En roman diffus gastrisk kræft modtagelighed variant i E-cadherin (CDH1) intron 2: En sag kontrol undersøgelse i en italiensk population

En roman diffus gastrisk kræft modtagelighed variant i E-cadherin (CDH1
) intron 2: En sag kontrol undersøgelse i en italiensk befolkning
abstrakt
Baggrund
arvet genetiske faktorer, såsom E-cadherin (CDH1
) promoter varianter menes at påvirke risikoen mod sporadisk diffus mavekræft (DGC). For nylig har en ny regulatorisk region afgørende for CDH1
transskription blevet identificeret i CDH1
intron 2.
Metoder
Vi genotypede alle kendte polymorfier beliggende inden konserverede sekvenser af CDH1
intron 2 (rs10673765, rs9932686, rs1125557, rs9282650, rs9931853) i en italiensk befolkning bestående af 134 DGC tilfælde og 100 raske kontrolpersoner (55 patient pårørende og 45 ubeslægtede, matchede individer). Indflydelsen af ​​individuelle varianter på DGC risiko blev vurderet ved hjælp af χ 2-test og logistisk regression. Den relative bidrag af alleler blev estimeret ved haplotypeanalyse
Resultater
Vi observerede en signifikant. (P < 0,0004) forening af CDH1
163 + 37235G > En variant (rs1125557) med DGC risiko. Odds ratio var 4,55 (95% CI = 2,09-9,93) og 1,38 (95% CI = 0,75-2,55) for AA og GA luftfartsselskaber, hhv. Korrigeret for alder, køn, rygning status, alkoholforbrug og H. pylori
infektion, de risikofaktorer skøn stort set betydning for AA luftfartsselskaber. Haplotypeanalyse foreslog de 163 + 37235A-allel bidrager til sygdomsrisiko uafhængigt af de andre varianter studeret
Konklusion
CDH1
163 + 37235G >. En polymorfisme kan repræsentere en ny modtagelighed variant til sporadisk DGC hvis bekræftet i andre befolkningsgrupper. I betragtning af den brede udtryk for E-cadherin i epitel, denne sonderende undersøgelse tilskynder til yderligere evaluering af 163 + 37235A-allel som en modtagelighed variant i andre karcinomer.
Baggrund
mavekræft er en væsentlig årsag til kræft-relaterede dødelighed og er normalt klassificeret i to histologiske typer, den tarm og diffuse formular (Lauren klassifikation [1]). De generelle incidensrater for mavekræft er i en konstant nedgang, hovedsagelig på grund af faldende priser på tarmkræft-type. Denne faldende frekvens menes at være resultatet af bedre ernæring og sanitære forhold. I modsætning hertil var forekomsten af ​​diffuse gastrisk cancer (DGC) alene synes mere stabile i de seneste årtier [1, 2]. Sådan en konstant hastighed foreslår en større bidrag af arvelige genetiske risiko snarere end miljømæssige faktorer til den diffuse form for mavekræft.
Grund af sin tidlige udvikling under maveslimhinden overflade [3], er DGC normalt diagnosticeres på et fremskredent stadium og derfor forbundet med en dårligere prognose [1]. Derfor kan genetiske DGC markører lette identifikationen af ​​personer med risiko og dermed bidrage til en forbedring af DGC diagnose og terapi.
På molekylært niveau, DGC adskiller sig fra den intestinale type på grundlag af sin unormal udtryk af cellen -celle adhæsionsmolekyle E-cadherin [4]. E-cadherin er centralt element i epitel adherens krydset, og som sådan er nødvendig for funktionel intercellulære vedhæftning inden epitel ark [5]. I modsætning til mange andre epitel kræftformer, er E-cadherin nedreguleret meget tidligt under DGC udvikling, hvilket tyder på en rolle i indledningen af ​​denne sygdom [3]. Mutation og promotor hypermethylering af E-cadherin genet (CDH1
) er de mest konsekvente genetiske ændringer observeret i sporadisk DGC [6, 7]. Desuden CDH1
germline mutationer disponerer for arvelig DGC [8] i overensstemmelse med en initierende funktion af E-cadherin mangel i DGC. CDH1
germline mutationer normalt co-segregerer med en dominerende mønster af sygdom blandt berørte familier, og lejlighedsvis kan findes i isolerede DGC tilfælde diagnosticeret i en ung alder (< 45 y) [9]. Men de udgør kun omkring 1% af alle DGC tilfælde [9], og kan derfor ikke forklare den genetiske ætiologi postuleres at bidrage til tilsyneladende sporadiske DGC sager. andre end CDH1
germline mutationer Genetiske ændringer er derfor sandsynligt, at tilføje til risikoen for at udvikle DGC i mangel af en klar familie historie eller en ung alder ved diagnose.
Fælles allelvarianter med en mild funktionel effekt kan påvirke risiko for sporadisk sygdom. Faktisk en enkelt (SNP) inden for CDH1
promotor (-160C > A) er blevet forbundet med en signifikant øget risiko for sporadisk DGC i visse høj forekomst befolkning [10-13]. Af de undersøgte CDH1
