Vedci skúmajú prepojenie črevnej mikroflóry s rakovinou hrubého čreva u pacientov s Lynchovým syndrómom

Výskumníčka Gabriela Debesa, člen výskumnej skupiny v Simbióze vedenej Andrésom Moyom v Nadácii na podporu zdravia a biomedicínskeho výskumu v regióne Valencia (Fisabio), študoval vzťah črevnej mikrobioty k rakovine hrubého čreva u pacientov s Lynchovým syndrómom (dedičné ochorenie, ktoré predisponuje vznik rakoviny) pomocou vzoriek tkaniva vo formalíne a konzervovaných v parafíne.

Hlavným cieľom bolo zistiť, či je možné získať informácie o mikrobiómoch na základe vzoriek konzervovaných týmto spôsobom. Toto sa skúmalo na vzorkách pacientov s Lynchovým syndrómom, u ktorých sa vyvinula rakovina hrubého čreva, a porovnávalo sa, či existujú rozdiely medzi sekvenciami bakteriálnej DNA črevnej sliznice a nádormi.

Podľa Gabriely Debesovej prvý signatár, ktorý získal preddoktorandský grant od Španielskej asociácie proti rakovine (AECC) vo Valencii, „Ukázalo sa, že v nádorových tkanivách v porovnaní s normálnou sliznicou je väčšia pravdepodobnosť výskytu niektorých bakteriálnych skupín spojených s nádormi, ako napr Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis a Campylobacter. "

Tieto výsledky už boli získané predtým vo vzorkách čerstvých tkanív, ale novou črtou tejto štúdie je, že tieto informácie extrahuje zo starých tkanív konzervovaných vo formalíne a parafíne, ktoré boli uložené v IBSP-CV, biobanka pre biomedicínsky výskum a verejné zdravie v Comunitat Valenciana, ktoré sú súčasťou valencijskej siete biobankingov.

Pri tomto type štúdií vzorky, ktoré sa bežne používajú, sú z čerstvých alebo mrazených tkanív, čo si vyžaduje okamžité poskytnutie vzoriek alebo závisí od komplexnej mraziarenskej infraštruktúry. Avšak, táto štúdia dokázala potvrdiť predchádzajúce štúdie, analýza blokov čerstvého tkaniva.

Andrés Moya, hlavný riešiteľ projektu, vysvetlil, že „je to dôležitý vývoj, pretože je zachovaných obrovské množstvo vzoriek, a preto sú k dispozícii v nemocniciach a biobankách. Klasicky, vzorky sa odoberú po chirurgickom zákroku z odstránenej oblasti a konzervujú sa v parafínových blokoch. Výhodou tohto spôsobu konzervácie je, že nevyžaduje špeciálne skladovacie podmienky a vydrží mnoho rokov. “

Avšak, tento typ konzervácie vzoriek predstavuje určité komplikácie. Pri štúdiu rakoviny, genomické informácie získavajú na význame. Táto metóda nie je taká účinná pri získavaní týchto informácií, vzhľadom na to, že poškodzuje ľudskú aj bakteriálnu DNA, čo sa používa na analýzu mikrobiómu.

Napriek týmto ťažkostiam získali sme výsledky na základe predchádzajúcich štúdií vykonaných s čerstvým tkanivom, kde je DNA v optimálnych podmienkach pre jej sekvenovanie. “

Vicente Pérez-Brocal, výskumník a prvý signatár štúdie

Nové horizonty

Táto metóda ponúka nové možnosti za predpokladu, že neobmedzuje vzorky na dostupné čerstvé tkanivá, ale je možné použiť oveľa viac uložených vzoriek. Hlavnou aplikáciou bude schopnosť vykonať retrospektívnu analýzu mikrobiómu v našich vzorkách konzervovaných v parafíne, ako alternatíva, keď nie je k dispozícii čerstvé tkanivo na rakovinu hrubého čreva a konečníka a iné patológie.

Lekár Antonio Llombart, hlavný výskumný pracovník skupiny Fisabio pre klinickú a molekulárnu onkológiu a prezident Technického výboru Valencie AECC vysvetlil, že „Táto štúdia je veľmi dôležitým krokom na uľahčenie výskumu toho, ako črevná mikrobiota ovplyvňuje vývoj rakoviny hrubého čreva u ľudí s Lynchovým syndrómom . To umožní, aby boli informácie schopné vyvíjať nové, účinnejšie metódy včasnej diagnostiky a prevencie, niečo, čo je nevyhnutné pri liečbe tohto typu rakoviny, čo je veľmi časté “.

Navyše, Doktor Llombart, vedúci Služby lekárskej onkológie v nemocnici Arnau de Vilanova, dodal, že „je dôležité neustále napredovať v boji proti rakovine hrubého čreva a konečníka, ktoré každý rok postihne viac ako 38, 790 nových pacientov v Španielsku a spôsobuje smrť viac ako 15, 770 ľudí. "

Na štúdium, Bolo použitých 98 vzoriek (jedna z nádorových tkanív a jedna zo zdravej sliznice pre každú osobu) od pacientov s diagnostikovaným Lynchovým syndrómom, ktorí boli chirurgicky ošetrení v rokoch 1996 až 2017. Vzorky patrili 21 ženám a 28 mužom vo vekovom rozmedzí 33 až 87 rokov.

• Nové klinické smernice AGA odporúčajú používať IGB u obéznych pacientov
• Ukázalo sa, že zničujúce svrbenie pečene má prekvapivú príčinu