DNA-kopia antal profiler för magcancer prekursor skador

DNA-kopia antal profiler för magcancer prekursor lesioner Bild Sammanfattning
Bakgrund
Kromosomal instabilitet (CIN) är den vanligaste typen av genomisk instabilitet i gastriska tumörer, men dess roll i malign transformation av magslemhinnan är fortfarande oklar . I den aktuella studien, vi bestämde sig för att studera om två morfologiskt distinkta kategorier av magcancer prekursor lesioner, dvs intestinal-typ och pyloric körtel adenomas, skulle bära olika mönster av DNA-kopieantal förändringar, möjligen återspeglar olika genetiska vägar av gastric cancer i dessa två adenom typer.
Resultat
använda en 5K BAC array CGH plattform, visade vi att de vanligaste avvikelser som delas av de 11 intestinal-typ och 10 pyloric körtel adenom var vinster av kromosomer 9 (29%), 11q ( 29%) och 20 (33%), och förlust av kromosomer 13q (48%), 6 (48%), 5 (43%) och 10 (33%). De vanligaste avvikelser i tarm-typ gastric adenom var vinster på 11q, 9q och 8 och förluster på kromosomer 5q, 6, 10 och 13, medan pyloric körtel gastric adenom dessa var vinster på kromosom 20 och förluster på 5q och 6. emellertid var inga signifikanta skillnader observerades mellan de två adenom typer.
Slutsats
resultaten tyder på att vinster på kromosomerna 8 9q, 11q och 20, och förluster på kromosomer 5q, 6, 10 och 13, troligen representerar tidigt händelser i gastric cancer. De fenotypiska enheter, intestinal-typ och pyloric körtel adenom, dock inte skiljer sig signifikant (P = 0,8) i nivå med DNA-kopietal förändringar.
Bakgrund
Gastric cancer är den näst vanligaste malignitet världen över och prognos av denna malignitet förblir mycket dålig [1]. Gastric cancer incidens och dödlighet skiljer sig mellan olika länder inom Europeiska unionen [2]. I Nederländerna rankas femte som en orsak till cancerdöd, med cirka 2200 nya fall varje år [3]. Kirurgi i kurativt syfte är behandling av valet i avancerade fall av magcancer, medan lokala endoskopisk mucosectomy kan vara botande i magcancer tidigt. Upptäckt och borttagning av gastric neoplasier i ett tidigt eller ens premaligna tillstånd kommer att bidra till att minska dödsfall på grund av magsäckscancer. För att uppnå detta mål, behövs bättre test för tidig upptäckt av magcancer, och en ökad förståelse för biologi magcancer progression är avgörande i detta avseende.
Enligt Correa modellen, gastriskt adenokarcinom följer patogenes av intestinal-typ en väg av kronisk aktiv gastrit grund av Helicobacter pylori
infektion, vilket leder till mukosala atrofi, intestinal metaplasi följt av intraepitelial neoplasi och slutligen invasiva adenokarcinom [4]. Genetisk karakterisering av vävnadsprover i intraepitelial neoplasi skede skulle bidra avsevärt till vår förståelse av den molekylära patogenes av magcancer. Men dessa lesioner sällan upptäcks, möjligen på grund av snabb utveckling genom detta skede mot cancer, och är vanligtvis närvarande endast i delar av biopsiprover, hindrar genomisk analys av dessa skador. Analys av alternativa prekursor sår kunde därför, åtminstone delvis, vara ett substitut. Utveckling av magcancer genom ett adenom skede, men mindre vanliga, är en sådan alternativ väg. Dessa adenom är ibland upptäcks under gastroskopi och närvarande som stora skador som histologiskt visar intra-epitelial neoplasi, vilket gör dem lämpliga för genomisk analys. Gastric adenom har en direkt malign potential och står för cirka 20% av alla epitelceller polyper [5, 6]. Gastric adenom kan ha en klassisk rörformad, tubulovillous eller villi morfologi med en övervägande intestinal typ epitel, men kan också visas som pyloric körtel adenom [6]. Pyloric körtel adenom uppstår från djupa mukoida körtlar i magen och är starkt positivt för mucin 6 [7, 8]. Ett stort antal av gastric adenom visar redan progression till adenocarcinom. På första diagnos omkring 30-40% av alla pyloric körtel adenom redan visar en inriktning av cancer [9, 10]. För intestinal-typ adenom detta nummer är lägre och varierar från 28,5% för villösa adenom och 29,4% för tubulovillous typ adenom till endast 5,4% i de rörformade adenom [11]. Båda adenokarcinom, ex intestinal typ adenom och ex pyloric körteln adenom, visar glandulära strukturer, i motsats till diffus typ magsäckscancer. Review, en viktig funktion i patogenesen av de gastric cancer, liksom i många andra fasta cancerformer är kromosom instabilitet , vilket resulterar i vinster och förluster av delar eller till och med hela kromosomer [12]. Dessa kromosomförändringar kan analyseras genom jämförande genomisk hybridisering (CGH). Flera tidigare studier har upptäckt genetiska förändringar i gastric adenom med denna teknik, är vinster på kromosom 7q, 8q, 13q, 20q, och förluster på kromosom 4p, 5q, 9p 17p och 18q [13-16]. Även ovanligt och endast observerats i adenom med hög kvalitet intraepitelial neoplasi, har hög nivå förstärkningar upptäckts på kromosomer 7q, 8p, 13q, 17q och 20q [13-16]. I gastric adenokarcinom, konsekvent beskrivna kromosomavvikelser är vinster på kromosom 3q, 7p, 7q, 8q, 13q, 17q och 20q och förluster på kromosom 4q, 5q, 6q, 9p, 17p och 18q. Hög nivå förstärkningar har upprepade gånger upptäckts på 7q, 8p, 8q, 17q, 19q och 20q [14, 17-23]. Ändå kromosomavvikelser, eller DNA-kopia numret ändras, är inte enhetliga i magcancer [24]. Grupper med olika mönster av DNA-kopietal förändringar kan identifieras, som har visat sig vara associerade med kliniskt utfall såväl [25].
I den aktuella studien, vi bestämde sig för att studera om två morfologiskt distinkta kategorier av magcancer prekursor-lesioner, dvs intestinal-typ och pyloric körtel adenomas, skulle bära olika mönster av DNA-kopieantal förändringar, möjligen återspeglar olika genetiska vägar av gastric cancer i de två adenom typer.
Resultat
DNA kopietal förändringar observerades i 10 av 11 intestinal typ adenom och nio av tio pyloric körteln adenom. Det genomsnittliga antalet kromosomala händelser, definierad som vinster och förluster per tumör var 6,0 (intervall 0-18), inklusive 2,9 (intervall 0-14) vinster och 3,0 (intervall 0-7) förluster. I intestinal typ adenom, det genomsnittliga antalet kromosomhändelser per tumör var 6,5 (intervall 0-18) varav 3,4 (intervall 0-14) vinster och 3,1 (intervall 0-7) förluster, och i pyloric körteln adenom medelvärdet tal var 5,4 (intervall 0-9), 2,4 (intervall 0-7) och 3,0 (intervall 0-7) respektive.
i tarm typ gastric adenom, de vanligaste avvikelser observerades var vinster på kromosomerna 8, 9q och 11q, och förluster på kromosomer 5q, 6, 10 och 13. i fyra adenom (36,4%), var vinst på kromosom 11q23.3 observeras med en gemensam region av överlappning på 2,6 Mb. Förstärkning av kromosom 9q observerades i fyra adenom (36,4%) med en 12,6 Mb gemensam region av överlappning belägen på kromosom 9q33.1-q34.13. Förstärkning av kromosom 8 observerades i tre adenom (31%), två av vilka adenom visade vinst om hel kromosom 8, och den tredje adenom visade en förstärkning av kromosom 8p-q22.3 med ytterligare 28,7 Mb förstärkning på kromosom 8q24.11 -qter. Därutöver har vinster observerades på kromosomerna 1, 3, 6p, 7, 11 p, 12p, 13q, 16, 17, 19, 20 och 22q. Inga förstärkningar sågs i tarm typ adenom.
