Virulenta patogener kan främjas av mikrobioter, men kommensal mikrobiota kan också undertrycka spridning av virus. Det har visat sig att dessa interaktioner påverkar kliniska resultat.
Hur fungerar den pågående COVID-19-pandemin (coronavirus-sjukdomen 2019), orsakad av allvarligt akut respiratoriskt syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2), påverka bakteriemikrobiomet?
I en nyligen genomförd studie ledd av Dr. Amy K Feehan, forskare antog att COVID-19-statusen skulle förknippas med en förändring av NP-mikrobiomet, särskilt hos sjukhusvårdade patienter. Resultaten från denna studie stöder de dynamiska och betydande förändringarna av mikrobiomet i NP -utrymmet, särskilt när patienter använder en andningsassistent.
Andningsbehandlingar tillhandahålls till sjukhusvistade covid-19-patienter. I den här studien, forskarna undersökte samhällssammansättningen i förhållande till tre attribut - COVID -19 -status, andningshjälp, och antibiotikaanvändning. Denna studie publiceras i tidskriften, Tillämpad mikrobiologi.
”Tvärsnittsskillnader i mikrobiomet var uppenbara med SARS-CoV-2-infektion, men longitudinella studier behövs för att förstå dynamiken i virus- och andningsbehandlingsmodulering av mikrober. ”
Forskarna använde grunda hagelgevärssekvensering av en tvärsnitts uppsättning medicinska avfallsprover från Louisiana, USA, som bekräftades av PCR-positiva för SARS-CoV-2 över en svårighetsgrad (asymptomatisk, sjukhusvistelse, och döden). Denna studie inkluderade 79 positiva prover från SARS-CoV-2 och 20 negativa prover (kontroll).
Forskarna presenterade demografin i samband med proverna. Till exempel, information som t.ex. användning av en andningsassistent, COVID-19 svårighetsgrad, rökningsstatus, ålder, kön, och ras.
Med hjälp av metagenomisk sekvensering och klassificering, de bedömde mikrobiomkompositionen hos nasofaryngeala pinnar av dessa positiva och negativa individer från SARS-CoV-2.
Stapeldiagram över procentandelen patienter inom varje grupp för tre attribut där släktet detekterades. Var och en av staplarna representerar en av de 21 släkten (x-axeln). Tre attribut testades:COVID-19 infektionsstatus De hittade totalt 202 unika släkten i alla prover, varav, de identifierade totalt 27 unika släkten. Dessutom, COVID-19-positivitet förknippades med ökad representation av Serratien , en allestädes närvarande mikroorganism. I synnerhet, Serratia marcescens är en erkänd orsakande orsak till mänskliga sjukdomar, inklusive lunginflammation.
Forskarna fann Serratien , Streptokock , Enterobacter , Veillonella , Prevotella , och Rothia ofta hos COVID-19-patienter som använde andningshjälpmedel.
Också, de rapporterade att två släkten: Finegoldia , en opportunistisk mänsklig patogen, och Peptoniphilus , vanligtvis associerad med tarmen och vaginal mikrobiota, var helt frånvarande hos COVID-19-patienterna som krävde andningshjälp; närvarande hos patienter som inte behövde andningshjälp.
De noterade att den individuella relativa överflöd av Veillonella var lik mellan grupper, och det relativa överflödet av Finegoldia var klart högre i antibiotikagruppen.
De beräknade alfa -mångfalden (mångfald inom ett visst område eller ekosystem, artrikedom) och betamångfalden (skillnad i mångfald av arter mellan ekosystem, artomsättning).
Till skillnad från COVID-19-status, forskarna fann att alfa -mångfalden var olika för åldersstatus och för individer som rökte. Det är välkänt att ålder och rökning påverkar tarmens mikrobiom, hud, och övre luftvägarna.
Även om de fann att beta-mångfalden i mikrobiomet var betydligt annorlunda för dem som hade COVID-19, använda andningshjälpmedel, hade en sjukhusvistelse, och, också, de som dog. Förvånande, forskarna observerade rasskillnader i beta-mångfald i NP-utrymmet och betonade behovet av en storprovstudie för att utvärdera detta ytterligare.
”Samspelet mellan SARS-CoV-2-infektion, andningsbehandling, sjukhusvistelse, och andningsmikrobiomer är komplexa, och en detaljerad tidslinje och/eller longitudinell provtagning av patienter krävs för att identifiera orsakssamband. ”
Även om denna studie inte beaktar användningen av specifika läkemedel som individerna tagit på grund av begränsningar vid tidpunkten för datainsamling, det belyser kraftfullt sambandet mellan COVID-19-infektion och förändringarna i de mikrobiella samhällena. Det är uppenbart att COVID -19 förändrar NP -mikrobiomet - i mångfald, frekvens, och överflöd. Dessutom, andningsbehandlingen påverkar typen och överflödet av de mikrobiella taxorna som innefattar NP -mikrobiomet.
Skillnader i patientpopulationer, geografi, och klimat, eller till och med kvantitet eller genomisk mångfald av SARS-CoV-2-viruset spelar helt och hållet någon roll i NP-mikrobiomet.
Syra-pH förbättrar SARS-CoV-2-infektionen genom att uppreglera ACE2-receptorn
Tester som används för GERD -diagnos
Sömnkvalitet kan vara en indikator för senare studier av Alzheimers sjukdom
En vegansk kost kan öka tarmmikrober som hjälper viktminskning
Osundig tarmmikrobiom minskar hjärnsynaptisk beskärning,
Studie med tvillingar visar att covid-19-symtom har ett genetiskt bidrag
SARS-CoV N-protein framkallar produktion av IFN-β genom att provocera ubiquitination av RIG-I,
finner studie Många medlemmar i Coronaviridae -familjen, såsom luftvägssyndrom i Mellanöstern (MERS), allvarligt akut respiratoriskt syndrom (SARS), och det svåra akuta respiratoriska syndromet corona
Använda FLUOstar Omega för att studera nya tarmbakterier som kan påverka vår hälsa
Gruppen Microbial Biology and Metagenomics vid University of Queenslands Diamantina Institute använder BMG LABTECH FLUOstar Omega mikroplattläsare för att utveckla nya metoder för att studera människa
Ulcerös kolit och en saknad mikrob i tarmen
Ulcerös kolit är en allvarligt försvagande inflammatorisk sjukdom i tarmen som leder till förlamande symptom som kan påverka livskvaliteten allvarligt. Forskare från Stanford University School of Medi