Istraživač genomike UChicaga dobitnik je nagrade NIH Directors New Innovator Award

Širina inovativne znanosti koju je iznijela kohorta ranih karijera i iskusnih istraživača 2020. impresivna je i nadahnjujuća. Uvjeren sam da će njihov rad potaknuti biomedicinska i bihevioralna istraživanja i dovesti do poboljšanja ljudskog zdravlja. "

Francis S. Collins, DOKTOR MEDICINE., Dr. Sc., Direktor NIH -a

Od dolaska na UChicago 2016. Basu je radio na raznim istraživačkim projektima. Ona istražuje složene biološke sustave koristeći jednostaničnu genomiku - izolirajući pojedinačne stanice i sekvencirajući njihove genetske podatke kako bi dobila bolju sliku staničnih razlika unutar uzorka tkiva. Ovaj, zauzvrat, pruža uvid u jedinstvene podtipove stanica i njihove funkcije unutar određenog tkiva.

Basu se školovao u laboratorijima Aviv Regeva, Doktor znanosti, i David Weitz, Doktor znanosti, obojica pioniri na području jednostanične genomike i mikrofluidike. Basu je suizumitelj prve visokopropusne jednostanične i jednojezgrene RNA-seq tehnologije koja je omogućila njihovo široko prihvaćanje širom svijeta.

Istraživački laboratorij Basu razvija i primjenjuje nove tehnologije za provođenje visokopropusnih jednostaničnih epigenomskih i transkriptomskih profila do 100, 000 stanica odjednom. Ovim pristupom, njezin tim radi na analizi i klasifikaciji jedinstvenih tipova stanica u različitim tkivima, uključujući mišji i ljudski mozak i populaciju mikrobnih stanica.

Njezino istraživanje također doprinosi Atlasu ljudskih stanica, globalni projekt koji uključuje stručnjake za genomiku diljem svijeta s ciljem stvaranja potpunog atlasa svih tipova stanica u ljudskom tijelu i po zdravlju i po bolestima. Ona radi na identificiranju i karakteriziranju tipova stanica u ljudskim crijevima kako bi uspostavila stanični atlas ileuma - krajnjeg dijela tankog crijeva. Korištenje uzoraka biopsije crijeva pacijenata sa i bez Crohnove bolesti, ona nastoji bolje razumjeti stanične vrste i obrasce izražavanja specifične za bolest povezane s iscrpljujućim stanjem.

Uz potporu nagrade New Innovator Award, Basu planira gurnuti ovu jednostaničnu tehnologiju u mikrobni svijet. Raznolikost jedinstvenih vrsta stanica u višestaničnim organizmima poput ljudi dovela je do potrebe za proučavanjem genoma na razini jedne stanice; slična razina raznolikosti također se može očekivati ​​u mikrobnim zajednicama. Bolje razumijevanje ove heterogenosti pomoći će odgovoriti na pitanja o kompliciranim temama poput evolucijske sposobnosti i otpornosti na mikrobe.

Proizvodnja alata koji mogu istražiti razlike među mikrobnim stanicama pri jednostaničnoj rezoluciji ostaje izazov. Basu i njezin tim rade na razvoju mikrofluidnih i genomskih alata koji će omogućiti istraživačima da dešifriraju složene interakcije između mikrobnih populacija, interakcija domaćin-patogen i mikrobiom.

Visoki rizik, Istraživački program s visokim nagradama katalizira znanstvena otkrića podržavajući prijedloge istraživanja koji, zbog svojstvenog rizika, mogu se boriti u tradicionalnom procesu recenziranja unatoč svom transformacijskom potencijalu. Podnositelji zahtjeva za program potiču se na razmišljanje „izvan okvira“ i na nastavak inovativnih ideja u bilo kojem području istraživanja relevantnom za misiju NIH -a u cilju unaprjeđenja znanja i poboljšanja zdravlja.

• Studija može objasniti zašto biljka kanabisa može smanjiti simptome različitih stanja crijeva
• Tiopurini bi mogli pomoći u zaustavljanju replikacije virusa u humanih koronavirusa