SNPs, den -160A promotor allelen er indtil videre den eneste variant impliceret i DGC risiko, men synes at virke i kombination med andre CDH1
polymorfier [10, 13].
Nylig, en ny CDH1
regulatoriske region er blevet beskrevet [14]. Denne region er indeholdt i CDH1
intron 2, den største ikke-kodende CDH1
segment (66% af den samlede sekvens) og har vist sig at være nødvendig for både initieringen og opretholdelsen af ​​transkriptionelle CDH1
aktivitet i differentieret epithel. Vigtigere, intron 2-sekvenser er også nødvendige for normal CDH1
transkription under voksenlivet, giver den mulighed, at varianter i denne region kan påvirke diffus gastrisk carcinogenese.
I denne undersøgelse har vi genotypet alle kendte varianter beliggende inden for konserverede sekvenser af CDH1
intron 2 og bestemt deres allele frekvenser i grupper af italienske sporadiske DGC sager og raske personer til at trævle mulige foreninger med sygdom.
Metoder
patienter
DNA-prøver blev indhentet fra 134 DGC patienter, der var indfødte i District of Pesaro-Urbino, Region Marche, Central Italien. Efter operationen blev DGC diagnosen uafhængigt bekræftet af to patologer. Patienterne blev evalueret klinisk på den lokale Medical Oncology Unit (Hospital d'Urbino), hvor de også gennemført en demografisk ark herunder deres personlige og familiær kræft historie. Data blev verificeret under interviews med deres onkologiske læger og deres familie historie blev sporet tilbage til ≥3 generationer og sideværts til 2 nd og 3 rd slægtninge. På grundlag af denne evaluering, ingen af ​​patienterne opfyldte de kliniske kriterier for kendte familiære cancer syndromer. Inklusionskriterierne for egnede patienter var: kaukasisk etnicitet, indfødte af de undersøgte geografiske område og manglende arvelig kræft. De samme kriterier plus mangel på personlig historie af kræft blev vedtaget for kontrollen. Kontrol-DNA-prøver blev opnået fra 55 sunde slægtninge, som enten var upåvirkede forældre (n = 15), søskende (22) eller børn (18) af de undersøgte DGC patienter. Da sunde slægtninge ikke var tilgængelige for alle DGC patient blev DNA-prøver fra en gruppe af uafhængige raske individer (n = 45) identificerede gennem puljen af ​​tidligere og nuværende bloddonorer fra hospitalet d'Urbino inkluderet giver i alt 100 kontroller. Uafhængige kontroller blev tilfældigt udvalgt med frekvenser matchende til tilfælde efter alder og køn. Gennemsnitsalderen for DGC patienter uden pårørende var 54,6 y ± 11.41SD, mens den for deres matchede kontroller var 52,2 y ± 10.21SD. Alle forsøgspersoner blev interviewet om deres ryge- og drikkevaner. H. pylori
status blev bestemt ved patologisk undersøgelse af gastriske prøver til tilfælde, og ved blod- eller ånde test for kontrol. De etiske krav blev verificeret og godkendt af den interne Etisk Udvalg (Hospital d'Urbino), og alle undersøgelsens deltagere gav deres skriftligt informeret samtykke.
CDH1 intron 2 bevarede regioner og polymorfier
bevarede dele af CDH1
intron 2 (GenBank NC_000016) blev identificeret ved at hente tilsvarende menneske, chimpanse, rotte og mus-sekvenser fra NCBI-databasen (NCBI, Entrez nukleotid) efterfulgt af justering ved hjælp af NCBI server (NCBI, Basic Local alignment Search Tool) og Invitrogen Vector NTI Advance ™ 9.0 software (Accelrys software Inc, San Diego, USA). Konserverede områder blev defineret som havende mindre end 5% sekvensvariationer mellem de forskellige arter. De konserverede regioner blev PCR-amplificeret i overlappende fragmenter på ca. 200 bp størrelse. De tilsvarende primere (se tabel 1 for sekvenser og betingelser), blev designet ved hjælp af GeneFisher online-værktøj [15], og fremstillet af Sigma-Proligo (Sigma-Aldrich Corporation, St. Louis, USA). FastStart Taq DNA polymerase (Roche, Basel, Schweiz) og PTC-200 PCR maskiner (MJ Research, Waltham, USA) blev anvendt. Følgende polymorfier er placeret (Ensemble GenomeBrowser [16]) inden de forstærkede områder: 163 + 14184ΔAGGG (rs10673765, ligger i PCR-fragment C2F1), 163 + 14384C > T (rs9932686, C2F2), 163 + 37235G > A (rs1125557, C3F2 ), 163 + 37276T > A (rs9282650, C3F2), og 163 + 49526C > G (rs9931853, C4F1). Den TESS online-værktøj [17] blev brugt til at søge efter formodede transskription bindende faktor sites, der kan blive berørt af ovenstående variants.Table 1 PCR primere og betingelser

