Kihasználva a legmodernebb technológia és a "big data" elemzés erejét, az újonnan létrehozott Arizona COVID-19 Genomics Union (ACGU) kutatói jobban meg akarják érteni, hogyan fejlődhet ez a vírus, hogyan továbbítják, és hogyan mozog a lakosság körében. Ez a molekuláris epidemiológiai megközelítés ötvözi a hagyományos járványügyi módszereket az evolúciós modellezéssel, amely a vírus genomjának nagy felbontású elemzésén alapul.
Az ACGU a COVID-19 páciensekből származó mintákat szekvenál, hogy elemezze a vírus genetikai kódjait, kövesse nyomon különböző törzseit, mutassa be, hogy az egyes minták honnan származnak, ahol esetleg továbbították, és - esetleg - olyan részleteket tár fel, amelyek kritikus információkat nyújthatnak a diagnosztikához, vírusellenes gyógyszerek célpontjai, és a vakcina kifejlesztése.
Csak a genomi szekvenálás és a fejlett elemzések segítségével, elkezdhetjük -e teljesen megérteni ezt a betegséget molekuláris szinten, kulcsokat keres a rejtélyek feltárásához. Képesek vagyunk minden beteg minden törzsének genomját szekvenálni - erre törekszünk. "
Dr. David Engelthaler, Társigazgató és egyetemi docens a TGen Patogén és Mikrobiom osztályán, a fertőző betegség ága Flagstaffban, TGen North néven
Dr. Engelthaler Arizona korábbi állami epidemiológusa és állami biodefense koordinátora. Korábban a CDC -nél volt, és vezette a helyi vizsgálatokat, nemzeti és nemzetközi betegségkitörések több mint 25 éve, kezdve Arizona 1993-94-es hantavírus-járványával. Ő koordinálja az új ACGU SARS-CoV-2 vírus genomikus szekvenálását, ami a COVID-19 betegséget okozza.
Az Unió további társalapítói Arizona két vezető fertőző betegségekkel foglalkozó tudósa:Dr. Paul Keim és Dr. Michael Worobey.
Dr. Keim világszerte szakértő az olyan kórokozókban, mint a pestis és a lépfene. Együttműködött az FBI -val, hogy feltörje a "lépfene betűk" ügyet szeptember 11 -e után. Az NAU -nál, ő a Regents biológia professzora, a mikrobiológia elismert székével rendelkezik, és a Pathogen and Microbiome Institute (PMI) ügyvezető igazgatója. A TGen kiváló professzora, A TGen North társigazgatója, és az ACGU igazgatója lesz.
"A genomszekvenciák ideálisak az elosztott tudományos kutatási erőfeszítésekhez, és az Arizona Unió nagymértékben támaszkodik a betegség nyomon követésére szolgáló nemzeti és globális tanulmányokra. Mindazonáltal, kulcsfontosságú, hogy a regionális szakértők vegyenek részt ebben a folyamatban, hogy maximalizálják az arizonai polgárok előnyeit, - mondta Dr. Keim.
Dr. Worobey az Arizonai Egyetem Ökológiai és Evolúciós Biológiai Tanszékének vezetője, és világhírű a vírusjárványokkal kapcsolatos munkájáról. A genomi epidemiológia segítségével véglegesen nyomon követte a HIV eredetét és világméretű terjedését, és azt is meghatározta, hogy az 1918 -as "spanyol influenza" világjárvány miért ölte meg a fiatal felnőttek millióit.
"A vírusok molekuláris elemzése kulcsfontosságú nyomokat ad arra vonatkozóan, hogyan kezdődnek a járványok, és hogyan lehet leküzdeni őket, - mondta Dr. Worobey. - Arizona tehetségének és infrastruktúrájának gazdagságát fogjuk kamatoztatni ebben a törekvésünkben.
Az Arizona COVID-19 Genomics Union hasonló a világ többi csoportjához, azon dolgozik, hogy talpra tudjon állni ebben az új koronavírusban. Gyors adatmegosztás és elemzés történt, és továbbra is az, kritikus a tudomány számára, a járvány orvosi és közegészségügyi megértése. Ironikusan, a COVID-19 első amerikai epicentruma, Seattle, a NextStrain otthona is, az internet otthona ennek és más kórokozóknak a genomkövetésére.
Az arizonai tudósok konzorciuma reméli, hogy regionális szekvenálásuk előnyt biztosít Arizona egészségügyi szolgáltatóinak és közpolitikai döntéshozóinak a járvány kezelésére.
Mint a NextStrain, Az ACGU nyilvánosságra hozza megállapításait; világszerte nyíltan elérhetőek az epidemiológusok és virológusok számára.
A nasopharyngealis mikrobiom összetétele és szerkezete összefügg a COVID-19 betegség súlyosságával
A DNS-alapú étrend és a személyre szabott orvosi ételek a jövő a fogyás szempontjából?
A kutatók in vitro azonosítanak egy SARS-CoV-2 elleni aktivitással rendelkező baktériumot:Dolosigranulum pigrum
A spermium mikrobiomája RNS szekvenálással derült ki
Gázérzékelő elektronikus tabletta a gyomor -bélrendszeri betegségek diagnosztizálásához
Egy új kutatás összefüggést azonosít a bél mikrobioma és a stroke között
A nyugati étrend növelheti a „halálos szepszis” kockázatát,
figyelmeztetik a szakértőket A Portland Állami Egyetemen végzett új kutatások azt sugallják, hogy a nyugati étrend növelheti a súlyos szepszis és a fertőzés okozta halálozás kockázatát. hu
A bélfokozó ételek világszerte véget vethetnek a gyermekkori alultápláltságnak
A kutatók új típusú élelmiszereket fejlesztettek ki, amelyek javítják a bélbaktériumokat az alultáplált gyermekeknél, és jobban képesek elindítani a növekedést, mint a szokásos élelmezési terápia.
A darazsak bélmikrobái segítenek legyőzni a peszticideket
Érdekes tanulmány 2020 februárjában jelent meg a folyóiratban Cell Host &Microbe arról számol be, hogy amikor a darazsak atrazinnak vannak kitéve, általánosan használt peszticid, a bél mikrobioma ol