Strykningar på kromosom 13 observerades i sju intestinal typ adenom (64%). Av dessa fem visade en 11,9 Mb deletion av kromosom 13q21.2-21.33 med ytterligare 7,7 Mb radering på kromosom 13q31.1-31.3. De andra två adenom visade en 16,6 Mb radering av 13q14.3-31. En deletion på kromosom 6 observerades i sex adenom (55%), med en överlappande region av 68,9 Mb belägna på 6cen-q22.1. En deletion av kromosom 5q observerades i fyra adenom (36%) med en gemensam region av överlappning belägen på kromosom 5q22.1-q23.2. Dessutom har en deletion av hela kromosom 10 observerades i fyra adenom (36%). Andra förluster som observeras i tarm-typ adenom var belägna på kromosomerna 8q, 9P, 10, 12q, 20Q och 21. En översikt över alla DNA-kopietal aberrationer hos de intestinala-typ adenom visas i tabell 1.Table en Översikt av DNA kopieantal förändringar i 11 intestinal typ adenom
vid Kromosomavvikelser

Kompletterande kloner
vid vid tumör ID
Vinster
Förluster
segmentstorleken (Mb) Review
Start
End
en
1p-p36.11
26,68
RP11-465B22
RP1-159A19
5q13.2-q23 0,2
55,26
RP11-115I6
CTB-1054G2
6p21.33-p21.1
13,78
RP11-346K8
RP11-227E22
6p21.1 -q16.1
52,05
RP11-89I17
RP3-393D12
9q33.1-34.2
17,32
RP11-27I1
RP11-417A4
11q23.3
4,80
RP11-4N9
RP11-730K11
13q21.1-q31.3
39,63
RP11-200F15
RP11-62D23 2
1p -1p33
46,90
RP11-465B22
RP11-330M19
6p21.33-p21.1
14,12
RP11-346K8
RP11-121G20
6p21.1 -q16.2
54,91
RP11-554O14
RP11-79G15
8p-q22.3
105,67
GS1-77L23
RP11-200A13
8q24.11 -qter
28,65
RP11-278L8
RP5-1056B24
9q33.1-q34.2
13,63
RP11-85O21
RP11-417A4
11p11.2 -q13.5
31,69
RP11-58K22
RP11-30J7
11q23.3
2,62
RP11-4N9
RP11-62A14
12q13.11-Q14 0,1
10,57
RP11-493L12
RP11-571M6
13q21.1-q21.33
18,24
RP11-200F15
RP11-335N6
13q31.1 -q31.3
12,49
RP11-533P8
RP11-62D23
16p13.3-q21
57,26
RP11-243K18
RP11-405F3
16q21-q22 0,1
5,97
RP11-105C20
RP11-298C15
16q22.1-q24.3
22,46
RP11-63M22
CTC-240G10
17
81,24
GS1-68F18
RP11-567O16
19
61,01
CTB-1031C16
GS1-1129C9
20q11.21-q11.23
5,09
RP3-324O17
RP5-977B1
20q13.12-qter
19,60
RP1-138B7
CTB81F12
3 -
-
4
6p21.1
3,32
RP11-79J5
RP11-121G20
6p12.3-q22.1
76,38
RP11-79G12
RP11-59D10
7
156,89
RP11-510K8
CTB-3K23
8q22.3-q23.3