Forward primer
Reverse primer
Ta *
Mg ++ †
DMSO ‡
C1F1
ccgccttaaagaaactcttg
accggtggcaaatactag
65 ° C
1,5 -
C1F2
tagaagggttgaacctgttc
tcttagtccacgagaagaag
65 ° C
1,5
-
C1F3
taggagagcttgtaacaagc
cactcggttctaccgaag
65 ° C
1,5 -
C2F1
tgtattagccacagagaag
ctaaaactagaccacgaag
65 ° C
1,5
-
C2F2
gtcacaaaacagcttg
ccttccttgagcaaggc
65 ° C
1,5 -
C3F1
ttgcctaaggccccctttttgttc
gaatctgcgaagtctacatc
65 ° C
1.5
-
C3F2
acactagccacacatgggactcaag
tgctggtgtggattcaaatgtg
65 ° C
1,5 -
C4F1
acctccgcctcctgggttcaagc
ttcctcccgcttagtg
60 ° C
1,5 -
C4F2
tggccaggcctgtcttaaactc
ttcttaggtccgtgggtttttacg
65 ° C
1,5 -
C4F3
aaagtgctgggattacaggtgtgag
tcgataatcccgagaactc
55 ° C
1,0
+
C4F4
gaaccataggactttgactgatgg
actgatggttatccgggttcccttg
65 ° C
1,5 -
C4F5
agctgttgagctgtcatcacaatcc
gaatttcctacccgtctatggtagg
65 ° C
1.5 -
C5F1
tagtggggagtggggtcttagcttc
tcgttcaccctcctttcttcttacc
58 ° C
1,5 -
C5F2
gggcatgttgaaatatacccagtc
tctgagtaatagaggggtacgttgg
65 ° C
1,5 -
C5F3
cttgccagcgtgacagtg
cgaaaccccgtggagtag
65 ° C
1,5 -
C5F4
caggttggggctcctcgtcatactg
cttccgacgtgacttaaggaaagag
65 ° C
1,5 -
C5F5
gcttgtctcaactttcactgtc
gaatttcctacccgtctatggtagg
65 ° C
1,5 -
C6F1
tggtattcaggaggatgcag
acctacgatcgtaaaaagt
65 ° C
1,5 -
C6F2
cccatcaatgcttatttgttctt
gcctgggagacggagact
65 ° C
1,5 -
C6F3
tgggctgtttgagttttgttc
cggtgtaaaaggttcgtgac
65 ° C
1,5 -
* Ta annealingstemperatur; † Mg ++ - koncentrationen er givet i mM; ‡ DMSO blev tilsat ved 5% fc
Single-konformationspolymorfisme
Single-konformationspolymorfisme (SSCP) blev anvendt til at scanne den konserverede intron 2 region i 19 italienske DGC patienter for tilstedeværelsen af ​​yderligere fælles, men befolkningsbaserede specifikke polymorfier. SSCP blev udført som beskrevet [18], med den undtagelse, at ULS ™ 495 fluorofor (kreatech Biotechnology, Amsterdam, Holland) blev anvendt i stedet for radioaktivitet til at mærke fragmenterne. Kort fortalt blev 1 pi PCR-produkt inkuberet med 0,2 pi farvestof i en 20 pi reaktion. . Geler blev scannet under anvendelse af et FX molekylær imager (BioRad, Hercules, USA) ved 488 nm
Genotypebestemmelse
Følgende restriktionsenzymer blev anvendt til genotypebestemmelse af DNA varianter: 0,06 U /pl BsaXI til 163 + 14184ΔAGGG, 1 U /ul Banll
for 163 + 14384C > T, 0,2 U /ul MaeIII
for 163 + 37276T > A, og 0,4 U /ul HpaII
for 163 + 49526C > G. Alle enzymer var fra New England Biolabs (Ipswich, USA) med undtagelse af MaeIII
fra Roche (Basel, Schweiz). Reaktioner blev inkuberet natten over og fragmenter blev adskilt på 4% (w /v) agarosegeler
Polymorphisms 163 + 37235G >. A og 163 + 37276T > A blev genotypebestemt på en ABI Prism 7900 (Applied Biosystems, Foster City, USA) ved hjælp af real-time PCR-baseret allele diskrimination analyser fra Applied Biosystems ifølge instruktionerne.
sekventering
