Vírusové sekvencie SARS-CoV-2 možno identifikovať z tampónov z povrchu nemocnice

Nová štúdia vedcov UC Davis potvrdzuje nízku pravdepodobnosť, že kontaminácia SARS-CoV-2 na nemocničných povrchoch je infekčná. Štúdium, publikované 24. júna v PLUS JEDEN, je pôvodná správa o obnove takmer úplných sekvencií genómu SARS-CoV-2 priamo z povrchových tampónov.

Náš tím bol prvým, kto preukázal, že sekvencie vírusu SARS-CoV-2 je možné identifikovať z tampónov z prostredia odobratých z povrchov nemocníc. "

Angela Haczku, respiračný imunológ a hlavný autor štúdie

Zmena protokolov čistenia a JIS spojených s nižším znečistením SARS-CoV-2

V apríli 2020, vypuknutie ochorenia COVID-19 medzi nemocničnými zamestnancami viedlo interdisciplinárny tím vedcov z UC Davis k vyšetreniu, či nedošlo k vírusovej kontaminácii často používaných povrchov v priestoroch pacientov slúžiacich na JIS a v priestoroch stretnutí personálu v zdravotnom stredisku UC Davis. V tom čase sa veľmi diskutovalo o úlohe fomitov (povrchov) pri šírení choroby. Zozbierali niekoľko vzoriek počas prvej (apríla 2020) a druhej (augusta 2020) vlny COVID-19 z povrchov a HVAC filtrov v nemocnici.

Vedci analyzovali povrchové tampóny na SARS-CoV-2 RNA a infekčnosť a hodnotili vhodnosť RNA na sekvenovanie.

Napriek výraznému zvýšeniu počtu hospitalizovaných pacientov s COVID-19 počas druhého nárastu, tím zistil, že iba 2% tampónov boli v auguste pozitívne testované v porovnaní s 11% vzoriek odobratých v apríli.

„Zníženie kontaminácie vírusom bolo pravdepodobne spôsobené zlepšením starostlivosti o pacienta a protokolov o čistení pacientov na JIS, „Haczku, povedal. Haczku je profesorom medicíny, riaditeľ pľúcneho centra UC Davis a prodekan pre translačný výskum na Lekárskej fakulte UC Davis.

Genómová sekvencia koronavírusu sa nachádza na povrchoch

Štúdia ukázala, že sekvenovaním genómu SARS-CoV-2 bolo možné detegovať dokonca aj zo vzoriek, ktoré boli inak testované na negatívne (nedetekovateľné) bežne používanými testami PCR. Výsledky tiež potvrdili, že RNA SARS-CoV-2 sa zachytila ​​z povrchu, hoci obsahuje takmer neporušenú genómovú sekvenciu, nebol infekčný. Toto zistenie podporuje hypotézu, že kontaminované povrchy nemusia byť hlavným spôsobom šírenia choroby COVID-19.

"Prvýkrát, Podľa našich vedomostí, boli sme schopní určiť sekvenciu vírusového genómu zo vzoriek povrchových tampónov získaných v nemocničnom prostredí, “povedal David Coil, vedecký pracovník projektu v UC Davis Genome Center a prvý autor štúdie. "Našli sme SARS-CoV-2 vo vzorkách, ktoré boli testované negatívne pomocou RT-PCR, čo naznačuje, že sekvenačná technológia je lepšia na detekciu vírusov vo vzorkách životného prostredia. “

Podľa Coila, sekvenovanie genómu vykonávané na vzorkách tampónov z nemocničného povrchu je veľmi dôležité. Získaním presných vírusových genómových sekvencií vedci mohli sledovať zdroj a zistiť, ako sa infekcia pohybuje.

"Naše údaje naznačili, že sekvencie určené pre vírusovú RNA z povrchov boli identické so sekvenciami odvodenými od pacientov hospitalizovaných na JIS v čase odberu vzorky. Schopnosť identifikovať sekvencie vírusového genómu zo vzoriek životného prostredia môže mať vysoký význam pre verejné zdravie." pri sledovaní ohniska a monitorovaní šírenia nových vírusových variantov, “Povedal Haczku.

• Vedci z UTHSC zverejňujú nové poznatky o tom, ako obezita ovplyvňuje liečbu rakoviny
• Zmes polysacharidov pochádzajúcich z kvasníc účinne inhibuje nástup,