Stomach Health > magen Hälsa >  > Stomach Knowledges > undersökningar

Genen-minskning effekten av kromosomala förluster upptäckts i magcancer

Genen-minskning effekten av kromosomala förluster upptäckts i magcancer Bild Sammanfattning
Bakgrund
Nivån på förlust av heterozygositet (LOH) som minskar en gen dos och utövar en cell negativ effekt är känd för att vara en parameter för den genetiska uppsättning av magcancer. Denna studie undersökte om cellen-negativ effekt som induceras med genen reduktionen var ett hastighetsbegränsande faktorn för de LOH evenemang i två distinkta histologiska typer av magcancer, de diffuse- och intestinala-typer.
Metoder
patologiska undersökta prover som erhållits från 145 patienter med ventrikelcancer var för nivån av LOH använder 40 mikrosatellitmarkörer på åtta cancerassocierade kromosomer (3p, 4p, 5q, 8p, 9p, 13q, 17p och 18q).
Resultat
flesta av cancerassocierade kromosomer befanns tillhöra gensefattiga kromosomer och för att innehålla några mage specifika gener som var högt uttryckta. En baslinje-nivå LOH omfattar en eller ingen kromosom var ofta i diffus typ gastric cancer. Kromosomen 17 som innehåller en relativt hög densitet av gener var vanligt förlorad i intestinal-typ cancrar men inte i diffus-typ cancer. En hög nivå LOH med fyra eller fler kromosomer tenderade att vara vanligare i gastric cancer med intestinal och blandad differentiering. Återfall var vanligt för gastric cancer med hög nivå LOH genom både hematogen (38%) och icke-hematogena (36%) vägar, och för baslinje-nivå LOH fall genom icke-hematogen väg (67%).
slutsatser
cell negativ effekt av genen reduktion mer tolereras i intestinal typ gastric cancer än i diffus typ cancer, och förlusten av höga doser gener i samband med hematogen metastas.
bakgrund
Gastric cancer genomgå hypermutations i enkla upprepningssekvenser och obalanserade kromosomala förluster, och dessa genetiska förändringar detekteras som en mikro instabilitet (MSI) och förlust av heterozygositet (LOH), respektive, genom att använda mycket polymorfa mikrosatellitmarkörer [1-4]. Den pathobiological beteende och prognos av magcancer har associerats med nivån på LOH och närvaron av MSI [3-6]. Djupet av invasionen och lymfkörtel metastas avsevärt framåt i fall av små dimensioner cancer med hög nivå LOH och dessa histologiska parametrar tenderar att vara linjärt relaterade till cancern storlek för lågaktivt LOH fall [7]. Eftersom en enda mikro genotyp på liknande sätt detekteras i hela kirurgisk vävnad samt den endoskopiska biopsiprovet [3, 7], är det möjligt att förutsäga sannolikheten för återfall och att besluta om lämpliga resektion förfarande baserat på mikroanalys av en förbehandlingsbiopsivävnad.
två-hits hypotes har föreslagit att kromosomal förlust och punktmutationen resulterar i den bialleliska inaktivering av tumörsuppressorgener [8]. Kromosom förluster som utövar en skadlig effekt på celltillväxt är mycket mindre tolereras än kromosomala vinster, och de två genetiska träffar ger en tillväxtfördel kunde skydda cancer stamceller från dödliga LOH händelser [9, 10]. Dessutom har tidigare studier föreslagit att de metylerade gen-kontrollregioner är allt mindre metylerade i en LOH-nivåberoende sätt i gastric cancer [11, 12] via en doseringskompensationsmekanism som upprätthåller en gen eller transkriptions dos under efterföljande cellcykler [9 ]. När det gäller doseringskompensationsmekanismen kan kromosom vinst och LOH-associerad demetylering resultera från dos-kompensations genetiska och epigenetiska svar på en minskning av kromosomala dosen [11-14]. Därför LOH händelser i kombination med en cell negativ effekt och en dos-kompenserande svar förutom tumörsuppressorgen inaktive kommer sannolikt att bestämma pathobiological beteende cancer stamceller.