9,69
RP11-142M8
RP11-261F23
9q33.1-q34 0,13
12,58
RP11-55P21
RP11-83N9
11q23.3
3,04
RP11-4N9
RP11-8K10
13q21.2-q21.33
17,05
RP11-240M20
RP11-77P3
13q31.1-q31.3
11,68
RP11-400M8
RP11-100A3
16q23.2-Q24 0,3
8,92
RP11-303E16
RP4-597G12
20p-q13.2
53,40
CTB-106I1
RP5-1162C3
20q13.31-qter
8,06
RP5-1167H4
CTB-81F12
22q
33,72
XX-P8708
CTB-99K24
5
12q24.31-qter
11,75
RP11-322N7
RP11-1K22
6
3
193,37
RP11-299N3
RP11-279P10
6cen-q24.1
88,49
RP11-91E17
RP11-86O4
7
156,09
RP11-510K8
RP11-518I12
8
144,26
RP11-91J19
RP5 -1118A7
13q21.1-q21.33
11,86
RP11-640E11
RP11-452P23
13q31.1-q31.3
9,62
RP11-400M8
RP11-306O1
20q13.2-q13.31
1,41
RP11-212M6
RP4-586J11
7
5q21.1-qter
80,52
CTC -1564E20
RP11-281O15
10
132,19
RP11-29A19
RP11-45A17
13q21.33-31.1
8,76
RP11-209P2
RP11 -470M1
8
5q22.1-q23.2
13,28
RP11-276O18
RP11-14L4
6p12.3-q22.1
74,37
RP11 -89l17
RP11-149M1
9p21.1-pter
31,18
RP11-147I11
RP11-12K1
10
133,18
RP11-10D13
RP11 -45A17
13q14.3-q31.3
39,71
RP11-211J11
RP11-306O1
17
77,65
GS1-68F18
RP11-398J5
19
63,31
CTC-546C11
CTD-3138B18
20
60,87
RP4-686C3
RP4-591C20
22q
31,25
XX -bac32
CTA-722E9
9
5q14.3-q23.2
33,06
RP11-302L17
RP11-14L4
6p22.2-q22.3
8,44
RP11-91n3
RP11-88h24
6p12.1-q24.1
88,89
RP11-7h16
RP11-368P1
8
145,95
GS1-77L23
CTC-489D14
9q33.1-qter
13,60
RP11-91G7
GS1-135I17
10
133,18
RP11-10D13
RP11-45A17
11q23.3
3,16
RP11-4N9
RP11-215D10
13q14.3-qter
58,59
RP11-240M20
RP11-480K16
20q13.2-q13.31
1,96
RP11-55E1
RP5-832E24
21cen-q21.3
17,39
RP11-193B6
RP11-41N19
10
8q22.3-q23.3
12,93
RP11-142M8
RP11-143P23
10
134,52
RP11-10D13
RP11-122K13
13q21.1-q21.33
18,03
RP11-322F18
RP11-335N6
13q31.1-q31.3
8,99
RP11-533P8
RP11 -505P2
11 -
-
vanligaste aberration observerats i pyloric körtel adenom var vinster på kromosom 20 och förluster på kromosomer 5q och 6. vinster på kromosom 20 sågs i fyra adenom (40 %). Tre adenom visade en 9,8 Mb vinst på kromosom 20q13.12-q13.33, och förstärkning av hela kromosom 20 observerades i andra adenom. Därutöver har vinster sett på kromosomerna 1, 3q, 5q, 7, 9q, 11q, 12q, 13q, 15q, 17 och 22q. En pyloric körtel adenom visade förstärkningar, som ligger på 12q13.2-q21.1 och 20q13.3-q13.33.
