A kutatók olyan eszközt fejlesztenek ki, amely felgyorsítja az orvosbiológiai adatok elemzését és közzétételét

A Sinai -hegyi Icahn Orvostudományi Egyetem kutatói kifejlesztettek egy olyan eszközt, amely felgyorsítja az orvosbiológiai adatok elemzését és közzétételét sok hónapról vagy évről néhány percre, megváltoztatva azt, ahogyan a kutatók kommunikálják tanulmányaik eredményeit. Mostanáig, az elsődleges módszer az orvosbiológiai kutatási adatok megosztására a tudományos folyóiratokban történő nyomtatott közzététel volt. Az új eszköz, BioJupies, a felhőalapú technológiákra támaszkodva nagy mennyiségű adatot elemez és vizualizál, mint például a genomszekvenálás, számának 2018. novemberi számában leírtak szerint Sejtrendszerek .

Az RNS szekvenálás a leggyakoribb kísérleti módszer a sejtek profilozására az orvosbiológiai kutatások során. Az elmúlt években, a szekvenálási technológia forradalmasította a tudósok genetikai adatok vizsgálatának módját, és ez az előrelépés döntő szerepet játszik a gyógyszerek felfedezésében és fejlesztésében. Hagyományosan, Az RNS szekvenálás elemzése kiterjedt számítógépes programozási ismereteket és a helyi nagy teljesítményű számítási lehetőségek elérését igényli, lassítja az orvosbiológiai adatok elemzésének sebességét, megosztva, és közzétették.

A BioJupies létrehozásával A felhasználók most az idő töredékében tölthetik fel és elemezhetik RNS szekvenálási adataikat, mint korábban. A platform felhőalapú számítástechnikai csővezetéket használ, amely az RNS-szekvenáló adatfeldolgozás költségeit mintánként kevesebb mint egy centre csökkenti. A BioJupies teljes körű, nyílt forráskód, interaktív jelentés a feldolgozott adatokból, lehetővé téve 300, 000 nyilvánosan elérhető RNS szekvenáló adatkészlet lekérése, újra elemezték, és újra felhasználják az orvosbiológiai kutatások megerősítésére.

"Ahogy az előállított biomedikai adatok mennyisége folyamatosan ugrásszerűen növekszik, így azok elemzéséhez és megosztásához használt eszközöknek is, - mondta Avi Maayan, PhD, A Mount Sinai Bioinformatikai Központ igazgatója, Egyetemi tanár, Farmakológiai Tudományok Tanszék, az Icahn Adattudományi Intézet karán, és a kiadvány vezető szerzője. "A BioJupies nemcsak felgyorsítja az adatok elemzésének és értelmezésének módját, de egy teljesen új módot is kínál az eredmények megosztására a globális kutatói közösséggel. "

Mivel az új genomikai technológiák lehetővé tették, hogy hatalmas mennyiségű biomedikai információt gyűjtsenek, amelyek felhasználhatók a precíziós gyógyászati ​​erőfeszítésekhez, megközelíthetőség, kölcsönös átjárhatóság, és ezen adatok újrafelhasználhatósága kulcsfontosságúvá vált a tudományos kutatás szempontjából. A BioJupies megnyitja az utat a számítástechnikai háttérrel nem rendelkező kutatók számára, hogy RNS -szekvenálási elemzést végezzenek anélkül, hogy együttműködniük kellene a bioinformatikusokkal, lehetővé téve, hogy további orvosi és tudományos fejlesztések virágozhassanak adatgazdag világunkban.

• A kutatók azt vizsgálják, hogy ajánlott-e alacsony gluténtartalmú étrend az allergiát nem szenvedőknek
• A tanulmány új betekintést nyújt a norovírus kitörésekbe,