PLoS ONE: polimorfizama jedan-Carbon metabolizam i rak jednjaka, želuca i jetre u kineskoj populaciji

Sažetak pregled

Jedan-ugljik metabolizam (folna kiselina metabolizam) se smatra važnim u procesu karcinogeneze zbog svoje uključenosti u sintezi DNK i bioloških reakcija metilacije. Istraživali smo udruge polimorfizama (SNP-ova) u folata metabolički put i rizika od tri karcinoma GI u populaciji bazi case-control studija u Taixing City, Kina, sa 218 jednjaka slučajeva raka, broj oboljelih od raka 206 u trbuhu, 204 jetre slučajeva raka, a 415 zdravih populacija. Sudionici istraživanja su bili intervjuirani sa standardiziranim upitnikom, a uzeti su uzorci krvi nakon intervjua. Mi genotipiziran SNP-ova u MTHFR
, MTR Netlogu, MTRR pregled, DNMT1
i ALDH2 pregled, geni, pomoću PCR- RFLP, SNPlex ili TaqMan analiza. Račun za višestruke usporedbe i smanjiti šanse lažnih izvješća, zaposleni smo polu-Bayes (SB) skupljanje analizu. Nakon skupljanja i prilagodbe za potencijalne čimbenike, pronašli smo pozitivne asocijacije između MTHFR
rs1801133 i rak želuca (bilo koji T u odnosu na C /C, SB izgledi omjer [SBOR]: 1,79, 95% stražnje granice: 1,18, 2,71) i rak jetre (SBOR: 1,51, 95% ograničenja stražnji: 0.98, 2.32). Došlo je do inverzna povezanost između DNMT1
rs2228612 i raka jednjaka (bilo G u odnosu na A /A, SBOR: 0,60, 95% granice stražnji: 0,39, 0,94). Osim toga, otkrili smo potencijalni heterogenost između različitih stanja pod utjecajem alkohola za ORS odnose MTRR pregled rs1801394 do jednjaka (posterior homogenosti P pregled = 0,005) i raka želuca (posterior homogenosti P
= 0,004), a ORS odnose MTR pregled rs1805087 do raka jetre (stražnji homogenost P pregled = 0,021). Među bezalkoholnih piju, varijanta alela (alel G) koji od ova dva SNP-u obrnutoj je bio povezan s rizikom od tih vrsta raka; dok je pozitivna veza je uočena među sve alkohola piju. Naši rezultati pokazuju da genetski polimorfizam koji se odnose na metabolizam jednog ugljika mogu biti povezani s karcinomom jednjaka, želuca i jetre. Heterogenost preko statusa potrošnje alkohola od povezanosti MTR pregled / MTRR pregled polimorfizama i tih karcinoma pokazuje potencijalne interakcije između pijenja alkohola i jedan ugljikov metabolički put pregled

Izvor:. Chang SC, Chang PY, Butler B, Goldstein BY, ul, Cai L, et al. (2014.) polimorfizama od jedne Carbon metabolizam i raka jednjaka, želuca i jetre u kineskoj populaciji. PLoS ONE 9 (10): e109235. doi: 10,1371 /journal.pone.0109235 pregled

Urednik: Nathan A. Ellis, Sveučilište u Arizoni, Sjedinjene Američke Države

Primljeno: 5. veljače 2014. godine Prihvaćeno: 9. rujna 2014. Objavljeno: 22. listopad 2014 pregled

Copyright: © 2014 Chang i sur. Ovo je otvorenog pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan

financiranja. Ovo djelo podržan u sklopu koje je Međunarodne unije protiv raka (UICC) za transfer tehnologije zajedništvo (ICRETT) koju dodjeljuje dr Li-na Mu i Zaklada za Autor Nacionalnog Izvrsna doktorskog rada NR Kine, broj 200157, dodjeljuje se dr . Lin Cai. Studija je također djelomično podržan od strane NIH National Institute of Environmental Health Sciences, National Cancer Institute, Ministarstva zdravstva i socijalne skrbi, daje ES06718, ES 011667, CA09142, kao i Alper istraživačkog programa genomike okoliša UCLA Jonsson Comprehensive Cancer Center i klinička istraživanja Unit UCLA prehrana. U financijeri nisu imali ulogu u studiju dizajna, prikupljanja i analize podataka, Odluka o objavi, ili pripremu rukopisa pregled

U konkurenciji interese.. Autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled

