Tutkijat ottavat uuden askeleen ymmärtääkseen Salmonella -epidemian aiheuttavia bakteereja

Liverpoolin yliopiston tutkijat ovat ottaneet uuden askeleen eteenpäin ymmärtääkseen tuhoisia bakteereja Salmonella epidemia tappaa tällä hetkellä noin 400 000 ihmistä vuosittain Saharan eteläpuolisessa Afrikassa.

Julkaistu lehdessä PLOS -biologia ja edustaa viiden vuoden työtä, Integroivan biologian instituutin tutkijat ovat saaneet päätökseen yhden suurimmista bakteerien vertailututkimuksista tähän mennessä.

Invasiivinen ei -tyypillinen salmonelloosi (iNTS) esiintyy, kun Salmonella bakteerit, jotka yleensä aiheuttavat ruoansulatuskanavan sairauksia, pääsee verenkiertoon ja leviää ihmiskehon läpi. Afrikan iNTS -epidemia johtuu muunnelmasta Salmonella Typhimurium (ST313), joka on resistentti antibiooteille ja vaikuttaa yleensä henkilöihin, joiden immuunijärjestelmä on heikentynyt malarian tai HIV:n vuoksi.

"Vaikka Afrikan ja maailman genomit S. Typhimurium ovat 95% identtisiä, loput 5% ovat hyvin erilaisia, "selittää tutkimuksen kirjoittaja tohtori Rocío Canals Alvarez." Suurin osa näistä eroista ei aiheuta muutoksia geeniekspressiossa, mutta meidän on tunnistettava geneettiset muutokset, jotka vaikuttavat geenien ilmentymiseen ja voivat vaikuttaa bakteeri -infektion lopputulokseen ihmisillä. "

Näiden keskeisten geneettisten erojen löytämiseksi tutkijat tekivät laajamittaisen vertailevan transkriptomisen lähestymistavan tappavan afrikkalaisen välillä Salmonella ja yleinen maailmanlaajuinen versio, joka aiheuttaa maha -suolitulehdusta.

Tutkijat kasvattivat jokaista Salmonella kantoja 16 eri tavalla, jotka edustivat ihmisen infektioprosessin eri vaiheita. He erittivät myös salmonellan hiiren makrofageista - immuunisoluista, joita bakteerit käyttivät kaapatakseen isännän infektion aikana.

Tutkimalla afrikkalaisen ja maailmanlaajuisen transkription S. Typhimurium näissä eri olosuhteissa, he havaitsivat, että 677 geeniä ja pieniä RNA:ita ilmennettiin eri tavalla näiden kahden kannan välillä.

Rinnakkainen proteominen lähestymistapa tunnisti geeniekspressioerot, jotka johtivat muutoksiin proteiinitasolla. Kaksi periaatteellista kokeilua paljasti afrikkalaisen salmonellan metabolisen vian geneettisen perustan ja löysi uuden bakteeriplasmidin ylläpitojärjestelmän.

Jotta tutkijat ympäri maailmaa voivat käsitellä uutta tietoa, uudet tiedot esitetään käyttäjäystävällisessä online-työkalussa nimeltä

"Tämä tutkimus vie transkriptiikan voiman uudelle tasolle bakteerille." Toiminnallinen transkriptinen "lähestymistapamme on relevantti laajalle yleisölle ja sitä voidaan soveltaa moniin muihin organismeihin. innostaa muita käyttämään vastaavaa lähestymistapaa vastaamaan tutkimuskysymyksiinsä, "lisää professori Jay Hinton, joka johti tutkimusta.

• Tutkimus määrittää suoliston mikrobiomin antibioottihäiriön vaikutuksen luuston terveyteen
• Tutkimus osoittaa, kuinka herpesvirukset ja -kasvaimet ovat oppineet manipuloimaan samaa vanhaa RNA:ta