Fundne varianter blev verificeret ved direkte sekventering ved hjælp af USB thermosequencing kit (USB, Cleveland, USA) og en LiCor 4000L DNA sequencer (LiCor, Lincoln, Nebraska USA).
Statistisk analyse
Differential distributioner blandt cases og kontroller blev vurderet af χ 2-test (med df = 2 for genotyper og df = 1 for alleler) . Risk blev estimeret ved univariat analyse og ved multipel logistisk regression (STATA software, StataCorp LP, College Station, USA). Den χ 2-test (df = 2) blev også anvendt til at undersøge afvigelser fra Hardy-Weinberg ligevægt. Aldersforskelle blandt patienter bærer forskellige genotyper blev beregnet under anvendelse af en 2-halet t-test.
Haplotypefrekvenser blev rekonstrueret fra unphased genotyper og bindingsuligevægt (LD) mellem SNP'er blev estimeret ved anvendelse af SHEsis software platform [19, 20]. Kun haplotyper med en relativ frekvens > 0,03 i begge tilfælde eller kontroller blev inkluderet i analysen. Global sammenslutning af haplotyper med sygdom blev beregnet ved en χ 2-test (df = 7). Den 163 + 14184ΔAGGG og 163 + 14384C > T varianter blev ikke medtaget i den endelige analyse, da de ikke var informativ. Foreningen af ​​individuelle haplotyper med sygdommen baseret på 2 × 2 kontingenstabeller i forhold til A-A-C-haplotype. LD blev udtrykt som r 2, med r 2 = 1 indikerer komplet LD, r 2 = 0 fravær af LD, og ​​r 2 < 0,33 tyder minimal LD.
Resultater
Seks konserverede regioner med en samlet størrelse på 3,2 kbp blev identificeret inden CDH1
intron 2. Ud over de fem kendte polymorfier (CDH1
163 + 14184ΔAGGG (rs10673765), 163 + 14384C > T (rs9932686), 163 + 37235G > A (rs1125557), 163 + 37276T > A (rs9282650), og 163 + 49526C > G (rs9931853)), ingen yderligere fælles polymorfier specifikke for den italienske befolkning under studiet var opdaget af SSCP i de seks regioner.
Brug restriktion polymorfisme og allele analyser forskelsbehandling blev de relative frekvenser af genotyper følge af de fem varianter bestemmes i DGC tilfælde og kontrollerne. Sekventering af stikprøver bekræftede de respektive genotyper. Alle polymorfier var i Hardy-Weinberg ligevægt for både cases og kontroller (p > 0,19). Tabel 2 opsummerer genotype fordelinger og deres forskelle mellem sager og controls.Table 2 CDH1
intron 2 genotype distributioner blandt DGC sager og kontroller
+ 14184ΔAGGG tilfælde (n = 134)
+ 14184ΔAGGG kontroller (n = 100)
χ2-test
OR (95% CI) *, †
OR (95% CI) *, †
+ /+
+ /Δ
Δ /Δ
+ /+
+ /Δ
Δ /Δ
p
Δ /Δ vs + /+
+ /Δ vs + /+
128
4
2
96
3
1
0,947
1,50 (0,13-16,78)
1,00 (0,21-4,57)
95,5%
3%
1,5%
97%
1,5%
1,5%
14,2%
2,5%
+ 14384C > T tilfælde (n = 134)
+ 14384C > T kontroller (n = 100)
χ 2 -test
OR (95% CI)
ELLER (95% CI)
CC
CT
TT
CC
CT
TT
p
TT vs CC
CT vs CC
130
2
2
98
1
1
0,895
1,51 (0,13-16,87)