Gastric cancer har kategoriseras i två distinkta histologiska typer , det vill säga, de diffuse- och intestinala-typer [15, 16]. Diffus typ cancer är vanligare hos unga medelålders patienter som saknar en precancerös lesion, medan intestinal typ cancer är vanligt i gamla medelålders patienter i samband med precancerösa intestinal metaplasi som liknar tarm körtlar [17]. Om man antar att de märghärstammande stamceller anpassar sig till magen vävnads miljön [18], de nyligen fastställda stamceller, som är potentiellt icke-sammanhängande och invasiva hos unga individer, utvecklas till diffus typ cancer. Intestinal typ cancer är vanligare bland de gamla medelålders patienter som har den långsiktiga anpassningen av nyligen fasta stamceller till den gastriska vävnadsmiljö. I detta avseende kan en given LOH händelse påverkar olika doser av transkription mellan diffuse- och tarm-typ gastric cancer som upprättar tydliga genexpressionsmönster.
I denna studie har korrelationer mellan de LOH händelser och pathobiological beteende magcancer i termer av de cell skadliga effekter av genen reduktion. De åtta cancerassocierade kromosomer Vi undersökte hade en låg densitet av gener och inga magen specifika gener, vilket kan resultera i en mild cell negativ effekt av LOH. De LOH händelser var vanligare i intestinal-typ magcancer, där förlusten av en kromosom skulle påverka en låg dos av transkription och utövar en mild cell negativ effekt.
Metoder
Val av fall
Hundra och fyrtiofem patienter med magcancer, som genomgick en kurativ kirurgisk resektion mellan februari 1996 och juni 2003 var inskrivna i denna studie. Den clinicopathologic och radiologiska uppgifter erhölls genom att granska de detaljerade register över patienterna. Etthundra sexton fall har tidigare analyserats av multifokal genetisk undersökning av heterogena tumörställen [3]. Resterande 29 patienter undersöktes med hjälp av en enda vävnad block av varje tumör.
De mikroskopiska diabilder granskades och sedan ett tumörställe som var representativt för histologiska funktionen valdes. Den histologiska typen av magcancer definierades som tarm (körtel, sammanhängande eller fast), diffusa, och blandas enligt Lauren klassificering [15, 16] och graden av differentiering graderades enligt WHO klassificering. Tumör platser anses var den övre magmunnen, kropp och antrum. Den clinicopathologic tumörstadium bestämdes enligt den tumör Node-metastaser (TNM) kriterier [19]. De flesta patienter med ventrikelcancer (140 av 145, 97%) hade genomgått R0 gastrektomi och D2 eller mer utsträckt lymfkörtlar. En övergripande medelvärde av 28,6 (median: 33) lymfkörtlar avlägsnades tillsammans med provet. Ingen av patienterna erhöll preoperativ kemoterapi och strålbehandling.
Uppföljningsdata om återfall och överlevnad Review, en kombinationsterapi av intravenös mitomycin, fluorouracil och cytarabin (MFC) följt av oral fluorouracil administrerades som en standard postoperativa adjuvant behandling enligt läkarens bedömning av den totala prognosen för varje enskilt fall. Under uppföljningsperioden, en fysisk undersökning, laboratorieprov, lungröntgen, buken ultraljud eller datortomografi, och gastrofiberscopy genomfördes var 3 eller 6 månader och sjukdom återfall histologiskt bekräftat, om det är möjligt. När mer än en återkommande plats upptäcktes vid första gången fel, var de enskilda upprepningar räknas separat. Den återkommande plats kategoriserades i hematogen metastas omfattar lungan, levern, eller andra avlägsna organ, och icke-hematogen metastas som ingår körtelinvolvering och peritoneal spridning. Gastric rest cancer exkluderades från analys återfall mönster.
Totala överlevnadstiden beräknades från dagen för kirurgisk resektion tills antingen dagen i den sista uppföljnings kontakt eller cancerrelaterad död. Uppgifterna om patienter som dött av andra orsaker censurerades vid tidpunkten för dödsfallet. Statistisk analys genomfördes i april 2007. Den genomsnittliga uppföljningsperiod av alla överlevande patienter 40 månader (intervall: 5 till 96 månader) och avslutades med 98% av de inskrivna patienterna. Under överlevnadsanalys, hade 50 patienter dött till följd av deras cancer och 12 patienter hade dött av andra orsaker.
