Stomach Health > Mo. Gesondheet >  > Q and A > Mo. Fro

Arizona COVID-19 Genomics Union verfollegt SARS-CoV-2 Genom Sequenzen

Éischt Erkenntnisser gemellt vun der Arizona COVID-19 Genomics Union (ACGU) suggeréieren datt nom Arizona säin éischte gemellt Fall vum COVID-19 Enn Januar, de Staat huet keng Fäll erlieft déi onentdeckt waren a COVID-frei waren bis op d'mannst 11 ënnerschiddlech Incursiounen tëscht Mëtt Februar a Ufank Abrëll stattfannen.

Déi verëffentlecht Resultater erschéngen am wëssenschaftleche Journal mBio .

Fakultéit um Translational Genomics Research Institute (TGen), en Affiliate vun der Stad vun der Hoffnung, Northern Arizona University (NAU), Universitéit vun Arizona (UArizona), an Arizona State University (ASU) hunn den ACGU am Abrëll gestart mat dem ausdrécklechen Zweck fir de causative Agent vum COVID-19 ze verfollegen, SARS-CoV-2:wéi et sech entwéckelt a wéi et sech verbreet, bannent an aus Arizona.

Den ACGU sequenzéiert d'SARS-CoV-2 Genome a sou vill viruspositive Patiente Proben an Arizona wéi méiglech, an zesumme mat den ëffentleche Gesondheetsbeamten vun Arizona schaffen, huet d'Resultater op staatlech Efforte applizéiert fir Patienten ze testen an ze verfollegen, souwéi Féierung fir Arizona ëffentlech Politiker.

Séier Handlung vun ASU a Maricopa County ëffentlech Gesondheetsbeamten, ACGU Wëssenschaftler sinn d'accord, huet méiglecherweis den éischten identifizéierten COVID-19 Patient an Arizona gehal-e Student dee just aus Hubei zréckkoum, déi chinesesch Provënz wou d'Krankheet hierkënnt - vum Ausbrennen vun engem Ausbroch, an huet verhënnert datt Arizona e fréie Epizenter fir de Contagioun gëtt.

"Dëst ass e super Beispill vu wéi eng séier a grëndlech ëffentlech Gesondheetsreaktioun erfollegräich ka sinn fir d'Verbreedung vun dëser Krankheet ze vermeiden, "sot den ACGU Direkter Dr. Paul Keim, Regents 'Professer fir Biologesch Wëssenschaften a Cowden Endowed Chair in Microbiology bei NAU an Exekutivdirekter vum NAU's Pathogen a Microbiome Institut.

"Ähnlech Schrëtt kéinte geholl ginn wann Dir zukünfteg Efforte formt fir Geschäfter a Schoulen nei opzemaachen, och wann de Virus weider zirkuléiert an d'Leit ufälleg bleiwen, "huet de Keim bäigefüügt, deen och en Distinguished Professor a Co-Direkter vun der TGen's Pathogen a Microbiome Divisioun ass.

Dr Michael Worobey, en ACGU Matgrënner a Chef vum University of Arizona Department of Ecology and Evolutionary Biology, averstanen.

"Et ass eng Kombinatioun vum Patient déi richteg Saachen mécht fir sech selwer ze isoléieren a sech bewosst ze sinn datt hien dës Krankheet méiglecherweis hat, an ëffentlech Gesondheetsbeamten déi richteg Saachen maachen. En Infall vum COVID-19 stoppen war eng Victoire fir de Staat Arizona, "Sot den Dokter Worobey.

Dëst kaaft Arizona wäertvoll Zäit fir Bereetschaftsefforten. Den éischte gemellt Fall vun "Gemeinschaft" Iwwerdroung ass am Arizona am fréie Mäerz erofgaang vum Washington State Ausbroch deen am Februar entdeckt gouf.

Méi wéi 80% vun de SARS-CoV-2 Genom Sequenzen aus Arizona COVID-19 Fäll stamen aus op d'mannst 11 getrennte Lineagen déi ufanks wäit an Europa zirkuléiert waren, a vu Rees dominéieren zënter dem Ausbroch uechter d'US Keen vun den observéierten Iwwerdroungskoupe sinn epidemiologesch verbonne mam originelle Reesverwandte Fall an Arizona, suggeréiert erfollegräich fréi Isolatioun a Quarantän.

