Túlexpressziója csiga van társítva nyirokcsomó-metasztázis és rossz prognózissal betegeknél gyomorrák

Túlexpressziója Csiga társul nyirokcsomómetastasis és rossz prognózisú betegeknél gyomorrákos katalógusa Abstract Background katalógusa katalógusa Epithelialis mesenchymalis tranzíció (EMT) jelentős szerepet játszik a tumor progressziójában és inváziót. Csiga egy ismert szabályozója EMT különböző rosszindulatú daganatok. Ebben a vizsgálatban a szerepe csiga gyomorrákban. Katalógusa Módszerek katalógusa Megvizsgáltuk a hatását elhallgattatott vagy túlzott mértékben csiga segítségével Lenti-víruskonstrukciók gyomorrákban sejtekben. Immunhisztokémiai elemzést szövet mikroarray származó 314 beteg gyomor adenokarcinóma (GC) arra használták, hogy meghatározzák csiga klinikopatológiai és prognosztikai jelentősége. Differenciális génexpresszió 45 GC példányok Csiga túlexpressziót vizsgáltuk cDNS microarray. Katalógusa eredményei katalógusa hangtompító csiga által shRNS csökkent invázió és a migráció GC sejtvonalak. Ezzel szemben, Csiga túltermelése fokozott invázió és a migráció a gyomorrák sejtek, összhangban fokozott VEGF és MMP11. Csiga túltermelése (≥75% pozitív magfestődés) is szignifikáns összefüggést mutatott a tumor progresszióját (P katalógusa < 0,001), nyirokcsomó áttétek (P katalógusa = 0,002), lymphovascularis invázió (P katalógusa = 0,002), és perineurális Invasion (p
= 0,002), a 314 GC betegek, és a rövidebb túlélés (p
= 0,023). cDNS microarray analízis kimutatta, 213 differenciáltan expresszálódó gének GC szövetek Csiga túlexpressziója, beleértve a géneket kapcsolódó metasztázis és invázió.
Következtetés
Csiga jelentősen befolyásolja invazivitását /vándorló képessége GC, és azt is lehet használni, mint egy prediktív biomarker prognózisa vagy agresszivitás glükokortikoid. katalógusa Kulcsszavak katalógusa Gyomor Adenocarcinoma csiga nyirokcsomó áttétek Survival Háttér katalógusa epithelialis mesenchymalis tranzíció (EMT), a fejlődési folyamat, amelynek során hámsejtek csökkenti az intercelluláris adhéziós és megszerezni fibroblast funkciók, alapvető fontosságú a tumor progressziója [1-3]. Alatt EMT, jelentős változások következnek be, beleértve a alulszabályozása epithelialis markerek, mint például E-kadherin, transzlokációját β-catenin (azaz disszociációja hártyás β-catenin és a transzlokációs a nukleáris rekeszben), és fokozza a mesenchymalis markerek, mint például vimentin és N -cadherin [3-6]. EMT által kiváltott elnyomás E-cadherin által EMT szabályozók, például csiga, csiga, és Twist. A Csiga család cink-ujj transzkripciós represszor közvetlenül elnyomja E-cadherin in vitro és in vivo katalógusa katalógusa kölcsönhatás útján közötti COOH-terminális régió és az 5 '- CACCTG-3 ' szekvenciát az E-kadherin-promoter [7-9]. Csiga állítólag fontossága számos karcinómák, ideértve a nem-kissejtes tüdőkarcinóma, petefészek-karcinómák, urothelialis karcinómák, és hepatocelluláris karcinóma [10-13]. A vizsgálatok azt is használják immunhisztokémiai vizsgálatok azt mutatják, hogy a klinikai jelentősége csiga túltermelése gyomor adenokarcinóma (GC) [14, 15]. Ugyanakkor kevés jelentések szerepét csiga GC van tüntetve klinikopatológiai prognosztikai, és in vitro funkcionális katalógusa analízisek, valamint génexpresszió eredménye. Kidolgoztunk tehát csiga hatása invazív /vándorló képesség a gyomorrák sejtvonalakon, valamint vizsgáltuk a lehetőségét, Csiga használt prediktív markerként értékelésére rosszabb a prognózisa vagy tumor agresszivitás GC betegeknél. Azt is értékelték a génexpressziós mintázatot 45 GC szövetek Csiga túltermelése, cDNS microarray. Katalógusa módszerek katalógusa shRNS lentivírus-mediált elhallgatása és túltermelése Csiga gyomorrákban sejtek
