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El estudio del genoma completo de la EII en afroamericanos revela un panorama de riesgo genético diferente

En los afroamericanos, el panorama de riesgo genético de la enfermedad inflamatoria intestinal (EII) es muy diferente al de las personas con ascendencia europea, según los resultados del primer estudio de genoma completo de la EII en afroamericanos. Los autores dicen que la investigación clínica futura sobre la EII debe tener en cuenta la ascendencia.

Hallazgos del estudio multicéntrico, que analizó los genomas completos de más de 1, 700 personas afectadas con enfermedad de Crohn y colitis ulcerosa y más de 1, 600 controles, fueron publicados el 17 de febrero en el Revista estadounidense de genética humana .

Como parte de su análisis, los investigadores desarrollaron un algoritmo que corrige la ascendencia al calcular una puntuación de riesgo poligénico de EII. Las puntuaciones de riesgo poligénico son herramientas para calcular el riesgo genético de una enfermedad, que se utilizan para la EII, así como para otras afecciones complejas, como la enfermedad de las arterias coronarias.

Aunque el destino de la enfermedad parece el mismo, las poblaciones se ven muy diferentes, en términos de qué genes específicos contribuyen al riesgo de EII. Muestra que no se puede desarrollar una puntuación de riesgo poligénica basada en una población y aplicarla a otra ".

Subra Kugathasan, MARYLAND, Autor principal

Kugathasan es director científico del programa de EII pediátrica y director del Centro Infantil de Trasplantes y Trastornos inmunomediados en Children's Healthcare of Atlanta. así como el profesor Marcus de pediatría y genética humana en la Facultad de Medicina de la Universidad de Emory.

El primer autor del artículo es el genetista Hari Somineni, Doctor, quien obtuvo su doctorado trabajando con Kugathasan en Emory, y ahora trabaja en Goldfinch Bio en Massachusetts.

Los sitios principales para reclutar participantes del estudio fueron Emory, Cedars-Sinai y Rutgers, junto con Johns Hopkins y la Universidad de Washington en Saint Louis. Junto con Kugathasan, los coautores principales y coorganizadores del estudio fueron Steven Brant, MD de Rutgers y Dermot McGovern, MARYLAND, Doctorado por Cedars-Sinai.

"Uno de nuestros objetivos en el tratamiento de la EII es avanzar hacia un enfoque más personalizado, "dice McGovern, la Cátedra Joshua L. y Lisa Z. Greer de Genética de la Enfermedad Inflamatoria Intestinal en Cedars-Sinai. "Descifrar la arquitectura genética es una parte importante de este esfuerzo. Estudios como este son vitales para asegurar que las poblaciones diversas, incluidos los afroamericanos, beneficiarse de los tremendos avances prometidos por la medicina genómica ".

Tener un familiar de primer grado con una forma de EII conlleva un riesgo mayor que cualquier factor ambiental conocido. Se cree convencionalmente que los afroamericanos tienen menos riesgo de contraer EII, pero Kugathasan dice que esa visión puede reflejar disparidades en el diagnóstico y el acceso a la atención médica.

El estudio mostró que el lugar de riesgo genético más importante para la EII en los afroamericanos, PTGER4, es relativamente menor en las poblaciones de ascendencia europea. Dice Kugathasan. A diferencia de, dos loci de genes que son importantes en los europeos, NOD2 e IL23R, desempeñan papeles más pequeños en los afroamericanos.

Existe cierta superposición en los factores de riesgo genéticos basados ​​en la población afroamericana que históricamente tiene alrededor del 20 por ciento de antecedentes genéticos europeos, con factores de riesgo conocidos de EII como IL23R provenientes del lado europeo.

En 2016, el equipo de investigación publicó el primer estudio de asociación de todo el genoma de la EII en afroamericanos, identificar regiones del genoma asociadas con la colitis ulcerosa solo en personas de ascendencia africana.

Los estudios clínicos futuros de los tratamientos de la EII deben tener en cuenta los antecedentes genéticos de poblaciones específicas, Dice Kugathasan. Se están desarrollando varias terapias para la EII que se dirigen a la vía del receptor de IL23, en parte porque IL23R es un factor de riesgo genético importante, con poco enfoque en PTGER4. Eso necesita cambiar él dice.

El estudio actual también identificó variantes genéticas raras que confieren riesgo de EII que son específicas de los afroamericanos, que no se había observado en estudios anteriores. Las variantes están conectadas al gen que codifica la calbindina 2 (CALB2), una proteína involucrada en la señalización del sistema nervioso.

Lo que el estudio no encontró, decepcionando a los investigadores, fue una serie de variantes genéticas raras que explican la "falta de heredabilidad" en la EII entre los afroamericanos. En estudios de asociación de genoma completo, la heredabilidad faltante se refiere al riesgo de enfermedad que no se explica por variantes genéticas comunes.

Para el futuro del campo de la EII, Kugathasan dice que los estudios de las interacciones gen-ambiente, que examinan factores como la dieta, microbioma, o exposiciones tóxicas - pueden proporcionar conocimientos que no han obtenido los estudios de asociación de todo el genoma.

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