Den ACGU benotzt modernste Sequenzer, Benotzerdefinéiert computational Analyse Workflows, a Supercomputer fir d'Sequenz vum RNA Genom vum Virus ze bestëmmen, dee knapp 30 ass, 000 Basen laang. Am Kontrast, et gi bal 3 Milliarde Basen am mënschleche Genom, déi Charaktere sou einfach wéi Aen an Hoerfaarf bestëmmen, an esou komplex wéi d'Privatitéit vun engem Individuum fir Kriibs an aner Krankheeten.

TGen huet bis elo d'SARS-CoV-2 Genome vu bal 3, 000 COVID-19 positiv Proben fir den ACGU, an zousätzlech Sequencing gouf op ASU an UArizona gesuergt, aus de méi wéi 200, 000 positiv Fäll an Arizona, mécht et zu de robuststen esou Efforten an der Natioun. ACGU kritt Arizona Proben gesammelt vum Staat, Grofschaft, Stamm a private Gesondheetssystemer.

ACGU Wëssenschaftler profitéiere vu klenge Verännerungen oder Mutatiounen am Genom vum Virus, déi natierlech mat der Zäit optrieden wéi de Virus sech reproduzéiert, fir d'Verbreedung vum Virus ze verfollegen. Duerch d'Mutatiounen ze vergläichen, déi an Arizona observéiert goufen mat deenen, déi a Stämme präsent sinn, déi ronderëm de Globus zirkuléieren, si kënne bestëmmen wéini a vu wou de Virus an Arizona agefouert gouf.

Mat Hëllef vu molekulare Aueranalysen, Fuerscher hunn erausfonnt datt d'Majoritéit vun Arizona Sequenzen duerch zwou Lineagen vertruede sinn-a verschidde Ënnerlinien-déi meescht vun deenen wahrscheinlech duerch Hausreesen agefouert goufen, awer mat e puer Beweiser fir international Import.

"Duerch den ACGU, mir notzen Expertise a Virologie, genomesch, Evolutioun a Bioinformatik aus ganz Arizona fir dës genomesch Donnéeën séier an handlungsräich Abléck ze distilléieren, déi dem Staat seng ëffentlech Gesondheetsreaktioun ergänzen kënnen, "Den Dr Keim sot." Dës Resultater weisen d'Kraaft vum ëffentleche Gesondheetskontakt Tracing a Selbstisolatioun no engem positiven Test fir de Stroum vun den Infektiounen ze beweegen. "

Dr David Engelthaler, Direkter vum TGen Nord zu Flagstaff, déi den Institut infektiiv Krankheet Filial enthält, sot déi initial ACGU Erkenntnisser weisen wéi all Gemeinschaft, all Staat schreift seng eege Geschicht fir wat an der COVID-19 Pandemie geschitt.

"Mir mussen all dës Komplottlinnen verstoen, déi gefouert hunn, wou mir elo sinn, "sot den Dr Engelthaler, en anere vun de Matgrënner vun der ACGU. "Eemol gouf dës Krankheet am Arizona de 26. Januar festgestallt, Ëffentlech Gesondheet sprang direkt an fir sécherzestellen datt all Kontakter identifizéiert goufen, Echantillon goufen gesammelt an de Patient gouf fir déi nächst puer Woche ganz no beobachtet fir sécherzestellen datt et keng Fäll méi ginn. "

An den nächste Méint, hie sot, et wäert noutwendeg sinn COVID-19 Ausbroch ze verfollegen an epidemiologesch Maueren ronderëm all Fall ze bauen, besonnesch fir déi am Risiko:Persounen iwwer 65, déi a Fleegeversécherungsanlagen, Prisongen, an déi mat existéierende Gesondheetsprobleemer.

"Wann Dir keng Aen op dat hutt, wann Dir kee Kontakt Tracing hutt, dann kann et sech ganz einfach vu Persoun zu Persoun beweegen, "Den Dr Engelthaler sot." Et ass wierklech nëtzlech fir ëffentlech Politiker fir lokal informéiert Entscheedungen ze treffen. "

Dr Efrem Lim, e Virolog deen d'ASU Team féiert, sot d'SARS-CoV-2 Genom Sequenzdaten kënne Gesondheetsversuerger an ëffentlech Politiker e Virdeel ginn am Kampf géint d'Pandemie.

D'Transmissioun vum Virus a seng Mutatiounen ze verfollegen garantéiert datt Therapeutik an Impfungen, déi entwéckelt ginn, um richtege Wee sinn. Mir hunn elo e Grëff wéi de SARS-CoV-2 Virus an eise Gemeinschaften um Sequenzniveau ausgesäit. "

Dr Efrem Lim, Virolog an Assistent Professer, Biodesign Institut, Arizona State University