Identificazione delle firme siero proteoma di cancro gastrico localmente avanzato e metastatico: un pilota study

Identificazione di firme proteoma del siero di cancro gastrico localmente avanzato e metastatico: uno studio pilota
Abstract
sfondo
Il cancro gastrico è uno dei più più comune e mortale di cancro in tutto il mondo. Lo sviluppo asintomatica iniziale e ulteriori sintomi non specifici provocano la diagnosi in fase avanzata con prognosi infausta. Eppure, clinicamente biomarcatori utili sono disponibili per questa neoplasia, e invasivo l'endoscopia gastrointestinale resta l'unica opzione affidabile in questo momento. Quindi, vi è la necessità per la scoperta di clinicamente utile strumento diagnostico e /o prognostico invasivo in alternativa (o complementare) per strumenti diagnostici attuali. Qui abbiamo mirato per la ricerca di proteine ​​del siero caratteristici per cancro gastrico locale e invasivo
Metodi
campioni di sangue pre-trattamento sono stati raccolti da pazienti con diagnosi di adenocarcinoma gastrico al diverso stadio di malattia:. 35 pazienti con tumore localmente avanzato e 18 pazienti con cancro metastatico; 50 donatori sani sono stati inclusi anche come gruppo di controllo. La frazione a basso peso molecolare del siero proteoma (cioè, peptidoma endogena) è stato profilato dalla spettrometria di massa MALDI-TOF, ei componenti interi proteoma sono stati identificati e quantificati da un approccio fucile LC-MS /MS.
Risultati
firme peptidoma multicomponente sono stati rivelati che ha permesso una buona discriminazione tra controlli sani e pazienti affetti da cancro, così come tra i pazienti con tumore localmente avanzato e metastatico. Inoltre, un approccio LC-MS /MS ha rivelato 49 proteine ​​del siero con differenti abbondanze tra donatori sani e pazienti affetti da cancro (prevalentemente proteine ​​associate con l'infiammazione e la risposta di fase acuta). Inoltre, sono state identificate 19 proteine ​​del siero con differenti abbondanze tra i pazienti con tumore localmente avanzato e metastatico (tra cui proteine ​​associate con citochine /chemochine risposta e il metabolismo degli acidi nucleici). Tuttavia, né peptidoma profilazione né fucile proteomica approccio ha permesso la rilevazione componenti del siero che discriminano tra due sottogruppi di pazienti con malattia locale che sviluppata o non hanno sviluppato metastasi durante il follow-up.
Conclusioni
Le differenze molecolari tra localmente avanzato e metastatico cancro gastrico, così come le differenze più evidenti tra gli individui sani e pazienti affetti da cancro, hanno segnato la riflessione a livello di proteoma sierico. Tuttavia, non abbiamo alcuna prova che si tratti di pre-trattamento del siero proteoma potrebbero predire il rischio di diffusione del cancro nei pazienti trattati a causa di malattia locale. Tuttavia, ha presentato i dati hanno confermato il potenziale applicabilità di un biomarcatore firma a base di siero proteoma nella diagnostica del cancro gastrico.
