Las puntuaciones de riesgo poligénico de datos de varias poblaciones podrían mejorar las predicciones de la EII

Usando datos genéticos de casi 30, 000 personas, Los investigadores de Mount Sinai han creado puntuaciones de riesgo a partir de una combinación de conjuntos de datos que representan distintas poblaciones ancestrales que mejoran la predicción del riesgo de enfermedades inflamatorias del intestino (EII), incluida la enfermedad de Crohn y la colitis ulcerosa. El estudio fue publicado en Gastroenterología el 24 de diciembre.

Los investigadores encontraron que las puntuaciones de riesgo poligénico, construido utilizando datos de asociación de múltiples poblaciones en BioMe Biobank multiétnico de Mount Sinai, predicciones maximizadas de EII para cada población en el biobanco. BioMe es un esfuerzo de todo el sistema en Mount Sinai que está revolucionando el diagnóstico y la clasificación de enfermedades según el perfil molecular del paciente.

El estudio mostró que las puntuaciones de riesgo calculadas a partir de la integración de datos mejoraron significativamente las predicciones entre las personas con europeo, Judío Ashkenazi, y ascendencia hispana en BioMe, así como individuos europeos en el Biobanco del Reino Unido, que contiene datos biológicos y médicos sobre medio millón de personas de entre 40 y 69 años que viven en el Reino Unido. El poder predictivo fue menor para los pacientes con ascendencia africana, probablemente debido a conjuntos de datos de referencia sustancialmente más pequeños y una diversidad genética sustancialmente mayor dentro de las poblaciones de ascendencia africana.

La capacidad de predecir con precisión el riesgo de enfermedad genética en individuos de diferentes ascendencias es una vía crítica que puede afectar positivamente los resultados de los pacientes. ya que se están considerando y desarrollando intervenciones tempranas e incluso medidas preventivas. Estos hallazgos apoyan la necesidad de una mayor diversidad genética, incluyendo más datos sobre poblaciones afroamericanas, para mejorar las predicciones de riesgo de enfermedad y reducir las disparidades de salud para todas las poblaciones ".

Judy H. Cho, MARYLAND, Autor principal de Atudy, Decano de Genética Traslacional y Director del Instituto Charles Bronfman de Medicina Personalizada, Escuela de Medicina Icahn, Monte Sinai

Estos puntajes de riesgo poligénico, que representan una estimación del riesgo general basado en la suma de los muchos de un individuo, mayormente común, variantes genéticas:se calcularon utilizando datos de asociación de EII de cohortes con europeos, Afroamericano, y antecedentes judíos asquenazíes.

Adicionalmente, Los investigadores evaluaron variantes raras en genes asociados con EII de inicio muy temprano dentro de cada población y encontraron que los portadores afroamericanos de variantes poco comunes de LRBA mostraron una expresión reducida de ambas proteínas LRBA y CTLA-4. La deficiencia de LRBA aumenta la susceptibilidad a la EII y da como resultado una menor expresión de CTLA-4, que puede revertirse con el fármaco antipalúdico comúnmente prescrito cloroquina. Los estudios futuros del Laboratorio Cho se centrarán en predecir qué subconjuntos de pacientes podrían beneficiarse de apuntar a esta vía.

"Dado que la expresión reducida de LRBA y CTLA-4 puede provocar EII, es alentador que la cloroquina pueda recuperar parcialmente la expresión, "dice el primer autor del estudio, Kyle Gettler, Doctor, becario postdoctoral en el Departamento de Genética y Ciencias Genómicas de la Escuela de Medicina Icahn en Mount Sinai.

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