Uvod pregled

gornjeg gastrointestinalnog (GI) karcinomi su glavni uzroci morbiditeta i mortaliteta u cijelom svijetu. Na temelju GLOBOCAN 2012 procjene, želuca, jetre i jednjaka su peti, šesti i osmi najčešći karcinom, odnosno, s globalnim incidencijom od oko 2.189.829 novih slučajeva raka (15,5% od ukupnog broja), te 1,868,700 smrtnih slučajeva (22,8 % od ukupnog broja) [1]. Većina tih slučajeva raka (1,694,874 slučajeva, 77,4%) se javljaju u manje razvijenim zemljama. Kina sama račune za gotovo polovicu svih vrsta raka incident GI (1,023,072 slučajevima, 46,7%) [1]. Pregled

Nastavak istraživanja u vezi s uključivanjem polimorfizama (SNP-ovima) u etiologiji tih triju gornjih karcinoma GI ima bila plodna. Od posebnog interesa su SNP nalaze unutar gena koji sudjeluju u metabolizmu folata [2] - [4]. Folna kiselina održava stabilnost DNA regulira biosintezu DNA, popravak DNA i DNA metilacije [5]. Novotvorine može razviti kada je ovaj put je neregulirano po iscrpljivanju mikronutrijenata ili putem ugradnjom polimorfizama [5]. Za nekoliko enzima koji su uključeni u metabolizam jednog ugljika, uključujući metilentetrahidrofolat reduktazu (MTHFR), metionin sintetaze (MTR), metionin sintetaze reduktaze (MTRR) DNA methyltransferases (DNMTs), te mitohondrijski aldehid dehidrogenaze 2 (ALDH2). MTHFR, MTR, a MTRR su uključeni u sintezu DNA i generacija S-adenosylmethionine (SAM) -a univerzalnog metil-donatora za metilacije reakcije. DNMTs kataliziraju metilacije DNA i repliciraju metilacijskih uzoraka. ALDH2 je odgovoran za metaboliziranje acetaldehid nastaje tijekom metabolizma alkohola. Alkohol i acetaldehid može spriječiti apsorpciju folata i narušavaju DNA metilacije [6]. Pregled

Uloga folne kiseline i metabolizma jednog ugljika u gornjim karcinoma GI nije u potpunosti razumio. Studije na životinjama pružili neke dokaze za posljedicu niske razine folata u oksidativnog stresa, metilacije DNA i hepatocarcinogenesis [7], [8]; dok visok unos folne kiseline može povećati globalni metilacije DNA i smanjiti rizik od raka želuca [9], [10]. Epidemiološke studije pokazale su da genetski polimorfizam gena jednog ugljika metaboličkom putu mogu modulirati rizik jednjaka i želuca raka. [4] Međutim, objavljeni su rezultati neuvjerljivi i ograničena u odnosu na broj gena /polimorfizmi se istražuje. Moguća preinaka za pripadajuće mikronutrijenata i poznatih faktora rizika rijetko je istražena. Stoga, s obzirom na važnost jednog ugljika metabolizam u razvoju gornje raka GI, ispitali smo povezanost između osam SNP-u gena u jednom ugljika metabolički put i raka jednjaka, želuca i jetre u kineskoj populaciji. Isto smo heterogenost udruga na različitim slojevima plazma mikronutrijenata (uključujući folna kiselina, vitamin B12, a ukupni homocistein) i poznatim čimbenicima rizika za ove vrste raka. Pregled

materijali i postupci

Etika izjava

Ova studija je izuzet od institucionalni pregled odbor Sveučilišta California u Los Angelesu (ovjerena oslobađaju 02-248). pregled

dizajn studije i stanovništvo pregled

a detaljan opis studija dizajna je ranije objavljeno [11], [12]. Ukratko, ovo je bio case-control studija populacija bazi provedena u Taixing City, Jiangsu Province, China. Prihvatljivi su slučajevi novodijagnosticiranih bolesnika s patološki ili klinički potvrđenom raka jednjaka (između 1. lipnja i 30. prosinca 2000.), karcinom želuca (između 1. lipnja i 30. prosinca 2000.) rak jetre, i (između 1. siječnja i 30. lipnja 2000.) prijavljeno Taixing CDC tumora Registra. Ostali kriteriji za uključivanje uključujući biti 20 godina ili stariji, u stabilnom zdravstvenom stanju kao što je određeno od strane liječnika, boravka u Taixing za 10 godina ili više, i spremnost na sudjelovanje. Ukupno 218 jednjaka slučajeva raka, 206 slučajeva raka želuca i 204 slučajeva raka jetre sudjelovao, što predstavlja 67, 65 i 57%, odnosno, od svih novodijagnosticiranih bolesnika s rakom. Pregled

