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Pesquisador de genômica da UChicago ganha Prêmio NIH Directors New Innovator

Oni Basu, PhD, um professor assistente de medicina genética na Universidade de Chicago, recebeu o prestigioso Prêmio Novo Inovador do Diretor do National Institutes of Health (NIH).

Esses prêmios, parte do alto risco do NIH, Programa de pesquisa de alta recompensa, são dados a cientistas excepcionalmente criativos que propõem alto risco, pesquisa de alto impacto em todas as fases da carreira. Prêmio Novo Inovador, financiado pelo Fundo Comum do NIH, está focado em apoiar pesquisadores em início de carreira, apoiar pesquisas invulgarmente inovadoras de investigadores em início de carreira que estão dentro de 10 anos após a conclusão de seu grau final. Este ano, 53 pesquisadores foram homenageados com o prêmio.

A amplitude da ciência inovadora apresentada pela coorte de 2020 de pesquisadores experientes e em início de carreira é impressionante e inspiradora. Estou confiante de que o trabalho deles impulsionará a pesquisa biomédica e comportamental e levará a melhorias na saúde humana. "

Francis S. Collins, M.D., Ph.D., Diretor do NIH

Desde que cheguei a UChicago em 2016, Basu trabalhou em vários projetos de pesquisa. Ela investiga sistemas biológicos complexos usando genômica de célula única - isolando células individuais e sequenciando suas informações genéticas para obter uma imagem melhor das diferenças celulares em uma amostra de tecido. Esse, por sua vez, fornece uma visão sobre os subtipos exclusivos de células e suas funções em um determinado tecido.

Basu treinou nos laboratórios de Aviv Regev, PhD, e David Weitz, PhD, ambos pioneiros no campo da genômica de uma única célula e microfluídica. A própria Basu é uma co-inventora das primeiras tecnologias de alto rendimento de célula única e de núcleo único de RNA-seq que possibilitaram sua adoção em larga escala em todo o mundo.

O laboratório de pesquisa Basu desenvolve e aplica novas tecnologias para conduzir perfis epigenômicos e transcriptômicos de célula única de alto rendimento de até 100, 000 células de uma vez. Com esta abordagem, sua equipe está trabalhando na análise e classificação de tipos únicos de células em uma variedade de tecidos, incluindo os cérebros de camundongos e humanos e populações de células microbianas.

Sua pesquisa também contribui para o Atlas de Células Humanas, um projeto global envolvendo especialistas em genômica de todo o mundo com o objetivo de criar um atlas completo de todos os tipos de células do corpo humano, tanto na saúde quanto na doença. Ela está trabalhando para identificar e caracterizar os tipos de células no intestino humano para estabelecer um atlas celular do íleo - a porção final do intestino delgado. Usando amostras de biópsia intestinal de pacientes com e sem doença de Crohn, ela procura compreender melhor os padrões de expressão de tipos celulares e específicos de doenças associados à condição debilitante.

Com o apoio do Prêmio Novo Inovador, Basu planeja levar essa tecnologia de célula única para o mundo microbiano. A variedade de tipos de células únicos em organismos multicelulares como os humanos levou à necessidade de estudar o genoma no nível de uma única célula; um nível semelhante de diversidade também pode ser esperado em comunidades microbianas. Uma melhor compreensão dessa heterogeneidade ajudará a responder a perguntas sobre tópicos complicados, como aptidão evolutiva e resistência antimicrobiana.

A produção de ferramentas capazes de investigar as diferenças entre as células microbianas na resolução de uma única célula permanece um desafio. Basu e sua equipe estão trabalhando para desenvolver ferramentas microfluídicas e genômicas que permitirão aos pesquisadores decifrar as complexas interações entre as populações microbianas, interação patógeno-hospedeiro e o microbioma.

O alto risco, O Programa de Pesquisa de Alta Recompensa catalisa a descoberta científica, apoiando propostas de pesquisa que, devido ao seu risco inerente, podem ter dificuldades no processo tradicional de revisão por pares, apesar de seu potencial transformador. Os candidatos ao programa são incentivados a pensar "fora da caixa" e a buscar idéias pioneiras em qualquer área de pesquisa relevante para a missão do NIH de avançar o conhecimento e melhorar a saúde.