Parole
Il cancro dello stomaco diagnosi precoce Neoplasie Proteomica Biological marcatori Sfondo
cancro gastrico è il quarto cancro più comune e la seconda causa di morte per cancro in tutto il mondo. Questo tipo di tumore colpisce soprattutto le popolazioni dell'Asia orientale, Europa orientale, e parti del Centro e Sud America, e il tasso di morbilità è due volte più elevato per gli uomini che per le donne [1]. La malignità è associata a sintomi aspecifici o lo sviluppo addirittura asintomatici nelle sue fasi iniziali, che spesso si traduce in diagnosi in fase avanzata. Fase di cancro gastrico è strettamente correlato con prognosi infausta. Secondo il rapporto del National Cancer Data Base, il tasso di sopravvivenza a 5 anni per stadio IA è stata del 78% ed è sceso sostanzialmente in ogni fase per circa il 7% per i pazienti con diagnosi di malattia in stadio IIIB o IV stadio [2]. Quindi, la diagnosi precoce del cancro gastrico potrebbe aumentare radicalmente l'efficacia del trattamento e migliorare la prognosi per questa malattia mortale. Attualmente lo strumento diagnostico più efficace per il rilevamento del cancro gastrico rimane un'endoscopia gastrointestinale, ma questa tecnica invasiva non è adatta per lo screening su larga scala. Purtroppo, non ci sono biomarcatori non invasivi alternative disponibili, in quanto i marcatori tumorali gastrointestinali comunemente usati come CEA, CA 19-9 o 72-4 CA non sono sufficienti per la diagnosi precoce di questo tumore a causa della loro bassa sensibilità e specificità (20-30 %) [3-5]. La maggior parte dei casi di cancro gastrico (superiori al 90%) sono classificati come adenocarcinomi. Più di recente quattro sottotipi molecolari di adenocarcinoma gastrico sono stati distinti basati sulla genomica profiling consegnati grazie al progetto Cancer Genome Atlas [6]. Tuttavia, la conoscenza sulla eterogeneità molecolare e della biologia di questo tipo di tumore, compreso il suo sviluppo e meccanismi di progressione, rimane ancora piuttosto limitata. Quindi, un urgente bisogno di identificazione di biomarcatori clinicamente rilevanti si riferisce non solo la diagnosi precoce, ma anche la prognosi e la previsione di risultato del trattamento.
Proteomica clinica è un approccio importante per la scoperta di biomarcatori del cancro gastrico [7]. E 'generalmente accettato che proteoma sangue è una fonte promettente di nuovi biomarker di questo tipo di tumore, tra cui gli indicatori di particolare pregio per la diagnosi precoce della malattia e monitoraggio della risposta al trattamento [8]. Mass profiling spettrometria a base della frazione a basso peso molecolare del proteoma sierico, cosiddetto peptidoma endogena, rivelato firme multi-peptide con potenziale applicabilità nella classificazione e la diagnosi di differenti tipi di cancro [9-13]. Alcuni lavori sono stati pubblicati che ha esplorato MALDI /profilatura SELDI a base di petidome siero /plasma per la diagnosi di cancro gastrico, che ha proposto le firme peptide che hanno permesso discriminare donatori sani e pazienti con cancro gastrico, o firme associate ad un decorso di una malattia [ ,,,0],14-22]. Diversi componenti di tali firme sono state ulteriormente identificati come frammenti di KNG1 [18], e APOC1 APOA2 [19], SAA [20], e TBB5 TYB4 [22] o FIBA ​​[23, 24]. Più di recente, un pannello di biomarcatori composto di proteine ​​del siero pre-selezionato in base al modello di topo preclinico (afamin, clusterina, VDBP e aptoglobina) è stato convalidato per discriminare tra i malati di cancro gastrico e paziente con malattie gastriche benigne [25]. Tuttavia, nessuna delle proposte di siero proteoma firme di cancro gastrico è stata ampiamente accettata e applicata nella pratica clinica ancora.
Qui abbiamo voluto caratterizzare le caratteristiche proteoma di siero pre-trattamento associato con il rischio di metastasi del cancro gastrico. Sono stati condotti due tipi di analisi proteomica: (1) la frazione a basso peso molecolare del proteoma sierico è stato profilato dalla spettrometria di massa MALDI-ToF, (2) i componenti intere proteoma sono stati identificati e quantificati mediante LC-MS /MS dopo la digestione con tripsina (un approccio "proteomica fucile"). Gruppi di pazienti precedentemente non trattati con cancro gastrico localmente avanzato e malattia metastatica sono stati arruolati in questo studio (un gruppo abbinato di individui sani è stato analizzato come riferimento); tale analisi completa proteomica è stata eseguita in un gruppo di caucasici pazienti affetti da cancro gastrico per la prima volta. firma siero proteoma che una distinzione tra i pazienti con tumore localmente avanzato e metastatico cancro è stato rilevato in questo studio pilota, ma caratteristiche specifiche per i pazienti con malattia localmente avanzata al momento della diagnosi che alla fine metastasi sviluppati non sono stati osservati a questo livello.