emberi gyomor rákos sejtvonalak SNU216 és SNU484 nyerték koreai sejtvonal Bank (KCLB) és hitelesítette DNS profil. Ezek a sejtek tenyésztett RPMI1640 tápközegben, amely 10% magzati borjúszérumot (FBS), 100 egység /ml penicillinnel és 100 ug /ml sztreptomicint (Hyclone, Ogden, UT). Az összes sejtet 37 ° C-on, 5% CO 2. Lentivirális alapú RNS knockdown és túltermelése használtak hangtompító és túlzott mértékű Csiga. Lentivírusok fejezik ki vagy nem célzott, vagy csiga katalógusa -targeted shRNS használtak hangtompító; egy PLKO lentivírus vektor célzás Csiga katalógusa vagy egy üres PLKO vektor használtak túltermelése csiga a SNU216 és SNU484 sejteket. Lentivírus készletek felhasználásával előállított Virapower ™ lentivirális csomagolás mix használatával 293FT szerinti sejtvonal a gyártó protokollja (Invitrogen, Carlsbad, CA). SNU216 és SNU484 sejteket növesztjük 50% összefolyás inkubáltuk 24 órán át 1: 1 hígítású vírus: a média, 5 ug /ml Polybrene. Miután egy 24 H gyógyulási időszak teljes média nélkül vírus poliklonális stabil sejtvonalakat szelektáltunk és karbantartott tartalmazó tápközegben 5 ug /ml puromicin. Hangtompító vagy overexpressziója Csiga határoztuk meg RT-PCR és Western-blottal.
Valós idejű RT-PCR analízise VEGF katalógusa, MMP11
, és csiga
gyomor rákos sejtekben
Az összes celluláris RNS t extraháltunk a TRIzol módszerrel (Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA). Az RT-PCR elemzés, 2-ug aliquot RNS vetettük alá cDNS szintézist 200 egység MMLV reverz transzkriptáz és 0,5 ug oligo (dT) -15 primert (Promega, Madison, WI, USA). Kvantitatív valós idejű PCR-t a Rotor-Gene ™ rendszer (Qiagen, Hilden, Németország) alkalmazásával AccuPower 2 × Greenstar qPCR Master Mix (Bioneer, Daejeon, Korea). cDNS 1 ul reakcióelegy amplifikáltuk 0,5 U GoTaq DNS-polimeráz (Promega) és 10 pmol, az alábbi szensz és antiszensz primerek: GAPDH
5 '- TCCATGACAACTTTGGTATCG-3 ', 5 '- TGTAGCCAAATTCGTTGTCA-3 '; Csiga katalógusa 5 '- CTTCCTCTCCATACCTG-3 ', 5 '- CATAGTTAGTCACACCTCGT-3 '; VEGF katalógusa 5 '- TTGCTGCTCTACCTCCACCA-3 ', 5 '- GCACACAGGATGGCTTGAA-3 '; MMP11 katalógusa 5 '- CTTGGCTGCTGTTGTGTGCT-3 ', 5-AGGTATGGAGCGATGTGACG-3 '. A termikus ciklusos profil a következő volt: denaturálás 30 másodpercig 95 ° C-, lágyítás, 30 másodpercig 52 ° C (függően alkalmazott primerek), és kiterjesztés 30 s-ig, 72 ° C-on. A félkvantitatív értékelésére expressziós szint, 30 ciklus alkalmaztunk minden egyes PCR-reakcióban. A PCR termékeket méret szerint frakcionáljuk 1,0% etídium-bromid /agaróz gélen és mennyiségileg UV átvilágítás mellett. A küszöb ciklus (CT) úgy definiáljuk, mint frakcionált ciklus számot, amelynél a fluoreszcencia átmegy egy rögzített küszöbérték alapvonal felett. Relatív génexpresszió mennyiségileg alkalmazásával átlagos CT értékét minden egyes három példányban minta mínusz az átlagos három párhuzamos CT érték GAPDH katalógusa. Különbség a kontroll (üres vektor) és a kísérleti csoportban (fertőzött Lentivírus) számították ki a képlet 2 - ([△ CT Lenti] - [△ CT kontroll]), és fejezzük ki szoros változást kifejezés szerint az összehasonlító küszöb ciklus módszer (2- △△ CT) [16].