Fem pyloric körteln adenom (50%) visade förlust av kromosom 5q, varav två hade förlorat en hel kromosom arm, medan två adenom visade en 22,4 Mb deletion av 5q11.2-q13.3 och ett adenom en 40,3 Mb deletion av 5q21.1-q31.2. Förlust av kromosom 6 observerades i fyra pyloric körteln adenom (40%), varav tre visade en total förlust av 6q och ett adenom visade en 51,2 Mb deletion av 6p21.1-q16.3. Andra kromosomala förluster observerades på kromosomer 1P, 2q, 4, 9p, 10, 12q 13q, 14q, 16, 18q, 20q, och 21. En översikt av DNA-kopietal aberrationer av pyloric körtel adenomas visas i tabell 2.Table 2 Översikt av DNA-kopian numret ändras i 10 pyloric körtel adenom
vid Kromosomavvikelser

Kompletterande kloner
vid vid tumör ID
Vinster
Förluster
segmentstorleken (Mb )
Start
End
12
1q21.3-q23.3
9,95
RP11-98D18
RP11-5K23
1q42.13-q43
14,07
RP11-375H24
RP11-80B9
3q
111,59
RP11-312H1
RP11-23M2
5q35.1-q35 0,3
9,11
RP11-20O22
RP11-451H23
6q
115,76
RP11-524H19
RP5-1086L22
7
156,09
RP11 -510K8
RP11-518I12
17
77,48
RP11-4F24
RP11-313F15
20
63,47
CTB-106I1
CTB-81F12
13 -
-
14 4
191,13
CTC-963K6
RP11-45F23
5q
128,59
CTD-2276O24
RP11-281O15
14q
83,81
RP11-98N22
RP11-73M18
16
89,71
RP11-344L6
RP4-597G12
20q13.2 -q13.33
10,84
RP4-724E16
CTB-81F12
15
9q33.2-q34.3
16,81
RP11-57K1
RP11-83N9
11q23.2-q24.3
16,04
RP11-635F12
RP11-567M21
12q14.3-q15
2,58
RP11-30I11
RP11-444B24
20q13.31-q13.33
6,86
RP5-1153D9
RP5-963E22
22q
32,53
XX-p8708
CTA-722E9
16
9q33.3-qter
13,57
RP11-85C21
GS1-135I17
10p12.1-qter
110,28
RP11-379L21
RP11-45A17
11q23.1-q24.3
17,72
RP11-107P10
RP11-567M21
13q31.1-q32.1
10,84
RP11-661D17
RP11-40H10
20q13.2-q13.31
1,96
RP11-55E1
RP4-586J11
17
1p34.3-pter
35,59
RP1-37J18
RP11-204L3
1p33-qter
203,62
RP4-739H11
RP11-551G24
2q31.1-qter
66,00
RP11-205B19
RP11-556H17
5q21.1-q31.2
40,27
CTD-2068C11
RP11-515C16
5q31.3-qter
39,06
CTD-2323H12
RP11-451H23
6q
113,61
RP11-89D6
CTB-57H24
10
134,52
RP11-10D13
RP11-122K13
13q31.1-qter
36,14
RP11-388E20
RP11-245B11
20q13.2-qter
11,24
RP11-15M15
RP5-1022E24
18
5q11.2-q21 0,2
51,24
CTC-1329H14
RP1-66P19
6p12.1-q16.3
51,24
RP11-7H16
RP11-438N24
9pter-q13
66,82
GS1-41L13
RP11-265B8
10
133,04
RP11-10D13
RP11-45A17
13q21.1-q21.33
18,39
RP11-240M20
RP11-335N6
13q31.1-q31.3
12,45
RP11-551D9
RP11-100A3
21cen-q21.3
17,39
RP11-193B6
RP11-41N19
19
1p32.3-p21.1
50,40
RP11-117D22
RP5-1108M17
5q11.2-q13 0,3
24,64
RP4-592P18
CTD-2200O3
13q12.11-q14.3
31,58
RP11-187L3
RP11-327P2
15q12-q26 0,3
77,21
RP11-131I21
CTB-154P1
18q21.1-q23
31,31
RP11-46D1
RP11-154H12
22q13.2-qter
10,02
CTA-229A8
CTA-799F10
20
9p-q13
66,57
GS1-41L13
RP11-274B18
12q13.2-Q21 0,1 (amplifiering)
19,50
RP11-548L8
RP11-255I14
12q21.2-qter
55,56
RP11-25J3
RP11-1K22
18q21. 31-q23
23,28
RP11-383D22
CTC-964M9
20q13.13-q13.33 (amplifiering) Review 14,62
RP5-1041C10
RP5-1022E24
21
5p
43,15
CTD-2265D9
RP11-28I9
5q
130,26
RP11-269M20
RP11-451H23
6p
62,57
CTB-62I11
RP11-506N21
6q
106,73
RP11-767J14
RP5-1086L22