Metodi
Caratteristiche dei gruppi di pazienti
Cinquanta-tre pazienti non precedentemente trattati con adenocarcinoma gastrico biopsia sono stati qualificati in questo studio: 35 pazienti con cancro localmente avanzato, tra cui 16 pazienti con metastasi sviluppato durante la terapia o il follow-up e 19 pazienti con non rilevato metastasi durante il follow-up, e 18 pazienti con cancro metastatico. Il secondo gruppo era composto da quattro pazienti con metastasi a distanza di singolo organo e 14 pazienti con diffusione a più organi; organi coinvolti inclusi peritoneo (13 casi), il fegato (otto casi), del polmone (tre casi), altri luoghi (otto casi). In generale, i criteri di inclusione coinvolti: Stato Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) la realizzazione di 0-2, età 20-85 anni, livelli sierici di creatinina < 1,5 mg /dl, livelli sierici di bilirubina < 2.0 mg /dl, un conteggio dei granulociti > 1500 cellule /ml e una conta piastrinica > 100.000 cellule /mL, mentre i criteri di esclusione coinvolti: malignità precedente, precedente intervento chirurgico, radioterapia o chemioterapia. La messa in scena pretrattamento sulla base di un esame fisico, esophagogastroscopy con biopsie, CT dell'esame all'addome e al torace ai raggi X o TAC. Cinquanta donatori libera da malattia per sesso e della stessa età sono stati inclusi come gruppo di controllo. Tutti i partecipanti allo studio sono stati caucasici (~ 65% uomini) con l'età alla gamma 34-74 anni. La tabella 1 sono riportate le informazioni più dettagliate sui gruppi analizzati. Lo studio è stato approvato dal Comitato Etico del caso, e tutte le persone che stavano prendendo parte a questo studio ha fornito un consenso informato che indica la loro participation.Table cosciente e volontaria 1 Caratteristiche dei gruppi di donatori arruolati nello studio
gruppo /parametro

di controllo sani
I malati di cancro (tutti i casi)
pazienti con carcinoma localmente avanzato
pazienti con carcinoma metastatico
No diffusione

Stendere
Numero
(n)
50 | 53
19
16
18
Sesso (M /F)
30/20
37/16
12/7 13/3

12/6
Età (anni)
28-60 (mediana 50)
34-74 (mediana 59)
36-70 (mediana 59)
34-73 (mediana 58)
35-74 (mediana 60)
Tumore posizione
Alto terzo -
15 (28%) Pagina 3 (16%)
6 (37%)
6 (33%)
Medio terzo -
31 (59%)
13 (68%)
9 (57%)
9 (50%)
terzo inferiore -
7 (13%)
3 (16%)
1 (6%)
3 (17%)
grado istologico
G1-G2 -
16 (30%)
10 (53%)
3 (19%)
3 ( 17%)
G3 -
29 (55%) Pagina 8 (42%)
11 (69%)
10 (56%)
Non specificato
- Pagina 8 (15%)
1 (5%)
2 (12%)
5 (27%)
tumore primitivo
CT1-T3
-
50 (94%)
19 (100%)
16 (100%)
15 (83%)
CT4 -
3 (6%)
0 (0%)
0 (0%)
3 (17%)
linfonodale
CN0 -
20 (38%)
13 (68%)
5 (31%)
2 (11%)
CN1-N3 -
33 (62%)
6 (32%)
11 (69%)
16 (89%)
Metastasi (iniziale)
CM0 -
35 (66%)
19 (100%)
16 (100%)
0 (0%)
CM1 -
18 (34%)
0 (0%)
0 (0%)
18 (100%)
Gruppo di pazienti con carcinoma localmente avanzato al momento della diagnosi sono stati ulteriormente suddivisi in sottogruppi in cui o il diffondersi (controllo) o il cancro consecutivo divulgazione /diffusione (metastasi a distanza) è stato rilevato
Preparazione di campioni di siero
sangue pre-trattamento è stato raccolto in 5 ml Vacutainer Tube (Becton-Dickinson), incubate per 30 min a temperatura ambiente per consentire la coagulazione e quindi centrifugati a 1000g
per 10 minuti per rimuovere il coagulo. Il siero è stato aliquotati e conservati a -70 ° C fino all'uso
