Stomach Health > Vatsa terveys >  > Q and A > vatsa kysymys

GW:n johtama konsortio saa 2,2 miljoonaa dollaria FDA:lta Biocompute Object Specification Project -hankkeeseen

George Washingtonin yliopiston (GW) johtamalle yhteenliittymälle on palautettu heidän BioCompute Object Specification Project -projektinsa, 2,2 miljoonan dollarin ansiosta Yhdysvaltain elintarvike- ja lääkeviraston (FDA) viiden vuoden apuraha. BioCompute Object Specification Project, joka lanseerattiin syksyllä 2017, tarjoaa kaivattuja standardeja korkean suorituskyvyn sekvensointi (HTS) -laskennan ja tietojen analysoinnin välittämiseen, tunnetaan nimellä BioCompute Objects (BCO).

Tämä yhteisölähtöinen projekti tehostaa tietojen ja työnkulun vaihtoa FDA:n, tutkijat, lääkeyhtiöt, ja bioinformatiikan teknologian kehittäjät. Useiden viime vuosien aikana konsortio järjesti säännöllisesti avoimia kokouksia, mukaan lukien vuosittainen työpaja, jonka avulla osallistujat voivat laajentua, tarkentaa, ja asettamaan etusijalle vakioraportoinnin tarpeen samalla kun keskustellaan myös omista sidosryhmäkohtaisista standardin vaatimuksistaan. Näiden työpajojen jälkeen BioCompute Object Specification Document julkaistiin - yksi vuonna 2017 ja toinen päivitetty asiakirja vuonna 2018 - parhaiden käytäntöjen välittämiseksi. GW:n johtamaan konsortioon kuuluu DNAnexuksen asiantuntijoita, Galaxy -projekti, Seitsemän siltaa, ja enemmän.

Henkilökohtaisen lääketieteen edistämiseksi meidän on löydettävä parempi tapa verrata ja hyödyntää genomitietoja, jotka voisivat antaa tietoa syövästä, syntyperä, mikrobiomidynamiikka, metagenomiikka, ja enemmän. Tässä kohtaa tulee BioCompute Object Specification Project. "

Raja Mazumder, PhD, hankkeen päätutkija ja biokemian ja molekyylilääketieteen professori GW -lääketieteen ja terveystieteiden korkeakoulussa

Sähkö- ja elektroniikkainsinöörien standardointijärjestö arvioi standardia parhaillaan virallisesti tunnustetuksi standardiksi. Koska HTS -standardien luominen ja ylläpitäminen tietojen validoimiseksi, laskenta ja yhteentoimivuus ovat kriittisiä FDA:n sääntelytehtävälle, konsortion tavoitteena on luoda mukana oleva tietokanta (BioComputeDB). Tähän kuuluu kehittää mekanismeja BCO:iden siirtämiseksi, teknisten eritelmien dokumentaation päivitykset, ja järjestämällä säännöllisiä tiedotustilaisuuksia FDA:n henkilöstölle BCO:iden luomisesta ja käytöstä.

"Uskon, että ehdotettu tietokanta ja mekanismi BCO:iden siirtämiseksi voi virtaviivaistaa lähetysprosessia, "sanoi Jonathon Keeney, PhD, hankkeen apulaistutkija ja biokemian ja molekyylilääketieteen apulaisprofessori GW:n lääketieteen ja terveystieteiden korkeakoulussa. "Aiomme tehdä tiivistä yhteistyötä FDA:n henkilöstön kanssa varmistaaksemme, että hanke tukee heidän tehtäväänsä, ja että se täyttää myös muiden yhteisön jäsenten tarpeet. "

BioCompute-projekti on myös koordinoinut "App-a-thon" -haasteen PrecisionFDA-alustalla, joka sai bioinformatiikkayhteisön rakentamaan BCO:ita ja niihin liittyviä sovelluksia, ja on myös äskettäin käynnistänyt julkisen ja yksityisen sektorin kumppanuuden, joka kehittää edelleen työkaluja ja palautetta, ja laajentaa hankkeen ulottuvuutta kattamaan lisää ryhmiä eri alueilta.

Other Languages