Tissue microdissection och DNA förstärkning
Fem serie 7 pm tjocka sektioner från varje formalinfixerade paraffininbäddade vävnadsprov avparaffinerades och i korthet färgades med hematoxylin och eosin. En enda tumörcellsrika fokus valdes genom mikroskopisk undersökning och en tumörområdet som sträcker sig från 5 mm till 7 mm i diameter manuellt dissekeras under stereomikroskop (förstoring, × 40) med hjälp av en kirurgisk skalpell. De microdissected vävnadsbitar var mikroskopiskt undersöktes om halten tumörcellen var > 70%, som hade bekräftats att återspegla en skillnad i den genetiska innehåll mellan de normala och tumörvävnader [3, 7].
Cirka 1000 microdissected tumörceller inkuberades i 20 mikroliter av DNA-extraktionsbuffert (0,5% Tween-20 , 1 mM EDTA pH 8,0, 50 mM Tris pH 8,0, 0,5 mg /ml proteinas K) vid 37 ° C under 24 h. Formalinfixerade paraffininbäddade vävnads DNA tenderar att vara dåligt amplifieras med PCR hos äldre exemplar. De flesta DNA extraherades inom fem år efter framställningen av de patologiska preparat, vilket säkerställer DNA kvalitet för PCR. Mängden DNA, med varierande kvaliteter, hos vävnaden lysatet bestäms på basis av PCR-bandet intensitet med 5-10 ng /mikroliter av den DNA, som amplifierades med användning av en mikrosatellit primeruppsättning, D19S226
(framåt: 5 ' - CCA GCA GAT TTT GGT GTT GTC TA - 3 ', omvänd: 5' - ACA GAG CCA GAG CCA GTA GGA GT - 3 '; amplicon storlek: 164 bp). PCR-förstärkningen genomfördes under en varm start tillstånd med hjälp av en radioisotop (α- 32P dCTP, PerkinElmer, Boston, MA, USA) såsom beskrivits tidigare [3, 7]. I korthet, totalt 10 mikroliter PCR-blandning genomgick 32 cykler av en seriell amplifieringssteg som bestod av 94 ° C under 50 sek, en primer-specifik glödgningstemperatur för 50 sekund, och 72 ° C under 1 min. De radioisotopmärkta mikrosatellitsekvenser separerades på en 6% polyakrylamidgel, som innehöll 7 M urea och de visualiserades genom upprepade exponeringar av varje autoradiograf och med användning av en radioluminograph scanner (BAS 2500, Fuji Photo Film Co. Ltd., Kanakawa, Japan)
Analys av mikrosatellit alleler
riktlinjerna för scoring status LOH och MSI har i detalj i tidigare studier som använde samma panel av mikrosatellitmarkörer [7].. Som referens typ av mikrosatellit alleler, hämtade vi dinukleotid kommande markörer som sträckte sig från 88 bp till 247 bp amplicon storlek och som hade en heterozygot frekvens > 50%. De mycket polymorfa mikrosatellitmarkörer på 8 cancerassocierade kromosomer (3p, 4p, 5q, 8p, 9p, 13q, 17p och 18q), som ofta drabbats av LOH i magcancer [3, 7, 20], har använts för att öka antalet heterozygota alleler på varje arm (Figur 1A). De fem mikrosatellitmarkörer på varje kromosomala armen visade det klara PCR-band av de heterozygota alleler och mätområdet hela längden av de åtta kromosomer [3, 5]. För att säkerställa den kromosomala reduktion, var den kromosomala förlust delas när LOH händelsen inom mer än två mikrosatellitmarkörer på en kromosomal armen [13]. Fyrtio par mikro primers blandades i totalt 22 reaktionsrör och som var och en innehöll en (4 blandningar) eller två (18 blandningar) primeruppsättningar som sträckte sig annorlunda stora amplikoner på samma glödgningstemperaturer. De resulterande entydiga mikro band indikerade hög specificitet av multiplex PCR tillstånd, som var användbart för små mängder microdissected patologiska vävnader. Figur 1 PCR-baserade mikrosatellitanalys (A) och den genetiska klassificering av magcancer (B). Representativa autoradiografer av proverna som undersöktes med PCR-baserade mikrosatellitanalys (A) och den genetiska klassificeringen av intestinal-typ och diffus-typ gastric cancer baserat på förlust av heterozygositet (LOH) och mikrosatellitinstabilitet (MSI) (B). (A) Den vänstra gelelektrofores visar högfrekvent MSI vid mer än 40% av de 15 homozygota markörer. Rätt gelelektrofores visar på hög nivå LOH omfattar kromosomer 3p, 4p, 5q, 9p, 13q, 17p och 18q. Den normala (N) och motsvarande tumör (T) DNA indikeras ovanför varje allelisk band. Asterisken anger MSI och LOH. Det genomiska DNA microdissected från formalin inbäddade paraffin-fast vävnad förstärktes och märkt med [α-32P] dCTP i varmstart skick multiplex PCR. Sammanlagt 80 mikro amplikoner från varje prov kördes samtidigt på två sekvenseringsgeler. (B) med hjälp av en panel av 40 mikrosatellitmarkörer på åtta cancerassocierade kromosomer var LOH tolkas på heterozygota markörer om 40% eller mindre av den homozygota markörer uppvisade MSI. Omfattningen av kromosomala förluster, som gjorde enligt antalet LOH-positiva kromosomer, delades in i hög-nivå (LOH-H) och låg nivå (LOH-L) förluster för både tarm-och diffusa typer. Vid diffus typ gastric cancer, var noll eller ett kromosomförlust klassificeras i baslinjen-nivå (LOH-B).