Kontrole su nasumično odabrani među zdravim stanovnika od Taixing City s omjerom 02:03 frekvencija odgovarajući na kombinaciji slučaju skupine na 5 godina dobne kategorije (20-24 do 80-84), spol i prebivalište (naselje u ruralnom mjestu ili u urbanom stambenom bloku u centru Taixing Grad). Postoji 23 gradovima (ruralnih područja) i jedan središnji grad (gradsko područje) u Taixing City. Svaki ruralni gradsko sastoji od 10-12 sela, a središnja gradsko područje se sastoji od 10-12 stambenih blokova. Ostali kriteriji za uključivanje bili su isti kao i predmeta. Ukupno 464 potencijalnih kontrole su prilazi, a 415 (89,4%), pristao je sudjelovati. Pregled

Epidemiološka prikupljanje podataka pregled

Sve regrutira predmetima i kontrola završio standardni upitnik kojim upravlja obučeni anketara. Razgovori dogodio ni u domovima sudionika, u bolnicama (za slučajeve), ili u županiji ambulanti (za nadzore). slučajeva raka obično su intervjuirani u roku od 6 mjeseci od dijagnoze. Upitnik prikupi detaljne podatke o demografskim čimbenicima, trenutna visina i težina, prehrambene povijest, povijest pušenje duhana, alkohola za piće povijesti, čaj navike pijenja, profesionalna povijest, obiteljsku povijest raka, kao i fizičke aktivnosti. Pregled

Laboratorijski testovi

Svaki sudionik studije pod uvjetom 5 ml uzorka u perifernoj krvi nakon njihovih razgovora. DNA je izolirana iz krvnih ugrušaka, koristeći metodu fenol-kloroform. Virusom hepatitisa B površinski antigen (HbsAg), IgG antitijela na virus hepatitisa C (HCV) i IgG antitijela za CagA- Helicobacter pylori (H.
pylori
) mjereni su enzimski immunosorbant test (ELISA), koristeći setove od reagensa Company of Shanghai bolnice za infektivne bolesti (Shanghai, Kina), Šangaj Huamei Biological Company (Shanghai, Kina), kao i reagensa Company of Shanghai Biotechnology Industry Park (Pudong, Šangaj, Kina), respektivno. Plazma razine aflatoksina B1 (AFB1) -albumin adukata su određene ELISA testom, kao što je prethodno opisano [13], pomoću slobodnog aflatoksin (Supelco) za aflatoksina standarda. Usporedba između slobodnog i vezanog aflatoksina standardima otkrila log-linearnom odnos, dopuštajući nam da se procijeni apsolutne vrijednosti uzoraka. Plazma folata i razina vitamina B12 su mjereni pomoću konkurentnu radioassay sa jodom 125 obilježenog folata i kobalta 57-označene vitamin B12 kao obilježivača (Quantaphase II B12 /folata radiobinding kit, Bio-Rad, CA). Plazma ukupno homocistein razine (tHcy) mjereni su pomoću komercijalno dostupnih kemiluminiscentne imuno (IMMULITE 1000 automatskom analizatoru, DPC, Los Angeles, CA). Pregled

Mi smo odabrali osam SNP-ova iz MTHFR pregled, MTR pregled, MTRR pregled, DNMT1 pregled i ALDH2 pregled, geni, na temelju sljedećih kriterija: 1) SNP-a koji su funkcionalni ili potencijalno funkcionalni (SNP nalazi se u kodiranju, 3 'i 5' neprevedenih regija); 2) SNP-ova već da je to povezano s gornje raka probavnog; i 3) SNP-ova s ​​malim alela učestalošću od najmanje 5% u Nacionalnom centru za biotehnološke informacije SNP baze podataka. Genotipizacija je izvedena pomoću TaqMan ( MTR
rs1805087, MTRR pregled rs1532268 /rs1801394 i ALDH2 pregled rs886205) ili SNPlex ( DNMT1
rs2228612 i ALDH2 pregled rs2238151) testa, kao što je prethodno opisano (Applied Biosystems od Life Technologies, Foster City, CA) [14], odnosno analizu PCR-RFLP ( MTHFR
rs1801133 i ALDH2 pregled rs671) modificirani iz prethodno objavljenih postupaka [15], [16]. Genotipizacija cijene poziva su više od 97% za TaqMan i PCR-RFLP metoda, a više od 80% za test SNPlex. Ponovljivost je bio 98% za SNPlex testa (3% random duplikate uzoraka) [17] i 100% za TaqMan testa (10% random duplikata uzoraka). Pregled