Profiling della frazione a basso peso molecolare del siero proteoma
Prima campioni di analisi sono stati diluiti 1:. 5 con tampone contenente 20% acetonitrile (ACN) e 25 mM di bicarbonato di ammonio, e poi filtrato mediante centrifugazione attraverso unità Ultra Amicon (50 kDa cut-off) per rimuovere le abbondanti proteine ​​ad alto peso molecolare, in particolare l'albumina. Immediatamente prima che i campioni di analisi sono stati dissalate e concentrate mediante caricamento su microcolonne ZipTip C18 (EMD Millipore), e quindi eluiti con 1 ml di soluzione di matrice (soluzione satura di alfa-ciano-4-idrossi-cinnamico acido nel 30% ACN /H <sub>2O e 0,1% TFA) direttamente nel piatto 800 micron AnchorChip ™ (Bruker Daltonics). L'analisi è stata eseguita utilizzando uno spettrometro di massa MALDI-ToF UltrafleXtreme (Bruker Daltonics); l'analizzatore ha lavorato in modalità lineare, e gli ioni positivi sono stati registrati nel range di massa tra il 1000 e 12.000 Da. I campioni sono stati avvistati in duplicato e per ogni posto due spettri sono stati acquisiti. calibrazione Messa è stata eseguita dopo ogni quattro campioni utilizzando Protein taratura standard I (Bruker Daltonics). Randomizzazione a blocchi è stato usato in registrazione spettri per evitare un possibile effetto batch. Successivamente i dati grezzi è stato esportato in file TXT e le componenti spettrali sono stati pre-elaborata utilizzando bioinformatica algoritmi creati nel nostro gruppo, che comprendeva l'allineamento, il rilevamento e la rimozione dei profili di valori anomali da test q (singoli spettri sono stati rimossi da circa il 5% dei campioni), media di ripetizioni tecnici, rimozione basale e normalizzazione della corrente ionica totale. Gli spettri levigante, raccolta di picco, binning e analisi statistiche sono state effettuate utilizzando il software Spectrolyzer (versione 1.0.21.3590, MedicWave).
LC-MS /MS analisi delle componenti proteoma del siero
campioni di siero sono stati ridotti con 5 mM ditiotreitolo per 5 min a 95 ° C, quindi alchilato con 10 mM iodoacetamide per 20 minuti al buio a temperatura ambiente, e poi digerito notte a 37 ° C con tripsina (Promega). L'analisi è stata effettuata su Dionex UltiMate 3000 RSLC nanoLC sistema collegato al Q Exactive Orbitrap spettrometro di massa (Thermo Fisher Scientific); ogni campione è stato analizzato separatamente. peptidi triptici (2,5 ug di peptidi) sono stati separati su colonna in fase inversa Acclaim PepMap RSLC nanoViper C18 (75 micron × 25 cm, 2 micron di granulazione) utilizzando il gradiente acetonitrile (da 4 a 60%, in 0,1% di acido formico) a 30 ° C e una portata di 250 nl /min (per 230 min). Lo spettrometro operava in modalità MS /MS dati-dipendente con scansioni indagine acquisite ad una risoluzione di 70.000 m /z 200 Da in modalità MS e 17.500 m /z 200 Da in modalità MS2 rispettivamente. Gli spettri sono stati registrati nell'intervallo di scansione m /z 300-2000 in modalità ioni positivi. Più alta energia di dissociazione collisionale (HCD) frammentazione ionica è stata eseguita con le energie di collisione normalizzati impostati su 25. L'identificazione delle proteine ​​è stata effettuata utilizzando Swiss-Prot del database umano con una tolleranza di precisione 10 ppm per le masse peptidi e 0.05 Da per masse frammento di ioni. Le abbondanze di proteine ​​identificate sono stati stimati utilizzando MaxQuant software 1.4.1.1.
