De nombreuses personnes en Afrique subsaharienne consomment régulièrement de la viande de brousse, jusqu'à deux à cinq fois par semaine, ce qui signifie que des millions de personnes pourraient s'exposer à ces agents pathogènes dangereux, et le nombre augmente. La consommation et le commerce de viande de brousse ont augmenté en raison de l'insécurité alimentaire croissante, faible coût par rapport aux autres produits carnés, et valeur médicinale perçue, entre autres."
Robab Katani, professeur adjoint de recherche en santé mondiale, Instituts Huck des sciences de la vie, État de Pennsylvanie
Le problème ne se limite pas non plus à l'Afrique, elle a ajouté.
« De la viande de brousse est introduite illégalement aux États-Unis et en Europe occidentale quotidiennement, " dit-elle. " Par exemple, L'aéroport Charles de Gaulle en France intercepte cinq tonnes par semaine. Cette pratique met encore plus de personnes à risque de contracter des maladies bactériennes dangereuses. »
Pour quantifier le risque associé à la consommation et à la manipulation de viande de brousse, les chercheurs devaient d'abord identifier les bactéries présentes dans la viande. Ils ont obtenu 56 échantillons de tissus de viande de brousse frais et transformés des grands herbivores prédominants - y compris le buffle, zèbre et girafe -- du parc national du Serengeti et des régions avoisinantes. Ils ont collecté ces échantillons dans trois régions écologiquement distinctes, appelé Bunda, Serengeti et Tarime, au sein de l'écosystème du Serengeti. En utilisant une large technique de séquençage génétique, appelé séquençage de l'ARNr 16S, ils ont analysé les microbiomes - tous les micro-organismes - présents dans chaque échantillon.
L'équipe a trouvé 27 groupes différents - appelés phylums - de bactéries dans les échantillons, avec Firmicutes, Protéobactéries, Les cyanobactéries et les Bacteroidetes étant les plus abondantes. Tous ces groupes contiennent les deux espèces pathogènes. Au sein de ces phylums, les chercheurs ont détecté des signatures ADN de bactéries du genre Bacillus, Brucella et Coxiella, qui contiennent les espèces qui causent l'anthrax, brucellose et fièvre Q, respectivement. Les résultats de l'équipe sur l'analyse du microbiome des échantillons apparaissent aujourd'hui (2 décembre) dans Rapports scientifiques .
"Anthrax, la brucellose et la fièvre Q peuvent être mortelles si elles ne sont pas traitées, " dit Vivek Kapur, professeur de microbiologie et maladies infectieuses, Huck Distinguished Chair in Global Health et directeur associé des Huck Institutes of Life Sciences, État de Penn. "Les antibiotiques fonctionnent, mais la plupart des gens n'y ont pas accès. Nous avons rencontré de nombreuses personnes qui ont tragiquement perdu un membre de leur famille à cause de ces maladies autrement évitables. »
Les chercheurs ont également trouvé une prévalence particulièrement élevée de bactéries du genre Clostridium, dont les espèces causent des maladies comme le botulisme et le tétanos. En réalité, les microbiomes de gnous collectés pendant la saison sèche comprenaient plus de 78 pour cent d'espèces clostridiennes.
« Il est nécessaire de comprendre quelles bactéries sont présentes dans la viande de brousse pour établir un plan visant à freiner les épidémies de ces maladies dangereuses, " a déclaré Kapur. "Nos données suggèrent la présence de certaines espèces pathogènes, et notre objectif est maintenant d'utiliser des analyses au niveau des espèces pour affiner notre concentration sur des agents pathogènes spécifiques et évaluer et atténuer avec précision le risque associé d'épidémies. Finalement, notre objectif est également d'aider à renforcer les capacités de diagnostic rapide et d'atténuation des risques dans les pays d'origine pour faire face à ces risques avant qu'ils ne deviennent un problème à l'échelle mondiale."
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