1,5% 1,51 (0,13-16,87)
97,0%
1,5%
98,0%
1,0%
1,0%
12,3%
12,3%
+ 37235G > A-tilfælde (n = 134)
+ 37235G > A kontroller (n = 100)
χ 2 -test
OR (95% CI)
OR (95% CI)
GG Georgien
AA
GG Georgien
AA
p
AA vs GG
GA vs GG
30
56
48
37
50
13
0,0003
4,55 (2,09-9,93)
1,38 (0,75-2,55)
22,4%
41,8%
35,8%
37,0%
50,0%
13,0%
100%
40,6%
+ 37276T > A-tilfælde (n = 134)
+ 37276T > A kontroller (n = 100)
χ 2 -test
OR (95% CI)
OR (95% CI)
TT
TA
AA
TT
TA
AA
s
AA vs TT
TA vs TT
65
65
4
46
51
3
0,929
0,94 (0,20-4,42 )
0,90 (0,53-1,53)
48,5%
48,5%
3,0%
46,0%
51,0%
3,0%
1,9%
1,6%
49526C > G tilfælde (n = 134)
+ 49526C > G kontroller (n = 100)
χ 2 -test
OR (95% CI)
OR (95% CI)
CC
CG
GG
CC
CG
GG
p
GG vs CC
CG vs GG
34
82
18
30
58
12
0,727
1,32 (0,55-3,19)
1,25 (0,69-2,26)
25,4%
61,2%
13,4 %
30,0%
58,0%
12,0%
32,2%
22,5%
* OR værdier er ukorrigerede.
† procentdelen under OR værdier anslår magt foreningen for hver variant på den tilsvarende eller niveau og under forudsætning af et signifikansniveau på 5%
af de undersøgte varianter, kun 163 + 37235G >. en SNP var signifikant associeret med sygdom på grund af en overrepræsentation af a-allelen blandt DGC tilfælde (56,7% vs. 38% i kontrollen, χ 2 = 16,1, p < 0,0001; se tabel 2). Den 163 + 37235AA genotype var 2,8 gange hyppigere i de tilfælde, sammenlignet med kontrolgruppen. Den tilsvarende Odds Ratio (OR) foreslog en signifikant forhøjet risiko for at udvikle DGC for AA luftfartsselskaber i forhold til GG luftfartsselskaber (OR = 4,55, 95% CI = 2,09-9,93, p = 0,0002, magt forening 100%; Tabel 2). Ingen signifikant øget risiko fremgik af bærer GA-genotypen (OR = 1,38, 95% CI = 0,75-2,55, p = 0,3, magt association 41%, tabel 2). Den DGC risiko for AA luftfartsselskaber fortsat betydelig, når yderste periferi blev justeret for alder, køn, alkoholindtag og H. pylori
infektion (tabel 3). Hos rygere imidlertid den tilknyttede risiko kun var af borderline signifikans (p = 0,089, tabel 3). De risici, der er forbundet med de andre varianter undersøgte forblev ikke-signifikant efter justering (data ikke vist). blev ikke observeret nogen sammenhæng mellem 163 + 37235G > En SNP og alder ved diagnose (p > 0,16) .table 3 Reguleret yderste periferi forbundet med CDH1
intron 2 163 + 37235G > En variant
Variable