Baserat på samma klassificering av mikro genotyper som tillämpas i den tidigare studien (Figur 1B) [ ,,,0],7], var de alleliska profiler av de 40 mikrosatellitmarkörer analyseras för MSI på homozygota markörer som visade några skugg eller stamma band i ett par av normala och tumör DNA. Eftersom MSI skymmer heterozygot allela status, de alleliska profiler av de 40 mikro sekvenser inledningsvis analyserat för MSI på homozygota markörer. Den LOH-status bestämdes baserat på den alleliska förlust i den heterozygota markör (Figur 1B). Omfattningen av kromosom förluster i varje fall bedömdes enligt antalet konstitutionella kromosom förluster som berör mer än en mikrosatellit allelen.
Analys av in silico
data för genen tätheten och transkription av enskilda kromosomer Review, en totalt 17,723 referens gener som identifierats i en offentlig databas (http:.. //genom ucsc edu /i mars 2006 montering) [21] analyserades för att beräkna antalet gener per 1-Mb nukleotider segmentet. Serieanalys av genuttryck uppgifter (SAGE) normal magslemhinna erhölls från en offentlig databas (http:.... //Www NCBI NLM NIH gov /geo /"SAGE_Stomach_normal_B_antrum"). Den transkriptionella aktiviteten av individuella gener beräknades genom att kombinera den referensgenen karta och de uttryckta genprodukter taggar. Baserat på en jämförelse av microarray och SAGE uppgifter utvärderar genuttrycksprofilerna, var antalet transkript räknade i SAGE data hittad att exakt uppskatta en stor skillnad i genaktivitet mellan magen specifika gener och housekeeping-gener [21].
Statistisk analys
Fishers exakta test och χ
2 tester användes för att jämföra de clinicopathologic funktioner med mikro genotypen av gastric cancer. Sannolikhetskurvor beräknades enligt Kaplan-Meier-metoden och jämfördes med användning av log-rank test. Multivariat analys utfördes av Cox proportional hazards metod med hjälp av stegvis förfarande. Sannolikhetsvärden var tvåsidiga, med ett P
värde mindre än 0,05 betraktas som statistiskt signifikant. Den statistiska programpaketet SPSS 11.0 (SPSS Inc., Chicago, IL, USA) användes för dataanalys.
Resultat
Analys av LOH händelserna i magcancer
flesta gastric cancer (116 av 145 fall) undersöktes i en tidigare multifokal analys på heterogena tumörställen från en given magcancer [3]. Nittiofem procent av gastric cancer som undersöktes befanns ha antingen en liknande nivå av LOH eller MSI vanligen delas av heterogena tumörställen och därefter varje magcancer kategoriserades i en enda mikro genotyp, och inte en blandad genotyp. De mikrosatellit genotyper av de ytterligare 27 fall poängsattes i enlighet med den nivå av LOH och närvaron av MSI, som detekterades i ett enda vävnadsstycke innehållande en representativ histologisk komponent.
