Le programme Dynamics of Colonization and Infection by Multidrug-Resistant Pathogens in Immunocompromised and Critically Ill Patients a reçu une subvention de 11 millions de dollars de l'Institut national des allergies et des maladies infectieuses pour mener cette étude de cinq ans.
L'équipe de recherche cherchera à expliquer les microbes, clinique, et les facteurs de résistance aux antimicrobiens de trois principaux agents pathogènes multirésistants :les entérocoques résistants à la vancomycine, Enterobacterales produisant des β-lactamases/carbapénémases à spectre étendu, et Clostridioides difficile. Les trois agents pathogènes sont résistants aux traitements antimicrobiens tels que les antibiotiques.
"Nous voulons en savoir plus sur la façon dont ces trois classes d'organismes colonisent le tractus gastro-intestinal des patients gravement malades et, finalement, provoquer des infections chez ces populations de patients, " dit César A. Arias, MARYLAND, MSc, Doctorat, chercheur principal de l'étude et professeur de maladies infectieuses à la McGovern Medical School de l'UTHealth. Il est également titulaire de la chaire Herbert L. et Margaret W. Dupont en maladies infectieuses à l'UTHealth School of Public Health.
Le projet utilisera une analyse de pointe des génomes des agents pathogènes et de leurs produits potentiels - associée à des analyses robustes du microbiome (flore intestinale) à l'aide d'échantillons de selles, écouvillonnages oraux, et des échantillons de sang.
Une technologie innovante, développé au Texas Children's Hospital Microbiome Center, qui utilise des ensembles de données de microbiome avec de grandes données cliniques, nous aidera à prédire avec précision la susceptibilité à la maladie de chaque patient afin de faciliter une gestion personnalisée des maladies infectieuses. »
Tor Savidge, Doctorat, professeur agrégé de pathologie et d'immunologie au Baylor College of Medicine et co-investigateur principal de l'étude
L'équipe de recherche prévoit de suivre les participants à l'étude pendant leur hospitalisation dans les unités de soins intensifs du Memorial Hermann Hospital-Texas Medical Center, ainsi que ceux de l'unité de greffe de moelle osseuse du MD Anderson, comprendre pourquoi certains patients qui ont ces agents pathogènes colonisés dans leur intestin ne développent pas d'infections, tandis que d'autres le font. La colonisation signifie que l'agent pathogène est présent dans le corps, et infection signifie que l'agent pathogène est présent et rend le patient malade. Les personnes les plus à risque de développer une infection bactérienne multirésistante sont celles dont le système immunitaire est affaibli et celles qui prennent des antibiotiques pour d'autres infections.
"Le but est de prendre les données de cette étude pour développer un algorithme qui peut déterminer si un patient est faible, moyen, ou à haut risque, puis sur la base de cette connaissance, développer de futures interventions, " dit Arias.
Le microbiote humain est l'ensemble collectif de tous les milliards de pathogènes (bactéries, champignons, protozoaires, et virus) qui vivent à l'intérieur du corps. La plus grande collection se trouve dans l'intestin. L'une des principales fonctions du microbiote est d'aider à réguler le système immunitaire, et toute modification du microbiote peut affecter la probabilité d'infection par un agent pathogène.
Le programme comprend des chercheurs du Center for Antimicrobial Resistance and Microbial Genomics de la McGovern Medical School, le Centre des maladies infectieuses de l'École de santé publique de l'UTHealth, MD Anderson, Hôpital pour enfants du Texas, Collège de médecine Baylor, l'Université de Houston, Université du riz, et les consortiums de la côte du golfe.
"Cette étude est essentielle pour améliorer les résultats cliniques de nos patients atteints de cancer car ils sont très vulnérables aux infections mortelles par des bactéries résistantes aux antimicrobiens, " a déclaré Samuel A. Shelburne, MARYLAND, Doctorat, le vice-président du département des maladies infectieuses, Contrôle des infections et santé des employés chez MD Anderson et co-chercheur principal de l'étude. "Grâce à une stratégie coopérative qui exploite les forces uniques des enquêteurs du Texas Medical Center, nous cherchons à tirer parti de la science basée sur le microbiome pour avancer vers notre objectif à long terme de faire disparaître le cancer, " il a dit.
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