Tidligere forskning har avslørt at CoV er utsatt for overføring av arter. Derfor, innsamlingen av mer informasjon om dyre -CoV er avgjørende for å forutsi fremtidige CoV -utbrudd og forhindre zoonotiske overføringshendelser.
Studie:En sammenligningsanalyse av Coronavirus Nucleocapsid (N) -proteiner avslører SADS-CoV N-proteinet motvirker IFN-β-produksjon ved å indusere ubiquitinering av RIG-I. Bildekreditt:Design_Cells / Shutterstock.com
Forskere har nylig avslørt svin akutt diaré syndrom (SADS) -CoV, som tilhører slekten Alphacoronavirus, som et nytt patogen som forårsaker diaré hos nyfødte smågriser. SADS-CoV, som også er kjent som svin enterisk alphacoronavirus (SeACoV), hadde rapportert dødelighet over 35% i Sør -Kina under et utbrudd i 2017.
Bortsett fra SADS-CoV, ytterligere fire svine -CoV har blitt identifisert til dags dato; nemlig, smittsomt gastroenterittvirus (TGEV), svin hemagglutinerende encefalomyelittvirus (PHEV), grisepidemisk diarévirus (PEDV), og porcine delta coronavirus (PDCoV). Siden SADS-CoV er nært beslektet med bat CoV HKU2-stammer, forskere mener at denne stammen har dukket opp som et resultat av genetisk drift eller rekombinasjon mellom co-infiserende CoV-er.
Genomiske studier har vist at SADS-CoV omfatter en genetisk sekvens som består av fire strukturelle proteiner, syv uavhengige åpne leserammer (ORF) som koder for seksten ikke-strukturelle proteiner, og ett ekstra protein, som alle ligner det som finnes i mange CoV -er. Av de fire strukturelle proteiner, nukleokapsid (N) -proteinet inneholder en høyt konservert genomisk sekvens som er sterkt uttrykt. N -proteinet spiller en rolle i virusinfeksjon og er også involvert i transkripsjon av subgenomisk ribonukleinsyre (RNA), viral genomreplikasjon, og dets interaksjon med andre proteiner for å støtte virionmontering.
Tidligere studier har antydet at SADS-CoV N-proteinet er involvert i virusets unnvikelse av vertens medfødte immunrespons, som er kroppens første forsvarslinje mot skadelige patogener. Lengre, type I interferon (IFN) signalveien spiller en viktig rolle i å beskytte verten mot virusinfeksjon, som inkluderer primær identifisering av patogenassosierte molekylære mønstre (PAMPs) ved mønstergjenkjenningsreseptorer (PRR).
Som andre RNA -virus, CoVs produserer PAMPer inkludert dobbeltstrenget RNA (dsRNA) og 5′-ppp RNA-mellomprodukter i cytoplasma under replikasjon. Disse PAMPene blir deretter identifisert av vertsmønstergjenkjenningsreseptorer (PRR), slik som retinsyreinduserbare gen I (RIG-I) -lignende reseptorer (RLR). Ettergjenkjenning og aktivering av RIG-I og/eller melanomdifferensieringsassosiert gen 5 (MDA5) fører til deres interaksjon med caspaseaktiverings- og rekrutteringsdomener (CARD).
I ettertid, prionlignende polymerer dannes, som stimulerer nedstrøms
TANK -binding kinase 1 (TBK1) og hemmer av κ B kinase-ϵ (IKKϵ). Aktiveringen av TBK1 fører til fosforylering av interferon regulatorisk faktor 3 (IRF3) som, i sin tur, fremmer produksjonen av IFN -er av type I. Dette fører til slutt til uttrykk for hundrevis av IFN-stimulerte gener (ISG).
ISG uttrykkes på en autokrin og parakrin måte i et forsøk på å beskytte vertscellen mot viral invasjon. Til tross for disse medfødte forsvarene, virus kan ofte utvikle seg for å unngå vertscelleforsvaret. For eksempel, flere CoV -er kan hemme verts -IFN -responser under infeksjon.
