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Genetica del paziente associata alla composizione e alla guarigione del microbioma della ferita

In uno studio unico nel suo genere, i ricercatori hanno determinato che la genetica può svolgere un ruolo nel modo in cui le ferite guariscono. Caleb Phillips, un assistente professore presso la Texas Tech University e direttore del Laboratorio Phillips nel Dipartimento di Scienze Biologiche, e il dottorando Craig Tipton hanno condotto lo studio, "La genetica del paziente è collegata alla composizione e alla guarigione del microbioma della ferita cronica, " pubblicato giovedì (18 giugno) in open-access, rivista medica peer-reviewed PLOS Pathogens.

Filippo, che ricopre anche il ruolo di curatore delle risorse genetiche presso la collezione di risorse genetiche del Natural Science Research Laboratory (NSRL) Robert J. Baker, ha affermato che lo studio ha determinato che alcuni geni sono associati al numero di batteri e all'abbondanza di agenti patogeni comuni nelle ferite. La raccolta di microbi, noto come "microbioma, " può determinare come una ferita guarisce e quanto tempo richiede tale processo. La ricerca ha anche dimostrato che maggiore è la diversità all'interno di un microbioma della ferita, meno tempo ci è voluto per guarire.

I pazienti che hanno visitato il Southwest Regional Wound Care Center (SWRWCC) di Lubbock per la cura di una ferita infetta agli arti inferiori hanno acconsentito a partecipare allo studio e hanno fornito campioni della loro ferita e di un tampone sulla guancia. Lo studio ha utilizzato il profilo del microbioma, impronte digitali del genoma, convalida del laboratorio umido, imaging e sviluppo del modello per analizzare i campioni e i dati, e includeva ricercatori di Texas Tech, il Texas Tech University Health Science Center (TTUHSC), il SWRWCC e l'Università del North Texas Health Science Center a Fort Worth (UNTHSC).

Abbiamo dimostrato che ci sono posizioni identificabili nel genoma delle persone dove, a seconda del loro genotipo, tendono a contrarre infezioni da batteri specifici. Le diverse localizzazioni genomiche identificate tendono ad essere correlate in termini di tipi di geni a cui sono vicine e che possono regolare. Un'ipotesi di lavoro che emerge dalla ricerca è che le differenze genetiche che influenzano i geni che codificano il modo in cui le nostre cellule interagiscono con l'ambiente e le une con le altre sono importanti per le differenze di infezione".

Caleb Phillips, Professore assistente, Università tecnologica del Texas

Sebbene ci sia ancora del lavoro da fare prima che la ricerca vada a beneficio diretto dei pazienti, Tipton ha detto che lo studio è un passo importante e promettente in quella direzione.

"La medicina personalizzata è un tema caldo e attuale nell'assistenza sanitaria moderna, dove l'obiettivo è identificare le differenze intrinseche all'interno degli individui che possono causare loro un impatto diverso dalla malattia e trovare trattamenti che siano adatti e su misura per l'individuo e possano contribuire a migliori risultati per il paziente, " Tipton ha detto. "Il nostro progetto promuove due vie di ricerca ugualmente interessanti con un potenziale trasferimento alla clinica. In uno, il nostro obiettivo è sviluppare modelli predittivi genomici robusti che potrebbero aiutare i medici a determinare il rischio di un paziente per l'infezione cronica della ferita, in particolare a batteri specifici.

"Nel secondo, questo lavoro aiuta a informare su come la variazione genetica nei pazienti può influenzare le interazioni microbioma-ospite e la patogenesi dell'infezione della ferita. Studiando ulteriormente la patogenesi dell'infezione e come interagiscono queste complesse comunità microbiche, potrebbe essere possibile migliorare le terapie esistenti o sviluppare del tutto nuove strategie terapeutiche".

Phillips ha detto che non vede l'ora di continuare la sua ricerca alla Texas Tech. Il suo laboratorio sta sviluppando uno studio di follow-up che spera possa raccogliere informazioni sufficienti per creare modelli predittivi accurati. Stanno anche lavorando a uno studio che esplora come la posizione di una persona negli Stati Uniti modella le differenze nei microbiomi delle ferite croniche.

"Texas Tech fornisce un buon supporto per la ricerca e lavora continuamente per la crescita, " Phillips ha detto. "La mia ricerca, come quello della maggior parte degli altri, è stato generalmente rafforzato dalla libertà accademica fornita all'università. Il Natural Science Research Laboratory è una delle principali collezioni di storia naturale, ei campioni archiviati presso la Genetic Resources Collection mi hanno permesso di progettare studi come questo che altrimenti non sarebbero stati possibili. Il duro lavoro e la creatività del dottorando Craig Tipton sono stati essenziali per il successo di questo progetto, così come la collaborazione con i laboratori di Nicole Phillips presso UNTHSC e Kendra P. Rumbaugh presso TTUHSC, Il professor Todd Little del Texas Tech College of Education, SWRWCC e NSRL."