Les chercheurs examinent de près les communautés invisibles de microbes dans la bouche

La plupart des gens savent qu'une bonne hygiène bucco-dentaire - brossage, la soie dentaire, et des visites dentaires régulières - est liée à une bonne santé. Les chercheurs sur le microbiome de la Colorado State University offrent de nouvelles preuves pour soutenir que la sagesse conventionnelle, en examinant de près les communautés invisibles de microbes qui vivent dans chaque bouche.

Le microbiome buccal - la somme totale des micro-organismes, y compris les bactéries et les champignons, qui occupent la bouche humaine - a fait l'objet d'un crowd-sourcé, étude axée sur la science citoyenne par le laboratoire de recherche de Jessica Metcalf au CSU et l'équipe de recherche de Nicole Garneau au Denver Museum of Nature &Science. Publié dans Rapports scientifiques , l'étude a trouvé, entre autres, une corrélation entre les personnes qui ne se rendaient pas régulièrement chez le dentiste et la présence accrue d'un agent pathogène qui cause la maladie parodontale.

Pour les expériences, réalisée par l'équipe de science communautaire de Garneau dans le laboratoire de génétique du goût du musée, un large échantillon de visiteurs du musée s'est soumis à un prélèvement de joue et a répondu à des questions simples sur leur démographie, modes de vie et habitudes de vie. Les données de séquençage de l'ADN microbien analysées par le groupe de Metcalf ont révélé, largement, que les habitudes de santé bucco-dentaire affectent les communautés de bactéries dans la bouche. L'étude a souligné la nécessité de considérer la santé bucco-dentaire comme fortement liée à la santé de l'ensemble du corps.

Notre étude a également montré que le crowdsourcing et l'utilisation de scientifiques communautaires peuvent être un très bon moyen d'obtenir ce type de données, sans avoir à utiliser de gros, études cas-témoins."

Zach Burcham, chercheur postdoctoral et auteur principal de l'article

L'auteur principal Metcalf est professeur agrégé au Département des sciences animales et membre du Microbiome Network de la CSU.

Écouvillons de joues

De retour en 2015, La co-auteure de l'article, Garneau, et son équipe ont formé des citoyens scientifiques bénévoles à utiliser de grands écouvillons pour prélever des cellules de joue des visiteurs du musée - une population naturellement diversifiée - qui ont consenti à l'étude. Ces scientifiques citoyens formés ont aidé à collecter des écouvillons auprès de 366 personnes - 181 adultes et 185 jeunes âgés de 8 à 17 ans.

L'impulsion initiale de l'étude était de déterminer si et dans quelle mesure le microbiome oral contribue à la façon dont les gens goûtent les choses sucrées. En recueillant ces données, qui a également été rapporté dans le journal, les chercheurs ont noté des points de données plus importants concernant les habitudes de santé bucco-dentaire.

Pour aider à traduire les données, Garneau s'est tourné vers l'équipe d'experts de Metcalf au CSU. Burcham et les scientifiques du microbiome ont utilisé des outils de séquençage et d'analyse sophistiqués pour déterminer quels microbes étaient présents dans quelles bouches. Le séquençage des données a été effectué en collaboration avec des scientifiques du groupe de Rob Knight à l'Université de Californie à San Diego. Une équipe de nutrition de la Michigan State University a également apporté son expertise sur l'importance des relations entre l'enfant et la mère pour l'analyse des données.

"Ensemble, nous avions une équipe de rêve pour utiliser la science communautaire pour répondre à des questions compliquées sur la santé humaine et la nutrition, en utilisant un séquençage et une analyse microbienne de pointe, " a déclaré Garneau.

La soie dentaire et les soins dentaires réguliers

L'étude a regroupé les personnes qui utilisaient ou n'utilisaient pas la soie dentaire (presque tout le monde a dit qu'elles se brossaient, ce n'était donc pas un point de données utile). Les participants qui utilisaient la soie dentaire présentaient une diversité microbienne plus faible dans leur bouche que les non-utilisatrices de la soie dentaire. Cela est probablement dû à l'élimination physique des bactéries qui pourraient être à l'origine d'une inflammation ou d'une maladie.

Les adultes qui étaient allés chez le dentiste au cours des trois derniers mois avaient une diversité microbienne globale plus faible dans leur bouche que ceux qui n'étaient pas allés chez le dentiste depuis 12 mois ou plus, et avait moins de l'agent pathogène buccal causant la maladie parodontale, Tréponème. Cette, de nouveau, était probablement due au nettoyage dentaire éliminant les taxons bactériens plus rares dans la bouche. Les jeunes avaient tendance à avoir eu une visite dentaire plus récemment que les adultes.

Les microbiomes des jeunes différaient entre les hommes et les femmes, et en poids. Les enfants considérés comme obèses selon leurs indices de masse corporelle avaient des microbiomes distincts par rapport aux enfants non obèses. Les enfants obèses avaient également tendance à avoir des niveaux plus élevés de Treponema, le même agent pathogène trouvé chez les adultes qui n'avaient pas été chez le dentiste depuis plus d'un an. En d'autres termes, les chercheurs ont vu un lien possible entre l'obésité infantile et les maladies parodontales. "C'était très intéressant pour moi, que nous avons pu détecter ces données dans une population aussi générale, avec un groupe de personnes aussi variable, " a déclaré Burcham.

Autres données découvertes : les microbiomes des jeunes participants, principalement dans la tranche des 8 à 9 ans, avaient plus de diversité que celles des adultes. Cependant, Les microbiomes adultes variaient plus largement d'une personne à l'autre. Les chercheurs pensent que cela est dû au fait que les environnements et les régimes alimentaires des adultes sont plus variés que ceux des enfants.

Ils ont également constaté que les personnes qui vivaient dans le même ménage partageaient des microbiomes oraux similaires.

"Quand vous regardez les familles qui vivent ensemble, vous trouvez qu'ils partagent plus de ces taxons rares, les bactéries qui ne se trouvent pas aussi souvent en plus grande abondance, " a expliqué Burcham. C'était un point de données qui soulignait la pertinence de l'environnement bâti par rapport aux communautés microbiennes de notre corps.

Travailler sur l'étude de la bouche était fascinant, bien qu'en dehors du champ d'application normal de Burcham ; il se concentre généralement sur l'étude de l'écologie microbienne de la décomposition.

"Je pense que nos vies sont essentiellement déterminées par nos microbiomes, et affectés par nos microbiomes, est intéressant, quel que soit le système que nous examinons, " a déclaré Burcham.

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