163+37235

Cases

Controls

OR (95% CI)



n
%
n
%

Age
≤ Median
GG
17
20
20
34
1 Georgien
37
45
30
52
1,45 (0,65-3,25)
AA
29
35
8
14
4,26 (1,55 til 11,77 )
> Median
GG
13
25
17
40
1 Georgien
19
37
20
48
1,24 ( 0,48-3,24)
AA
19
37
5
12
4,97 (1,47-16,86)
Sex
Kvindelige
GG
13
20
20
34
1 Georgien
28
44
30
51
1,44 (0,60-3,42)
AA
23
36
9
15
3,93 (1,39-11,12)
Mand
GG
17
24
17
41
1 Georgien
28
40
20
49
1,40 (0,58-3,39)
AA
25
36
4
10
6,25 (1,79-21,84)
Rygning
aldrig
GG
17
24
25
42
1 Georgien
30
42
30
50
1,47 (0,66-3,26)
AA
25
35
5
8
7,35 (2,34-23,01)
nogensinde
GG
13
21
12
30
1 Georgien
26
42
20
50
1,20 (0,45-3,19)
AA
23
37
8
20
2,65 (0,86-8,16))
Alkohol
≤ 20 g /dag
GG
24
26
26
40
1 Georgien
35
38
31
48
1,22 (0,59-2,55 )
AA
34
37
8
12
4,60 (1,78-11,90)
> 20 g /dag
GG
6
15
11
31
1 Georgien
21
51
19
54
2,01 (0,63-6,55)
AA
14
34
5
15
5,13 (1,23-21,36)
H. pylori
Negativ
GG
2
11
16
37
1 Georgien
22
48
22
51
3.2 (1,00-10,26)
AA
19
41
5
12
12.16 (2,98-49,64)
Positiv
GG
25
28
21
37
1 Georgien
34
39
28
49
1,02 (0,472 -. 19)
AA
29
33
8
14
3,045 (1,15-8,07)
for at bestemme, om CDH1
163 + 37235A-allel giver DGC risiko uafhængigt eller i kombination med den anden intron 2 varianter haplotyper som følge af fem polymorfier blev rekonstrueret og deres frekvenser blev anslået i de tilfælde og kontroller. De to 5'-varianter var ikke informativ og blev derfor udelukket. Intron 2 haplotyper viste en global sammenslutning med sygdom (df = 7, χ 2 = 24,09, p < 0,002). Generelt haplotyper der indeholder 163 + 37235A-allel var hyppigere i de tilfælde, i forhold til kontrolgruppen, mens tre af de fire haplotyper med G-allelen var hyppigere blandt kontrollerne (tabel 4). Den stærkeste association med sygdom blev observeret for AAG og ATC-haplotyper (med 163 + 37235A ved position 1). Omvendt GAG og GTC haplotyper viste den stærkeste beskyttelse. Koblingsuligevægt analyse viste stort set fraværende LD mellem de undersøgte varianter (r 2 < 0,03; tabel 5), hvilket tyder på, at CDH1
163 + 37235G > kan En SNP tillægge en øget modtagelighed over for DGC uafhængigt af de andre varianter investigated.Table 4 CDH1
intron 2 haplotypefrekvenser blandt DGA sager og kontroller

Case (freq) †

Kontrol (freq) †
Fishers p
Pearsons p
OR (95% CI)
AAC *
16.04 (0,060)
5,31 (0,027)
0,088
0,088
2,33 (0,86-6,34)
AAG
17,49 (0,065)
5,34 (0,027 )
0,056
0,056
2,55 (0,95-6,83)
ATC
73,09 (0,273)
35.43 (0,177)
0,015
0,015
1,74 (1,11 -2,74)
ATG
45,38 (0,169)
29,91 (0,150)
0,565
0,565
1,16 (0,70-1,92)
GAC
21,73 (0,081)
24,18 (0,121)
0,152
0,152
0,64 (0,35-1,18)
GAG
17,75 (0,066)
22,17 (0,111)
0,087
0,087
0,57 (0,30-1,09)
GTC
39,15 (0,146)
53,07 (0,265)
0.001
0.001
0,47 (0,30 til 0,75)
GTG
37,37 (0,139)
24,85 (0,123)
0,602
0,602
1,16 (0,67-1,99)
* Haplotype rækkefølge: 163 + 37235G > A, 163 + 37276T > A, 163 + 49526C > G. De to 5'-varianter blev ikke medtaget, da de ikke længere opdele haplotyper.
† tal henviser til rekonstruerede haplotype numre blandt sager (257) og kontroller (192), med den enkelte bærer to kromosomer. Relative hyppigheder er givet i procent. Ikke alle genotype data blev inkluderet i analysen, som lavfrekvente haplotyper blev droppet.
Tabel 5 Bindingsuligevægt mellem CDH1
intron 2 polymorfier
r2 koblingsuligevægt

163 + 14384C > T
163 + 37235G > En
163 + 37276T > En
163 + 49526C >G
163 + 14184ΔAGGG
0,001
0.000
0.001
0.001
163 + 14384C > T -
0,002
0.000
0.000
163 + 37235G > A
- -
0,028
0.000
163 + 37276T > A -
- -
0,003 <

• Forholdet af vaskulær endotelvækstfaktor gen polymorfier og klinisk resultat i avancerede mavecancerpatienter behandlet med FOLFOX: VEGF polymorfi i gastrisk cancer
• Præoperativ kemostråleterapi for lokalt fremskreden mavekræft