Western blot
sejteket összegyűjtöttük és megzavarta lízis pufferben (1% Triton X-100, 1 mM EGTA, 1 mM EDTA, 10 mM Tris-HCI, pH = 7,4 és proteáz inhibitorok). A sejttörmeléket centrifugálással távolítjuk el 10000 g-n katalógusa 10 percen át 4 ° C-on. Az így kapott felülúszókat megoldódott egy 12% -os SDS-PAGE szerint denaturálták redukáló körülmények között, és nitrocellulóz membránra transzferáltuk. A membránokat blokkoltuk 5% zsírmentes szárított tej szobahőmérsékleten 30 percig, és inkubáltuk primer antitestekkel. A membránokat mostuk és inkubáltuk tormaperoxidázzal konjugált másodlagos antitesttel. A jel tettük láthatóvá alkalmazásával fokozott kemilumineszcencia (Amersham, Buckinghamshire, Egyesült Királyság).
-Migráció és Matrigel inváziós vizsgálat
Gyomorrák sejteket összegyűjtöttük 0,05% tripszin, amely 0,02% EDTA-t (Sigma-Aldrich), és szuszpendáljuk RPMI koncentrációban 3 × 10 3 sejt /lyuk. Membránszűrők (pórusméret: 8 um) az eldobható 96 lyukú kemotaxis kamra (Neuro Probe, Gaithersburg, MD) adunk előzetesen bevont 4 órán át 5 mg /ml fibronektinnel, szobahőmérsékleten. Aliquotjait (50 ul /lyuk), a sejtszuszpenzió betöltve a felső kamrák, és 1% FBS-t viszünk be az alsó kamrába. Miután 24 órán inkubálás nem-migráló sejteket eltávolítjuk a felső kamrában egy vattacsomót; sejtek jelen az alsó felületén az inzert megfestettük Hoechst33342 (Sigma-Aldrich). Az invazív sejteket megszámláltuk fluoreszcens mikroszkóp alatti at × 10 nagyítással.
A Matrigel inváziós vizsgálat, 3 × 104 sejt /lyuk oltottunk a felső kamrában, melyet bevont Matrigel (5 mg /ml hideg közeg, a BD Transduction Laboratories, Franklin Lakes, NJ, USA), és a szérum-mentes tápközegben, amely 1% FBS-t vagy kontroll jármű adtunk az alsó kamrába. Miután 24 órán inkubálás nem-migráló sejteket eltávolítjuk a felső kamrában egy vattacsomót, és a sejteket jelen az alsó felületén az inzert megfestettük Hoechst33342 (Sigma-Aldrich). Az invazív sejteket megszámoltuk fluoreszcens mikroszkóp alatt meg × 10-szeres nagyítású. Katalógusa Tissue microarray, immunhisztokémia, és az eredmények értelmezése katalógusa A félautomata szövet arrayer (Beecher Instruments, WI, USA) alkalmaztunk a szöveti microarray . Kaptunk 3 szövet magok, egyenként 0,6 mm átmérőjű, származó tumor blokkok vett GC betegeknél. Magokat nem szedett több invazív frontális vagy központi területein a daganatok. A metszeteket sütött 60 ° C-on 30 percig, paraffint xilollal eltávolítjuk, majd a rehidratált. A metszeteket ezt követően belemerül a citrát antigén visszakeresés puffer, microwaved antigén visszakeresés kezeljük, 3% -os hidrogén-peroxiddal metanolban oltja endogén peroxidáz aktivitás, majd inkubáljuk 1% szarvasmarha-szérum-albumin, hogy blokkolja a nem-specifikus kötődés. Ezt követően a metszeteket nyúl anti-Csiga (ABCAM, UK) éjszakán át 4 ° C-on. Normál nyúlszérumot használtunk negatív kontrollként. Mosás után, a szöveti metszeteket kezelt szekunder antitesttel, hematoxilinnel ellenfestettük, dehidratált, és az egységet. Legalább 500 tumor sejteket megszámláltuk. A sejtek százalékában Csiga + sejtmagok fejeztük képest a teljes száma a tumoros sejtek megszámláltuk. Nukleáris kifejezése csiga osztályoztuk osztályozásával mértéke pozitív magfestés mint ≤50%, 50-75%, illetve ≥75%.