De vanligaste avvikelser som delas av både intestinal typ och pyloric körtel adenom var vinst på kromosom 9q (29%), 11q (29%), och 20q (33%) och förlust av kromosom 5 (43%), 6 (48%), 10 (33%) och 13q (48%). Genom att jämföra intestinal-typ och pyloric körtel adenom avslöjade CGH Multiarray åtta kloner att vara väsentligt annorlunda, varav sex är belägna på kromosom 6q14-q21 (p = 0,02 till 0,05) och två kloner på kromosom 9p22-p23 (p = 0,02 och 0,04, respektive) (fig 1). Inga gener belägna i de regioner som omfattas av dessa kloner har varit kända för att vara inblandade i cancerrelaterade biologiska processer. Ännu, CGH Multiarray Region, efter korrektion för multiplicitet, gav ett falskt upptäckt hastighet (FDR) av en för alla dessa regioner, vilket indikerar inga signifikanta skillnader mellan de två olika typerna av adenom på kromosomnivå. Obevakad hierarkisk klusteranalys gav 2 kluster. Inga signifikanta samband hittades här (p = 0,8). Figur 1 Jämförelse av DNA kopieantal förändringar i tarm och pyloric körtel typ gastric adenom. Ett p-värde (Y-axeln) beräknades för varje klon, baserad på en Wilcoxon test med band, och plottades i kromosomal ordning från kromosom 1 till 22 (X-axeln). Åtta kloner nått den nivå av signifikans (p < 0,05)., Men misslyckades med att upprätthålla en signifikant låg falsk upptäckten hastighet efter korrigering för multipla jämförelser
Diskussion
Med tanke på den heterogena fenotypen av magcancer, den aktuella studien syftar främst att jämföra antal kopior förändringar mellan intestinal typ adenom och pyloric körtel adenom, för att hitta leder mot genetiska vägar som är involverade i patogenesen av magcancer. Adenom till cancer progression observeras i 30-40% av pyloric körteln adenom och cirka 5-30% av intestinal-typ adenom (varierande från ca 5% i rörformiga adenom till nästan 30% för tubulovillous och villi adenom) [9-11], som anger direkt maligna potentialen hos dessa två adenom typer och göra gastric adenom en lämplig modell för att upptäcka tidiga händelser i gastric cancer.
pyloric körteln adenom utgör en nyligen erkänt enheten [8, 26]. Så vitt vi vet har denna typ av adenom aldrig analyserats av array CGH innan. Det genomsnittliga antalet händelser i den här typen av adenom var 5,4 (0-9), med 2,4 (0-7) vinster och 3 (0-7) förluster. Detta kan jämföras med det genomsnittliga antalet avvikelser i tarm typ adenom (6,5 (0-18), 3,4 (0-14) och 3,1 (0-7) respektive). I pyloric körtel adenom, ofta händelser var vinst på kromosom 20 och förluster på kromosomer 5q och 6, medan intestinal typ adenom visade huvudsakligen vinst på kromosomerna 8 9q och 11q och förluster på kromosomer 5q, 6, 10 och 13. I den aktuella studien, vinst på kromosom 7 var mindre vanligt än tidigare [16] fann. Även om dessa ofta förändrade regioner skiljer sig mellan de två typerna av adenom, hierarkiska kluster analyserar inte skilja grupperna. Dessutom gjorde CGH Multiarray Region inte avslöja några signifikanta skillnader efter korrigering för multipla jämförelser. Denna brist på statistiskt signifikanta skillnader kan bero på den begränsade provstorleken i kombination med det faktum att det i allmänhet, adenom visar små kromosomavvikelser. Å andra sidan, kan det helt enkelt vara så att dessa morfologiskt olika enheter som inte skiljer sig åt i fråga om kromosom vinster och förluster. Att hitta några signifikanta skillnader på kromosomnivå utesluter inte andra genetiska och biologiska skillnader såsom mutation eller promotor metylering status av specifika gener.