Statistica e bioinformatica
le analisi per ogni componente di massa MALDI profili il confronto tra i gruppi di donatori è stata eseguita utilizzando il test t di Student dopo la trasformazione logaritmica dei dati. classificatori a più componenti sono stati costruiti e testati con il metodo SVM-based utilizzando il software Spectrolyzer (versione 1.0.21.3590, MedicWave). Significatività delle differenze di abbondanza di proteine ​​quantificate da LC-MS /MS sono stati valutati utilizzando il test t o il test di Mann-Whitney seconda normalità dei dati (tipo di distribuzione è stato stimato utilizzando il test di Shapiro-Wilk, il test Lilliefors e la F test per l'omogeneità delle varianze), e il test Nemenyi per confronti a coppie. In generale, p = 0,05 è stato selezionato come soglia di significatività statistica tranne per profilatura MALDI cui è stata applicata la correzione Bonferroni per test multipli. Il empirica proteomica Ontology Knowledge Base (EPO-KB), che annota i valori registrati m /z di noti peptidi /proteine ​​[26], è stato impiegato per assegnare ipotetica identificazione dei componenti spettri (0,5% limite di accuratezza di massa è stato permesso). Elenco dei geni corrispondenti alle proteine ​​identificate è stato annotato in termini GO utilizzando gProfiler (http: //biit cs ut EE /gprofiler /...); il significato del termine sovra-rappresentazione è stata valutata utilizzando il test di distribuzione ipergeometrica. Al fine di visualizzare le relazioni funzionali tra proteine ​​identificate geni corrispondenti sono stati annotati presso il plugin GeneMANIA Cytoscape per le reti di interazione via (http: //. Pagine genemania org /plugin /.)
Risultati
Messa. profili della peptidoma endogena del siero (la frazione a basso peso molecolare del proteoma sierico) sono stati caratterizzati da MALDI-TOF spettrometria in tutto il gruppo di 53 pazienti con cancro gastrico e 50 donatori sani abbinati. Questa analisi ci ha permesso di valutare grado complessivo di differenze e le somiglianze tra sottogruppi di individui analizzati. In generale, 255 componenti spettrali (ioni peptide) sono stati distinti nel range di massa analizzato (Fig. 1a), e abbondanza di 101 componenti hanno rivelato variazioni statisticamente significative tra i gruppi a confronto (dopo la correzione di Bonferroni contro i test multiplo). La tabella 2 presenta il numero di componenti del siero che peptidoma differenziati particolari gruppi di donatori. sono state osservate Le principali differenze in abbondanza di componenti specifici nel siero tra i pazienti affetti da cancro e donatori sani (circa il 39% dei componenti registrati crogiolava differenze statisticamente significative). sono state osservate anche le grandi differenze tra i pazienti con tumore localmente avanzato (tutti i casi) e pazienti con carcinoma metastatico (circa il 9% dei componenti registrati crogiolava differenze statisticamente significative); questo è degno di nota che un numero simile di componenti che differenziano sono stati osservati quando i pazienti con tumore metastatico sono stati confrontati con entrambi i sottogruppi con malattia locale separatamente (cioè, gruppo in cui è stato rilevato diffusione a distanza di cancro durante il follow-up e di gruppo, senza evidenza di malattia). Coerentemente, classificatori e dello spettacolo potrebbe essere costruito sulla base di caratteristiche di peptidoma siero che separavano gruppi rispetto di donatori sani e pazienti con carcinoma localmente avanzato o metastatico (la misura AUC per classificatore SVM-based è stato superiore al 90% in entrambi i casi). In netto contrasto, nessuna differenza statisticamente significativa è stata rilevata quando sono stati confrontati due sottogruppi di pazienti con cancro localmente avanzato (che non sviluppata o metastasi durante il follow-up sviluppato) (l'AUC del classificatore SVM-based è stata