Klinikopatológiai és túlélési elemzés gyomorrákos betegek
Vizsgáltuk kohort 314 GC betegeknél, akik minden ment gastrostomiás a nyirokcsomók a Pusani Nemzeti Egyetemi Kórház (PNUH) 2005 és 2007 között a csoport áll 218 férfi és 96 nő, átlagéletkoruk 58,3 év volt (tartomány, 25-83 év). Normál formalin-fixált és paraffinba ágyazott metszeteket kapott a Department of Pathology, PNUH, és a Nemzeti Biobank Koreai PNUH. A tanulmány által jóváhagyott intézményi Review Board. Egyik beteg részesült preoperatív sugárkezelés és /vagy kemoterápia. Adjuváns kemoterápia alapján 5-FU beadásának stádiumú II, III és IV után kuratív rezekció. Megvizsgáltuk több klinikopatológiai faktorok szerint a koreai Szabványosított patológiai jelentés gyomorrák, a japán osztályozása gyomorrák (3 rd angol kiadás), és az American Joint Committee on Cancer Staging Manual (7 th kiadás), beleértve a tumor helyén, bruttó megjelenése és mérete, mélysége invázió, szövettani osztályozás (azaz a bél vagy diffúz), és lymphovascularis invázió [17-19]. Klinikai eredmény minden betegnél követte napjától műtét a halál időpontját, illetve 2012. március 1-nyomonkövetési időszakok között mozgott körülbelül 1-81,5 hónap (átlag 51,4 hónap). Esetekben elveszett a követés vagy bármely okból bekövetkező halál eltérő gyomorrák cenzúrázták a túlélési arány elemzés. Klinikopatológiai jellemzők segítségével elemeztük Student-féle t-próba katalógusa, a χ 2 teszt, vagy Fisher-féle egzakt teszt, hogy teszteljék a különbségek csiga kifejezés. Kumulatív túlélési görbéket kaptuk a Kaplan-Meier-módszerrel, a szignifikancia képest a log-rank teszt. A prognosztikai tényezőket azonosították a Cox-féle regressziós lépcsőzetes módszer (arányos hazárd modell), korrigálva a betegek életkora, neme, a tumor helyén, morfológiai típus (bél versus diffúz). Statisztikai szignifikancia P katalógusa < 0.05. A statisztikai számításokat végeztünk SPSS version 10.0 for Windows (SPSS Inc., Chicago, IL, USA).