Statistička analiza pregled

Mi smo koristili Pearsonov hi-kvadrat test za Hardy-Weinberg ravnoteže (HWE) za distribucijama frekvencije genotipova za osam SNP-ova u samo kontrola. Testiranje za HWE među kontrola je uobičajeno za prethodni postupak kontrole kvalitete u genetičkim studijama udruge prepoznati sustavne genotipizacija pogreške u nepovezanim pojedincima. Analizirali smo svaki SNP-raka udrugu ko-dominantna, log-linearnom, dominantan i recesivan genetskih modela, koristeći bezuvjetne logističke regresijske modele za izračun omjer vjerojatnosti (OR ') i 95% intervala pouzdanosti (CIS). Modeli uključeni dobi-odgovarajuće kategorije, seks, prebivalište (urbana /ruralna), obrazovanju (nepismenosti /osnovnu školu /viša od srednje škole), indeks tjelesne mase (BMI, kontinuirano), pušenje paket-godina (stalno), učestalost konzumacije alkohola ( nikada /ponekad /često /svakodnevno), H. pylori pregled infekcija (rak želuca, negativ /pozitiv), HBsAg status (rak jetre, negativni /pozitivni) i plazma AFB1-albumin razine adukata u kvintilima (rak jetre, procjenjuje kvintilni: < 222,7, 222,7 - 344,2, 344.2- 442,6, 442,6 - 588,5 i > 588,5 fmol /mg). Za podešavanje za zaostalih zbunjujućih učinaka od starosti, također uključuje odstupanje doba svake osobe iz srednje dobi u svakoj dobnoj kategoriji [18]. Mi upozoravaju da je broj varijabli prilagodbe može biti pod utjecajem genetskih varijacija, kao što je ove varijable pojavljuju poslije. U najboljem slučaju, naši su procjene izravne genotipa efekte i na drugi način može biti više prilagođen ili smesti od nekontroliranih čimbenika koji utječu na obje varijable prilagodbe i ishode [19]. Dakle, provjerili smo procjene za izravna genotipa djelovanja protiv procjenama podesiti samo za dob i spol. Pregled

Mi i dalje provodi slojevitih analize provjeriti heterogenost preko slojeva mikronutrijenata ili izmjenjive čimbenike rizika, uključujući i plazma mikronutrijenata (folna kiselina, vitamin B12, i tHcy), status, konzumiranje alkohola pušenje, H. pylori pregled infekcija (rak želuca), HBsAg status (raka jetre), a razine u plazmi AFB1 (raka jetre). Koristili smo Procjenjeni medijan razina u kontrolama dichotomize plazmatske razine folata (12,76 nmol /l), vitamin B12 (228,88 pmol /l), tHcy (9,5 umol /l), a AFB1 (388,95 fmol /mg). Koristili smo dominantni genetski model koji pretpostavlja da je učinak varijante alela je dominantan ako je omjer ORS usporedbe varijante alela homozigoti za heterozigota bio manji nego da usporedba heterozigota za uobičajene alela homozigoti; inače mi se recesivan genetski model. Procijenili smo heterogenost preko slojeva pomoću omjera vjerojatnosti ispitivanja usporedbom modela sa i bez uvjeta proizvoda. pregled

Kako bi smanjili rizik od višestrukog usporedbe artefakata i pristranosti prorijeđena-podataka, koristili smo polu-Bayes (SB) skupljanje ( kažnjen-vjerojatnost) metoda za procjenu koeficijenata genotip [20]; izgledi omjer procjene izvještavamo su antilogs tih koeficijenata. Procjena skupljanja je opsežno preporuča kao alternativa superiorniji Bonferronijev u statističkom literaturi za uklanjanje višestrukog testiranja artefakte u komparativnim istraživanjima [21] - [24]. U procjeni skupljanja, umjesto mijenjanja razine alfa, mi nazadovanja ( 'smanjiti') procjene prema nula do stupnja proporcionalna procijenjenog odstupanja i obrnuto proporcionalna prije odstupanja v. Prethodna varijance igra ulogu analognog prilagođenim a razine tla, u smislu da manje vrijednosti odgovaraju strože odbacivanje /otkrivanja kriterija, s a = 0 i v = 0 bude donje granice prilagodbe na kojoj odbacivanje nulte postaje nemoguće. Na drugu krajnost, prilagodba događa kada se koristi izvornu vrijednost a ili ogromnim (efektivno beskonačnog) vrijednosti za v. Pregled

