A tanulmány leírja a kezdeti kiindulási egészséges bél mikrobióma adatbázist és a bőségprofilt

A szeptember 11 -én közzétett tanulmány leírja az egészséges bél mikrobioma kezdeti adatbázisát és bőségprofilját. 2019 a PLOS ONE nyílt hozzáférésű folyóiratban, Charles Hadley King, a George Washington Egyetem Orvosi Központjából, USA, és kollégái.

Ebben a vizsgálatban az összes mikrobiomtaxon filogenetikai összetételének halmozott oszlopdiagramja a székletmintákban a phyla szintjén összeomlott. A zöld sávok a Firmicutes -t, a kékek a Bacteroidetes -t jelölik, a két legelterjedtebb baktériumcsalád. Esztétikai okokból a minták (n =98, alul) a Bacteroidetes és a Firmicutes összetételük szerint rendezték, hogy bemutassák, hogy a bél kiindulási mikrobiológiai eredményeit hogyan lehet felhasználni a korábbi vizsgálatok eredményeivel együtt. Hitel:King és mtsai, 2019

Jóllehet az emberi bél mikrobióma általános egészségre gyakorolt ​​jelentősége iránti kutatási érdeklődés tovább nő, jelenleg nincs átfogó bélmikrobióm referencia lista a kutatók és a betegek számára. Ebben a tanulmányban, King és munkatársai elkezdik katalogizálni az egészséges emberi bél mikrobiómák szervezeti összetételét, és kifejlesztett egy prototípus jelentési sablont a klinikusok számára, hogy továbbítsák az eredményeket a betegeknek.

Adatbázisuk összeállításához, a szerzők genetikailag szekvenáltak 48 ürülékmintát tizenhat egészséges résztvevőtől, akik a washingtoni George Washington Egyetem campusából kerültek be, D.C., amellett, hogy 50 egészséges székletből származó metagenomiai mintát használtak, amelyeket a „Human Microbiome Project” -ből töltöttek le „egészségesként” szűrt személyektől.

Miután az összes minta genomiális és metagenomikus szekvenciáját elemezte egy új szoftver-alapú munkafolyamat segítségével, King és munkatársai összeállítottak egy kezdeti adatbázist a megerősített mikrobákról és azok relatív mennyiségéről az összes mintában, a GutFeelingKB, az NCBI átfogó és nyilvánosan elérhető genetikai információinak felhasználásával metaadatokat szolgáltat a leírt szervezetekről.

A GutFeelingKB 157 élőlényt (155 bakteriális és két régészeti élőlény) ír le 60 különböző nemzetségben. A legnagyobb képviselt baktériumfaj a Firmicutes volt (a listán szereplő összes organizmus 40 százaléka), amely viszont 20 százalékban Clostridia -ból állt, 19 százalék Bacterioidia, 17 % Bifidobacteriales, 14 százalék Enterobacterales, és 14 százalék Lactobacillales baktérium - a joghurtban és más probiotikus ételekben is megtalálható baktériumok. A szerzők azt is megjegyzik, hogy 84 élőlény volt közös minden mintában, potenciálisan jelezve, hogy ezek az emberi bél alapvető fajai lehetnek.

Ez a tanulmány csak tizenhat résztvevőt vett fel, egy kis minta. Míg azonban további tanulmányok folytathatják a világ minden tájáról származó egészséges bélben található további organizmusok azonosítását, A GutFeelingKB fontos első lépés. Az adatbázis kiindulópontként szolgálhat a minták összehasonlító elemzéséhez és a jövőbeni páciens mikrobiom kezelések kifejlesztéséhez.

A szerzők hozzáteszik:

Célunk az egészséges bél mikrobióma feltérképezése, hogy mi és más kutatók felhasználhassuk adatainkat betegségspecifikus előrejelzési modellek kidolgozására. "

• A 10 mérföldre egymástól talált nyugat -nílusi vírus minták különböző helyekről érkeztek,
• Rendellenes bélbaktériumok, amelyek gyenge kognitív teljesítményhez kapcsolódnak PTSD -ben és cirrhosisban szenvedő állatorvosoknál