CDNS mikroarray analízise GC szövetek alapuló csiga overexpressziója
egy összesen 45 frissen GC szöveteket szereztünk be a National biobank Korea, PNUH és CNUH; jóváhagyást nyert intézményi etikai bizottság. Teljes RNS-t extraháljuk a frissen fagyasztott szövetek segítségével Mirvana RNS izolációs kit (Ambion Inc., Austin, Texas). Öt száz nanogramm teljes RNS-t használjuk cDNS-szintézishez, majd egy amplifikáció /címkézés lépés (in vitro
transzkripció) a Illumina TotalPrep RNS amplifikációjára készlet (Ambion) szintetizálni biotinnal jelölt cRNS. cRNS koncentrációkat mértük a RiboGreen módszerrel (Quant-iT RiboGreen RNS assay kit; Invitrogen-Molecular Probes, ON, Kanada) alkalmazásával Victor3 spektrofotométerrel (Perkin-Elmer, CT), és a cRNS minőség határoztuk meg 1% -os agaróz gélen. Feliratú, amplifikált anyagot (1500 ng per array) hibridizáljuk Illumina HumanHT-12 BeadChips v4.0 szerint a gyártó utasításai (Illumina, San Diego, CA). Array jelek által kifejlesztett streptavidin-Cy3. Rácsok beolvasott egy Illumina iScan rendszer. A microarray adatok normalizálódtak a kvantilis normalizációs módszert Illumina BeadStudio szoftver. Az expressziós szintjét az egyes gének átalakult log 2 bázis előtt további elemzést. Excel elsősorban statisztikai elemzésekhez. A génexpressziós eltérések statisztikailag szignifikánsnak tekintettük, ha p katalógusa < 0,05; Minden tesztet 2-farkú. Cluster analízist használva Cluster és Treeview [20]. A gén ontológia (GO) program is (http: //david. ABCC. Ncifcrf. Gov /) fogalmát használtuk a gének alcsoportokra alapuló biológiai funkció. Fisher-féle egzakt tesztet alkalmaztunk annak meghatározására, hogy az arányokat a gének mindegyik kategóriában különböztek csoport. GC szöveteket tovább osztható a magasabb (≥75%) és alsó (< 75%) szintje Csiga kifejezés; differenciális génexpresszió a csoportok között azonosították. Elsődleges microarray adatok állnak rendelkezésre NCBI GEO (Gene Expression Omnibus) adatbázis (http: //www. NCBI. NLM. NIH. Gov /geo /lekérdezés /acc. Cgi? Acc = GSE38024). katalógusa eredményei katalógusa rendelet a migráció és invázió gyomorrák sejtek csiga katalógusa lentivírus alapú RNS knockdown és túltermelése módszereket használtak annak megállapítására, csiga szerepét invázió és a migráció a gyomor rákos sejtvonalak. SNU216 és SNU484 sejtek ebben a vizsgálatban alkalmazott hoznak létre gyomor adenokarcinóma sejtvonal koreai betegeknél. Ezeket a sejteket fertőztünk egy lentivírus expresszáló vagy nem célzott, vagy csiga
-targeted shRNS számára hangtompító. A PLKO lentivirális vektorral, hogy a célzott Csiga katalógusa és egy üres PLKO vektort kiváltására használható csiga túltermelés SNU216 és SNU484 sejteket. Poliklonális stabil sejtvonalak alkalmazásával szelektáltuk puromicin. Csiga
expresszióját úgy határoztuk meg, RT-PCR és Western blot; stabil Csiga
kiütése (SH-csiga), és csiga overexpressziója sejtvonalak (OE-csiga) kapunk (1. ábra). 1. ábra szerepe csiga invázió és a migráció a gyomor rákos sejtvonalak. A. SNU216 (felső panel), és SNU484 (alsó panel) sejteket fertőztünk lentivírusok expresszáló akár nem célzott shRNS (shNT katalógusa), vagy csiga
shRNS a 0. napon, majd a betakarított a 7. napon a fertőzés után. Csiga
knockdown határoztuk meg RT-PCR és Western blot; stabil sejtvonalakat generáltunk mind a sejtvonalak (SH-Csiga). Elhallgattatása csiga
SNU216 és SNU484 indukált sejtek csökkent migrációs és behatolás. B. SNU216 (felső panel), és SNU484 (alsó panel) sejteket fertőztünk lentivírusok expresszáló akár lentivirális PLKO vektor célzási Csiga katalógusa vagy egy üres PLKO vektor (EV) a 0. napon, majd a betakarított a 7. napon a fertőzés utáni . Overexpressziója csiga határoztuk meg RT-PCR és Western blot; stabil sejtvonalat hoztunk létre, az egyes sejtvonalak (O /E-csiga). Csiga túltermelése SNU216 és SNU484 indukált sejtek fokozott migrációs és behatolás. C. Csiga túltermelése által indukált fokozott mRNS expressziója VEGF
és MMP11
SNU216 és SNU484 sejtek valós idejű RT-PCR analízis. Alsó panel jelzi reprezentatív RT-PCR adatok VEGF katalógusa, MMP11 katalógusa, Csiga katalógusa, és GAPDH katalógusa. Az adatok azt mutatják az átlag ± SE legalább 3 független kísérlet során. A * -gal jelölt P katalógusa < 0,05 Student-féle t
-próba.