Varje kromosomal förlust korrelerades med de clinicopathologic parametrarna för gastric cancer (tabell 1). De flesta kromosomala förluster (4p, 5q, 9p, 13q, 17p och 18q) associerades med sen debut sjukdom (P Hotel < 0,05). Två eller flera kromosomala förluster samtidigt relaterade till den antral läge (9P och 18q förluster), tarm-eller blandad typ histologi (5q, 17p och 18q förluster), och en dålig överlevnad (3p, 9P och 13q förluster) (P Hotel < 0,05). Den 17p förlust var vanligast i tarmen-typ cancer (67%). Den 13q förlust var vanligast i de diffusa-typ cancer (47%). Tabell 1 Relationer av clinicopathologic egenskaper och enda kromosomförlust
Egenskaper
vid 3p förlust
4p förlust
5q förlust
8p förlust
9p förlust
13q förlust
17p förlust
18q förlust
Nej av patienterna
130
47
47
51
30
50
57
77
55
Ålder
Medelvärde
60
61
63
63
63
64
63
63
63
± SD
±
12,60 ± 10,18
± 10,49
± 9,28
± 10,24
± 10,28
± 10,43
± 10,94
± 11,20
P
0,290
0,029
0,014
0,102
0,003
0,030
< 0,0001
0,030
Sex
Man
86
37
34
36
18
37
42
52
36
Female
44
10
13
15 12
13
15
25
19
P
0,033
0,335
0,450
0.510
0,182
0,136
0.710
1,000
tumörlokalisation
Cardia
13 4
3
5 1
2 Review 5
8
3
Body
48
16
16
13
10
14
16
24
16
Antrum
69
27
28
33
19
34
36
45
36
P
0,743
0,424
0,078
0,267
0,018
0,119
0,253
0,043
Histologisk typ
intestinal
54
19
19
23
13
22
20
36
27
Diffusa
32
9
9
6
5
8
15
11
7
Blandad
44
19
19
22
12
20
22
30
21
P
0,395
0,395
0,018
0,480
0,176
0,404
0,004
0,026
Tumörstorlek storlek~~POS=HEADCOMP
Medelvärde
5,3
5,8
5,1
4,9
5,1
4,9
5,7
5,2
5,5
± SD
±
3,01
± 2,86
± 2,64
± 2,29
± 2,42
± 2,73
± 3,02 ± 2,86
± 3.13
P
0,129
0,631
0,131
0,705
0,181
0,179
0,564
0,483
Stage
I & II
64
20
21
20
14
22
21
36
24
III & IV
66
27
26
31
16
28
36
41
31
P
0,277
0,469
0,075
0,836
0,372
0,014
0,593
0,292
Återfall
Peritoneal
24 10
9
8
5
10
12
16
11
Lymfkörtel
10 4
3
3 2
5
4
6
3
hematogen
22
13
11
14
8
11
14
15
10
Totalt
56
27
23
25
15
26
30
37
24
P

0,422
0,507
0,070
0,428 0,826
0,415
0,899
0,663
Vital status
119
42
41
47
29
44
51
68
48
Alive
70
19
21
26
16
20
24
36
27
Dead
49
23
20
21
13
24
27
32
21
P
0,021
0,152
0,330
0,402
0,019
0,019
0,094
0,389
P
värden mindre än 0,05 indikeras i fetstil tryck. Review, en stor del (52%) av diffus typ gastric cancer hade en eller inga kromosomala förluster, som klassificerades i en baslinje-nivå LOH (LOH-B), eftersom de flesta av tarm -och blandad typ cancer (86%) hade två eller flera kromosom förluster (Figur 2) [7]. De LOH fall på hög nivå med fyra eller fler kromosomala förluster var vanligast i de blandade differentierings fall med både intestinal- och diffus typ gastric cancer (44%). Sammantaget 15 LOH-B (10%), 65 LOH-L (45%), 50 LOH-H (35%), och 15 MSI (10%) fall konstaterades i 145 kirurgiska prover. Figur 2 Relationer mellan histologiska typ och nr. av kromosom förluster i gastric cancer. Den histologiska typen av magcancer definierades som diffuse- (n = 32, sluten låda), intestinal- (n = 54, grå ruta), och blandade typer (n = 44, öppen låda), enligt Lauren klassificering.