En fersk studie publisert i Grenser i immunologi fokuserer på rollene til SADS-CoV N-proteinet i IFN-undertrykkelse under infeksjon. I denne studien, forskere sammenlignet aminosyrelikhetene mellom N -proteiner fra forskjellige CoV -er som tilhører fire forskjellige slekter. Målene for hvert N -protein assosiert med IFN -signalering blir også diskutert. Mekanismen for IFN-inhibering er blitt bestemt ved bruk av SADS-CoV N-protein via komparativ analyse.
Forskerne i denne studien avslørte at for undertrykkelse av IFN -signalering, trinnet for PAMP -gjenkjenning er et kritisk mål for N -proteinet. For dette formål, samspillet mellom SADS-CoV N-proteinet og RIG-I utløser ubiquitination, som fremmer proteasomavhengig nedbrytning. Dette fører til undertrykkelse av vertens IFN -svar.
Denne studien har også evaluert flere N-proteiner av SADS-CoV for å vurdere deres evne til å hemme IFN-respons. Til syvende og sist, forskerne fant at inhiberingen av denne responsen ikke er avhengig av aminosyresekvensens likhet. For eksempel, det er en 91,2% aminosyre-likhet mellom SARS-CoV-2 og SARS-CoV. Derimot, når det gjelder mekanismene som spilles for SARS-CoV-2, N -proteinet kan hemme aktiviteten til IFN -promotoren, som ellers er indusert av RIG-I, MAVS, TBK1, og IKKϵ, mens SARS-CoV N-protein ikke klarte å gjøre det.
Et slikt resultat fremhever viktigheten av tertiær struktur for å definere proteinfunksjon. Det er fortsatt et gap i dagens forskning i en fullstendig forståelse av den tertiære strukturen til CoV N -proteinet. Selv om dette kan være sant, data om strukturer i N -terminaldomenet (NTD) og C -terminaldomenet (CTD) for forskjellige CoV N -proteiner er for tiden tilgjengelig.
Resultatet av den nåværende forskningen er i tråd med tidligere rapporter. For dette formål, tidligere studier har vist at N -proteinet i PEDV provoserer verts -IFN -svar ved å samhandle med TBK1 direkte. I tillegg N-proteinet til SARS-CoV samhandler direkte eller indirekte med TRIM25 og proteinaktivatoren til proteinkinase R (PACT) for å aktivere RIG-I.
Den nåværende forskningen har også antydet at N-proteinet i SADS-CoV retter seg mot de første trinnene i IFN-responsen og kan direkte forstyrre aktiveringen av RIG-I. Denne komparative analysen har også vist at interferens ved bruk av RIG-I kan være den ledende metoden for N-proteinet i SADS-CoV for å undertrykke signalering av RIG-I-lignende reseptor (RLR). Denne studien observerte at SADS-CoV N-proteinet retter seg mot RIG-I for å hemme IFN-β-promotoraktivitet.
DNA -metabarkoding kan forbedre analysen av menneskelig kosthold
En type tarmbakterier kan øke risikoen for tarmkreft
Genetisk risiko for autoimmunitet kan være knyttet til forskjeller i tarmmikrobiomet
Fordøyelsesmanifestasjoner er vanlige, men milde blant sykehusinnlagte COVID-19 pasienter
Land med eldre befolkninger har høyere SARS-CoV-2 infeksjoner og dødsfall,
Menneskelige koronavirus trenger organiske materialer for å overføre effektivt mellom overflater
Organiske epler har probiotiske egenskaper
Et eple om dagen ... sier det gamle ordtaket. Det ser ut til at alle er enige, å dømme etter posisjon nummer 1 som epler holder blant frukt over hele verden, med 83 millioner epler som produseres hver
Bakterier i fødselskanalen er knyttet til lavere risiko for eggstokkreft
En ny studie viser at noe så enkelt som en livmorhalspinne kan ha potensial til å hjelpe hundrevis av kvinner som har ekstremt høy risiko for eggstokkreft fordi de har en mutasjon i BRCA1 -genet. Di
Pasienter på immunterapier bør konsumere mer fiber,
færre probiotika En ny studie har funnet ut at bruk av probiotika drastisk kan redusere kreftpasienters respons på immunterapi. Probiotika er fritt tilgjengelig uten resept og er ikke regulert av US