PLoS ONE: Analyse af mave og Gut Microbiomes i den østlige Oyster (Crassostrea virginica) fra Coastal Louisiana, USA

Abstrakt

Vi brugte high throughput pyrosekventering at karakterisere mave og tarm indhold microbiomes af Crassostrea virginica
, påske østers, fremstillet af to steder, et i Barataria Bay (Hackberry Bay) og den anden i Terrebonne Bay (Lake Caillou), Louisiana, USA. Mave microbiomes i østers fra Hackberry Bay var overvældende domineret af Mollicutes mest tæt knyttet til Mycoplasma
; en mere rigt samfund domineret af Planctomyctes fandt sted i Lake Caillou østers maver. Gut fællesskaber for østers fra begge steder adskilte sig fra mave samfund, og nærede en forholdsvis forskelligartet samling af phylotypes. Phylotypes mest tæt knyttet til Shewanella
og en Chloroflexi stamme domineret Lake Caillou og Hackberry Bay gut mikrobiota hhv. Mens mange medlemmer af mave og tarm microbiomes syntes at være transienter eller opportunister, blev en formodet kerne microbiome identificeret baseret på phylotypes der fandt sted i alle maven eller tarmen prøver kun. Den formodede kerne mave microbiome omfattede 5 Otus i 3 phyla, mens den formodede kerne gut microbiome indeholdt 44 Otus i 12 phyla. Disse resultater kollektivt afsløret nye mikrobielle samfund i østers fordøjelsessystemet, funktioner østers microbiome er stort set ukendt. En sammenligning af microbiomes fra Louisiana østers med bakterielle samfund rapporteret for andre marine hvirvelløse dyr og fisk viste, at bloeddyr microbiomes var mere ligner hinanden end til microbiomes af polychæter, decapoder og fisk

Henvisning:. Kong GM, Judd C , Kuske CR Smith C (2012) Analyse af mave og Gut Microbiomes i den østlige Oyster ( Crassostrea virginica
) fra Coastal Louisiana, USA. PLoS ONE 7 (12): e51475. doi: 10,1371 /journal.pone.0051475

Redaktør: Josh Neufeld, University of Waterloo, Canada

Modtaget: Juni 8, 2012; Accepteret: 5. november 2012; Udgivet: 12. december, 2012

• PLoS ONE: cannabinoid HU210 Beskytter Isoleret Rat mave mod forringelse af Serum af rotter med eksperimentel akut pancreatitis
• PLoS ONE: kitinase mRNA-niveauer ved kvantitativ PCR Brug af Single Standard DNA: Sur Mammalian chitinase- er en stor udskrift i Mouse Stomach