Gli scienziati descrivono la composizione del microbioma in pazienti affetti da IBD e PSC

Nel 2012, Il professor Jeroen Raes (VIB-KU Leuven Center for Microbiology) ha lanciato il progetto Flemish Gut Flora. Sequenziamento di campioni fecali di oltre 3, 000 volontari sani, Il prof. Raes e il suo team hanno definito i confini di un normale, microbiota intestinale correlato alla salute. Prossimo, il team si è rivolto a gruppi di pazienti per identificare le alterazioni del microbioma associate alle malattie. Recentemente, hanno descritto il cosiddetto enterotipo B2, carente di alcuni batteri antinfiammatori. Oggi, i loro risultati sull'elevata prevalenza di questo particolare enterotipo in più diagnosi sono pubblicati in Microbiologia della natura .

Confronto tra microbiomi

La malattia infiammatoria intestinale (IBD) raggruppa diverse condizioni caratterizzate da infiammazione cronica del tratto intestinale, compresa la colite ulcerosa e il morbo di Crohn. La colangite sclerosante primitiva (PSC) è una condizione epatica cronica che comporta infiammazione e cicatrizzazione del dotto biliare, spesso concomitante con IBD. Nel loro nuovo studio, gli scienziati del VIB-KU Leuven descrivono la composizione del microbioma in pazienti affetti da IBD e PSC.

Prof. Jeroen Raes, VIB-KU Lovanio

Negli anni, molti gruppi di ricerca in tutto il mondo hanno tentato di descrivere le alterazioni del microbiota associate alle malattie. Soprattutto l'IBD è un argomento caldo nella ricerca sul microbioma. Il nostro studio si differenzia da questi precedenti tentativi su tre fronti. Primo, abbiamo confrontato il microbiota dei pazienti con i profili di volontari sani del nostro catalogo Flemish Gut Flora Project di oltre 3, 000 microbiomi. Secondo, nelle nostre analisi, non abbiamo esaminato solo le percentuali di diversi batteri presenti nei campioni di feci, ma usarono anche una nuova tecnica per quantificare le loro abbondanze. Terzo, abbiamo corretto i nostri risultati per fattori come feci molli, spesso sintomatico nelle malattie studiate, ma influenzando l'esito delle analisi del microbioma".

Un'impronta microbica della malattia

Combinando la loro esperienza unica nella profilazione quantitativa del microbioma con le loro conoscenze sulla variazione del microbiota associata alla salute, gli scienziati di Lovanio hanno identificato una configurazione alterata del microbioma - noto anche come enterotipo - con un'alta prevalenza tra i gruppi di pazienti. Mentre questo enterotipo è stato osservato nel 13% dei volontari sani, potrebbe essere identificato nel 38-78% dei pazienti con PSC e IBD.

Prof.ssa Séverine Vermeire, gastroenterologo presso UZ Leuven/KU Leuven, che hanno partecipato alla ricerca, chiarisce:"Questa configurazione aberrante del microbioma, che chiamiamo enterotipo B2, è caratterizzata da bassa abbondanza batterica e biodiversità. È particolarmente carente di alcuni batteri antinfiammatori come il Faecalibacterium. Infatti, rileviamo livelli più elevati di infiammazione intestinale in pazienti con enterotipo B2. Anche tra individui sani, i portatori di questo enterotipo hanno livelli leggermente più alti di infiammazione generale di basso grado".

Infiammazione intestinale, microbi, e depressione

Sorprendentemente, solo pochi mesi fa, il laboratorio del Prof. Raes ha descritto una simile alterazione del microbiota da associare a una minore qualità della vita e persino alla depressione.

Il prof. Jeroen Raes afferma:"Sembra esserci una grande sovrapposizione nelle alterazioni del microbioma osservate in diversi gruppi di pazienti. Abbiamo rilevato l'enterotipo B2 in circa il 26% degli individui depressi. Mentre il microbiota intestinale ha dimostrato di svolgere un ruolo nello sviluppo della malattia in, Per esempio, colite ulcerosa e morbo di Crohn, questo è molto meno chiaro per la depressione. Però, esploreremo l'associazione tra l'enterotipo B2 e la depressione in modo più dettagliato in studi futuri".

Mentre circa il 13% degli individui sani può essere classificato come portatore dell'enterotipo B2, i ricercatori sottolineano che questo non dovrebbe essere motivo di preoccupazione.

Prof. Jeroen Raes:"A questo punto, non possiamo fare alcuna previsione sulla suscettibilità alla malattia o sul rischio in base all'enterotipo di una persona. Inoltre, gli enterotipi non sono fissi e possono essere alterati da, Per esempio, cambiare la tua dieta. Le associazioni osservate tra malattie e costellazioni del microbiota non implicano che i batteri intestinali causino effettivamente la malattia. Molti personali, stile di vita, e fattori ambientali sono legati a un enterotipo B2. Però, poiché anche l'infiammazione risulta essere un fattore associato a B2 in alcuni individui, sicuramente esamineremo ulteriormente la potenziale causalità."​

• I test dei marker infiammatori non sono abbastanza sensibili da escludere condizioni gravi,
• La ricerca evidenzia potenziali obiettivi per aiutare a combattere il morbo di Crohn