U našoj studiji, dodjeljuje se prethodno varijance 0,50, a prethodno medijan ili = 1 (bez asocijacija), što rezultira 95% prethodne vjerojatnosti pada u intervalu 0,25, 4. Ovaj vuče uočene udruge prema nula do te mjere da bi rezultat, ako je došlo do prethodne null eksperiment promatranje 4 /v = 8 slučajevi ukupno i to je bila spojena s aktualnim podacima [20], [25]. Kada je različita sloja specifične SNP učinci su ostavljene, kao što je stratificirani analiza, prije varijanca je smanjena na 0,25, što odgovara varijancu od 0,50 za koeficijentom stratum-SNP produkta (interakcije). Za svaku stražnjeg procjeni SB, mi i dalje pružati smjera (jednostrane) SB p-vrijednosti, koji su jednaki stražnji vjerojatnost da se procjena točka je na pogrešnoj strani null pod ugrađenom modelu i skupljanja Priors [26], [27]. pregled

Da rezimiramo udrugama 8 SNP za svaku od tri gornja karcinoma GI, konstruirali smo poligenetička ocjenu rizika (PRS) [28]. PRS je izračunata kao ponderirani zbroj genotipa rizika (pod dominantnim ili recesivnim modela kao u stratificiranom analizama) broji, gdje je težina za svaku SNP je određen polu-Bayes prijaviti ILI svoje povezanosti sa svakom raka u u potpunosti prilagođen model. PRS je procijenjena samo među onima s potpunim genotipa podatke o svim 8 SNP, koji uključuju 126 jednjaka slučajeva raka, 125 slučajeva raka želuca, 142 slučajeva raka jetre, i 287 kontrola. Raspon (maksimalno minimalni minus) od PRS za svaki rak je bio podijeljen u tri jednako razmaknutih kategorije; ovi rasponi su od 0,11 do 2,05 za jednjaka, 0 do 1,91 karcinoma želuca, i od 0 do 1,40 karcinoma jetre. analize podataka izvedena je uporabom SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC). pregled

Rezultati

U usporedbi s kontrolama stanovništva, broj oboljelih od raka skloni biti pušači, imali manju BMI i niže obrazovanje razine (Tablica 1). Jednjaka i želuca slučajeva raka bili stariji od kontrola, dok je broj oboljelih od raka jetre bila najmlađa. pacijenata oboljelih od raka jetre imali su najveću muškarac-na-ženski omjer 3,53, a bili su najvjerojatnije konzumiraju alkohol; pacijenata oboljelih od raka jednjaka pili češće od ostalih slučajeva raka i kontrola u ovom istraživanju. Za faktora rizika koji su specifični za svaku stranicu raka, nismo promatrati različito učestalost H. pylori
infekcije među oboljelima od raka želuca i kontrole. U usporedbi s kontrolnom skupinom, pacijenata oboljelih od raka jetre pokazala je veći postotak HBsAg pozitivni (65 naspram 25%), anti-HCV pozitivan (9 vs 3%), a imali su višu plazma AFB1-albumin razine adukata (30 vs 20% u 5 ^{th kvintilne) pregled}

u tablici 2 prikazani su SB izgledi omjer procjene (SBOR) za svaku SNP-raka udruge osam SNP-ova. Tablica S1, S2, S3, S4, S5, S6 pokazuje slojevitih udruge i Slika 1 prikazuje odabrane rezultate. Genotipova distribucija među kontrolama pojavio kompatibilan s Hardy-Weinberg ravnoteže, osim eventualno za DNMT1
rs2228612, koja je P pregled = 0,010, ispod tradicionalne alfa razini od 0,05, ali veći od Bonferroni- podešena razina alfa 0,05 /8 = 0.006 (testiranje svih osam SNP-ova). Međutim, imajte na umu da odgovara mogu utjecati kontrolira daleko od ravnoteže, ako su se slični faktori povezani s oba SNP-ova i raka. Pregled

Mi smo ranije izvijestili pozitivne asocijacije alela T MTHFR
rs1801133 s želuca i raka jetre [11], [12]. U ovoj analizi, te udruge su ostali očito nakon prilagodbe confounder i SB skupljanja (bilo koji T u odnosu na C /C, u potpunosti prilagođen SBOR: 1,79, 95% ograničava stražnji: 1,18, 2,71 za rak želuca; SBOR: 1,51, 95% ograničenja stražnji: 0.98, 2.32 za rak jetre). U analizama stratificirani SB, povezanost između MTHFR
rs1801133 i raka želuca pojavio jači među pojedincima koji su imali niže razine u plazmi folata, veći plazma vitamin B12 ili tHcy, a među pušačima (slika 1). Nije bilo jasno udruženje MTHFR
rs1801133 s raka jednjaka (tablica 2 i tablica S1, S2, S3, S4, S5). Pregled

