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Investigador de genómica de UChicago gana el premio NIH Directors New Innovator

Oni Basu, Doctor, profesor asistente de medicina genética en la Universidad de Chicago, ha recibido el prestigioso Premio al Nuevo Innovador del Director de los Institutos Nacionales de Salud (NIH).

Estos premios, parte del alto riesgo de los NIH, Programa de investigación de alta recompensa, se dan a científicos excepcionalmente creativos que proponen de alto riesgo, investigación de alto impacto en todas las etapas de la carrera. El premio al nuevo innovador, financiado a través del Fondo Común de los NIH, se centra en apoyar a los investigadores de carrera temprana, Apoyar la investigación inusualmente innovadora de investigadores de carrera temprana que se encuentran dentro de los 10 años posteriores a la finalización de su título final. Este año, 53 investigadores fueron reconocidos con el premio.

La amplitud de la ciencia innovadora presentada por la cohorte de 2020 de investigadores experimentados y de carrera temprana es impresionante e inspiradora. Estoy seguro de que su trabajo impulsará la investigación biomédica y del comportamiento y conducirá a mejoras en la salud humana ".

Francis S. Collins, MARYLAND., Doctor., Director de NIH

Desde que llegó a UChicago en 2016, Basu ha trabajado en una variedad de proyectos de investigación. Ella investiga sistemas biológicos complejos utilizando genómica unicelular, aislando células individuales y secuenciando su información genética para obtener una mejor imagen de las diferencias celulares dentro de una muestra de tejido. Esta, Sucesivamente, proporciona información sobre los subtipos únicos de células y sus funciones dentro de un tejido determinado.

Basu se formó en los laboratorios de Aviv Regev, Doctor, y David Weitz, Doctor, ambos pioneros en el campo de la genómica unicelular y la microfluídica. La propia Basu es co-inventora de las primeras tecnologías de ARN-seq de un solo núcleo y unicelular de alto rendimiento que permitieron su adopción a gran escala en todo el mundo.

El laboratorio de investigación de Basu desarrolla y aplica nuevas tecnologías para realizar perfiles epigenómicos y transcriptómicos unicelulares de alto rendimiento de hasta 100, 000 células a la vez. Con este enfoque, su equipo está trabajando en analizar y clasificar tipos de células únicos en una variedad de tejidos, incluidos los cerebros de ratones y humanos y las poblaciones de células microbianas.

Su investigación también contribuye al Atlas de células humanas, un proyecto global en el que participan expertos en genómica de todo el mundo con el objetivo de crear un atlas completo de todos los tipos de células del cuerpo humano tanto en la salud como en la enfermedad. Ella está trabajando para identificar y caracterizar los tipos de células en el intestino humano para establecer un atlas celular del íleon, la porción final del intestino delgado. Usando muestras de biopsia intestinal de pacientes con y sin enfermedad de Crohn, busca comprender mejor los patrones de expresión específicos del tipo de célula y de la enfermedad asociados con la condición debilitante.

Con el apoyo del Premio al Nuevo Innovador, Basu planea llevar esta tecnología unicelular al mundo microbiano. La variedad de tipos de células únicos en organismos multicelulares como los humanos ha impulsado la necesidad de estudiar el genoma a nivel unicelular; también se podría esperar un nivel similar de diversidad en las comunidades microbianas. Una mejor comprensión de esta heterogeneidad ayudará a responder preguntas sobre temas complicados como la aptitud evolutiva y la resistencia a los antimicrobianos.

La producción de herramientas capaces de investigar las diferencias entre las células microbianas en la resolución de una sola célula sigue siendo un desafío. Basu y su equipo están trabajando para desarrollar herramientas microfluídicas y genómicas que permitirán a los investigadores descifrar las complejas interacciones entre poblaciones microbianas, interacción huésped-patógeno y el microbioma.

El de alto riesgo, El programa de investigación de alta recompensa cataliza el descubrimiento científico al respaldar propuestas de investigación que, debido a su riesgo inherente, pueden tener dificultades en el proceso tradicional de revisión por pares a pesar de su potencial transformador. Se anima a los solicitantes del programa a pensar "fuera de la caja" y a perseguir ideas pioneras en cualquier área de investigación relevante para la misión de los NIH de promover el conocimiento y mejorar la salud.