PLoS ONE: I livelli di mRNA chitinasi di PCR quantitativa Usando il DNA singolo standard: Acido mammiferi chitinasi è una trascrizione Maggiore nello stomaco mouse

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chitinasi idrolizzare i legami β-1-4 glicosidici di chitina, un importante componente strutturale di funghi, crostacei e insetti. Anche se i mammiferi non producono chitina o il suo sintasi, esprimono due chitinasi attivi, chitotriosidasi (Chit1) e chitinasi mammiferi acida (AMCase). Questi chitinasi mammiferi hanno attirato notevole attenzione a causa della loro maggiore espressione in individui con una serie di condizioni patologiche, tra cui la malattia di Gaucher, la malattia di Alzheimer e l'asma. Tuttavia, il contributo di questi enzimi per la fisiopatologia di queste malattie resta ancora da determinare. La quantificazione dei livelli Chit1 e AMCase mRNA e il confronto di tali livelli con i livelli di geni di riferimento noti possono generare informazioni utili e biomedico rilevante. In principio, abbiamo istituito un sistema di PCR real-time quantitativa che utilizza il DNA standard prodotto legando i frammenti di cDNA dei geni bersaglio. Questo sistema ha permesso di quantificare e confrontare i livelli di espressione delle chitinasi ei geni di riferimento sulla stessa scala. Abbiamo scoperto che AMCase mRNA è sintetizzato a livelli straordinariamente elevati nello stomaco del mouse. Il livello di questo mRNA nello stomaco topo era 7- a 10 volte superiore rispetto ai livelli dei geni housekeeping e era paragonabile a che il livello del mRNA per pepsinogeno C (progastricsin), un componente principale della mucosa gastrica. Così, AMCase mRNA è un importante trascrizione nel topo stomaco, suggerendo che le funzioni AMCase come un enzima digestivo che scompone chitina polimerica e come parte della difesa dell'ospite contro gli agenti patogeni chitina-contenente, in contenuto gastrico. La nostra metodologia è applicabile alla quantificazione di mRNA per geni multipli su più esemplari che utilizzano la stessa scala

Visto:. Ohno M, Tsuda K, M Sakaguchi, Sugahara Y, Oyama F (2012) chitinase mRNA livelli di Quantitative PCR usando il DNA singolo standard: acido mammiferi chitinasi è una trascrizione Maggiore nello stomaco mouse. PLoS One 7 (11): e50381. doi: 10.1371 /journal.pone.0050381

Editor: Dominik Hartl, Università di Tubinga, Germania

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