Virusne sekvence SARS-CoV-2 mogle su se identificirati iz briseva s bolničke površine

Naš je tim prvi pokazao da se sekvence virusa SARS-CoV-2 mogu identificirati iz briseva iz okoliša prikupljenih s bolničkih površina. "

Angela Haczku, respiratorni imunolog i viši autor studije

Promjena protokola čišćenja i ICU-a povezanih sa nižom kontaminacijom SARS-CoV-2

U travnju 2020. izbijanje COVID-19 među bolničkim osobljem dovelo je interdisciplinarni tim istraživača UC Davis-a da istraži je li došlo do kontaminacije virusa često korištenim površinama u odjelima za pacijente koji se nalaze na intenzivnoj njezi i sastancima osoblja u Medicinskom centru UC Davis. U to se vrijeme jako raspravljalo o ulozi fomita (površina) u širenju bolesti. Prikupili su više uzoraka tijekom prvog (travanj 2020.) i drugog (kolovoz 2020.) vala COVID-19 s površina i HVAC filtera u bolnici.

Istraživači su analizirali površinske briseve za SARS-CoV-2 RNA i infektivnost te ocijenili prikladnost RNA za sekvenciranje.

Unatoč značajnom povećanju broja bolničkih pacijenata s COVID-19 tijekom drugog vala, tim je otkrio da je samo 2% briseva bilo pozitivno u kolovozu, u usporedbi s 11% uzoraka prikupljenih u travnju.

"Smanjenje kontaminacije virusom vjerojatno je posljedica poboljšanog upravljanja pacijentima na ICU i protokola čišćenja, "Haczku je rekao. Haczku je profesor medicine, ravnatelj Centra za pluća UC Davis i prodekan za translacijska istraživanja na Medicinskom fakultetu UC Davis.

Genomski slijed koronavirusa pronađen je na površinama

Studija je pokazala da sekvenciranjem genoma, SARS-CoV-2 mogao bi se otkriti čak i iz uzoraka koji su inače negativni (neotkrivivi) uobičajenim PCR testovima. Rezultati su također potvrdili da je SARS-CoV-2 RNA pokupljena s površine, iako sadrži gotovo netaknuti genomski niz, nije bio zarazan. Ovaj nalaz podupire hipotezu da zagađene površine možda nisu glavni način širenja bolesti COVID-19.

"Prvi put, na naše znanje, uspjeli smo odrediti sekvencu virusnog genoma iz površinskih uzoraka brisa dobivenih u bolničkom okruženju, "rekao je David Coil, znanstvenik na projektu u UC Davis Genome Centru i prvi autor studije. "Pronašli smo SARS-CoV-2 u uzorcima koji su bili negativni na RT-PCR, sugerirajući da je tehnologija sekvenciranja superiorna za otkrivanje virusa u uzorcima okoliša. "

Prema Coil -u, sekvenciranje genoma izvedeno na uzorcima brisa s bolničke površine vrlo je važno. Dobivanjem točnih virusnih genomskih sekvenci, istraživači su mogli pratiti izvor i shvatiti kako se infekcija kreće.

"Naši podaci pokazuju da su sekvence utvrđene za virusnu RNA s površina identične onima koje su izvedene od pacijenata hospitaliziranih na intenzivnoj njezi u vrijeme prikupljanja uzoraka. Sposobnost identificiranja sekvenci virusnog genoma iz uzoraka okoliša može imati veliki značaj za javno zdravlje u praćenju izbijanja epidemije i praćenju širenja novih virusnih varijanti, "Rekao je Haczku.

• Istraživači UTHSC -a objavljuju nova otkrića o tome kako pretilost utječe na liječenje raka
• Mješavina polisaharida dobivena iz kvasca učinkovito inhibira početak,