Genomická analýza špecifického kmeňa E. coli môže pomôcť pri vývoji potenciálnych vakcín

Potravinové patogény sú veľmi časté a zvyčajne benígne, ale niektoré virulentné kmene patogénov môžu mať za následok vážne choroby a dokonca smrť. Rozlíšenie konkrétnych kmeňov patogénov môže vedcom pomôcť lepšie im porozumieť a vyvinúť biomarkery, ktoré ich pomôžu odhaliť u pacientov, urýchlenie diagnostiky a liečby.

Vedci z univerzity v Buffale teraz dokončili genomickú analýzu špecifického kmeňa Shiga-toxínu E. coli (STEC), ktorá môže spôsobiť vážne ohniská chorôb a je stále bežnejšia. Výskum by mohol hrať úlohu v rozšírení chápania infekcií STEC a, potenciálne, pri vývoji vakcín proti nim.

Podľa Centier pre kontrolu a prevenciu chorôb Odhaduje sa, že STEC spôsobuje viac ako 265, 000 infekcií ročne v USA, a sú spojené s viac ako 3, 600 hospitalizácií a približne 30 úmrtí.

Vydaný v BMC genomika minulý mesiac, článok popisuje genomickú analýzu dokončenú na jedinečnom kmeni STEC izolovanom od inak zdravého 2 ½ ročného dieťaťa žijúceho v Davidson County, Tennessee.

Patogén spôsobil vážne ochorenie, vrátane hemolyticko -uremického syndrómu, stav, ktorý ničí červené krvinky, znižuje krvné doštičky a blokuje krvné cievy v obličkách, čo má za následok anémiu a poškodenie obličiek.

Dieťa prežilo, ale bolo hospitalizované na mesiac a utrpelo vážne komplikácie postihujúce viaceré orgánové systémy, vrátane jej pľúc, Srdce, oblička, mozog, obehový systém a gastrointestinálny trakt.

Rastúce obavy o verejné zdravie

Produkuje Shiga-toxín E. coli bola infikovaná, ktorá nepatrí do 0157 STEC. Zatiaľ čo patogény klasifikované ako 0157 infekcií STEC sú vo všeobecnosti častejšie a vedú k závažnejším ochoreniam, počet vznikajúcich, patogénov STEC, ktoré nie sú 0157, je na vzostupe. Niektoré vedú k závažným chorobám, vyvoláva rastúci záujem o verejné zdravie, podľa výskumníkov UB.

Dokument uvádza, že existuje viac ako 400 týchto kmeňov STEC, ktoré nepochádzajú z 0157, a viac ako štvrtina údajne spôsobuje gastrointestinálne ochorenia, často sa prejavuje najskôr ako krvavá hnačka s hemolyticko -uremickým syndrómom a ak je neliečená, v zriedkavých prípadoch, smrť.

Špecifickým patogénom, ktorým bolo dieťa infikované, bol STEC 0145:H25. „Pretože genómové štúdie na nových STEC, ktoré nepatria do 0157, sú obmedzené, Naše štúdie sú významné, pretože odhaľujú genetické usporiadanie vznikajúcich STEC 0145:H25 v porovnaní s inými kmeňmi STEC. "

Oscar G. Gómez-Duarte, MD, PhD., Študujte zodpovedajúceho autora a docenta, Katedra pediatrie, Univerzita v Buffale

Gómez-Duarte je tiež vedúcim Oddelenia detských infekčných chorôb na Jacobsovej škole medicíny a biomedicínskych vied UB a pediatrom s UBMD Pediatrics.

„Zistenia odhaľujú, ako tento vznikajúci STEC spôsobuje vážne choroby a že môže byť rovnako virulentný, alebo ešte virulentnejšie, než bežnejšie kmene STEC, vedúce k závažným a dokonca smrteľným ochoreniam u vnímavých hostiteľov, "povedal." Poskytuje tiež informácie o tom, ako táto potenciálne preventívna infekcia naďalej ovplyvňuje zraniteľné osoby. “

Gény virulencie

Kľúčové zistenie štúdie, povedal, bolo, že tento sérotyp 0145:H25 vedie k obzvlášť závažnej infekcii. Navyše, okrem nosenia génov virulencie prítomných v 0157 STEC, v porovnaní s inými kmeňmi, ktoré neboli študované, má ďalšie gény a nové potenciálne gény virulencie. „Tieto zistenia si zaslúžia ďalšiu analýzu, aby sme pochopili patogenézu týchto vznikajúcich infekcií STEC, “povedala Gómez-Duarte.

• Vedci zistili súvislosť medzi narušeným spánkom,
• Mechanizmus starnutia psov a výkon pamäte spojený so zložením črevných mikrobiómov