsatt den ursprungliga författaren och källan kredit datatillgänglighet: Alla relevanta uppgifter är inom pappers- och dess stödjande information filer Finansiering:. Detta arbete stöddes av KAKENHI bidrag 19390351 och 20590572 till TN, och genom bidrag R01 CA72851 och 181.572 från National Cancer Institute, National Institutes of Health, och medel från Baylor Research Institute till AG konkurrerande intressen. författarna har deklarerat att inga konkurrerande intressen finns Introduktion Gastric cancer är den näst vanligaste orsaken till cancer. -relaterade dödsfall, med cirka 700.000 bekräftade dödlighet årligen över hela världen, även om förekomsten har gradvis minskat [1-3]. Gastric cancer är i allmänhet diagnostiseras i ett framskridet stadium, vilket är den främsta orsaken till den dåliga prognosen [4]. För att förbättra resultatet av magcancer, krävs identifiering av genetiska eller epigenetiska händelser i utvecklingen av magcancer. Den viktigaste epigenetisk händelse i utvecklingen av cancer är metylering av promotor CpG regioner av viktiga tumörsuppressorgener. CpG-öar är nästan 1-kb långa sekvenser av DNA med hög guanin-cytosin-innehåll i promotorregioner för generna [5]. I motsats till normala celler, är CpG-öar inom tumörsuppressorgener i cancerceller ofta hypermethylated, vilket leder till en CpG-ö methylator fenotyp (CIMP) [6,7]. Epigenetisk tystande av tumörrelaterade gener på grund av CpG-ö-metylering har nyligen rapporterats i magcancer. Aberrant CpG-ö metylering av > 100 tillväxt regulatoriska gener i magcancer har hittills rapporterats [8-24], men den kliniska betydelsen av CIMP i magcancer fortfarande outforskat och dåligt förstådda I kontrast. är mismatch reparation (MMR) brist på magcancer också en viktig genetisk händelse. Genomisk instabilitet i antalet mikro upprepningar (eller mikro) kallas mikro instabilitet (MSI). MSI är en funktion som orsakas av en defekt DNA MMR-systemet. Funktionell inaktivering av MMR-gener, såsom MLH1 Med tanke på denna lucka i kunskap, i denna studie undersökte vi betydelsen av CIMP och MMR-brist i magcancer och bestäms deras bidrag som prognostiska markörer hos patienter med magcancer. Material och metoder Vävnadsprover prover~~POS=HEADCOMP Denna studie ingår en kohort av patienter med patologiskt bekräftad magcancer som hade genomgått kirurgisk resektion vid Okayama University Hospital (Okayama, Japan) 1998-2004. Totalt 68 magcancer vävnader och deras matchade normala magslemhinnan analyserades. Alla normala magslemhinnan vävnader erhölls från platser intill, men åtminstone 5 cm från den ursprungliga tumören. Alla patienter som skriftligt informerat samtycke och studien godkändes av den etiska kommittén i Okayama Universitetssjukhuset. Alla patienter som skriftligt informerat samtycke till användning av deras uppgifter för framtida analyser. Alla gastric cancer och normal magslemhinna var färska frysta vävnadsprover, som DNA extraherades med användning av en QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN). MSI analys utfördes genom undersökning av 2 mononukleotid upprepningar (BAT25 och BAT26), 12 dinukleotid upprepningar (D17S250, D18S35, D18S58, D18S69, D2S123, D4S1559, D4S2381, D4S470, D5S107, D5S346, och D8S87, TP53), och en tetranukleotid upprepningar, MYCL, såsom beskrivits tidigare [ ,,,0],31]. Tumörer som visar alleliska förändringar i ≥5 av 15 markörer klassificerades som MSI-H (härefter kallat "MSI"), och resten klassificerades som mikro stabil (MSS). Eftersom frekvent hypermetylering av flera gener är ett av de utmärkande dragen av tumörer med CIMP undersökte vi metylering status 28 promotor CpG-ö relaterade loci ( APC
mutationsstatus, och kombinerade CIMP / MLH1
metylering status i förhållande till total överlevnad (OS).
= 0,0088), bättre tumördifferentiering ( P
= 0,0267) och CIMP hög och MLH1 3 '
denaturerad status ( P
= 0,0312). Skiktning av CIMP status med avseende på MLH1
metylering status ytterligare aktiverat förutsägelse av magcancer prognos.
Slutsatser
metylering status kan ha en potential att bli prognostiska biomarkörer för patienter med magcancer
eller MSH2
genom promotor metylering är ansvarig för MSI-high (MSI-H) fenotyp i magcancer. I en tidigare studie, magsäckscancer med MSI-H visade en högre frekvens av antral läge, tarm subtyp, lägre förekomst av lymfkörtelmetastaser, och förbättrad överlevnad, jämfört med mikro stabil (MSS) eller MSI-L gastric cancer [17,25 -30]. Men den kliniska betydelsen av MMR-brist i magsäckscancer är okänd.
MSI analys
Natriumbisulfit modifiering och CIMP analyser
, CACNA1G
, CHFR
, COX2
, DAPK
, DCC
, HPP1
, MGMT-Mp region
, MGMT-Eh region
, MINT1
, MINT2
, MINT31
, MLH1 5 '
MLH1 3 '
, P14
, P16
, RASSF1A
, RASSF2A-region1
, RASSF2A-region2
, RASSF3
, RASSF5
, RASSF6
, RUNX3
, SFRP2-region1
, SFRP2- region2
, UNC5C
, 3OST2
, FOXL2
), och motsvarande primersekvenser listas i S1 tabell. Genomisk DNA bisulfit-modifierad för att konvertera alla ometylerade cytosinenheter till uraciler. I korthet, 0,5-2,0