Dok nije bilo jasno ukupni povezanost SNP u MTR pregled i MTRR pregled i bilo rak u glavni efekt analize (Tablica 2), heterogenost udruge je predložen u stratificirani analize o konzumiranju alkohola, uključujući i udruženja MTR pregled rs1805087 s rak jetre (homogenost P pregled = 0,021) i MTRR pregled rs1801394 s obje jednjaka (homogenost P pregled = 0,005) i raka želuca (homogenost P
= 0.004). Dok G alela nositelji MTR
rs1805087 su obrnuto povezana s rakom jetre među ne-alkoholičara (SBOR: 0,57, 95% granice stražnji: 0,31, 1,04), oni su pozitivno povezani s rakom jetre među drinkers (SBOR: 1,48, 95% stražnji granice: 0,85, 2,57) (Slika 1). Isto tako, G alela nositelji MTRR
rs1801394 su obrnuto povezana s jednjaka i želuca među ne-alkoholičara (SBOR: 0,59, 95% granice stražnji: 0,37, 0,94 za raka jednjaka, SBOR: 0,49, 95% stražnjim ograničenja: 0.30, 0.79 za rak želuca), ali pozitivno je povezano s rakom kod alkoholičara (SBOR: 1,56, 95% granice stražnji: 0,95, 2,56 za raka jednjaka, SBOR: 1,39, 95% granice stražnji: 0,83, 2,32 za rak želuca) ( Slika 1.) pregled

DNMT1 pregled polimorfizam, rs2228612 obrnuto je bio povezan s raka jednjaka u dominantnom genetskom modelu (bilo G u odnosu na A /A, SBOR: 0,60, 95% granice stražnje: 0,39 , 0,94) (Tablica 2). Među tri ALDH2 pregled, SNP, rs671 je bio povezan s raka jednjaka u recesivnog genetskog modela (A /A u odnosu na bilo koji G, SBOR: 1,76, 95% granice stražnje: 0,96, 3,24). U stratificiranom prilagođenim analizama, ALDH2 pregled rs671 pojavila povezana s raka jednjaka kod pojedinaca s razinama nižim plazmi folata (a /a u odnosu na bilo koji G, SBOR: 2,12, 95% granice stražnje: 1.01, 4.44) (Slika 1) , ALDH2
rs2238151 pojavila obrnuto povezana s rakom jetre kada se uspoređuju alela T nosače za one sa C /C genotipa (dob i spol prilagođen SBOR: 0,47, 95% granice stražnje: 0,24, 0,92). Iako nismo pronašli povezanost između ALDH2 pregled rs886205 i rak osjetljivost na glavni efekt analize, sloj specifične SBOR predložio da ALDH2 pregled rs886205 pozitivno je povezano s rakom želuca kod ispitanika s više vitamina plazma B12 razine (SBOR: 1,87, 95% granice stražnji: 1,09, 3,20) (Slika 1) pregled

Osim za analizu na jednu SNP modela, mi također nije zajednički SNP-ove analize, uključujući sve od 8 SNP u modelu. (Tablica 3). Rezultati iz zajedničkog SNP-ovima analize predložio sličnim udrugama kao što je u jednu SNP modela, ali 95% stražnji intervali su šire. Pregled

Analiza na PRS predložio otprilike udvostručenje izgledi za rak jednjaka i jetre među pojedincima u najviša kategorija PRS u usporedbi s onima u najnižoj kategoriji (SBOR: 2,06; 95% ograničenja stražnji: 1,13, 3,77 za raka jednjaka i SBOR: 2,09, 95% granice lateralnim: 1,05, 4,17 za rak jetre), s nešto manje dosljednost kategorijama za rak želuca. U kontinuiranoj analizi PRS, rezultati predložio udvostručenje izgledi za ta tri gornje karcinoma GI s jednom jedinicom (u zapisniku OR) povećanje PRS (Tablica 4). Mi upozoravaju, međutim, da PRS analizira ne računa za rezultat gradnje od podataka, i na taj način se može precijeniti efekte i podcjenjuju varijabilnost dobivenih procjena. Pregled

