El diagrama de barras apiladas de la composición filogenética de todos los taxones del microbioma en este estudio colapsó a nivel de phyla en muestras fecales. Las barras verdes representan Firmicutes y las azules representan Bacteroidetes, las dos familias bacterianas más abundantes. A efectos estéticos las muestras (n =98, abajo) se clasificaron de acuerdo con su composición de Bacteroidetes y Firmicutes para demostrar cómo los resultados del microbioma intestinal de referencia de este estudio podrían usarse junto con los resultados de estudios anteriores. Crédito:King et al, 2019 Aunque el interés de la investigación en la importancia del microbioma intestinal humano para la salud en general sigue creciendo, Actualmente no existe una lista completa de referencia de microbiomas intestinales disponible para investigadores y pacientes. En este estudio, King y sus colegas comienzan a catalogar la composición orgánica de los microbiomas intestinales humanos sanos, y desarrolló un prototipo de plantilla de informes para que los médicos transmitieran los resultados a los pacientes.
Para compilar su base de datos, los autores secuenciaron genéticamente 48 muestras fecales de dieciséis participantes sanos reclutados en el campus de la Universidad George Washington en Washington, CORRIENTE CONTINUA., además de utilizar 50 muestras metagenómicas fecales descargadas del Proyecto de Microbioma Humano de individuos seleccionados como "sanos".
Después de analizar las secuencias genómicas y metagenómicas de todas las muestras mediante un nuevo flujo de trabajo basado en software, King y sus colegas compilaron una base de datos inicial de microbios confirmados y su abundancia relativa en todas las muestras, el GutFeelingKB, utilizando la información genética completa y públicamente disponible del NCBI para proporcionar metadatos sobre los organismos descritos.
El GutFeelingKB describe 157 organismos (155 bacterias y dos organismos arqueales) en 60 géneros distintos. El filo de bacterias más grande representado fue Firmicutes (40 por ciento de todos los organismos en la lista), que a su vez estaba compuesta por un 20 por ciento de Clostridia, 19 por ciento de bacterioidios, 17 por ciento de Bifidobacteriales, 14 por ciento Enterobacterales, y 14 por ciento de bacterias Lactobacillales, clases de bacterias que también se encuentran en el yogur y otros alimentos probióticos. Los autores también señalan que 84 organismos eran comunes a todas las muestras, potencialmente indicando que estas pueden ser especies centrales para el intestino humano.
Este estudio solo reclutó a dieciséis participantes, una pequeña muestra. Pero aunque más estudios podrían continuar identificando organismos adicionales presentes en intestinos sanos de todo el mundo, GutFeelingKB es un primer paso importante. La base de datos podría actuar como punto de partida para el análisis comparativo de muestras y el desarrollo de futuros tratamientos de microbiomas de pacientes.
Los autores añaden:
Nuestro objetivo es mapear el microbioma intestinal sano para que nosotros y otros investigadores podamos utilizar nuestros datos para desarrollar modelos de predicción específicos de enfermedades ".
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