Meghatározásához csiga szerepeket gyomorrák sejtek invázióját, mértük kemotaktikus invázió sejtek által a Transwell-rendszer szűrőkkel előre bevont Matrigel. Méréséhez migrációját gyomorrák-sejtek, azt vizsgáljuk sejtmigrációt egy Boyden-kamra berendezés. Némító csiga katalógusa által shRNS indukált csökkent migráció és invázió SNU216 és SNU484 sejteket, amint az 1A ábrán látható. Ezzel szemben a csiga
hangtompító eredményeket, overexpressziója csiga által indukált fokozott migrációt és invázió SNU216 és SNU484 sejtek, amint azt az 1B ábra. Túlexpressziója csiga is összefüggésbe hozható a megnövekedett VEGF és MMP11 (1C). Katalógusa hatása Csiga túltermelése a tumor agresszivitását és GC betegek túlélését katalógusa Pozitív magfestődés a csiga szinten a ≤50%, 50-75%, és ≥75% volt megfigyelhető 13,4% (42/314), 52,2% (164/314), és 34,4% (108/314), illetőleg a 314 GC betegek immunhisztokémiai elemzést. Csiga kifejezés volt megfigyelhető bél és a diffúz típusú GC (2A ábra, B). Csiga túltermelése (≥75% pozitivitás) szignifikánsan korrelál a tumor mérete, bruttó típus, mélység invázió lymphovascularis invázió, perineurális invázió, és nyirokcsomómetastasis (1. táblázat). Csiga túlexpressziót is összefüggésbe hozható a megnövekedett tumor mérete (P katalógusa = 0.028) és feltárt bruttó típusú (P katalógusa < 0,001); és növelte a tumor invazív, vagyis nagyobb a T stádium (P katalógusa < 0,001), és a jelenléte perineurális invázió (P katalógusa < 0,001) és lymphovascularis tumor embólusok (P katalógusa = 0,002). Fokozott nyirokcsomómetastasis is kapcsolódik Csiga túltermelése (P katalógusa = 0,002) .A szerint a fenti adatok mutatják a pozitív kapcsolata Csiga túltermelése és GC agresszivitás, Csiga túltermelése szignifikánsan korrelált a teljes túlélés között GC betegek (P
= 0,023) (2C ábra). A lineáris összefüggés volt megfigyelhető a fokozott nukleáris kifejezése csiga és rövidebb túlélés (≤50%: 76,6 ± 2,7 hónap; 50-75%: 68,5 ± 2,0 hónap; ≥75%: 63,3 ± 2,8 hónap). Csiga túltermelése (≥75% pozitivitás) azonosították független előrejelzője rossz prognózissal 314 beteg GC, korrigált kor, a nem, a szövettani osztályozás, és a tumor helye, a Cox-féle regressziós arányos hazárd modellt (P = 0,033 katalógusa; 2. táblázat). 2. ábra csiga kifejezést gyomor adenokarcinóma (GC) szövetminták és Kaplan-Meir parcellák teljes túlélés 314 GC betegeknél. Csiga leginkább kifejezett magok GC sejtek (intesztinális típusú (A), és a diffúz típusú (Signet gyűrű) sejtek (B)) tartalmazza szövet array példányok. Néhány reaktív fibroblasztok is kimutatta, Csiga nukleáris kifejezés (nagyítás: × 400). C. Kaplan-Meier analízis A teljes túlélés a GC betegeknél a csiga kifejezés. A lineáris kapcsolat áll fenn a megnövekedett Csiga nukleáris kifejezés és rövidebb túlélés volt látható körében GC beteg (P katalógusa = 0,023). Log-rank teszttel AP kiszámításához katalógusa értékeket.