Rasprava pregled

Ispitali smo povezanost između osam SNP u gena uključenih u metabolički put jednog ugljika i osjetljivosti jednjaka, želuca i debelog jetre u kineskoj populaciji. Nakon nanošenja SB metode skupljanja i kontrolu za potencijalne Ëimbenike, primijetili smo da je bilo T genotip od MTHFR
rs1801133 je pozitivno povezana s oba želuca i raka jetre. Također smo otkrili obrnutu povezanost između varijanti G alela DNMT1
rs2228612 i raka jednjaka. Osim toga, naša studija pokazuje potencijalne ili varijacije preko slojeva konzumacije alkohola, uključujući i udruženja MTRR pregled rs1801394 s jednjaka i želuca i MTR pregled rs1805087 s rakom jetre. Izgledi za gornji karcinoma GI su otprilike udvostručio za kineske sudionika s jedne jedinice (u zapisniku OR) povećanje PRS. Pregled

U metabolizmu jedan ugljika, MTHFR nepovratno katalizira pretvorbu 5,10-metilentetrahidrofolat (5, 10-methyleneTHF) 5-methyltetrahydrofolate (5-methylTHF). 5,10-methyleneTHF je neophodno purina i timidilat sinteze, i 5-methylTHF ko-supstrat za remethylation homocisteina u metionin, koji se dalje konvertira u SAM za metilaciju reakcije [5]. MTHFR C677T pregled (rs1801133) polimorfizam, koji rezultira alanina u valin zamjenu, dovodi do smanjenja MTHFR aktivnosti enzima [29], smanjena 5-methylTHF i nakupljanje 5,10-methyleneTHF u crvenim krvnim stanicama [30]. pregled

Niska MTHFR aktivnost je povezana s rizikom porast karcinoma zbog niskog krvnog 5-methylTHF i oštećena DNA metilacije. S druge strane, to bi moglo smanjiti rizik od raka povećanjem dostupnosti 5,10-methyleneTHF za normalnu sintezu DNA i sprečavanje uracila misincorporation i kromosomske lom [5]. Iako dokazi u prilog tih hipoteza je slabo i neujednačeno [5], In vitro pregled studija sugerira da je učinak MTHFR
rs1801133 na stabilnost DNA i metilacije je site-specific i može ovisiti na folata dostupnosti [31]. Kada je folna kiselina opskrbe je primjerena ili visoka, T alel MTHFR pregled je povezana s povećanim genomske DNA metilacije u stanicama raka debelog crijeva, ali smanjio metilacije DNA u stanicama raka dojke. Kad folata opskrba je ograničen, ova varijanta je povezana sa smanjenom i nepromijenjenom metilacije DNA u debelog crijeva i raka dojke stanicama, odnosno [31]. Uracil misincorporation je smanjen u stanicama raka debelog crijeva izražavajući MTHFR
T alel, a povećana u stanicama raka dojke izražava istu varijantu [31]. Ovaj site-specific razlika može djelomično objasniti razliku u riziku od raka povezan s MTHFR pregled rs1801133 polimorfizma [4]. U epidemiološkim studijama, T alel izgleda da smanjuju rizik od kolorektalnog i raka dojke [32], [33], ali povećava rizik od raka jednjaka, želuca, jetre, mokraćnog mjehura, grlića maternice i pluća [2] - [4], [34] - [36] pregled

u ovom analizom pomoću SB skupljanje, utvrdili smo naše prijašnje rezultate pozitivne povezanosti alela T MTHFR
rs1801133 i karcinoma. želuca i jetre u ovom Taixing stanovništva [11], [12], što znači da je poremećaj metilacije DNA koja proizlazi iz ove varijante igra važnu ulogu u želucu i jetre karcinogeneze. Nedavna meta-analize izvijestio sličnim udrugama (T /T u odnosu na C /C, ILI: 1,40, 95% CI: 1,19-1,66 za rak želuca, ILI: 1,21, 95% CI: 0,95-1,56 za rak jetre) [3], [4]. Osim toga, Zacho et al. [4] prijavio veću povezanost MTHFR
rs1801133 i raka želuca među studijske populacije bez utvrda folne kiseline (ili: 1,60, 95% CI: 1,36-1,88), u usporedbi s onima s utvrda (ILI: 1,15 , 95% CI: 0,81-1,63), koji je sličan našem nalazu jačeg udruge među onima s nižim razinama folne kiseline u plazmi. Za raka jednjaka, naši podaci sugerirao povećani rizik među MTHFR pregled rs1801133 T alela nosača (bilo koji T vs C /C, SBOR: 1,25, 95% granice stražnji: 0,85, 1,84), što je u skladu s nalazima od meta-analizi 19 studija (C /T u odnosu na C /C, ili: 1,47, 95% CI: 1.32-1.63 T /T u odnosu na C /C, ili: 1,69, 95% CI: 1.49-1.91) [ ,,,0],2]. pregled