inferiore al 50%). Figura 1b presenta esempi di componenti peptidoma siero con significativamente differenti abbondanze tra i gruppi a confronto. Questo è interessante notare che tra petidome componenti che differenziano entrambi i controlli sani di pazienti affetti da cancro e pazienti con tumore localmente avanzato da pazienti con malattia metastatica ci sono stati diversi componenti che putativamente corrispondevano a frammenti di fibrinopeptide A (FIBA). Questi componenti inclusi con sede m /valore z 1088,7, 5903,5 e 5916,6 Da significativamente downregulated nel siero di pazienti affetti da cancro, e componenti 1469.9 e 1.626,0 DA con abbondanze marcatamente più elevati nel siero dei pazienti con malattia metastatica rispetto ai pazienti con cancro localmente avanzato (vedi fig . 1b; sui file 1: Tabella S1). Abbiamo concluso che le differenze molecolari tra cancro gastrico localmente avanzato e metastatico (così come le differenze tra gli individui e pazienti sani con cancro gastrico in generale) hanno riflessione a livello di peptidoma siero. Tuttavia, le caratteristiche di peptidoma di siero pre-trattamento potrebbe essere difficilmente applicati per la prognosi della malattia diffusa durante /dopo il trattamento. Figura. 1 Profilo di endogena del siero peptidoma dei pazienti con cancro gastrico. uno spettro di massa media nell'intervallo 1000-10,000 Da. b Esempi di componenti peptidoma siero, che abbondanze erano diverse tra campioni di controlli sani e diversi gruppi di pazienti con cancro allo stomaco. Boxplot
mostrare minima, inferiore quartile, mediana, quartile superiore, i valori massimi e valori anomali; asterischi
marcate differenze significative (p < 0.05 con la correzione di Bonferroni)
Tabella 2 Numero di componenti del siero peptidoma con abbondanze diversi tra i gruppi rispetto degli individui
Gruppi /differenze
contro Controllo cancro (tutti i casi)
localmente avanzato contro il cancro metastatico
locale /no diffusione metastatica contro il cancro
locale /diffusione contro il cancro metastatico
locale /diffondersi contro il cancro /diffusione locale
n
50 vs 53
35 vs 18
19 vs 18
16 vs 18
19 vs . 16
p < 0.05
182
88
74
75
11
FDR
7%
14%
17%
17%
100%
p < 0.05 /Bonferroni
101
23
11
16
0
AUC (SVM)
0.94
0.91
0.92
0,97
0.48 Quali sono riportati i numeri di differenziare i componenti che hanno raggiunto la soglia di significatività statistica p = 0,05 (con un opportuno stima FDR) o soglia rafforzato con la correzione di Bonferroni, e la potenza di SVM classificatore costruite di componenti peptidoma (caratterizzato dal valore AUC)
nella seconda fase abbiamo selezionato i campioni di 12 donatori sani e dieci pazienti provenienti da ogni sottogruppo cancro per garantire stessa età (mediane circa 56 anni) e proporzione tra i sessi (circa l'80% dei maschi) in sottogruppi rispetto. Questi campioni sono stati utilizzati per ulteriori analisi basate sul fucile approccio LC-MS /MS. In generale, circa 450 proteine ​​sono state identificate in campioni di siero analizzati. I livelli di 234 proteine ​​del siero sono stati quantificati in campioni prelevati da ciascuno dei 42 soggetti, tra cui 129 proteine ​​uniche del siero non legate alle immunoglobuline (105 immunoglobuline e proteine ​​Ig-correlate, così come le proteine ​​non caratterizzate putativi, sono stati esclusi da ulteriori analisi); dati completi sono riportati nel file aggiuntivo 1: Tabella S2. C'erano 49 proteine ​​del siero con abbondanze diversi tra donatori sani e pazienti con cancro gastrico (valore p < 0,05; valore stimato FDR = 13%): 41 proteine ​​sono state upregulated mentre otto proteine ​​sono state inibiti nel sangue di pazienti affetti da cancro (proteine ​​elencate nella Tabella 3;. esempi in Fig 2). Questo è degno di nota che simili modelli di up-regulation cancro-correlata o down-regulation di proteine ​​del siero è stato osservato in tutti i sottogruppi