1. táblázat közötti kapcsolat csiga kifejezés klinikopatológiai jellemzők 314 gyomorrákos betegeknél
betegek száma (N = 314) hotelben
csiga pozitivitás Matton pvalue
< 75% Matton ≥75%
Életkor (év)
58,5 ± 10,6 katalógusa 59,1 ± 11,9 katalógusa 0,695 katalógusa szex katalógusa Férfi katalógusa 218 katalógusa 143 katalógusa 75 katalógusa 0.996 fiatal női katalógusa 96 katalógusa 63 katalógusa 33 katalógusa tumor méretét katalógusa ≤4.0 cm katalógusa 192 katalógusa 135 katalógusa 57 katalógusa 0,028 katalógusa > 4,0 cm katalógusa 122 katalógusa 71 katalógusa 51 katalógusa Location katalógusa Felső /Közép katalógusa 167 katalógusa 112 katalógusa 55 katalógusa 0.561 katalógusa Alsó katalógusa 147 katalógusa 94 katalógusa 53 katalógusa invázió mélysége
T1 katalógusa 160 katalógusa 127 katalógusa 33 katalógusa < 0.001 katalógusa T2 katalógusa 41 katalógusa 26 katalógusa 15 katalógusa T3 katalógusa 68 katalógusa 33 katalógusa 35 katalógusa T4 katalógusa 43 katalógusa 19 katalógusa 24
Gross típusú katalógusa Emelkedett
77 katalógusa 51 katalógusa 26 katalógusa < 0.001 katalógusa Lakás /depressziós katalógusa 131 katalógusa 105 katalógusa 26 katalógusa kitermelt katalógusa 106 katalógusa 50 katalógusa 56 katalógusa szövettani típus katalógusa Bél katalógusa 182
123 katalógusa 59 katalógusa 0,609 katalógusa Diffúz katalógusa 122 katalógusa 76 katalógusa 46 katalógusa Vegyes katalógusa 10 katalógusa 7 katalógusa 3 katalógusa perineurális invázió katalógusa negatív katalógusa 202 katalógusa 150 katalógusa 52 katalógusa < 0.001 katalógusa Pozitív katalógusa 111 katalógusa 55 katalógusa 56 katalógusa lymphovascularis emboli katalógusa Negatív katalógusa 193 katalógusa 139 katalógusa 54 katalógusa 0.002 katalógusa Pozitív katalógusa 120 katalógusa 66 katalógusa 54 katalógusa nyirokcsomó áttétek katalógusa N0, N1 katalógusa 270 katalógusa 186 katalógusa 84 katalógusa 0,002 katalógusa N2, N3 katalógusa 44 katalógusa 20 katalógusa 24
2. táblázat többváltozós túlélési elemzés Cox regressziós modell 314 gyomorrák katalógusa változók
B Matton SE Matton HR (95% CI) Matton P Matton Age (≤59 versus > 59) hotelben -0,438 katalógusa 0.264 katalógusa 0,645 (0,385-1,082) hotelben 0,097 katalógusa Nem (férfi versus női) hotelben -0,037 katalógusa 0,267 katalógusa 0,963 (0,571-1,626) hotelben 0.889
Site (felső és középső versus alacsonyabb) hotelben 0,635 katalógusa 0.264 katalógusa 1,887 (1,126 -3,164) hotelben 0,016 katalógusa Lauren (bél vs diffúz) hotelben -0,537 katalógusa 0.263 katalógusa 0,585 (0,349-0,978) hotelben 0,041 katalógusa csiga (≥75% versus < 75 %) hotelben -0,528 katalógusa 0.248 katalógusa 0,590 (0,363-0,958) hotelben 0,033 katalógusa Megjegyzés: B, együttható; HR, hazard ratio; CI, konfidencia intervallum.
