Stomach Health > želudac Zdravlje >  > Q and A > želudac pitanje

Konzorcij pod vodstvom GW-a dobiva 2,2 milijuna dolara od FDA-e za Projekt specifikacije bioračunarskih objekata

Konzorcij predvođen Sveučilištem George Washington (GW) vraćen je za njihov projekt specifikacije objekata BioCompute, zahvaljujući 2,2 milijuna dolara, petogodišnju potporu američke Uprave za hranu i lijekove (FDA). Projekt specifikacije objekta BioCompute, koji je pokrenut u jesen 2017. pruža prijeko potrebne standarde za komuniciranje proračuna visokopropusnog sekvenciranja (HTS) i analize podataka, poznati kao BioCompute objekti (BCO).

Ovaj projekt koji vodi zajednica radi na pojednostavljivanju razmjene podataka i tijeka rada između FDA-e, istraživači, farmaceutske tvrtke, i programeri bioinformatičke tehnologije. U posljednjih nekoliko godina, konzorcij je organizirao redovne otvorene sastanke, uključujući godišnju radionicu koja će omogućiti sudionicima da se prošire, oplemeniti, te dati prioritet potrebi za standardnim izvješćivanjem, a također raspravljati o vlastitim zahtjevima standarda za dionike. Nakon ovih radionica, objavljen je dokument o specifikaciji objekata BioCompute - jedan 2017., a drugi ažurirani dokument 2018. - radi prenošenja najboljih praksi. U konzorcij pod vodstvom GW-a uključeni su stručnjaci iz DNAnexusa, Projekt Galaxy, Sedam mostova, i više.

Kako biste pomogli u vožnji personalizirane medicine, moramo pronaći bolji način za usporedbu i nadogradnju na genomskim podacima koji bi mogli dati uvid u rak, podrijetlo, dinamika mikrobioma, metagenomika, i više. Ovdje dolazi projekt specifikacije objekta BioCompute. "

Raja Mazumder, Doktor znanosti, glavni istraživač projekta i profesor biokemije i molekularne medicine na GW School of Medicine and Health Sciences

Standard trenutno ocjenjuje Udruženje za standarde Instituta za elektrotehniku ​​i elektroniku kako bi postao službeno priznati standard. Zbog uspostavljanja i održavanja HTS standarda za provjeru valjanosti podataka, računanje i interoperabilnost ključni su za regulatornu misiju FDA -e, konzorcij ima za cilj stvoriti popratnu bazu podataka (BioComputeDB). To će uključivati ​​razvoj mehanizama za prijenos BCO -a, ažuriranja dokumentacije o tehničkim specifikacijama, i održavanje redovnih informativnih sastanaka za osoblje FDA -e o stvaranju i korištenju BCO -a.

"Mislim da naša predložena baza podataka i mehanizam za prijenos BCO -a ima potencijal pojednostaviti postupak podnošenja, "rekao je Jonathon Keeney, Doktor znanosti, su-istraživač na projektu i docent istraživač biokemije i molekularne medicine na GW School of Medicine and Health Sciences. "Planiramo blisko surađivati ​​s osobljem FDA -e kako bismo bili sigurni da projekt podržava njihovu misiju, te da zadovoljava potrebe i drugih članova zajednice. "

Projekt BioCompute također je koordinirao "App-a-thon" izazov na platformi PrecisionFDA koji je angažirao bioinformatičku zajednicu za izgradnju BCO-a i aplikacija povezanih s njima, a također je nedavno pokrenuo javno -privatno partnerstvo koje će dalje razvijati alate i povratne informacije, i proširit će doseg projekta tako da uključi više skupina iz različitih područja.

Other Languages