Analys av genen densitet och hög grad uttryckta gener på cancerassocierade kromosomer
densitet av gener per 1-Mb segmentet de 100 aktiva gener som var starkt uttryckt i magen, och frekvensen av LOH genotyper som upptäckts i gastric cancer analyserades på varje kromosom (tabell 2). I jämförelse med de åtta cancerassocierade kromosomer vi granskade och de återstående 14 kromosomer, tätheten av gener (4,8 gener kontra 6,9 gener per 1-Mb-segmentet) och det genomsnittliga antalet hög grad uttryckta generna (3,3 gener kontra 5,3 gener) var lägre i cancerassocierade kromosomer än i de andra kromosomer. Det genomsnittliga antalet transkript som uppskattas i varje starkt uttryckt gen var också låg i cancerassocierade kromosomer (54 kontra 69 avskrifter per varje gen). De individuella autosomer grupperades i storleksordningen genen densiteter. Kromosomerna 2, 3, 4, 5, 8, 13 och 18 kategoriseras i låg genen densitet grupp mindre än fem gener per 1 Mb segment. Kromosomerna 11, 16, 17, 19, 20 och 22 hade en hög täthet av gener från mer än åtta gener per 1 Mb segment. Följaktligen av de åtta cancerassocierade gener som undersöktes, sex (kromosomer 3, 4, 5, 8, 13 och 18) tillhörde gen fattiga kromosomer, och de återstående två generna tillhörde medel- (kromosomen 9 ) och hög (kromosom 17) gen densitet grupper. Kromosomerna 17 och 13 innehöll höga och låga tätheter av gener (13,4 och 2,7 gener per 1-Mb-segmentet), respektive. Kromosom 17 visade en hög frekvens av LOH i LOH-L (49%), men inte i de fall de LOH-B (13%). Frekvensen av kromosom 13 förlust var likartad i LOH-L (25%) och fall LOH-B (27%). Tabell 2 Genen densitet, högt uttryckta gener, och LOH nivå på enskilda kromosomer uppskattas i magen cancer och noncancerous vävnader
vid No. av gener per 1-Mb segment *
Top 100 starkt uttryckta gener
(Antal utskrifter per gen) *
Nivå LOH (%) §


vid vid baslinjen
(n = 15)
Låg
(n = 65)
Hög
(n = 50)
cancerassocierade kromosomer
3
4,9
3 (76) Review 1 (7) Review 18 (28) Review 28 (56) 4
3,6
5 (53) Review 2 (13) Review 12 (18) Review 33 (66) Review 5
4,4
4 (44) Review 0 (0) Review 14 (22) Review 37 (74) Review 8
4,1
3 (32) Review 0 (0)
9 (14) Review 21 (42) katalog 9
5,2
4 (60) Review 1 (7) Review 15 (23) Review 34 (68)
13
2,7
2 (121) Review 4 (27) Review 16 (25) Review 37 (74) Review 17
13,4
5 (42)
2 (13) Review 32 (49) Review 43 (86) Review 18
3,2
0 (0) Review 1 (7) Review 18 (28)
36 (72) Review Medelvärden
4,8
3,3 (54) Review Andra kromosomer 1
7,7
8 (47) 2
4,7
9 (132) Review 6
5,8
7 (39) katalog 7
5,2
6 (45) Review 10
5,0
2 ( 37) katalog 11
8,9
9 (85) Review 12
7,3
10 (62) Review 14
5,3
6 (43) Review 15
5,3
2 (90) Review 16
8,6
3 (34) Review 19
19,8
8 (61) Review 20
8,3
2 (76) Review 21
5,1
en (268) katalog 22
8,4
en (55) Review Medelvärden
6,9
5,3 (69) Review * Totala antalet transkript av 17,723 gener analyserades med användning av de tidigare publicerade data [21].
§The detaljer finns beskrivna i avsnittet material och sätt.