Azonosítása génexpressziós mintázatok alapján csiga overexpressziója cDNS microarray
cDNS microarray használtunk összeh génexpressziós profilokat 45 GC példányok. Azonosítottunk 213 gének, amelyek arra eltérően expresszált jelentős szinten (p
< 0,05) között GC példányok nagyobb (≥75%) és az alsó szinten (< 75%) Csiga expresszió (3. táblázat). Ezek közül 213 gén 82 volt túlszabályozott és 131 volt downregulált a GC egyedek magasabb (≥75%) csiga kifejezés. Mi használt hierarchikus klaszterezést vizsgálatra a 213 gének és 45 GC példányok felügyelt csoportosítással elemzés adta minták minták magasabb és alacsonyabb csiga kifejezés fürtözött 2 különböző csoportok, kivéve egy mintát, ahol magasabb a csiga kifejezés (3. ábra). Hogy vizsgálja meg a biológiai funkciók részt diszkrimináló gének végeztünk GO kategóriában elemzést. Tizenegy géneket társított szabályozó rákos sejt-ECM adhéziós (P katalógusa < 0,021) és az ECM fehérje szabályozása (P katalógusa < 0,028, 4. táblázat). A legtöbb is hozták összefüggésbe a rák. ONECUT1
, ADAMTS
, IFNAR2
, MSR1
, és SORL1
befolyásolják a migráció vagy a metasztázis, egy folyamat, amely magában kötődés a tumorsejtek az alapmembrán, degradációja helyi kötőszövet, és penetráció és tumorsejtek migrációját keresztül stroma [21-25] .table 3 gének eltérő módon fejeződnek ki GC példányok magasabb csiga kifejezés katalógusa PROBE_ID Matton JEL Matton NÉV katalógusa
a gének fokozódik egyedek magasabb (≥75%) a csiga kifejezés (P katalógusa < 0,05) hotelben ILMN_2374449 katalógusa SPP1 Matton kiválasztódó foszfoproteinnek 1 katalógusa ILMN_2337923 katalógusa TPD52L1 Matton tumor fehérje D52-szerű 1 katalógusa ILMN_1679838 katalógusa WBP5 Matton WW domén kötő fehérje 5 katalógusa ILMN_2078592 katalógusa C6orf105 Matton androgén-függő TFPI -regulating fehérje katalógusa ILMN_1714383 katalógusa TPD52L1 Matton tumor fehérje D52-szerű 1 katalógusa ILMN_1674817 katalógusa C1orf115 Matton kromoszóma 1 nyitott leolvasási keret 115 katalógusa ILMN_1813561 katalógusa SCIN Matton Scinderin katalógusa ILMN_1759818 katalógusa SORL1 Matton Sortilin kapcsolatos receptor, L (DLR osztály) A ismétlődő tartalmazó katalógusa ILMN_1745686 katalógusa MFHAS1 Matton malignus rostos histiocytoma amplifikált szekvencia 1 katalógusa ILMN_2060115 katalógusa SORL1 Matton Sortilin kapcsolatos receptor, L (DLR osztály) A ismétlődő tartalmazó katalógusa ILMN_2337263 katalógusa PKIB Matton protein-kináz (cAMP függő, katalitikus) gátló béta katalógusa ILMN_2173835 katalógusa FTHL3 Matton ferritin nehéz polipeptid 1 pszeudogén 3 katalógusa ILMN_1791057 katalógusa IFNAR2 Matton interferon (alfa, béta és omega) receptor 2

• Légúti sejtes lipid macrophagok és mikrobiológiai gyomorsav és légúti gyerekeknél reflux oesophagitis
• Prognosztikai neutrofil limfocita arány és vérlemezke limfocita arány előrehaladott gyomorrákban FOLFOX kezelést kapott betegek chemotherapy