MTR i MTRR su druga dva važna enzima koji sudjeluju u metabolizmu jedan ugljika. MTR katalizira metilaciju homocisteina za metionin. MTR pregled A2756G (rs1805087), zajednički SNP dovodi do supstitucije od asparaginske kiseline s glicin, je u velikoj mjeri istražena. Međutim, bez očite asocijacije su promatrane s rakom na sljedećim mjestima: pluća, prostate, glave i vrata, mjehura, jednjaka, želuca, dojke ili debelog crijeva i rektum [37] - [46]. MTRR obnavlja funkcionalni MTR redukcijskim metilacije. Dvije zajedničke polimorfizmi, MTRR pregled A66G (rs1801394, pretvara izoleucin na metionina) i C524T (rs1532268, mijenja serina na leucin), su pokazala za regeneraciju MTR manje učinkovito [47]. G alela nositelji MTRR
rs1801394 su povezane s povećanim rizikom za hepatocelularnog karcinoma (HCC) [48]. Isto tako, udruge su u suprotnosti s drugim malignih bolesti, uključujući jednjaka karcinom pločastih stanica (ESCC), rak želuca i rak debelog crijeva [37], [44], [49] - [53]. Većina studija koje su istraživali MTRR pregled rs1532268 izvijestio nikakvih povezanost s debelom crijevu, želuca, dojke i raka pluća [44], [51], [53] - [56]. Pri tome treba imati na umu, međutim, da očigledne nedosljednosti i izvješća bez udruge može biti samo odraz očekuje varijacije u P pregled -values ​​( "statistički značajne"), a ne pravih sukoba. Pregled

Naša studija promatra izgledi omjer varijacija povezanost između njih MTR pregled / MTRR pregled polimorfizama i gornje karcinoma GI preko konzumacije alkohola, čak i nakon konzervativna SB skupljanja. Konzumiranje alkohola, čini se, modificirani prevaga omjeri odnose MTR pregled rs1805087 do raka jetre, i MTRR pregled rs1801394 za jednjaka i rak želuca. G alela nositelji tih dviju SNP-ova su pozitivno povezana s rakom kod alkoholičara, i obrnuto povezana s rakom među ne-drinkers. . Matsuo et al, primijetio sličan ili varijacija [57]: G /G genotip nositelji MTR
rs1805087 pokazali veći rizik od raka debelog među alkohol piju i manji rizik među ne-drinkers. Iako funkcionalni učinak MTR /MTRR pregled polimorfizam nije utvrđen, naši rezultati su biološki moguć kao alkohol može poremetiti metabolizam jedan-ugljik, inhibira apsorpciju folata, suzbijanju sintezu SAM i ugrožavanja DNA metilacije [6]. Alkohol također može uzrokovati inhibiciju metionin sintaze [6]. Dakle, moguće je da je varijanta alela od ova dva MTR /MTRR pregled polimorfizama je zaštitni za gornje karcinoma GI ispod okoliš, bez izloženosti alkoholu. Međutim, to postaje štetno kada je metabolizam jedan ugljikov prekine zbog alkohola i njegovih metabolita. Pregled

ALDH2 je uključen u metabolizam alkohola oksidacijom acetaldehida, grupa 2B ljudski karcinogen, na octenu kiselinu. ALDH2 pregled rs671 polimorfizma-dobro poznata varijanta koja se javlja isključivo u azijskim populacijama-uzrokuje manju katalitičku efikasnost ALDH2, a time čini manju sposobnost da se eliminiraju acetaldehid [58]. ALDH2 pregled rs671 alela (sporo tipa) je bila povezana s povećanim rizikom od raka glave i vrata, kao i raka jednjaka [59], [60]. U skladu s ranijim nalazima, gledali smo pozitivnu povezanost između A /A genotipa i raka jednjaka u ovom istraživanju, te nadalje izvijestio jaču povezanost među onima s nižim razinama folne kiseline u plazmi. Acetaldehid također ometa metabolizam folata [6].

• PLoS ONE: Želudac Virtualni nepoboljšane CT s druge generacije, Dual-Energy CT: preliminarni Study
• PLoS ONE: svjetlosna i elektronska mikroskopija Europske dabar (Castor fiber) Želudac otkriti Jedinstvena morfoloških obilježja s Mogući Opće Biološka Significance