Förhållanden mellan de clinicopathologic funktioner och den mikro genotyper sälja The 145 gastric cancer analyserades för förhållandet mellan nivån på LOH och clinicopathologic funktioner (tabell 3). Både LOH-H och LOH-B gastric cancer var vanligen förknippas med högrisk fenotyper såsom lymfatisk invasion (P
= 0,006), venös invasion (P
= 0,005), avancerade stadier (P
< 0,0001), återfall (P
= 0,023) och en dålig överlevnad (P Hotel < 0,0001), medan LOH-L och MSI gastric cancer var korrelerade med väl och måttligt differentiering (P
= 0,033) och en tidig tumörstadium (P Hotel < 0,0001). De två genotyper samband med högrisk-fenotyp var olik enligt den anatomiska platsen för händelsen och mönstret av återfall. De LOH-H fall inträffade ofta i antral delen (70%) och de återkom genom hematogen spridning till levern, lungorna och andra avlägsna organ (38%), såväl som icke-hematogen metastas såsom peritoneal sådd och körtelinvolvering ( 36%). De flesta av de LOH-B-fall var närvarande i hjärt- och kroppspartiet (94%) och de återfallit i den peritoneala håligheten (67%), i stället för i avlägsna organ (13%). Uppkomsten ålder LOH-B (45 år) och LOH-H (65 år) fall var signifikant (P Hotel < 0,0001) .table 3 Relationer mellan mikro genotyper och clinicopathologic funktionerna i magcancer
Egenskaper
vid Högrisk genotyper

vid låg risk genotyper
vid P
värde
vid (%)
LOH H (%) *
LOH-B (%) *
P
värde
LOH-L (%) *
MSI (%) *
P
värde
vid No. patient
145
50
15
65
15
Ålder (år) Hotel < 0,0001
0,038
0,710
Mean
61
65
45
60
67
SD
± 12,5
± 9,8
± 12,7
± 11,6
± 9,8
Sex
0,118
0,008
0,393
Man
90 (62) Review 36 (72) Review 7 (47) Review 43 (66) Review 4 (27) Review Kvinna
55 (38) Review 14 (28) Review 8 (53) Review 22 (34)
11 (73) Review Tumörstorlek storlek~~POS=HEADCOMP
0,247
0,502
0,394
Mean
5,34
5,3
6,34
5,0
5,6
SD
± 2,94
± 2,62
± 3,77
± 3,10
± 2,33
Differentiering
0,052
0,094
0,033
Väl
11 (8) Review 3 (6) Review 8 (12) Review Medel
53 (36) Review 17 (34) Review 1 (7) Review 25 (39)
10 (67) katalog Poor
81 (56) Review 30 (60) Review 14 (93) Review 32 (49) Review 5 (33) Review Tumör plats Hotel < 0,0001
0,037
0,791
Cardia
13 (9) Review 3 (6) katalog 4 (27) Review 6 (9) Review Body
50 ( 35) Review 12 (24) Review 10 (67) Review 26 (40) Review 2 (13) Review Antrum
82 (56) Review 35 (70)
1 (6) Review 33 (51) Review 13 (87) Review Lauren klassificering Hotel < 0,0001
0,016 Hotel < 0,0001
Intestinal
58 (40) Review 19 (38) Review 0 (0) Review 35 (54) Review 4 (27) Review Diffusa
32 (22 ) Review 9 (18) Review 15 (100) Review 8 (12) Review 0 (0) Review Blandad
55 (38) Review 22 (44) Review 0 (0) Review 22 (34) Review 11 (73) Review tillväxtmönster
0.600 Hotel < 0,0001 Hotel < 0,0001
Expanderande
20 (14) katalog 1 (2) Review 1 (7) Review 9 (14) Review 9 (60) Review infiltrativt
70 (48 ) Review 32 (64) Review 10 (67) Review 28 (43) Review Mixed
55 (38) Review 17 (34) Review 4 (26) Review 28 (43) Review 6 (40) Review lymfatiska invasion
1,000
0,771
0,006
Ingen
44 (30) Review 9 (18) Review 3 (20) Review 34 (52) Review 5 (33) Review Ja
101 (70) Review 41 (82) Review 12 (80) Review 31 (48)
10 (67) Review Venös invasion
0,351
0,113
0,005
Ingen
112 (77) Review 35 (70) Review 8 (53)
54 (83) Review 15 (100) katalog Ja
33 (23) Review 15 (30) Review 7 (47) Review 11 (17) Review tumörstadium

0,757 0,763 Hotel < 0,0001
Tidig
75 (52) Review 16 (32) Review 6 (40) Review 42 (65) Review 11 (73) Review Advanced
70 (48 ) Review 34 (68) Review 9 (60) Review 23 (35) Review 4 (27) Review Återfall
0,035
0,517
0,023
Icke