di là i malati di cancro (anche se più piccola dimensione dei gruppi analizzati potrebbe ridurre la significatività statistica delle differenze; ​​vedi file aggiuntivo 1: Tabella S3). Inoltre, ci sono stati 19 proteine ​​del siero con abbondanze differenti tra i pazienti con tumore localmente avanzato e metastatico (valore p < 0,05; valore stimato FDR = 34%): tre proteine ​​sono state sovraregolati mentre 16 proteine ​​sono state inibiti nel sangue di pazienti con malattia metastatica. Questo è degno di nota che abbondanza di proteina C-reattiva e angiogenina generalmente upregulated in tumori campioni ulteriore aumento nei campioni metastatici, mentre abbondanze di carbonica 1 generalmente downregulated nei campioni tumorali ulteriormente diminuiti nei campioni metastatici (Tabella 3). Inoltre, i modelli di differenze tra i campioni di pazienti con carcinoma metastatico e tutti i pazienti con malattia locale sono stati mantenuti quando due sottogruppi più piccoli di pazienti con cancro localmente avanzato sono stati a coppie rispetto al tumore metastatico (vedi file aggiuntivo 1: Tabella S4). D'altra parte, l'abbondanza di una sola proteina (antitrombina-3) ha mostrato una differenza statisticamente significativa quando entrambi i sottogruppi di pazienti con carcinoma localmente avanzato sono stati confrontati (abbondanza di questa proteina era il più alto gruppo di pazienti con malattia locale che non diffondono durante seguito). Abbiamo concluso che firma multi-proteina potrebbe essere identificato per la classificazione dei campioni di siero pre-trattamento di pazienti affetti da cancro gastrico, che soffriva di malattia o localmente avanzato o metastatico. Tuttavia, le caratteristiche di proteoma sierico non riusciva a distinguere i pazienti con malattia locale che si diffondono durante il follow-up dopo le proteine ​​del siero treatment.Table 3 di differenziazione
nome Proteine ​​
Proteine ​​nome completo
del gene
di controllo /carcinoma metastatico

rapporto
valore locale /p
rapporto
valore p

A1AG1
glicoproteina alfa-1-acido 1
ORM1
0.67
0,0008
1.00
0,5824
A1AG2
Alpha glicoproteina 1-acido 2
ORM2
0.68
0,0006
1.00
0,7414
A1AT
alfa-1-antitripsina
SERPINA1
0.50
< 0,0001
1.03
0,6441
A1BG
alfa-1B-glicoproteina
A1BG
0,76
0,0072

1.04
0,5824
A2GL
alfa-2-glicoproteina ricca di leucina
LRG1
0.46
0,0016
0,80
0,4414
AACT
alfa-1-antichimotripsina
SERPINA3
0.54
0,0007
0,97
0,9124
ADIPO
adiponectina
ADIPOQ
0.41
0,0092
1.60
0,3442
AFAM
Afamin
AFM
1.30
0,0355

1.06
0,5824
ANGI
Angiogenina
ANG
0.30
0,0465
0,24
0,0294
APOA1
apolipoproteina AI
APOA1
0.47
< 0,0001
1.31
0,0235
APOC1
Apolipoproteina CI
APOC1
0.25
< 0,0001
1.52
0,1183
APOC3
Apolipoproteina C-III
APOC3
1.82

0,0108
1.20
0,5824
APOE
apolipoproteina E
APOE
0.62
0,0040
1.01
0,6441
APOF
Apolipoproteina F
APOF
0.64
0,0085
0,80
0,5235
APOM
Apolipoproteina M
APOM
0.92
0,4275
1.51
0,0263
C1S
Complemento C1s sottocomponente
C1S
0,70
0,0016
1.22
0,0748
CAH1
anidrasi carbonica 1
CA1
2.96
0,0173
2.41
0,0143
CBG globulina legante i corticosteroidi

SERPINA6
0.53
0,0117
1.08
0,7749
CD14
monociti antigene CD14
CD14
0.56
0,0033
1.21
0,1658
CERU
Ceruloplasmina
CP
0.67
0,0013
1.05
0,6129
CFAB
complemento fattore B
CFB
0.61
0,0006
1.11
0,6441
CO2
complemento C2
C2
0.64
0,0475
1.57
0,0679
CO4A
Complemento C4-A
C4A
0.87
0,0435
0.94
0,7749
CO4B
Complemento C4-B
C4B
0.73
0,0127
0.99
0,5526
CO5
C5 del complemento
C5
0,77
0,0085
0.91
0,8776
CO6
Complemento componente C6
C6
0.64
0,0013
0,97
0,8431
CO8G
Complemento componente C8 gamma
C8G
0.66
0,0137

1.12
0,4679
CO9
Complemento componente C9
C9
0.42
< 0,0001
0.93
0,9124
CRP
C-reattiva
CRP
< 0,01
0,0389
0.15
0,0414
CXCL7
piastrinica proteina basica
PPBP
0.83
0,1516
1.53
0,0030
FETUA
Alpha-2-HS-glicoproteina
AHSG
0.90
0,3095
1.34
0,0068
FHR1
Complemento fattore prot H-related. 1
CFHR1
0.66
0,0725
1.30
0,0366
GPX3
glutatione perossidasi 3
GPX3
0.92
0,6065</sub>