Les chercheurs identifient les facteurs clés pour assurer le succès des greffes de microbiote fécal

Le numéro deux pourrait-il être le numéro un lorsqu'il s'agit de lutter contre la récurrence Clostridium difficile (ICD) ?

En utilisant l'analyse du matériel génétique et l'apprentissage automatique, Les chercheurs de l'UBC ont identifié plusieurs facteurs clés pour assurer le succès des greffes de microbiote fécal (FMT), qui ont fait leurs preuves dans le traitement des infections bactériennes dans l'intestin, y compris des maladies comme C. difficile , La maladie de Crohn, Colite et même obésité, explique l'auteur principal Negin Kazemian.

Cette thérapie n'en est qu'à ses balbutiements, mais des études comme la nôtre aident à identifier les principaux contributeurs à son succès global."

Negin Kazemian, Auteur principal de l'étude et étudiant diplômé, École d'ingénieurs, Campus Okanagan de l'Université de la Colombie-Britannique

Kazemian et son superviseur, Professeur adjoint Sepideh Pakpour, étudient la dynamique interne des donneurs et des receveurs pour définir une formule pour l'efficacité de la thérapie.

C. difficile est l'une des infections nosocomiales les plus fréquemment identifiées en Amérique du Nord, Elle ajoute. Une fois qu'un patient l'obtient, la maladie revient souvent, ayant un impact négatif significatif sur les micro-organismes intestinaux d'un patient.

Kazemian explique que les écosystèmes intestinaux gravement endommagés, comme quelqu'un qui a eu C. difficile , ne se renouvellent pas automatiquement. Par conséquent, FMT peut aider en restaurant les systèmes endommagés grâce à la recréation de l'écosystème d'origine, ou la construction d'un écosystème entièrement nouveau et alternatif.

« Dans notre étude, nous avons montré que le succès de la récupération écologique intestinale grâce à la FMT dépend de plusieurs facteurs, y compris le microbiome intestinal du donneur - la présence de bactéries spécifiques - ainsi que les structures de la communauté intestinale pré-FMT du receveur et l'absence de bactéries et de champignons spécifiques.

Certaines études antérieures ont souligné la possibilité de « super » donneurs, mais ces nouvelles découvertes indiquent que la relation entre les donateurs et les bénéficiaires est beaucoup plus complexe. Pakpour dit que la notion de super-donateur est simplifiée à l'extrême en raison des fluctuations à court terme observées. Le microbiote d'un receveur peut être tout aussi important à prendre en compte pour prédire les résultats d'un traitement, en particulier dans des conditions déséquilibrées telles que la colite ulcéreuse.

"Prendre, par exemple, greffes de sang où nous avons une solide compréhension des quatre principaux groupes ou types sanguins, et comment ils interagissent les uns avec les autres, ", dit Pakpour. "Avec les transplantations fécales, la recherche jusqu'à présent n'a pas été aussi claire sur ce qui constitue une bonne correspondance ou une bonne compatibilité."

En travaillant avec les données de l'hôpital de l'Université de l'Alberta, Kazemian et Pakpour ont analysé la composition intestinale et l'ADN d'échantillons extraits avant et après la FMT.

Selon Kazemian, leurs résultats indiquent qu'il n'existe pas d'approche « un seul tabouret pour tous » pour assurer le succès de la transplantation.

"Les données illustrent que les micro-organismes uniques dans le corps de chacun réagissent différemment au fil du temps, et cela a des implications profondes sur le fait que ces greffes fonctionnent bien ou non. »

Les chercheurs suggèrent que la préparation des écosystèmes intestinaux des donneurs et des patients avant la greffe, peut-être en utilisant des métabolites, synchroniseraient potentiellement leur microbiote, ouvrant la voie à une probabilité plus élevée de réussite de la transplantation.

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