Aberrations redan upptäckts i adenom kan vara tidiga händelser i stegvis process att samla förändringar som kan orsaka progression av adenom till cancer. Som väntat, det genomsnittliga antalet kromosomala händelser var lägre i adenom jämfört med karcinom [13, 14, 27]. Dessutom hög nivå förstärkningar är ovanliga i adenom, medan karcinom visar ofta hög nivå förstärkningar [13, 16]. Sälja The avvikelser som finns i både intestinal-typ och pyloric körtel adenomas, såsom förluster på kromosom 5q, är också ofta upptäckts i gastriska karcinom [15, 19, 28]. Tidigare CGH Resultaten visade en signifikant högre antal kromosom 5q förluster i intestinal-typ cancer jämfört med diffus typ cancer [29]. Kromosom 6, också förlorat i båda typerna av adenom, ofta bort i gastriska karcinom som bestäms av LOH studier [30, 31]. Dessutom har kromosom 6q radering rapporterats vara inblandad i ett tidigt skede av gastric cancer, eftersom kromosom 6q deletioner ofta upptäcks i magcancer tidigt och även i intestinal metaplasi [31, 32]. Förluster av kromosomerna 10 och 13 har tidigare observerats i adenom vid lägre frekvenser. I gastric karcinom har både vinster och förluster på kromosom 10 och 13 observerats av tidigare CGH studier [15, 19, 21, 33]. Kromosom 10 hamnar onkogenen FGFR2
(10q26) och tumörsuppressorgener PTEN /MMAC1
(10q23) och DMBT1
(10q25-Q26), båda engagerade i cancer, vilket skulle kunna förklara observationen av både vinster och förlust av kromosomer 10 i gastriska karcinom [34-36]. Faktum kromosom 13 hamnar tumörsuppressorgener såsom BRCA2
(13q12.3) och retinoblastom-genen (RB1
) (13q14). Däremot har förstärkningen av kromosom 13q korrelerats till kolorektal adenom-till-karcinom progression, och amplifiering av kromosom 13 har observerats i gastriska adenom med svåra intraepitelial neoplasi [14, 37]. Den exakta rollen av kromosom 13 aberration i magcancer återstår därför att lösas.
Vanligaste kopietal vinster observerades på kromosomerna 8 9q, 11q och 20. Speciellt vinster av kromosomer 8 och 20 överensstämmer med tidigare (array) CGH studier i både gastric adenom och gastriska karcinom [13-16, 19, 25], implicerar detta som tidiga händelser i tumörbildning. Även förstärkningen av kromosom 11q inte har beskrivits som en frekvent händelse i adenom i karcinom vinst eller förstärkning på kromosom 11q är vanligt [13-16]. I den aktuella studien vinst på kromosom 11q var ofta observerats i adenom, vilket innebär den maligna potentialen hos dessa adenom.
Slutsats
Dessa data tyder på att vinster på kromosomerna 8 9q, 11q och 20 och förluster på kromosomer 5q, 6, 10 och 13 är tidiga händelser i gastric cancer. Trots de fenotypiska skillnaderna behöver intestinal-typ och pyloric körteln adenom inte signifikant på nivån för DNA-kopietal förändringar.
Metoder
Material
Tjugoen paraffininbäddade gastric adenom, 11 intestinal-typ och 10 pyloric körtel adenom, ingick i denna studie (figur 2A och 2B). Tumör och patientdata ges i tabell 3. För varje fall var en tumör område som består under minst 70% av tumörcellerna avgränsade på en 4 um hematoxylin och eosin färgade vävnadssnitt. Intilliggande 10-15 seriella sektioner av 10

• Nedreglering av bindvävstillväxtfaktor hämmar tillväxten och invasion av gastriska cancerceller och dämpar peritoneal dissemination
• Association mellan Helicobacter pylori genotyper och svårighetsgraden av kronisk gastrit, magsår och gastrointestinala interleukin-8 nivåer: Bevis från en studie i USA East